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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
30/01/2017 |
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Data da última atualização: |
02/03/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, R. C. U.; CANÇADO, L. J.; VALLE, C. B. do; CHIARI, L.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
REBECCA, C. U. FERREIRA, UNICAMP; LETÍCIA J. CANÇADO; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; ANETE P DE SOUZA, UNICAMP. |
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Título: |
Microsatellite loci for Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster and cross-amplification in other Urochloa species. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
BMC Research Notes, v. 9, n. 152, p. 1-11, 2016. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Background: Forage grasses of the African genus Urochloa (syn. Brachiaria) are the basis of Brazilian beef production, and there is a strong demand for high quality, productive and adapted forage plants. Among the approximately 100 species of the genus Urochloa, Urochloa decumbens is one of the most important tropical forage grasses used for pastures due to several of its agronomic attributes. However, the level of understanding of these attributes and the tools with which to control them at the genetic level are limited, mainly due to the apomixis and ploidy level of this species. In this context, the present study aimed to identify and characterize molecular microsatellite markers of U. decumbens and to evaluate their cross-amplification in other Urochloa species. Findings: Microsatellite loci were isolated from a previously constructed enriched library from one U. decumbens genotype. Specific primers were designed for one hundred thirteen loci, and ninety-three primer pairs successfully amplified microsatellite regions, yielding an average of 4.93 alleles per locus. The polymorphism information content ( IC) values of these loci ranged from 0.26 to 0.85 (average 0.68), and the associated discriminating power (DP) values ranged from 0.22 to 0.97 (average 0.77). Cross-amplification studies demonstrated the potential transferability of these microsatellites to four other Urochloa species. Structure analysis revealed the existence of three distinct groups, providing evidence in the allelic pool that U. decumbens is closely related to Urochloa ruziziensis and Urochloa brizantha. The genetic distance values determined using Jaccard?s coefficient ranged from 0.06 to 0.76. Conclusions: The microsatellite markers identified in this study are the first set of molecular markers for U. decumbens species. Their availability will facilitate understanding the genetics of this and other Urochloa species and breeding them, and will be useful for germplasm characterization, linkage mapping and marker-assisted selection. Keywords: Enriched library, Forage, Signalgrass, Simple sequence repeat, Transferability MenosBackground: Forage grasses of the African genus Urochloa (syn. Brachiaria) are the basis of Brazilian beef production, and there is a strong demand for high quality, productive and adapted forage plants. Among the approximately 100 species of the genus Urochloa, Urochloa decumbens is one of the most important tropical forage grasses used for pastures due to several of its agronomic attributes. However, the level of understanding of these attributes and the tools with which to control them at the genetic level are limited, mainly due to the apomixis and ploidy level of this species. In this context, the present study aimed to identify and characterize molecular microsatellite markers of U. decumbens and to evaluate their cross-amplification in other Urochloa species. Findings: Microsatellite loci were isolated from a previously constructed enriched library from one U. decumbens genotype. Specific primers were designed for one hundred thirteen loci, and ninety-three primer pairs successfully amplified microsatellite regions, yielding an average of 4.93 alleles per locus. The polymorphism information content ( IC) values of these loci ranged from 0.26 to 0.85 (average 0.68), and the associated discriminating power (DP) values ranged from 0.22 to 0.97 (average 0.77). Cross-amplification studies demonstrated the potential transferability of these microsatellites to four other Urochloa species. Structure analysis revealed the existence of three distinct groups, providing evidence ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Enriched library; Transferability. |
