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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Soja. Para informações adicionais entre em contato com valeria.cardoso@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
11/02/2009 |
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Data da última atualização: |
03/08/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GODOY, L. P.; VASCONCELOS, A. T. R.; CHUEIRE, L. M. O.; SOUZA, R. C.; NICOLÁS, M. F.; BARCELLOS, F. G.; HUNGRIA, M. |
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Afiliação: |
Leandro Pereira Godoy, CNPSo/UEL; Ana Tereza Ribeiro Vasconcelos Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Ligia Maria Oliveira Chueire, CNPSo; Rangel Celso Souza Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Marisa Fabiana Nicolás Laboratório Nacional de Computação Científica Petrópolis RJ; Fernando Gomes Barcellos, CNPS; Mariangela Hungria, CNPSo. |
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Título: |
Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Soil Biology & Biochemistry, v. 40, n. 11, p. 2743-2753, 2008. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Of the many genomes of prokaryotes that have been sequenced, most are pathogenic organisms and very few of agriculturally beneficial bacteria. Soybean, the most important cash crop in Brazil, can provide its need for nitrogen through a symbiosis with exotic strains of bradyrhizobia. Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (equates to SEMIA 5079, the same serogroup as USDA 123), which is a highly competitive commercial strain applied to soybean crops since the early 1990s, is now established on several millions of hectares. As financial resources for sequencing genomes are still very limited in developing countries, a panoramic genomic view of CPAC 15 was generated. A total of 4328 shotgun reads resulted in 2,046,740 bp with a phred score_ 20; the assemblage resulted in 1106 phrap contigs scattered by 69 scaffolds and 966 isolated contigs, with an average of 2.5 reads per contig, covering approximately 13% of the genome. Annotation identified 1371 coding DNA sequences (CDSs), 53% with putative known functions, 23% encoding conserved hypothetical and 24% hypothetical genes, representing about 16% of the estimated putative genes. Several comparisons - on COG and KEGG databases, tRNAs, transposases, Gþ C content of CPAC 15 with the complete genome of B. japonicum strain USDA 110 indicated a successful coverage of the whole genome. However, the two strains were surprisingly different, as at least 35% of the CDS of CPAC 15 shows higher similarity to microorganisms other than strain USDA 110. Several new putative genes and others with low similarity to USDA 110, were identified. These were related to nodulation, interaction with the host plant and adaptation, e.g., nodB, nodW, ndvA, effector nopP, genes of secretion systems, transporters and environmentally related genes. MenosOf the many genomes of prokaryotes that have been sequenced, most are pathogenic organisms and very few of agriculturally beneficial bacteria. Soybean, the most important cash crop in Brazil, can provide its need for nitrogen through a symbiosis with exotic strains of bradyrhizobia. Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (equates to SEMIA 5079, the same serogroup as USDA 123), which is a highly competitive commercial strain applied to soybean crops since the early 1990s, is now established on several millions of hectares. As financial resources for sequencing genomes are still very limited in developing countries, a panoramic genomic view of CPAC 15 was generated. A total of 4328 shotgun reads resulted in 2,046,740 bp with a phred score_ 20; the assemblage resulted in 1106 phrap contigs scattered by 69 scaffolds and 966 isolated contigs, with an average of 2.5 reads per contig, covering approximately 13% of the genome. Annotation identified 1371 coding DNA sequences (CDSs), 53% with putative known functions, 23% encoding conserved hypothetical and 24% hypothetical genes, representing about 16% of the estimated putative genes. Several comparisons - on COG and KEGG databases, tRNAs, transposases, Gþ C content of CPAC 15 with the complete genome of B. japonicum strain USDA 110 indicated a successful coverage of the whole genome. However, the two strains were surprisingly different, as at least 35% of the CDS of CPAC 15 shows higher similarity to microorganisms other than strai... Mostrar Tudo |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
15/02/2023 |
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Data da última atualização: |
16/05/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 4 |
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Autoria: |
CASTRILLON, R. G.; HELM, C. V.; MATHIAS, A. L. |
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Afiliação: |
RAFAELA GRAZIELE CASTRILLON, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; CRISTIANE VIEIRA HELM, CNPF; ALVARO LUIZ MATHIAS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ. |
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Título: |
Araucaria angustifolia and the pinhão seed: Starch, bioactive compounds and functional activity - a bibliometric review. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, v. 53, n. 9, e20220048, 2023. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
A Araucaria angustifolia caracteriza as Florestas Ombrófilas mistas. Este pinheiro do Paraná tem tido grande importância econômica, cultural e social para o Sul do Brasil. Seu corte está restrito, pois está ameaçada de extinção e o uso de sua semente tem sido incentivado. Este estudo destaca as pesquisas científicas sobre esta conífera por análise bibliométrica e revisa as tendências de novas pesquisas sobre sua semente e algumas de suas aplicações alimentícias. A base de dados Web of Science© revelou 620 artigos científicos e a análise bibliométrica por meio do VOSviewer demonstrou o interesse mundial em ascendência. O aumento das pesquisas nas áreas de silvicultura, fitociência e ecologia refletem à preocupação com a preservação das Matas das Araucárias. Concomitantemente, pesquisas em ciência e tecnologia de alimentos têm aumentado, pois a semente de pinhão pode produzir uma farinha alimentar rica em amido com baixa resposta glicêmica e fonte de fibra dietética e de alguns minerais. Ainda, junto com sua casca, disponibilizar compostos bioativos com potencial de aplicação nas indústrias de alimento especial, de embalagem ativa/inteligente e reforçada e, até mesmo, farmacológica. |
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Palavras-Chave: |
Alimento funcional; Alimento sem glúten; Amido resistente; Composto bioativo; Cosmético; Oligoelemento. |
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Thesagro: |
Araucária Angustifólia; Composto Fenólico; Pinhão. |
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Categoria do assunto: |
Q Alimentos e Nutrição Humana |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1151787/1/Araucaria-angustifolia-and-the-pinhao-seed-2023-Helm.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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