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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Algodão; Embrapa Territorial.
Data corrente:  01/12/2023
Data da última atualização:  01/12/2023
Tipo da produção científica:  Documentos
Autoria:  BOGIANI, J. C.; KANO, C.; BARROSO, P. A. V.; PAIM, F. A. de P.; PERINA, F. J.; LOVISI FILHO, E.; CUSTODIO, D. de O.; LEIVAS, J. F.; TAKEMURA, C. M.; GARCON, E. A. M.; FURTADO, A. L. dos S.; MOTA, J. C.
Afiliação:  JULIO CESAR BOGIANI, CNPM; CRISTIAINI KANO, CNPM; PAULO AUGUSTO VIANNA BARROSO, CNPM; FERNANDO ANTONIO DE PADUA PAIM, CNPM; FABIANO JOSE PERINA, CNPA; ELIO LOVISI FILHO, CNPM; DAVI DE OLIVEIRA CUSTODIO, CNPM; JANICE FREITAS LEIVAS, CNPM; CELINA MAKI TAKEMURA, CNPM; EDLENE APARECIDA MONTEIRO GARCON, CNPM; ANDRE LUIZ DOS SANTOS FURTADO, CNPM; JAIME COSTA MOTA, CNPM.
Título:  Monitora Oeste: uma ferramenta digital para o monitoramento fitossanitário e agrometeorológico no Extremo Oeste Baiano.
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  Campinas: Embrapa Territorial, 2023.
Páginas:  20 p.
Série:  (Embrapa Territorial. Documentos, 149)
ISSN:  0103-7811
Idioma:  Português
Notas:  ODS 2
Conteúdo:  Doenças fúngicas podem gerar sérios danos às plantas e afetar a produtividade final de lavouras. Monitorar os fatores que as desencadeiam no campo é determinante para definir estratégias de manejo mais adequadas para controlar essas doenças. A ferramenta digital Monitora Oeste disponibiliza ao produtor informações de fácil acessibilidade e em tempo real, para subsidiar decisões quanto à condução agronômica e ao manejo de controle para a mancha de Ramularia e a ferrugem-asiática no Extremo Oeste Baiano. Esta obra apresenta o aplicativo e o sistema web do Monitora Oeste e todas as funcionalidades disponíveis, e contribui para garantir sistemas sustentáveis de produção e implementar práticas agrícolas resilientes, favorecendo o alcance do Objetivo de Desenvolvimento Sustentável (ODS) número 2, que visa promover a agricultura sustentável, da Organização das Nações Unidas (ONU).
Palavras-Chave:  Aplicativo; Controle fitossanitário; Doenças fúngicas; Selo ODS 2.
Categoria do assunto:  O Insetos e Entomologia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1158996/1/6180.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Territorial (CNPM)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPA29093 - 1UPEFL - DD
CNPM6180 - 1UMTFL - DD23/068DC2023.068
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Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br.

Registro Completo

Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  07/12/2016
Data da última atualização:  06/02/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  UTSUNOMIYA, A. T. H.; SANTOS, D. J. A.; BOISON, S. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MILANESI, M.; BICKHART, D. M.; AJMONE-MARSAN, P.; SOLKNER, J.; GARCIA, J. F.; FONSECA, R. da; SILVA, M. V. G. B.
Afiliação:  Adam T. H. Utsunomiya, UNESP; Daniel J. A. Santos, UNESP; Solomon A. Boison, Nofima, Ås, Norway; Yuri T. Utsunomiya, UNESP; Marco Milanesi, UNESP; Derek M. Bickhart, ARS, USDA, Beltsville; Paolo Ajmone-Marsan, Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza, Italy; Johann Sölkner, BOKU - University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna, Austria; José F. Garcia, UNESP / IAEA; Ricardo da Fonseca, UNESP; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL.
Título:  Revealing misassembled segments in the bovine reference genome by high resolution linkage disequilibrium scan.
Ano de publicação:  2016
Fonte/Imprenta:  BMC Genomics, v. 17, article 705, 2016.
DOI:  https://doi.org/10.1186/s12864-016-3049-8
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Background- Misassembly signatures, created by shuffling the order of sequences while assembling a genome, can be detected by the unexpected behavior of marker linkage disequilibrium (LD) decay. We developed a heuristic process to identify misassembly signatures, applied it to the bovine reference genome assembly (UMDv3.1) and presented the consequences of misassemblies in two case studies. Results -We identified 2,906 single nucleotide polymorphism (SNP) markers presenting unexpected LD decay behavior in 626 putative misassembled contigs, which comprised less than 1 % of the whole genome. Although this represents a small fraction of the reference sequence, these poorly assembled segments can lead to severe implications to local genome context. For instance, we showed that one of the misassembled regions mapped to the POLL locus, which affected the annotation of positional candidate genes in a GWAS case study for polledness in Nellore (Bos indicus beef cattle). Additionally, we found that poorly performing markers in imputation mapped to putative misassembled regions, and that correction of marker positions based on LD was capable to recover imputation accuracy. Conclusions - This heuristic approach can be useful to cross validate reference assemblies and to filter out markers located at low confidence genomic regions before conducting downstream analyses.
Palavras-Chave:  GWAS; Imputation; Misassembly.
Thesagro:  Bos Indicus; Bos Taurus.
Thesaurus NAL:  Genome; linkage disequilibrium.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPGL22984 - 1UPCAP - DD
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