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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
12/02/2008 |
Data da última atualização: |
24/07/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
TARGON, M. L. P. N.; TAKITA, M. A.; AMARAL, A. M. do; SOUZA, A. A. de; LOCALI-FABRIS, E. C.; DORTA, S. de O.; BORGES, K. M.; SOUZA, J. M. de; RODRIGUES, C. M.; LUCHETA, A. R.; FREITAS-ÁSTUA, J.; MACHADO, M. A. |
Afiliação: |
Maria Luísa P. Natividade Targon, APTA; Marco Aurélio Takita, APTA; Alexandre M. do Amaral, CENARGEN; Alessandra A. de Souza, APTA; Eliane Cristina Locali-Fabris, APTA; Sílvia de Oliveira Dorta, APTA; Kleber Martins Borges, APTA; Juliana Mendonça de Souza, APTA; Carolina Munari Rodrigues, APTA; Adriano Reis Lucheta, APTA; Juliana Freitas-Astúa, CNPMF; Marcos Antonio Machado, APTA. |
Título: |
CitEST libraries. |
Ano de publicação: |
2007 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 3, p. 1019-1023, 2007. |
ISSN: |
1415-4757 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
In order to obtain a better understanding of what is citrus, 33 cDNA libraries were constructed from different citrus species and genera. Total RNA was extracted from fruits, leaves, flowers, bark, seeds and roots, and subjected or not to different biotic and abiotic stresses (pathogens and drought) and at several developmental stages. To identify putative promoter sequences, as well as molecular markers that could be useful for breeding programs, one shotgun library was prepared from sweet orange (Citrus sinensis var. Olimpia). In addition, EST libraries were also constructed for a citrus pathogen, the oomycete Phythophthora parasitica in either virulent or avirulent form. A total of 286,559 cDNA clones from citrus were sequenced from their 5 end, generating 242,790 valid reads of citrus. A total of 9,504 sequences were produced in the shotgun library and the valid reads were assembled using CAP3. In this procedure, we obtained 1,131 contigs and 4,083 singletons. A total of 19,200 cDNA clones from P. parasitica were sequenced, resulting in 16,400 valid reads. The number of ESTs generated in this project is, to our knowledge, the largest citrus sequence database in the world. |
Palavras-Chave: |
ESTs; Phytopathogen; Shotgun. |
Thesaurus Nal: |
Citrus. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02025naa a2200313 a 4500 001 1654649 005 2023-07-24 008 2007 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1415-4757 100 1 $aTARGON, M. L. P. N. 245 $aCitEST libraries.$h[electronic resource] 260 $c2007 520 $aIn order to obtain a better understanding of what is citrus, 33 cDNA libraries were constructed from different citrus species and genera. Total RNA was extracted from fruits, leaves, flowers, bark, seeds and roots, and subjected or not to different biotic and abiotic stresses (pathogens and drought) and at several developmental stages. To identify putative promoter sequences, as well as molecular markers that could be useful for breeding programs, one shotgun library was prepared from sweet orange (Citrus sinensis var. Olimpia). In addition, EST libraries were also constructed for a citrus pathogen, the oomycete Phythophthora parasitica in either virulent or avirulent form. A total of 286,559 cDNA clones from citrus were sequenced from their 5 end, generating 242,790 valid reads of citrus. A total of 9,504 sequences were produced in the shotgun library and the valid reads were assembled using CAP3. In this procedure, we obtained 1,131 contigs and 4,083 singletons. A total of 19,200 cDNA clones from P. parasitica were sequenced, resulting in 16,400 valid reads. The number of ESTs generated in this project is, to our knowledge, the largest citrus sequence database in the world. 650 $aCitrus 653 $aESTs 653 $aPhytopathogen 653 $aShotgun 700 1 $aTAKITA, M. A. 700 1 $aAMARAL, A. M. do 700 1 $aSOUZA, A. A. de 700 1 $aLOCALI-FABRIS, E. C. 700 1 $aDORTA, S. de O. 700 1 $aBORGES, K. M. 700 1 $aSOUZA, J. M. de 700 1 $aRODRIGUES, C. M. 700 1 $aLUCHETA, A. R. 700 1 $aFREITAS-ÁSTUA, J. 700 1 $aMACHADO, M. A. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 30, n. 3, p. 1019-1023, 2007.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Registros recuperados : 9 | |
