| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
|
Data corrente: |
16/03/2017 |
|
Data da última atualização: |
15/12/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
SOUSA, T. V.; CAIXETA, E. T.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. |
|
Afiliação: |
TIAGO VIEIRA SOUSA, BIOAGRO, Biocafé/UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; EMILLY RUAS ALKIMIM, BIOAGRO, Biocafé/UFV; ANTONIO CARLOS BAIAO DE OLIVEIRA, SAPC; ANTONIO ALVES PEREIRA, EPAMIG; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV. |
|
Título: |
Molecular markers useful to discriminate Coffea arabica cultivars with high genetic similarity. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 213, n. 3, March, 2017. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
New cultivars are released every year to meet market demands. However, in species with a narrow genetic base, such as Coffea arabica, the cultivars are closely related and phenotypically similar. This hinders the accurate discrimination of genotypes sing morphological descriptors in distinctness, uniformity, and stability (DUS) testing, which is required for the registration and protection of new cultivars. In this sense, molecular markers are an auxiliary tool for accurate and precise discrimination of cultivars. This study aimed to verify the informative capacity and effectiveness of a molecular marker set to discriminate among C. arabica varieties, create a database of DNA profiles and allele frequencies, analyze the genetic diversity in this collection, and explore genetic kinships. Thirty-four C. arabica cultivars/progenies, which belong to the Brazilian Cultivar Trial, were analyzed using 31 microsatellite markers. Markers with weak bands were removed, and of the remaining, 74.07% were polymorphic and revealed 47 alleles. The obtained molecular profiles revealed segregation between and within cultivars/progenies, and genetic variability was observed between all the cultivars/progenies. Sixteen markers were selected for dendrogram construction and for fingerprinting analysis of the cultivars. The ability of these markers to detect varietal mixture and analyze diversity between and within cultivars was also discussed in detail. The results demonstrated the effectiveness of markers in distinguishing related genotypes from those with similar phenotypic traits. This biotechnological tool will assist breeders in DUS testing of cultivars. MenosNew cultivars are released every year to meet market demands. However, in species with a narrow genetic base, such as Coffea arabica, the cultivars are closely related and phenotypically similar. This hinders the accurate discrimination of genotypes sing morphological descriptors in distinctness, uniformity, and stability (DUS) testing, which is required for the registration and protection of new cultivars. In this sense, molecular markers are an auxiliary tool for accurate and precise discrimination of cultivars. This study aimed to verify the informative capacity and effectiveness of a molecular marker set to discriminate among C. arabica varieties, create a database of DNA profiles and allele frequencies, analyze the genetic diversity in this collection, and explore genetic kinships. Thirty-four C. arabica cultivars/progenies, which belong to the Brazilian Cultivar Trial, were analyzed using 31 microsatellite markers. Markers with weak bands were removed, and of the remaining, 74.07% were polymorphic and revealed 47 alleles. The obtained molecular profiles revealed segregation between and within cultivars/progenies, and genetic variability was observed between all the cultivars/progenies. Sixteen markers were selected for dendrogram construction and for fingerprinting analysis of the cultivars. The ability of these markers to detect varietal mixture and analyze diversity between and within cultivars was also discussed in detail. The results demonstrated the effectiveness ... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Cultivars register; Molecular profiling; Protection of plant cultivars; SSR marker. |
|
Thesaurus Nal: |
Coffea; Cultivar identification; DNA fingerprinting; Genetic variation. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/157715/1/Molecular-markers-useful-to-discriminate-Coffea.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02511naa a2200289 a 4500
001 2067171
005 2017-12-15
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSOUSA, T. V.
245 $aMolecular markers useful to discriminate Coffea arabica cultivars with high genetic similarity.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aNew cultivars are released every year to meet market demands. However, in species with a narrow genetic base, such as Coffea arabica, the cultivars are closely related and phenotypically similar. This hinders the accurate discrimination of genotypes sing morphological descriptors in distinctness, uniformity, and stability (DUS) testing, which is required for the registration and protection of new cultivars. In this sense, molecular markers are an auxiliary tool for accurate and precise discrimination of cultivars. This study aimed to verify the informative capacity and effectiveness of a molecular marker set to discriminate among C. arabica varieties, create a database of DNA profiles and allele frequencies, analyze the genetic diversity in this collection, and explore genetic kinships. Thirty-four C. arabica cultivars/progenies, which belong to the Brazilian Cultivar Trial, were analyzed using 31 microsatellite markers. Markers with weak bands were removed, and of the remaining, 74.07% were polymorphic and revealed 47 alleles. The obtained molecular profiles revealed segregation between and within cultivars/progenies, and genetic variability was observed between all the cultivars/progenies. Sixteen markers were selected for dendrogram construction and for fingerprinting analysis of the cultivars. The ability of these markers to detect varietal mixture and analyze diversity between and within cultivars was also discussed in detail. The results demonstrated the effectiveness of markers in distinguishing related genotypes from those with similar phenotypic traits. This biotechnological tool will assist breeders in DUS testing of cultivars.
650 $aCoffea
650 $aCultivar identification
650 $aDNA fingerprinting
650 $aGenetic variation
653 $aCultivars register
653 $aMolecular profiling
653 $aProtection of plant cultivars
653 $aSSR marker
700 1 $aCAIXETA, E. T.
700 1 $aALKIMIM, E. R.