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Thesaurus Nal: |
Forage; Microsatellite repeats; Urochloa brizantha. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/154227/1/Microsatellite-loci-for-Urochloa.pdf
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Marc: |
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520 $aBackground: Forage grasses of the African genus Urochloa (syn. Brachiaria) are the basis of Brazilian beef production, and there is a strong demand for high quality, productive and adapted forage plants. Among the approximately 100 species of the genus Urochloa, Urochloa decumbens is one of the most important tropical forage grasses used for pastures due to several of its agronomic attributes. However, the level of understanding of these attributes and the tools with which to control them at the genetic level are limited, mainly due to the apomixis and ploidy level of this species. In this context, the present study aimed to identify and characterize molecular microsatellite markers of U. decumbens and to evaluate their cross-amplification in other Urochloa species. Findings: Microsatellite loci were isolated from a previously constructed enriched library from one U. decumbens genotype. Specific primers were designed for one hundred thirteen loci, and ninety-three primer pairs successfully amplified microsatellite regions, yielding an average of 4.93 alleles per locus. The polymorphism information content ( IC) values of these loci ranged from 0.26 to 0.85 (average 0.68), and the associated discriminating power (DP) values ranged from 0.22 to 0.97 (average 0.77). Cross-amplification studies demonstrated the potential transferability of these microsatellites to four other Urochloa species. Structure analysis revealed the existence of three distinct groups, providing evidence in the allelic pool that U. decumbens is closely related to Urochloa ruziziensis and Urochloa brizantha. The genetic distance values determined using Jaccard?s coefficient ranged from 0.06 to 0.76. Conclusions: The microsatellite markers identified in this study are the first set of molecular markers for U. decumbens species. Their availability will facilitate understanding the genetics of this and other Urochloa species and breeding them, and will be useful for germplasm characterization, linkage mapping and marker-assisted selection. Keywords: Enriched library, Forage, Signalgrass, Simple sequence repeat, Transferability
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 176 | |
| 141. |  | MARTINS, M. T. B.; SOUZA, A. P. de; ARENQUE, B.; GOULART, M. de O.; MURAD, A. M.; ANDRADE, A. C.; QUIRINO, B. F.; BUCKERIDGE, M. S.; MOLINARI, H. B. C. Characterization of Saccharum spp. L. cell-wall at different stages of leaf senescence. In: SUGARCANE BREEDING AND GERMPLASM WORKSHOP, 9., 2009, Cairns. [Abstracts...] [S.l.]: International Society of Sugar Cane Technologists, 2009. p. 12.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 142. | | FRADE, M. T. S.; FIRMINO, M. de O.; MAIA, L. A.; SILVEIRA, A. M.; NASCIMENTO, M. J. R. do; MARTINS, F. S. de M.; SOUZA, A. P. de; DANTAS, A. F. M. Características epidemiológicas, clínico-patológicas e morfotintoriais de quatorze casos de nocardiose em cães. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 38, n. 1, p. 99-106, janeiro 2018. Título e inglês: Epidemiological, clinical, pathological and morphotinctorial features of fourteen cases of nocardiosis in dogs.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 143. | | MARTINS, M. T. B.; SOUZA, A. P. de; ARENQUE, B.; GOULART, M. O.; MURAD, A. M.; QUIRINO, B. F.; ANDRADE, A. C.; BUCKERIDGE, M. S.; MOLINARI, H. B. C. Caracterização bioquímica da parede celular de cana-de-açúcar e identificação de genes associados à senescência foliar. In: WORKSHOP EM CIÊNCIAS GENÔMICAS E BIOTECNOLOGIA, 1., 2009, Brasília, DF. [Anais...]. Brasília, DF: [UCB], 2009. Não paginado| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 144. | | SILVA, T. C. F.; DODE, M. A. N.; BRAGA, T. F.; MARQUES, M. G.; VARGAS, L. N.; FARIA, O. A. C. de; SOUZA, A. P. de; ALBRING, D.; CAETANO, A. R.; FRANCO, M. M. Cumulus-oocyte complexes from sows show differences in lipid metabolism compared to cumulus-oocyte complexes from prepubertal gilts during in vitro maturation. Molecular Reproduction & Development, v. 90, n. 5, p. 323-335. 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Suínos e Aves. |
