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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/06/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSOA, UFRRJ; CARLOS MAGNO DOS SANTOS, UFRRJ; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021. |
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ISSN: |
2190-5738 |
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DOI: |
10.1007/s13205-021-02848-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial transcriptome profiling in the presence of plant fluids or extracts during microbial growth may provide relevant information on plant?bacteria interactions. Here, RNA sequencing (RNA-Seq) was used to determine the transcriptomic profile of Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 at the early stages of response to sugarcane apoplastic fluid. Differentially expressed gene (DEG) analysis was performed using the DESeq2 and edgeR packages, followed by functional annotation using Blast2GO and gene ontology enrichment analysis using the COG and KEGG databases. After 2 h of sugarcane apoplastic fluid addition to the H. seropedicae HRC54 culture, respectively, 44 and 45 genes were upregulated and downregulated. These genes were enriched in bacterial metabolism (e.g., oxidoreductase and transferase), ABC transporters, motility, secretion systems, and signal transduction. RNA-Seq expression profiles of 12 genes identified in data analyses were verified by RT-qPCR. The results suggested that H. seropedicae HRC54 recognized sugarcane apoplastic fluid as the host signal, and some DEGs were closely involved at the early stages of the establishment of plant?bacteria interactions. |
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Palavras-Chave: |
Plant bacteria interactions. |
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Thesaurus Nal: |
Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
03/03/2016 |
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Data da última atualização: |
22/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SOUSA, A. O.; RODRIGUES, B. A.; NARCISO, M. G.; MENESES, M. V.; GUIMARAES, C. M. |
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Afiliação: |
ANDERSON OLIVEIRA SOUSA, UFG; BERNARDO ARAUJO RODRIGUES, USP; MARCELO GONCALVES NARCISO, CNPAF; MARCUS VINÍCIUS MENESES, UFG; CLEBER MORAIS GUIMARAES, CNPAF. |
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Título: |
Software de obtenção do Índice de Vegetação por Diferença Normalizada. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. |
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Páginas: |
p. 94. |
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Série: |
(Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309). |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O objetivo desse trabalho foi desenvolver um software para processar uma imagem obtida por meio de uma câmera multiespectral de baixo custo, calcular e disponibilizar, pixel-a-pixel, os valores do Índice de Vegetação por Diferença Normalizada da planta ou cultura alvo. |
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Palavras-Chave: |
Avaliação; Índice de Vegetação por Diferença Normalizada. |
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Thesagro: |
Cobertura vegetal. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141562/1/CNPAF-2015-p94.pdf
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Marc: |
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520 $aO objetivo desse trabalho foi desenvolver um software para processar uma imagem obtida por meio de uma câmera multiespectral de baixo custo, calcular e disponibilizar, pixel-a-pixel, os valores do Índice de Vegetação por Diferença Normalizada da planta ou cultura alvo.
650 $aCobertura vegetal
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653 $aÍndice de Vegetação por Diferença Normalizada
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
ID |
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