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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
19/02/2018 |
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Data da última atualização: |
18/07/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROMEROA, A. R. da S.; SIQUEIRA, F.; SANTIAGO, G. G.; REGITANO, L. C. de A.; SOUZA JÚNIOR, M. D. de; TORRES JúNIOR, R. A. de A.; NASCIMENTO, A. V. do; GRISOLIA, A. B. |
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Afiliação: |
Andrea Renata da Silva Romeroa, Federal University of Dourados - UFGD; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; Gustavo Garcia Santiago, Federal University of Mato Grosso do Sul - UFMS; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Maury Dorta de Souza Júnior, Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; Roberto Augusto de Almeida Torres Júnior; André Vieira do Nascimento, São Paulo State University - UNESP; Alexeia Barufatti Grisolia, Federal University of Dourados - UFGD. |
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Título: |
Prospecting genes associated with navel length, coat and scrotal circumference traits in Canchim cattle. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 210, p. 33-38, April 2018 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The aim of this work was to identify genomic regions and genes in association with the navel length, coat and scrotal circumference traits of Canchim breed of cattle, using genome-wide association studies (GWAS). Imputed data from single nucleotide polymorphism type markers were used, with accuracy greater than 95%. The analyses of genome-wide association were conducted by the Bayes B method, implemented in the GenSel program. Non-overlapping windows that explained at least 0.19% of the additive genetic variance were considered as significant, this value corresponds five times the expected for 1 Mb size windows. GWAS indicated 31 regions in association with navel length, one coat region, and four SC-related regions. In these regions, 4 quantitative loci (QTLs) related to navel length and 5 with SC were identified, as for the coat, the QTLs detected did not present previously described relation with this trait. Among the candidate genes in the associated regions, 7 genes were cited in previous studies, with biological functions related to navel length, one for coat and three for SC. The candidate genes TMEM176A and TMEM176AB, which are orthologous in humans, are in association with navel's trait and compose the Androgen Induced 1 cluster. The identification of genes and QTLs, with a function related to the studied traits, previously described in the literature, reinforces the evidence that the found regions are associated with navel length, coat and SC. This information may contribute to the understanding of the genetic architecture involved with of these traits, to guiding genetic validation studies, gene introgression and contribute to include information concerning molecular markers in genetic evaluation of animal improvement programs. MenosThe aim of this work was to identify genomic regions and genes in association with the navel length, coat and scrotal circumference traits of Canchim breed of cattle, using genome-wide association studies (GWAS). Imputed data from single nucleotide polymorphism type markers were used, with accuracy greater than 95%. The analyses of genome-wide association were conducted by the Bayes B method, implemented in the GenSel program. Non-overlapping windows that explained at least 0.19% of the additive genetic variance were considered as significant, this value corresponds five times the expected for 1 Mb size windows. GWAS indicated 31 regions in association with navel length, one coat region, and four SC-related regions. In these regions, 4 quantitative loci (QTLs) related to navel length and 5 with SC were identified, as for the coat, the QTLs detected did not present previously described relation with this trait. Among the candidate genes in the associated regions, 7 genes were cited in previous studies, with biological functions related to navel length, one for coat and three for SC. The candidate genes TMEM176A and TMEM176AB, which are orthologous in humans, are in association with navel's trait and compose the Androgen Induced 1 cluster. The identification of genes and QTLs, with a function related to the studied traits, previously described in the literature, reinforces the evidence that the found regions are associated with navel length, coat and SC. This information may c... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
GWAS; Inference Bayesian; Polymorphisms. |
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Thesaurus Nal: |
Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| 2. |  | SOUZA JUNIOR, M. D. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; FEIJO, G. L. D.; BATTISTELLI, J. V. F.; SILVA, L. N. Características de carcaça e qualidade de carne de animais cruzados de raças sintéticas, taurinas adaptadas e não adaptadas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p. SBMA 2012. 3 p. SBMA 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 3. | | BATTISTELLI, J. V. F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MENEZES, G. R. de O.; REGGIORI, M. R.; SOUZA JUNIOR, M. D.; SILVA, L. O. C. da. Alternativas de cruzamento utilizando raças taurinas adaptadas ou não sobre matrizes Nelore para produção de novilhos precoce ? Fases de cria e recria1. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 10., 2013, Uberaba. Anais... Viçosa: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2013. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | CARVALHO, T. D. de; SIQUEIRA, F.; SOARES, C. O.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FEIJO, G. L. D.; MEDEIROS, S. R. de; SOUZA JUNIOR, M. D. Associação de polimorfismos nos genes lep e tg com características de qualidade de carne e de produtividade em bovinos cruzados e criados em sistema superprecoce. