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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
22/10/2009 |
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Data da última atualização: |
17/12/2009 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
LEDO, C. A. da S.; GONÇALVES, L. S. A.; SOUZA, E. H.; SOUZA, F. V. D. |
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Afiliação: |
Carlos Alberto da Silva Ledo, CNPMF; Leandro Simões Azeredo Gonçalves, UENF; Everton Hilo Souza, UFRB; Fernanda Vidigal Duarte Souza, CNPMF. |
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Título: |
Análise de agrupamento utilizando variáveis quantitativas e qualitativas para o estudo da diversidade genética em acessos de abacaxizeiro. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
pdf 2545 |
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Conteúdo: |
A análise conjunta de variáveis qualitativas e quantitativas tem sido apontada como uma ferramenta útil na estimativa da diversidade genética entre os acessos de uma coleção de germoplasma. O objetiv deste trabalho foi promover a análise simultânea de variáveis qualitativas e quantitativas e posterior agrupamento para definição da diversidade genética entre acessos de abacaxizeiro por meio do algoritmo de Gower. Foram avaliadas 11 características quantitativas e 12 qualitativas em 18 acessos do banco ativo de germoplasma de abacaxizeiro da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. A análise simultânea de variáveis qualitativas e quantitativas foi eficiente em expressar o grau de diversidade genética entre os acessos de abacaxizeiro quando comparadas com a análise individual de cada variável. |
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Palavras-Chave: |
Algoritimo de Gower. |
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Thesagro: |
Abacaxi; Germoplasma. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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520 $aA análise conjunta de variáveis qualitativas e quantitativas tem sido apontada como uma ferramenta útil na estimativa da diversidade genética entre os acessos de uma coleção de germoplasma. O objetiv deste trabalho foi promover a análise simultânea de variáveis qualitativas e quantitativas e posterior agrupamento para definição da diversidade genética entre acessos de abacaxizeiro por meio do algoritmo de Gower. Foram avaliadas 11 características quantitativas e 12 qualitativas em 18 acessos do banco ativo de germoplasma de abacaxizeiro da Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. A análise simultânea de variáveis qualitativas e quantitativas foi eficiente em expressar o grau de diversidade genética entre os acessos de abacaxizeiro quando comparadas com a análise individual de cada variável.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Nenhum exemplar cadastrado para este documento. |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
25/01/2011 |
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Data da última atualização: |
17/06/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
NASCIMENTO, L. C.; COSTA, G. G. L.; MEYER, L.; BINNECK, E.; RODRIGUES, F.; KULCHESKI, F. R.; MARGIS, R.; KIDO, E. A.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.; ABDELNOOR, R. V.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. |
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Afiliação: |
L. C. NASCIMENTO, Universidade Estadual de Campinas; G. G. L. COSTA, Universidade Estadual de Campinas; L. MEYER, Universidade Estadual de Campinas; ELISEU BINNECK, CNPSO; F. RODRIGUES; F. R. KULCHESKI, UFRGS; R. MARGIS, UFRGS; E. A. KIDO, Universidade Federal de Pernambuco; FRANCISMAR CORREA MARCELINO, CNPSO; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO; RICARDO VILELA ABDELNOOR, CNPSO; G. A. G. PEREIRA, Universidade Estadual de Campinas; M. F. CARAZZOLLE, Universidade Estadual de Campinas. |
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Título: |
A brazilian soybean database. |
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Ano de publicação: |
2010 |
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Fonte/Imprenta: |
In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soybean is a legume with large economic importance in the international market, with a world production of almost two hundred and ten million tons in the 2008/2009 harvest. Brazil appears as the second largest producer, with about twenty-five percent of the world production. In 2007, the Brazilian Soybean Genome Consortium (GENOSOJA) was established with the goal of integrating several institutions currently working with soybean genomics in Brazil. The project has an initiative to search for new treats to improve the soybean production process, emphasizing in stresses that affect the national production, like the occurrence of droughts, pests attacks and the Asian Rust disease. Among the objectives of GENOSOJA is the creation of a relational database, integrating the results achieved by different methodologies utilized in the project. In the GENOSOJA context, we created a brazilian soybean database, integrating: (1) public data consisting