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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
30/12/2019 |
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Data da última atualização: |
30/12/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
SUNIGA, P. A. P. |
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Afiliação: |
PAULA ADAS PEREIRA SUNIGA. |
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Título: |
Ancestralidade genética da raça Senepol por meio da análise de painés de polimorfismos de nucleotídeo único. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, MS, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Orientadora: Andréa Alves do Egito, Pesquisadora da Embrapa Gado de Corte, matrícula: 257.064; Coorientador: Gilberto Romeiro de Oliveira Menezes - Pesquisador da Embrapa Gado de Corte, Matrícula: 351.204; Coorientador: Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva - Pesquisador da Embrapa Gado de Leite, Matrícula: 307.003. |
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Conteúdo: |
This work aimed to evaluate the genetic ancestry of the Senepol breed by genomic analysis based on large-scale SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers to elucidate its genetic composition. Twenty Senepol bulls were genotyped, which were chosen based on their contribution to the Brazilian population, with the BovineHD BeadChip panel. Prior quality control was performed for samples, those with call rates above 0.9 remained in the analysis, and for markers, minor allele frequency (MAF) above 0.5 and call rates 0.95 were also maintained. Analyzes of ADMIXTURE and main components were performed. For the first analysis, the markers in high binding imbalance were removed. The results show that Senepol has, in greater proportion, allelic sharing with European taurines, compatible with its history. The proportion of African Taureans is small ( ̅ = 2%) and there is an average 14.4% introgression of Zebu alleles. In addition, it was possible to observe that a genetic composition similar to the locally adapted breeds of Brazil, being even closer genetically. It is concluded that the Senepol breed has predominantly European taurine ancestry and it was verified the participation of Creole cattle in its formation, probably through their use in absorbent crosses. |
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Palavras-Chave: |
Adapted taurine; ADMIXTURE; Genetic composition; SNP. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02218nam a2200169 a 4500
001 2117951
005 2019-12-30
008 2019 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aSUNIGA, P. A. P.
245 $aAncestralidade genética da raça Senepol por meio da análise de painés de polimorfismos de nucleotídeo único.$h[electronic resource]
260 $aDissertação (Mestrado) - Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul, Campo Grande, MS$c2019
500 $aOrientadora: Andréa Alves do Egito, Pesquisadora da Embrapa Gado de Corte, matrícula: 257.064; Coorientador: Gilberto Romeiro de Oliveira Menezes - Pesquisador da Embrapa Gado de Corte, Matrícula: 351.204; Coorientador: Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva - Pesquisador da Embrapa Gado de Leite, Matrícula: 307.003.
520 $aThis work aimed to evaluate the genetic ancestry of the Senepol breed by genomic analysis based on large-scale SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers to elucidate its genetic composition. Twenty Senepol bulls were genotyped, which were chosen based on their contribution to the Brazilian population, with the BovineHD BeadChip panel. Prior quality control was performed for samples, those with call rates above 0.9 remained in the analysis, and for markers, minor allele frequency (MAF) above 0.5 and call rates 0.95 were also maintained. Analyzes of ADMIXTURE and main components were performed. For the first analysis, the markers in high binding imbalance were removed. The results show that Senepol has, in greater proportion, allelic sharing with European taurines, compatible with its history. The proportion of African Taureans is small ( ̅ = 2%) and there is an average 14.4% introgression of Zebu alleles. In addition, it was possible to observe that a genetic composition similar to the locally adapted breeds of Brazil, being even closer genetically. It is concluded that the Senepol breed has predominantly European taurine ancestry and it was verified the participation of Creole cattle in its formation, probably through their use in absorbent crosses.
