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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
13/08/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; CECON, P. R.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, A. C. C.; AZEVEDO, C. F.; MARQUES, D. B. D.; SILVA, M. V. G. B.; CARNEIRO, A. P. S.; PAIXAO, D. M. |
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Afiliação: |
Universidade Federal do Piauí; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; A.C.C. NASCIMENTO, Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; D.B.D. MARQUES, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; A.P.S. CARNEIRO, Universidade Federal de Viçosa; Universidade de São Paulo. |
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Título: |
Genomic prediction of lactation curves of Girolando cattle based on nonlinear mixed models. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 1, gmr18691, 2021. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr18691 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Knowledge of lactation curves in dairy cattle is essential for understanding the animal production in milk production systems. Genomic prediction of lactation curves represents the genetic pattern of milk production of the animals in the herd. In this context, we made genomic predictions of lactation curves through genome-wide selection (GWS) to characterize the genetic pattern of lactation traits in Girolando cattle based on parameters estimated by nonlinear mixed effects (NLME) models. Data of 1,822 milk control records from 226 Girolando animals genotyped for 37,673 single nucleotide polymorphisms were analyzed. Nine NLME models were compared to identify the equation with the best fit. The lactation traits estimated by the best model were submitted to GWS analysis, using the Bayesian LASSO method. Then, based on the genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained, genomic predictions of lactation curves were constructed, and the genetic parameters were calculated. Wood's equation showed the best fit among the evaluated models. Heritabilities ranged from 0.09 to 0.29 for the seven lactation variables (initial production, rates of increase and decline, lactation peak, time to peak yield, persistence and total production). The correlations among GEBVs ranged from -0.85 to 0.98. The concordances between the best animals selected according to the selected traits were greater when the correlations between GEBVs for these traits were also high. Consequently, the methodology allowed us to identify the best nonlinear model and to construct the genetic lactation curves of a Girolando cattle population, as well as to assess the differences between animals and the association between lactation variables. MenosKnowledge of lactation curves in dairy cattle is essential for understanding the animal production in milk production systems. Genomic prediction of lactation curves represents the genetic pattern of milk production of the animals in the herd. In this context, we made genomic predictions of lactation curves through genome-wide selection (GWS) to characterize the genetic pattern of lactation traits in Girolando cattle based on parameters estimated by nonlinear mixed effects (NLME) models. Data of 1,822 milk control records from 226 Girolando animals genotyped for 37,673 single nucleotide polymorphisms were analyzed. Nine NLME models were compared to identify the equation with the best fit. The lactation traits estimated by the best model were submitted to GWS analysis, using the Bayesian LASSO method. Then, based on the genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained, genomic predictions of lactation curves were constructed, and the genetic parameters were calculated. Wood's equation showed the best fit among the evaluated models. Heritabilities ranged from 0.09 to 0.29 for the seven lactation variables (initial production, rates of increase and decline, lactation peak, time to peak yield, persistence and total production). The correlations among GEBVs ranged from -0.85 to 0.98. The concordances between the best animals selected according to the selected traits were greater when the correlations between GEBVs for these traits were also high. Consequently, the methodology a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Previsão genômica. |
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Thesagro: |
Bovino; Curva de Lactação; Gado Leiteiro. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Girolando; Heritability. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225151/1/Genomic-prediction.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 1. |  | GROSSI-DE-SÁ, M. F.; CRUZ, C. M.; TEIXEIRA, F. R.; SARTO, R. P.; SILVA, M. C. M. Insecticidal activity of shuffled alpha-amylase inhibitors. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 1., 2007, Natal, Rio Grande do Norte. [Resumos...]. [S.l]: Monsanto; Brasília: CNPq, 2007. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 2. | | SILVA, M. C. M.; CRUZ, C. M.; TEIXEIRA, F. R.; SARTO, R. P.; BEZERRA-AGASIE, I. C.; COUTINHO, M. V.; GROSSI de SÁ, M. F. Insecticidal activity of shuffled alpha-amylase inhibitors. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 35., 2006, Águas de Lindóia, SP. Programas e resumos... São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | SILVA, M. C. M.; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M.; COUTINHO, M. V.; ROCHA, T. L.; OLIVEIRA-NETO, O. B.; NESHICH, G.; GROSSI DE SÁ, M. F. Bean shuffled alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to insect alpha-amylases. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 1., 2007, Natal, Rio Grande do Norte. [Resumos...]. [S.l]: Monsanto; Brasília: CNPq, 2007. p. 26.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | MARUYAMA, S. R.; HORACKOVA, J.; TEIXEIRA, F. R.; MORE, D. D.; GARCIA, G. R.; FERREIRA, B. R.; SANTOS, I. K. F. de M. Reverse immunogenomics for discovery of new antigens for a vaccine against the cattle tick, Rhipicephalus microplus. In: EUROPEAN VETERINARY IMMUNOLOGY WORKSHOP, 3, 2009, Berlin. Abstract Book of ECI. [s. l.]: European Veterinary Immunology Group, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | DEL SARTO, R. P. Z.; COSTA, M. F. da; TEIXEIRA, F. R.; FIGUEIRA, E. L. S.; SILVA, M. C. M.