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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
17/09/2007 |
Data da última atualização: |
18/02/2008 |
Autoria: |
AMARAL, P. de P. R.; ALVES, P. C. M.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JÚNIOR, M. T. |
Título: |
Identification and characterization of a Resistence Gene Analog (RGA) from the Caricaceae Dumort family. |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 28, n. 3, p. 458-462, dez. 2006. |
ISSN: |
0100-2945 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); V cauliflora C papaya; Papaya. MenosThe majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
Cri... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
cauliflora; Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); Papaya. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02300naa a2200241 a 4500 001 1654024 005 2008-02-18 008 2006 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a0100-2945 100 1 $aAMARAL, P. de P. R. 245 $aIdentification and characterization of a Resistence Gene Analog (RGA) from the Caricaceae Dumort family. 260 $c2006 520 $aThe majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases. Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); V cauliflora C papaya; Papaya. 653 $acauliflora 653 $aCricaceae 653 $aNucleotide-binding site (NBS) 653 $aPapaya 700 1 $aALVES, P. C. M. 700 1 $aMARTINS, N. F. 700 1 $aSILVA, F. R. da 700 1 $aCAPDEVILLE, G. de 700 1 $aSOUZA JÚNIOR, M. T. 773 $tRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal$gv. 28, n. 3, p. 458-462, dez. 2006.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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141. | | ESPAÑA, M. D.; CARMONA, P. A. O.; CUNHA, R. N. V. da; ALVES, A. A.; MENDONCA, S.; SOUZA JUNIOR, M. T. Teor de óleo e umidade no mesocarpo de cinco acessos de Caiaué (Elaeis oleifera) da Amazônia Brasileira. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 9., 2016, Natal, RN. Biodiesel: 10 anos de pesquisa, desenvolvimento e inovação no Brasil: anais. Lavras: UFLA, 2016. Não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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142. | | DÍAZ-TRUJILLO, C.; KOBAYASHI, A. K.; SOUZA JUNIOR, M. T.; CHONG, P.; MEIJER, H. J. G.; ISAZA, R. E. A.; KEMA, G. H. J. Targeted and random genetic modification of the black Sigatoka pathogen Pseudocercospora fijiensis by Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation. Journal of Microbiological Methods, v. 148, p. 127-137, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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143. | | SANTOS, M. de L.; SILVA, V. N. B. e.; VIEIRA, L. R.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Use of Setaria viridis (A10.1) as model plant for validation of genes for cold tolerance. In: BRAZILIAN CONGRESS OF PLANT PHYSIOLOGY, 16., 2017, São Pedro, SP. Abstract ... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Fisiologia Vegetal, 2017. p. 108.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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144. | | VIANNA, G. R.; IRALA, L. H.; SANTOS, C. R.; RAMA SWAMI, N.; BONFIM, K.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; ARAGÃO, F. J. L.; RECH, E. L. Transformação genética de tabaco visando obter plantas mais tolerantes a estresses abióticos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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145. | | SANTOS, C. M. R.; FERREIRA, C. F.; CASSIANO, L. P.; COELHO, M. C. F.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T. Transcriptome analysis of leaves and roots of Musa balbisiana var. 'Pisang Klutuk Wulung'. Tree and Forestry Science and Biotechnology, v. 4, special issue 1, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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146. | | SANTOS, C. M. R.; FERREIRA, C. F.; CASSIANO, L. P.; COELHO, M. C. F.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; SOUZA JUNIOR, M. T. Transcriptome analysis of leaves and roots of Musa balbisiana var. 'Pisang Klutuk Wulung'. Tree and Forestry Science and Biotechnology, v. 4, special issue 1, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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147. | | SILVA, T. L. C. da; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Transcriptome-wide analysis of aquaporins and their responses in Gliricidia Sepium under high level of salinity stress. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal, RN. Porto Alegre: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 321Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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149. | | SALGADO, F. F.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and annotation of miRNAs and the preponderant role of transcription factors in the response of Elaeis guineensis Jacq to abiotic stresses of drought and salinity. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFOMATICS (BSB 2023), 16., 2023, Curitiba, PR. [Proceedings...]. