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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
12/02/2008 |
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Data da última atualização: |
24/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BOASCARIOL-CAMARGO, R. L.; BERGER, I. J.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ÁSTUA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MEDINA, C. L.; REIS, M. S.; MACHADO, M. A. |
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Afiliação: |
Raquel L. Boscariol-Camargo, APTA; Irving J. Berger, APTA; Alessandra A. Souza, APTA; Alexandre M. do Amaral, CENARGEN; Eduardo F. Carlos, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marco A. Takita, APTA; Maria Luisa P.N. Targon, APTA; Camilo L. Medina, Grupo de Consultores em Citros; Marcelo S. Reis, APTA; Marcos A. Machado, APTA. |
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Título: |
In silico analysis of ESTs from roots of Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 906-916, 2007. |
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ISSN: |
1415-4757 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
CitEST project resulted in the construction of cDNA libraries from different Citrus sp. tissues under various physiological conditions. Among them, plantlets of Rangpur lime were exposed to hydroponic conditions with and without water stress using PEG6000. RNA from roots was obtained and generated a total of 4,130 valid cDNA reads, with 2,020 from the non-stressed condition and 2,110 from the stressed set. Bioinformatic analyses measured the frequency of each read in the libraries and yielded an in silico transcriptional profile for each condition. A total of 40 contigs were differentially expressed and allowed to detect up-regulated homologue sequences to well known genes involved in stress response, such as aquaporins, dehydrin, sucrose synthase, and proline-related synthase. Some sequences could not be classified by using FunCat and remained with an unknown function. A large number of sequences presented high similarities to annotated genes involved with cell energy, protein synthesis and cellular transport, suggesting that Rangpur lime may sustain active cell growth under stressed condition. The presence of membrane transporters and cell signaling components could be an indication of a coordinated morphological adaptation and biochemical response during drought, helping to explain the higher tolerance of this rootstock to water stress. |
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Palavras-Chave: |
Molecular response; Rootstock; Transcription. |
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Thesaurus Nal: |
drought; expressed sequence tags. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Status |
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| Registros recuperados : 32 | |
| 1. |  | COLETTA FILHO, H. D.; RODRIGUES, C.; TAKITA, M. A.; MACHADO, M. A. Ensaio de patogenicidade da bactéria Xylella fastidiosa, estirpe J1 a 12, em plantas de tabaco. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, supl., p. S48, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 2. | | MEHTA, A.; SILVA, M. S.; GONZALEZ, S. G.; CARRER, H.; TAKITA, M. A.; MARTINS, N. F. Signaling pathways in a citrus EST database. Genetics and Molecular Biology, v. 30, n. 3, suppl., p. 734-751, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | MEHTA, A.; SILVA, M. S.; GUIDETTI-GONZALEZ, S.; CARRER, H.; TAKITA, M. A.; MARTINS, N. F. Signaling pathways in a citrus EST database. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 734-751, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | SOUZA, A. A. de; TAKITA, M. A.; PEREIRA, E. O.; RODRIGUES, C. M. COLETTA FILHO, H. D.; MACHADO, M. A. Expressão de genes de adesão e adaptação de Xylella fastidiosa durante crescimento in planta e formação de biofilme in vitro. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, supl., p. S44, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 6. | | CRISTOFANI, M.; SOUZA, A. A.; KISHI, L.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; MACHADO, M. A. Genes diferencialmente expressos em híbridos de Citrus sunki vs Poncirus trifoliata resistentes ao Citrus tristeza virus detectados por hibridização subtrativa. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S223, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 7. | | AMARAL, A. M. do; BAPTISTA, J. C.; SOUZA, C. B.; WINCK, F. V.; RONCOLETTA, J.; COLETTA FILHO, H. D.; TAKITA, M. A.; MACHADO, M. A. Functional genomics and diagnostic of Xanthomonas axonopodis pv. citri towards pathogenicity-related genes. In: INTERNATIONAL CITRUS CANKER AND HUANGLONGBING RESEARCH WORKSHOP, 2. 2005, Orlando. Proceedings... Orlando: Florida Citrus Muual, 2005. p. 69| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 8. | | COLETTA-FILHO, H. D.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; DE NEGRI, J. D.; POMPEU JUNIOR, J.; MACHADO, M. A.; AMARAL, A. M.; MULLER, G. W. First report of the causal agent of Huanglongbing ("Candidatus Liberibacter asiaticus") in Brazil. Plant Disease, v. 88, n. 12, p. 1382, 2004.