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| 145. | | SOUZA, A. P. de S. B. e; BOMFIM, M. R.; COUTO, J. L. do; SILVA, E. de J.; LIMA, J. A. M. de C.; BASTOS, A. M. da S.; SANTOS, J. A. G.; SOUZA, L. da S.; TRINDADE, A. V. Qualidade do solo em uma topossequência sob cultivo de citrus avaliada através de atributos microbiológicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios:anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 2539.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 146. | | FRADE, M. T. S.; DINIZ, P. V. N.; OLINDA, R. G.; MAIA, L. A.; GALIZA, G. J. N. de; SOUZA, A. P. de; NÓBREGA NETO, P. I. da; DANTAS, A. F. M. Pythiosis in dogs in the semiarid region of Northeast Brazil. Pesquisa Veterinária Brasileira, Rio de Janeiro, v. 37, n. 5, p. 485-490, maio 2017. Título em português: Pitiose em cães na região semiárida do Nordeste, Brasil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 147. | | MARTINS, F. B.; MORAES, A. C. L.; AONO, A. H.; FERREIRA, R. C. U.; CHIARI, L.; SIMEÃO, R. M.; BARRIOS, S. C. L.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; VIGNA, B. B. Z.; SOUZA, A. P. DE. A semi-automated SNP-based approach for contaminant identification in biparental Polyploid Populations of tropical forage grasses. Frontiers in Plant Science, v.12, article 737919, 2021. 19 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 148. | | BALSALOBRE, T. W. A.; PEREIRA, G. da S.; ZAVAGLIA, L. P.; BARRETO, F. Z.; PASTINA, M. M.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de; HOFFMANN, H. P.; CARNEIRO, M. S. Estimativa da herdabilidade em sentido amplo de características de importância econômica em população comercial bi-parental de cana-de-açúcar. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Variedade melhorada: a força da nossa agricultura: anais. Viçosa, MG: SBMP, 2013. p. 333-337.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 149. | | BOMFIM, M. R.; SILVA, E. de J. da; COUTO, J. L.; SOUZA, A. P. de S.; MONTEIRO, J. A.; CONCEIÇÃO, A. M. da S. B.; CARVALHO, Z. S. de; GONZAGA, J. A.; SOUZA, L. da S. Comportamento da curva de compactação de três solos numa topossequência em Tabuleiros Costeiros no Recôncavo da Bahia. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios: anais. Fortaleza: SBCS: UFC, 2009. 1 CD-ROM. Trabalho 2061.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 150. | | RODRIGUES, T. de S.; ARGE, L. W. P.; GUEDES, F. A. de F.; TRAVASSOS-LINS, J.; SOUZA, A. P. de; COCURON, J.-C.; BUCKERIDGE, M. S.; SA, M. F. G. de; ALVES-FERREIRA, M. Elevated CO2 increases biomass of Sorghum bicolor green prop roots under drought conditions via soluble sugar accumulation and photosynthetic activity. Physiologia Plantarum, v. 175, n. 4, 2023. e13984. Na publicação: Maria Fátima Grossi-de-Sá.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 151. | | DEO, T. G.; FERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. C.; MORAES, A. C. L.; ALVES-PEREIRA, A.; OLIVEIRA, F. A. de; GARCIA, A. A. F.; SANTOS, M. F.; JANK, L.; SOUZA, A. P. de. High-Resolution Linkage Map With Allele Dosage Allows the Identification of Regions Governing Complex Traits and Apospory in Guinea Grass (Megathyrsus maximus). Frontiers in Plant Science, 26 fev.. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 157. | | FERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. de C.; CHIARI, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de. Genetic Mapping With Allele Dosage Information in Tetraploid Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster Reveals Insights Into Spittlebug (Notozulia entreriana Berg) Resistance. Frontiers in Plant Science, v. 10, February, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 158. | | BRAGA, T. F.; SILVA, T. C. F.; MARQUES, M. G.; SOUZA, A. P. de; ALBRING, D.; SILVA, L. P.; CAETANO, A. R.; DODE, M. A. N.; FRANCO, M. M. The dynamics of gene expression, lipid composition and DNA methylation reprogramming are different during in vitro maturation of pig oocytes obtained from prepubertal gilts and cycling sows. Reproduction in Domestic Animals, v. 54, n. 9, p. 1217-1229, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 160. | | OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, L. M. da; FORMIGHIERI, E. F.; PETERS, L. P.; ASSIS, G. M. L. de; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; CAMPOS, T. de. Novel microsatellite markers derived from Arachis pintoi transcriptome sequencing for cross-species transferability and varietal identification. Plant Molecular Biology Reporter, v. 42, p. 183-192, Mar. 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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