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Seleção de inibidores de a-amilase contra a-amilase do bicudo-do-algodoeiro (Anthonomus grandis - BOHEMAN). In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 9., 2004, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. p. 76.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | SILVA, M. C. M.; SARTO, R. P.; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. M.; COUTINHO, M. V.; GROSSI DE SÁ, M. F. Efficiency of shuffed alpha-amylase inhibitor in inhibit Anthonomus grandis alpha-amylase. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts. [S.l.]: SBBq, 2007. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | TEIXEIRA, F. R.; FIGUEIRA, E. L. Z.; BRÍGIDO, M. M; MARANHÃO, A. Q.; GROSSI-de-SÁ, M. F.; SILVA, M. C. M. Uso da biblioteca combinatória de inibidores de a-amilase para a seleção de genes potencialmente ativos contra o bruquídeo Zabrotes subfasciatus. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 9., 2004, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2004. p. 79.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | DEL SARTO, R. P.; CRUZ, C. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; BEZERRA, I. C.; SILVA, M. C. M.; GROSSI DE SÁ, M. F. Variantes de inibidores de []-amilases selecionados por Phage display com atividade para []-amilases do bicudo do algodoeiro (Anthonomus grandis), Coleptera: Curculionidae. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 26-30. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M. da; TOGAWA, R. C.; NESHICH, G.; SA, M. F. G. de. In vitro molecular evolution of bean alpha-amylase inhibitors to investigate specificity of binding to alpha-amylases. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. [Proceedings...]. Detroit: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster LB-28.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 11. | | SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; CRUZ, C. C. M. da; TOGAWA, R. C.; GROSSI de SÁ, M. F. In vitro molecular evolution of bean alpha-amylase inhibitors to investigate specificty of binding to alpha-amylases. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza, CE. [Proceedings...]. Detroit: ISCB, 2006. Não paginado.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | SILVA, M. C. M. da; SARTO, R. P. del; LUCENA, W. A.; RIGDEN, D. J.; TEIXEIRA, F. R.; BEZERRA, C. de A.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; GROSSI DE SA, M. F. Employing in vitro directed molecular evolution for the selection of α-amylase variant inhibitors with activity toward cotton boll weevil enzyme. Journal of Biotechnology, v. 167, p. 377-385, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | SILVA, M. C. M. da; DEL SARTO, R. P.; LUCENA, W. A.; RIGDEN, D. J.; TEIXEIRA, F. R.; BEZERRA, C. de A.; FR, E. V. S. A.; GROSSI-DE-SA, M. F. Employing in vitro directed molecular evolution for the selection of α-amylase variant inhibitors with activity toward cotton boll weevil enzyme. Journal of Biotechnology, v.167, n. 4, p. 377?385, 2013| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 14. | | DIAS, S. C; SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; FIGUEIRA, E. L. Z.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; LIMA, L. A. de; FRANCO, O. L.; SA, M. F. G. de. Investigation of insecticidal activity of rye α-amylase inhibitor gene expressed in transgenic tobacco (Nicotiana tabacum) toward cotton boll weevil (Anthonomus grandis). Pesticide Biochemistry and Physiology, v. 98 , n. 1, p. 39-44, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | DIAS, S. C.; SILVA, M. M. da; OLIVEIRA NETO, O. B. de; MAGALHÃES, C. P.; TEIXEIRA, F. R.; FRANCO, O. L.; FILGUEIRA, E. L. Z.; LAUMANN, R.; MELLO, F.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Functional expression of a a- amylase/trypsin inhibitor domain from rye and its potential use in the control of cotton boll wevil (Anthonomus grandis). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 20., 2004, Gramado. Programa e resumos... Gramado: Sociedade Entomológica do Brasil, 2004. p. 261.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; SARTO, R. P. del; COUTINHO, M. V.; ROCHA, T. L.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; PAULA, A. W. de; OLIVEIRA, U. A. de; GROSSI DE SÁ, M. F. Evolução in vitro de moléculas com potencial para uso no controle de insetos de grãos armazenados. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. p. 847-850. (IAC. Documentos, 85).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; CECON, P. R.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, A. C. C.; AZEVEDO, C. F.; MARQUES, D. B. D.; SILVA, M. V. G. B.; CARNEIRO, A. P. S.; PAIXAO, D. M. Genomic prediction of lactation curves of Girolando cattle based on nonlinear mixed models. Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 1, gmr18691, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | SILVA, M. C. M. da; TEIXEIRA, F. R.; SARTO, R. P. del; CRUZ, C. C. M. da; AGASIE, I. C. B.; MARANHÃO, A. Q.; VENTURA, M. C.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; MAGALHÃES, J. C. C.; ROCHA, T. L.; GROSSI DE SÁ, M. F. Biblioteca combinatória de genes para inibidores de alfa-amilases: seleção de novos genes com potencial aplicação no controle de insetos-praga de armazenamento. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. 29 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 185).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | DEL SARTO, R. P.; SILVA, M. C. M. da; CRUZ, C. C. M. da; FIGUEIRA, E. L. Z.; TEIXEIRA, F. R.; MARANHÃO, A. Q.; BRÍGIDO, M. M.; COSTA, M. F. da; COUTINHO, M. V.; BEZERRA, I. C.; GROSSI-de-SÁ, M. F. Seleção de inibidores de alfa-amilases específicos para Anthonomus grandis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ALGODÃO, 5., 2005, Salvador. Algodão: uma fibra natural: resumos. Salvador: ABAPA, 2005. p. 6. Painel 7.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | SILVA, M. C. M. da; BRUNETTA, P. S. F.; FIGUEIRA, E. L. Z.; MAGALHÃES, M. T. Q.; OLIVEIRA, G. R.; RAMOS, H. B.; SARTO, R. P. del; CRUZ, C. M.; OLIVEIRA, R. S.; CAVALCANTI, K. L.; CRAVEIRO, K.; BARBOSA, A. E. A. D.; PAES, N. S.; ROCHA, T. L.; TEIXEIRA, F. R.; COUTINHO, M. V.; GROSSI-DE-SÁ, M. F. Evolução molecular in vitro: seleção de moléculas inseticidas para insetos-praga do algodoeiro. Brasília, DF : Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. 22 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 99).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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