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 9. | | COLETTA-FILHO, H. D.; CARLOS, E. F.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; ALVES, K. C. S.; AMARAL, A. M. do; MACHADO, M. A. Effective detection and genome sequencing approaches of candidatus Liberibacter sp. causing Huanglongbing (HLB) in São Paulo, Brazil. In: INTERNATIONAL CITRUS CANKER AND HUANGLONGBING RESEARCH WORKSHOP, 2., 2005, Orlando. Proceedings... Orlando: Florida Citrus Mutual, 2005. p. 79| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | TAKITA, M. A.; SOUZA, A. A. de; BORGES, K. M.; COLETTA FILHO, H. D.; MONGE, G. A.; DESTÉFANO, S.; RODRIGUES NETO, J.; MACHADO, M. A. Região RPF (Regulação de Fatores de Patogenicidade) distingue espécies de Xanthomonas. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S253, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | TAKITA, M. A.; AMARAL, A. M. do; SOUZA, A. A. de; COLETTA FILHO, H. D.; CARVALHO, S. A.; MACHADO, M. A. Resistência de plantas de diferentes espécies de Capsicum a Xanthomonas axonopodis PV. Citri. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S255, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 13. | | MACHADO, M. A.; ASTUA-MONGE, G.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ASTUA, J.; SOUZA, A. A.; COLETA FILHO, H. D.; AMARAL, A. M. do; CRISTOFANI, M.; BASTIANEL, M. Citrus genomics in Brazil (CitEST): experiences and future perspectives. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 13., 2005, San Diego, USA. Abstracts... San Diego: Scherago International, 2005. p. 18| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | MACHADO, M. A.; ASTUA-MONGE, G.; TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; FREITAS-ASTUA, J.; SOUZA, A. A.; COLETTA FILHO, H. D.; AMARAL, A. M. do; CRISTOFANI, M.; BASTIANEL, M.; PALMIERI, D. A.; BASILIO, A. C. Citrus genomics in Brazil (CitEST): experiences and future perspectives. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 34., 2005, Águas de Lindóia. Programa e índices... Águas de Lindóia: SBBq, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | CAMPOS, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; SOUZA, A. A.; MONGE, G. A.; TEIXEIRA, J. E. C.; TAKITA, M. A.; KISHI, L.; PAIVA, L. V.; MACHADO, M. A. Elicitin-like genes from Phytophthora parasitica regulated during the interaction with Cirtros sinensis 'Pêra IAC'. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S276, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 16. | | TAKITA, M. A.; ASTUA, J. de F.; PALMIERI, D. A.; KISHI, L. T.; CAMARGO, G. C.; NASCIMENTO, L. C.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G.; MACHADO, M. A. Introns and exons in citrus genome. In: CONFERENCE PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH , 20., 2012, San Diego. The Largest Ag-Genomics Meeting in the World. SanDiego: Intl-Pag, 2012. Anais Web.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | SILVA-PINHATI, A. C.; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; MALOSSO, A.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ASTUA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. N. P.; MACHADO, M. A. ESTs of roots of different citrus species and differential expression of genes associated to drought tolerance. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 16., 2008, San Diego. Final abstracts guide. San Diego: Illumina, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 18. | | SILVA-PINHATI, A. C.; BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; MALOSSO, A.; SOUZA, A. A. de; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ASTUA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. N. P.; MACHADO, M. A. ESTs of roots of different citrus species and differential expression of genes associated to drought tolerance. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. W112| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 19. | | SOUZA, A. A. de; TARGON, M. L. P. N.; KISHI, L. T.; ROSA, D. D.; CAMPOS, M. A.; ASTUA MONGE, G.; CRISTOFANI, M.; TAKITA, M. A.; MACHADO, M. A. Genes de Phytophthora parasitica relacionados à degradação da parede celular vegetal isolados por biblioteca de cDNA. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 29, p. S200, ago. 2004. Edição dos Resumos do XXXVII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Gramado, RS, ago. 2004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | BOSCARIOL-CAMARGO, R. L.; SILVA-PINHATI, A. C.; SOUZA, A. A.; AMARAL, A. M. do; CARLOS, E. F.; FREITAS-ASTÚA, J.; TAKITA, M. A.; TARGON, M. L. P. N.; REIS, S. M.; MACHADO, M. A. Gene expression of Rangpur Lime (Citrus limonia Osbeck) under water stress. In: THE INTERNATIONAL CONFERENCE ON THE STATUS OF PLANT & ANIMAL GENOME RESEARCH, 16., 2008, San Diego. Final abstracts guide. San Diego: Illumina, 2008. P24| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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