4. | | GALVANI, F.; FÉLIX, C. G. S.; SORRILHA, G. M.; CARMONA, V. B.; MARCONCINI, J. M. Branqueamento de fibras de folhas e fibras do cacho/ráquis da bocaiuva visando a obtenção de celulose. Cadernos de Agroecologia, v. 10, n. 3, out. 2015. Edição dos Resumos do IX Congresso Brasileiro de Agroecologia e IV Seminário Estadual de Agroecologia, Belém, PA, set./out. 2015Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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5. | | RODRIGUES, A.; COSTA, E. A. da; SOUZA, D. M. de; FÉLIX, C. G. S.; PAULA, R. S. de; FEIDEN, A. Gestão e avaliação da feira da incubadora tecnológica de cooperativas populares do Pantanal e da fronteira. In: SEMINÁRIO REGIONAL DE EXTENSÃO UNIVERSITÁRIA DA REGIÃO CENTRO OESTE, 8., 2018, Dourados, MS. Anais... Dourados, MS: UFGD, 2018. p. 694-695. VIII SEREX.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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6. | | COSTA, E. A. da; RODRIGUES, A.; SOUZA, D. M. de; FÉLIX, C. G. S.; PAULA, R. S. de; FEIDEN, A. Perfil dos consumidores da feira de produtos de transição agroecológica na UFMS, Corumbá-MS, Brasil. In: SEMINÁRIO INTERNACIONAL DE AGROECOLOGIA DA AMÉRICA DO SUL, 2.; JORNADA INTERNACIONAL DE EDUCAÇÃO DO CAMPO, 1.; SEMINÁRIO DE AGROECOLOGIA DE MATO GROSSO DO SUL, 6; ENCONTRO DE PRODUTORES AGROECOLÓGICOS DE MATO GROSSO DO SUL, 5.; SEMINÁRIO DE SISTEMAS AGROFLORESTAIS EM BASES AGROECOLÓGICAS DE MATO GROSSO DO SUL, 2., 2016, Dourados. Agroecologia e soberania alimentar: saberes em busca do bem viver: anais. Dourados: UFGD, 2016. Não paginado. Agroecol 2016. 1 CD-ROM. Publicado também em: Cadernos de Agroecologia, v. 11, n. 2, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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7. | | MANOEL, A. F.; CARMONA, V. B.; FELIX, C. G. S.; GALVANI, F.; MARCONCINI, J. M.; MATTOSO, L. H. C.; MANTOVANI, G. L. Efeitos do processo de branqueamento de fibras nativas do Pantanal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE POLIMEROS, 13., 2015. Anais. Natal: Associação Brasileira de Polímeros, 2015.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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8. | | SOUZA, K. R. de; ALVES, B. G.; RAPOSO, D. de S.; SOUSA, T. F.; DANTAS, P. H. S.; FELIX, C. G. S.; KRAMER, Y. V.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Criação de uma micoteca de fungos endofíticos de frutas regionais com potencial antimalárico. In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; JESUS, M. A. de; ROCHA, L. C. da; BENTES, J. L. da S.; KIRSCH, L. de S.; ANDRADE, S. L. de (Org.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Inpa, 2019. p. 39-45.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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9. | | SOUZA, K. R. de; ALVES, B. G.; GONÇALVES, K. D.; RAPOSO, D. de S.; SOUSA, T. F.; DANTAS, P. H. S.; FELIX, C. G. S.; KRAMER, Y. V.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. Criação de uma micoteca de fungos endofíticos de frutas regionais e seu potencial antimalárico. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 7., 2018, Manaus. Resumos... Manaus: UEA, 2018. p. 51.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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