653 $aAdapted taurine
653 $aADMIXTURE
653 $aGenetic composition
653 $aSNP
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 12 | |
| 3. |  | SUNIGA, P. A. P.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Genotipagem e prospecção de SNPs no gene HSF1, relacionado à termotolerância em bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 84-85. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | SUNIGA, P. A. P.; SILVA, M. V. G. B.; MENEZES, G. R. de O.; EGITO, A. A. do. Impacto do desequilíbrio de ligação em análises de admixture. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. p. 70-71| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | SILVA, M. C. C. da; OLIVEIRA, F. S.; SUNIGA, P. A. P.; LIMA, T. P. C.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Frequência alélica do SNP c.909t>c do gene HSF1 em bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 12., 2016, Campo Grande, MS. Anais... Brasília, DF: Embrapa Gado de Corte, 2016. 112 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 227). Comissão organizadora: Marta Pereira da Silva - Coordenadora; Mateus Figueiredo Santos - Vice-Coordenador; Rodrigo Carvalho Alva - Secretário Executivo e Editoração.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | OLIVEIRA, F. S.; LIMA, T. P. C.; FERRAZ, A. L. J.; FERREIRA, A. B. R.; SUNIGA, P. A. P.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Sequenciamento e diversidade do gene drb3.2 do complexo principal de histocompatibilidade (mhc) de bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 40-41. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | SUNIGA, P. A. P.; SANTIAGO, G. G.; MENEZES, G. R. de O.; MILANESI, M.; GONDO, A.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SILVA, L. O. C. da; NOBRE, P. R. C.; SIQUEIRA, F.; EGITO, A. A. do. Acurácia em diferentes modelos para predição de valores genéticos em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). P. 94-95| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 8. | | RIEGER, J. S. G.; MANTOVANI, C.; SUNIGA, P. A. P.; PINTO, I. B.; SOUSA, G. A. A.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; SANTOS, L. R.; ARAÚJO, F. R.; ZANELLA, J. R. C. Standardization of ELISA with senecavirus A recombinant VP2 protein and its use in swine herds in Brazil. Genetics and Molecular Research, v. 22, n. 1, ed. gmr19118, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 9. | | GASPAR, E. B.; SANTOS, L. R. dos; EGITO, A. A. do; SANTOS, M. G. dos; MANTOVANI, C.; RIEGER, J. DA S. G.; ABRANTES, G. A. DE S.; SUNIGA, P. A. P.; FAVACHO, J. DE M.; PINTO, I. B.; NASSAR, A. F. DE C.; SANTOS, F. L. DOS; ARAUJO, F. R. Assessment of the virulence of the Burkholderia mallei Strain BAC 86/19 in BALB/c Mice. Microorganisms, v. 11, issue 10, e2597, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 10. | | SUNIGA, P. A. P.; MANTOVANI, C.; SANTOS, M. G. dos; EGITO, A. A. do; VERBISCK, N. V.; SANTOS, L. R. dos; DÁVILA, A. M. R.; ZIMPEL, C. K.; ZERPA, M. C. S.; CHIEBAO, D. P.; GUIMARÃES, A. M. DE S.; NASSAR, A. F. DE C.; ARAUJO, F. R. Glanders Diagnosis in an Asymptomatic Mare from Brazil: Insights from Serology, Microbiological Culture, Mass Spectrometry, and Genome Sequencing. Pathogens, v. 12, e1250, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | SUNIGA, P. A. P.; MANTOVANI, C.; SANTOS, M. G. dos; RIEGER, J. S. G.; GASPAR, E. B.; SANTOS, F. L. dos; MOTA, R. A.; CHAVES, K. P.; EGITO, A. A.; O. FILHO, J. C.; NASSAR, A. F. C.; SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R. Molecular detection of Burkholderia mallei in different geographic regions of Brazil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, n. 2, p. 1275-1285, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sul. |
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| 12. | | SUNIGA, P. A. P.; MANTOVANI, C.; SANTOS, M. G.; RIEGER, J. S. G.; GASPAR, E. B.; SANTOS, F. L. DOS; MOTA, R. A.; CHAVES, K. P.; EGITO, A. A. do; OLIVEIRA FILHO, J. C. DE; NASSAR, A. F. DE C.; SANTOS, L. R. dos; ARAUJO, F. R. Molecular detection of Burkholderia mallei in different geographic regions of Brazil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 54, issue 2, p. 1275-1285, 2023. Na publicação: José Carlos O. Filho; Alessandra F. Castro Nassar| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sul. |
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