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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
27/09/2023 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, I. P. de; AZEVEDO, B. R. de; COELHO, A. S. G.; SOUZA, T. L. P. O. de; VALDISSER, P. A. M. R.; GOMES-MESSIAS, L. M.; FUNICHELI, B. W.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
ISABELA PAVANELLI DE SOUZA, bolsista CNPAF; BEATRIZ ROSA DE AZEVEDO, bolsista CNPAF; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; THIAGO LIVIO PESSOA OLIV DE SOUZA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; LUCAS MATIAS GOMES-MESSIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; BRENO OSVALDO FUNICHELI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Whole-genome resequencing of common bean elite breeding lines. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 13, 12721, 2023. |
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ISSN: |
2045-2322 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-023-39399-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The expansion of bean genome technologies has prompted new perspectives on generating resources and knowledge essential to research and implementing biotechnological tools for the practical operations of plant breeding programs. This study aimed to resequence the entire genome (whole genome sequencing?WGS) of 40 bean genotypes selected based on their significance in breeding programs worldwide, with the objective of generating an extensive database for the identification of single nucleotide polymorphisms (SNPs). Over 6 million SNPs were identified, distributed across the 11 bean chromosomes. After quality variant filtering, 420,509 high-quality SNPs were established, with an average of 38,228 SNPs per chromosome. These variants were categorized based on their predicted effects, revealing that the majority exerted a modifier impact on non-coding genome regions (94.68%). Notably, a significant proportion of SNPs occurred in intergenic regions (62.89%) and at least one SNP was identified in 58.63% of the genes annotated in the bean genome. Of particular interest, 7841 SNPs were identified in 85% of the putative plant disease defense-related genes, presenting a valuable resource for crop breeding efforts. These findings provide a foundation for the development of innovative and broadly applicable technologies for the routine selection of superior genotypes in global bean improvement and germplasm characterization programs. |
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Thesagro: |
Feijão; Genoma; Melhoramento. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Breeding; Breeding lines; Genome; Genotype; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1156925/1/sr-2023.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 11 | |
| 2. |  | CAETANO, P.; SANTANA, C. G.; CARNEIRO, R. M. D. G.; SA, M. F. G. de; OLIVEIRA, J. T. A.; REIS, A. M. dos. Análise proteômica de raízes de feijão-de-corda (Vigna unguiculata) infectadas com o nematóide Meloidogyne incognita. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 276.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 3. | | CAETANO, P.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; DA SILVA, F. R.; CARNEIRO, R. M. D. G.; GROSSI DE SÁ, M. F.; MEHTA, A. Caracterização de bibliotecas subtrativas de cDNA de genótipos susceptível e resistente de algodão infectados com Meloidogyne incognita. In: WORKSHOP INTERAÇÃO MOLECULAR PLANTA-PRAGAS, 2., 2007, Brasília, DF. II Workshop Interação Molecular Planta-Praga. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. p. 127-129. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 229).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | CAETANO, P.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R. da; CARNEIRO, R. M. D.; GROSSI DE SÁ, M. F.; MEHTA, A. Caracterização de bibliotecas subtrativas de c.DNA de genótipos suscetível e resistente de algodão infectados com Meloidogyne incognita. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 2, p. 152, 2007. Edição dos resumos do XXVII Congresso Brasileiro de Nematologia, Goiânia, GO, maio 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | CAETANO, P. H. P.; GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; FERREIRA, A. C. B.; SILVA, M. A. S. da. Caracterização de Latossolo Vermelho de cerrado sob manejo convencional: efeitos nas propriedades químicas e físicas do solo em profundidade. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 79. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 6. | | MASCARENHAS, I. S.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; CORRECHEL, V.; SILVA, M. A. S. da. Características físicas de solos de várzea e produtividade do arroz irrigado por inundação. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 100. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 7. | | GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; SILVA, M. A. S. da. Composição da solução do solo em produção de arroz irrigado em várzeas tropicais utilizando diferentes doses e fontes nitrogenadas. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 101. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 8. | | GONÇALVES, G. de M. O.; MASCARENHAS, Y. S.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; FERNANDES, E. de P.; SILVA, M. A. S. da. Variações na concentração de íons na solução do solo em função de doses e fontes de fertilizantes nitrogenados no cultivo de arroz em várzea tropical. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 128. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 9. | | MASCARENHAS, Y. S.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; CORRECHEL, V.; SILVA, M. A. S. da. Condutividade Hidráulica Saturada em áreas de várzeas tropicais sob cultivo de arroz irrigado por inundação. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 122. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 10. | | SILVA, M. A. S. da; SANTOS, A. B. dos; MADARI, B. E.; GONÇALVES, G. de M. O.; CAETANO, P. H. P.; MASCARENHAS, Y. S. Nitrato e amônio no solo: efeitos na eficiência agronômica e na produtividade de arroz irrigado tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ARROZ IRRIGADO, 9., 2015, Pelotas. Ciência e tecnologia para otimização da orizicultura: anais. Brasília, DF: Embrapa; Pelotas: Sosbai, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 11. | | MASCARENHAS, Y. S.; SILVA, M. A. S. da; CORRECHEL, V.; SANTOS, A. B. dos; CARVALHO, M. T. de M.; MADARI, B. E.; COELHO, A. S.; GONÇALVES, G. M. de O.; CAETANO, P. H. P. Emission of nitrous oxide in flooded rice cultivation in tropical area of Brazil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01497, 2020. Título em português: Emissão de óxido nitroso em cultivo de arroz inundado em área tropical do Brasil.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Unidades Centrais. |
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