of genome and predicted genes from JGI, an assembly of 1,276,813 of NCBI ESTs from several cultivars and 4,712 full-length cDNA sequences from one japanese cultivar; and (2) private data consisting of (i ) three cDNA libraries explored by SuperSAGE methodology, resulting in 4,373,053 tags of 26 bp, (ii ) 22 cDNA subctrative libraries from several brazilian cultivars under different stresses and (iii ) several libraries of soybean microRNAs under eight conditions and size between 19 and 24 bp. All these data were sequenced using Solexa/Illumina sequencing technology. This database offers to the users some features, including keywords searches, statics comparisons, automatic annotation, gene ontology classification and gene expression of the genes under certain conditions. All data are storage in a Fedora Linux machine, running the MySQL database server. The web interface is based in a combination of CGI scripts using Perl language (including BioPerl module) and the Apache Web Server. MenosSoybean is a legume with large economic importance in the international market, with a world production of almost two hundred and ten million tons in the 2008/2009 harvest. Brazil appears as the second largest producer, with about twenty-five percent of the world production. In 2007, the Brazilian Soybean Genome Consortium (GENOSOJA) was established with the goal of integrating several institutions currently working with soybean genomics in Brazil. The project has an initiative to search for new treats to improve the soybean production process, emphasizing in stresses that affect the national production, like the occurrence of droughts, pests attacks and the Asian Rust disease. Among the objectives of GENOSOJA is the creation of a relational database, integrating the results achieved by different methodologies utilized in the project. In the GENOSOJA context, we created a brazilian soybean database, integrating: (1) public data consisting of genome and predicted genes from JGI, an assembly of 1,276,813 of NCBI ESTs from several cultivars and 4,712 full-length cDNA sequences from one japanese cultivar; and (2) private data consisting of (i ) three cDNA libraries explored by SuperSAGE methodology, resulting in 4,373,053 tags of 26 bp, (ii ) 22 cDNA subctrative libraries from several brazilian cultivars under different stresses and (iii ) several libraries of soybean microRNAs under eight conditions and size between 19 and 24 bp. All these data were sequenced using Solexa/Illum... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Soybean. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/36659/1/Xmeeting-Abstracts-2010.pdf
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Marc: |
LEADER 02779nam a2200265 a 4500
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245 $aA brazilian soybean database.
260 $aIn: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 6., 2010, Ouro Preto. Abstracts book... Ouro Preto: AB3C, 2010. p. 120. X-Meeting 2010.$c2010
520 $aSoybean is a legume with large economic importance in the international market, with a world production of almost two hundred and ten million tons in the 2008/2009 harvest. Brazil appears as the second largest producer, with about twenty-five percent of the world production. In 2007, the Brazilian Soybean Genome Consortium (GENOSOJA) was established with the goal of integrating several institutions currently working with soybean genomics in Brazil. The project has an initiative to search for new treats to improve the soybean production process, emphasizing in stresses that affect the national production, like the occurrence of droughts, pests attacks and the Asian Rust disease. Among the objectives of GENOSOJA is the creation of a relational database, integrating the results achieved by different methodologies utilized in the project. In the GENOSOJA context, we created a brazilian soybean database, integrating: (1) public data consisting of genome and predicted genes from JGI, an assembly of 1,276,813 of NCBI ESTs from several cultivars and 4,712 full-length cDNA sequences from one japanese cultivar; and (2) private data consisting of (i ) three cDNA libraries explored by SuperSAGE methodology, resulting in 4,373,053 tags of 26 bp, (ii ) 22 cDNA subctrative libraries from several brazilian cultivars under different stresses and (iii ) several libraries of soybean microRNAs under eight conditions and size between 19 and 24 bp. All these data were sequenced using Solexa/Illumina sequencing technology. This database offers to the users some features, including keywords searches, statics comparisons, automatic annotation, gene ontology classification and gene expression of the genes under certain conditions. All data are storage in a Fedora Linux machine, running the MySQL database server. The web interface is based in a combination of CGI scripts using Perl language (including BioPerl module) and the Apache Web Server.
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700 1 $aABDELNOOR, R. V.
700 1 $aPEREIRA, G. A. G.
700 1 $aCARAZZOLLE, M. F.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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