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 5. | | SOUSA, I. I.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; SANTIAGO, G. G.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; FARIA, F. J. C. Análise funcional de genes associados com espessura de gordura subcutânea em bovinos Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 42-43.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 6. | | SILVA, L. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GASPARINO, E.; SOUZA JÚNIOR, M. D. de; EUCLIDES FILHO, K.; SILVA, L. O. C. da; BATTISTELLI, J. V. F. Avaliação de medidas de eficiência reprodutiva em diferentes matrizes cruzadas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 8., 2010, Maringá. Melhoramento animal no Brasil: uma visão crítica. Maringá: SBMA, 2010. 3 p. 1 CD-ROM. SBMA.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 7. | | SOUZA JUNIOR, M. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FIGUEIREDO, G. R.; AMARAL, T. B.; CURIEL JUNIOR, A. J.; SILVA, L. N.; PESSOA, M. C. Avaliação de medidas na fase de cria de animais nelore e oriundos de cruzamento simples. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 4., 2008, Campo Grande, MS. Anais [da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2008. 1 CD-ROM. Editores técnicos Valdemir Antônio Laura, Paulo Henrique Nogueira Biscola. p. 1 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 8. | | SOUZA JUNIOR, M. D. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FIGUEIREDO, G. R.; MEDEIROS, S. R. de; SILVA, L. N.; BATTISTELLI, J. V. F. Desempenho na fase de cria de animais Nelore e cruzados Angus-Nelore e Caracu-Nelore. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Inovação científica e tecnológica em zootecnia: anais dos resumos. Maringá: SBZ: UEM, 2009. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 9. | | SILVA, L. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GASPARINO, E.; SOUZA JÚNIOR, M. D.; EUCLIDES FILHO, K.; SILVA, L. O. C. da; BATTISTELLI, J. V. F. Repetibilidade e correlações genotípicas para características reprodutivas e produtivas de matrizes cruzadas. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 10. | | SANTI, F. M; ALVES, L. G. C.; OLIVEIRA, T. E.; REZENDE, M. A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; FEIJO, G. L. D. Uso da ultrassonografia no acompanhamento da deposição tecidual em animais superprecoces. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 12. | | SILVA, L. N.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GASPARINO, E.; EUCLIDES FILHO, K.; FIGUEIREDO, G. R.; SOUZA JÚNIOR, M. D.; BATTISTELLI, J. V. F.; CURIEL JÚNIOR, A. J. Avaliação do desempenho reprodutivo de vavas Angus X Caracu X Nelore e Valdostana X Nelore. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 13. | | BALSANI, T. F.; BATTISTELLI, J. V. F.; SILVA, L. N.; SOUZA JÚNIOR, M. D.; SILVA FILHO, R. B. da; REZENDE, M. A.; MEDEIROS, S. R. de; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. Alternativas de cruzamento para melhorar a eficiência de produção e qualidade da carne bovina produzida na Região Centro-Oeste. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE, 6., 2010, Campo Grande, MS. Ética na pesquisa científica: [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2010. 1 CD-ROM. Coordenadora: Vanessa Felipe de Souza 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 14. | | CARVALHO, T. D. de; SIQUEIRA, F.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; FEIJO, G. L. D.; SOUZA JUNIOR, M. D. de; BLECHA, I. M. Z.; SOARES, C. O. Association of polymorphisms in the leptin and thyroglobulin genes with meat quality and carcass traits in beef cattle. Revista Brasileira de Zootecnia, v.41, n.10, p.2162-2168, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 15. | | CARVALHO, T. D.; SIQUEIRA, F.; SOARES, C. O.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; FEIJO, G. L. D.; SOUZA JÚNIOR, M. D.; BLECHA, I. M. Z. Associação dos marcadores LEP/Kpn2I e TG/MboI com características de qualidade de carne e carcaça em bovinos de corte. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 7., 2011, CAMPO GRANDE, MS. [Anais da]... Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2011.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | SOUZA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; SANTIAGO, G. G.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; SIQUEIRA, F. Associação de um polimorfismo no gene FABP3 com características de produtividade em bovinos da raça Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 17. | | MENEZES, G. R. de O.; KATSURAGI, R. R.; NOBRE, P. R. C.; SOUZA JUNIOR, M. D. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; GONDO, A. Avaliação genômica e resultados para características Slick e Dupla musculatura de fêmeas da raça Senepol: edição 2022. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2022. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 304).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | MENEZES, G. R. de O.; KATSURAGI, R. R.; NOBRE, P. R. C.; SOUZA JUNIOR, M. D. de; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; GONDO, A. Avaliação genômica e resultados para características Slick e Dupla musculatura de touros da raça Senepol: edição 2022. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2022. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 305).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | MENEZES, G. R. de O.; KATSURAGI, R. R.; SANTOS JUNIOR, E. F. DOS; CARVALHO FILHO, I.; NOBRE, P. R. C.; SOUZA JUNIOR, M. D. DE; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; GONDO, A. Avaliação genômica e resultados para características Slick e Dupla Musculatura de touros da raça Senepol: edição 2023. Campo Grande, MS: Embrapa Gado e Corte, 2023. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 315).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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