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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150. | | CAPDEVILLE, G. D.; SOUZA JUNIOR, M. T.; SZINAY, D.; DINIZ, L. E. C.; WIJNKER, E.; SWENNEN, R.; KEMA, G. H. J.; DE JONG, H. The potential of high-resolution BAC-FISH in banana breeding. Euphytica, v.166, p. 431-443, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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151. | | CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JUNIOR, M. T.; SZINAY, D.; DINIZ, L. E. C.; WIJNKER, E.; SWENNEN, R.; KEMA, G. H. J.; JONG, H. de. The potential of righ-resolution BAC-FISH in banana breeding. Euphytica, Wageningen, n. 166, p. 431-443, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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152. | | SILVA, P. H. da; FERREIRA, C. F.; VILARINHOS, A. D.; AMORIM, E. P.; CIAMPI, A. Y.; Miller, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Validação de marcadores est-ssrs em diplóides de bananeira contrastantes para resistência à sigatoka amarela e negra. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil: [anais]. Búzios: Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2011. 1 CD-ROM. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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153. | | SILVA, P. H. da; FERREIRA, C. F.; VILARINHOS, A. D.; AMORIM, E. P.; ANA YAMAGUISHI CIAMPI; MILLER, R. N. G.; SOUZA JUNIOR, M. T. Validação de marcadores moleculares do tipo microssatélites em bananeira. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 4., 2010, Cruz das Almas. [Anais...] Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura, 2010. (Embrapa Mandioca e Fruticultura. Documentos, 190). 1 CD-ROM. PDF. 033.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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154. | | PEREIRA, V. M.; FERREIRA FILHO, J. A.; LEAO, A. P.; VARGAS, L. H. G.; FARIAS, M. P. de; RIOS, S. de A.; CUNHA, R. N. V. da; FORMIGHIERI, E. F.; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. American oil palm from Brazil: Genetic diversity, population structure, and core collection. Crop Science, v. 60, p. 3212-3227, Nov./Dec. 2020. il.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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155. | | SANTOS, C. M.; MARTINS, N. F.; HORBERG, H. M.; ALMEIDA, E. R. de; COELHO, M. C.; ROGAWA, R. C.; SILVA, F. R. da; MILLER, R. N.; SOUZA JUNIOR, M. T. Analysis of expressed sequence tags from Musa acuminata ssp. burmannicoides, var. Calcutta 4 (AA) leaves submitted to temperature stresses. Theoretical and Applied Genetics, Berlin, v. 110, n. 8, p. 1517-1522, May 2005.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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156. | | MILLER, R. N. G.; BERTIOLI, D. J.; BAURENS, F. C.; SANTOS, C. M. R.; ALVES, P. C.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J. Analysis of non-TIR NBS-LRR resistance gene analogs in Musa acuminata Colla: isolation, RFLP marker development, and physical mapping. BMC Plant Biology, v.8, p.15, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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157. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analog in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. não paginado.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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158. | | ANJOS, R. A.; BATISTA, D. S.; PASSOS, M. A. N.; LERIA, H. M. B.; BERTIOLI, D. J.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R.; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; MILLER, R. N. G. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata cv Calcutta 4. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1200.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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159. | | MILLER, R. N. G; ALVES, P. C. S.; SANTOS, C. M. R.; COELHO, M. C. F.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; SOUZA JÚNIOR, M. T.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; BERTIOLI, D. J. Analysis of resistance gene analogs in Musa acuminata VAR. Calcutta 4, An. In: ENCONTRO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO DE PLANTAS REGIONAL DF, 1., 2005, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. p. 92. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 144).Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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160. | | SILVA, E. A. da; PACHECO, T. F.; MENDES, T. D.; LEMOS, M.; CARVALHO, F. B. de P.; FAVARO, L. C. de L.; MENDONCA, S.; SIQUEIRA, F. G. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Combinação de extratos enzimáticos de basidiomicetos e ascomicetos para hidrólise do cacho vazio de dendê. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 4.,2017, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 88-94.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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