700 1 $aOLIVEIRA, A. C. B. de
700 1 $aPEREIRA, A. A.
700 1 $aZAMBOLIM, L.
700 1 $aSAKIYAMA, N. S.
773 $tEuphytica$gv. 213, n. 3, March, 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 298 | |
| 141. |  | SOUZA, M. A.; AGUIAR, J. L. P. de; BELCHIOR, E. B.; SOUSA, T. C. R. de; LÔBO, C. F.; ARAÚJO, A. K. S. Caracterização dos produtores do núcleo Rural Buriti Vermelho, DF. In: ENCONTRO DE JOVENS TALENTOS DA EMBRAPA CERRADOS, 4., 2009, Planaltina, DF. Resumos apresentados... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2009. p. 124-125 (Embrapa Cerrados. Documentos, 243).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
|    |
| 142. | | RAMOS, M. L. G.; SILVA, V. G. da; CARVALHO, A. M. de; MALAQUIAS, J. V.; OLIVEIRA, A. D. de; SOUSA, T. R. de; SILVA, S. B. Carbon fractions in soil under no-tillage corn and cover crops in the Brazilian Cerrado. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 55, e01743, 2020. Título em português: Frações de carbono no solo sob milho em plantio direto e plantas de cobertura no Cerrado brasileiro.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Unidades Centrais. |
| |
| 144. | | SOUSA, T. S. de; ALCANTARA, R. M. C. M. de; PERES, T. de L.; SILVA, E. A. da; OLIVEIRA, A. K. da S.; COSTA, P. M. Componentes da produção do milho inoculado com bactérias promotoras de crescimento vegetativo em Teresina, Piauí. In: JORNADA CIENTIFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 6., 2020,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2021. p. 28 (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 284).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 145. | | MEDEIROS, A. C.; CAIXETA, E. T.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SOUSA, T. V.; STOCK, V. de M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. P. Combining ability and molecular marker approach identified genetic resources to improve agronomic performance in coffea arabica breeding. Frontiers in Sustainable Food Systems, v. 5, 705278, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| 146. | | CARVALHO, A. M. de; SILVA, J. F. da; REIN, T. A.; COSER, T. R.; RIBEIRO JUNIOR, W. Q.; VIEIRA, D. L.; SOUSA, T. R.; COOMES, D. A. EMISSÃO DE N2O EM CANA-DE-AÇÚCAR COM APLICAÇÃO DE FERTILIZANTE NITROGENADO E VINHAÇA NO CERRADO. In: Coletânea dos fatores de emissão e remoção de gases de efeito estufa da agricultura brasileira. Brasília, DF: MAPA/SENAR, 2020. p. 62-63| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 148. | | OLIVEIRA, F. I. C. de; SOUSA, T. R. M. de; CAVALCANTI, J. J. V.; VIDAL NETO, F. das C.; SANTOS, F. H. C. dos; CORDEIRO, E. R. Estimativa de parâmetros genéticos de progênies de cajueiro-anão para aspectos morfológicos no Estado do Ceará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
| |
| 149. | | COSTA, P. M.; ALCANTARA, R. M. C. M. de; SILVA, E. A. da; OLIVEIRA, A. K. da S.; SOUSA, T. S. de; PERES, T. de L. Eficiência agronômica da cultura do milho associada à Azospirillum brasilense e Herbaspirillum seropedicae em solos de cerrados. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 5., 2019,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2022. 96 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 285). p. 62.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 150. | | SOUZA, A. C. A de; CORTES, M. V. de B.; SILVA, G. B. da; SOUSA, T. P. de; RODRIGUES, F. A.; FILIPPI, M. C. C. Enzyme-induced defense response in the suppression of rice leaf blast (Magnaporthe Oryzae) by silicon fertilization and bioagents. International Journal of Research Studies in Biosciences, v. 3, n. 5, p. 22-32, May 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 151. | | SOUSA, T. V.; ALKIMIM, E. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. Estrutura de populações e diversidade genética de Coffea arabica analisadas por marcadores moleculares SNP. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 533| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
|  |
| 153. | | CATARINO, A. de M.; HANADA, R. E.; QUEIROZ, C. A. de; SOUSA, T. F.; LIMA, I. N.; GASPAROTTO, L.; SILVA, G. F. da. First report of Pseudopestalotiopsis dawaina causing spots in Caryota mitis in Brazil. Plant Disease, v. 104, n. 3, 2020.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
| |
| 154. | | CARVALHO, A. M. de; OLIVEIRA, A. D. de; SOUSA, T. R. de; COSER, T. R.; GONÇALVES, A. D. M. de A. Fluxos de óxido nitroso no solo sob cana-de-açúcar irrigada e com nitrogênio no cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROMETEOROLOGIA, 20.; SIMPÓSIO DE MUDANÇAS CLIMÁTICAS E DESERTIFICAÇÃO DO SEMIÁRIDO BRASILEIRO, 5., 2017, Juazeiro. A agrometeorologia na solução de problemas multiescala: anais 2017... Juazeiro: Sociedade Brasileira de Agrometeorologia, 2017. P. 1675-1679| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 155. | | SILVA, V. G. da; CARVALHO, A. M. de; RAMOS, M. L. G.; SOUSA, T. R. de; SILVA, B. B. da; VIEIRA, D. L. Fluxos de óxido nitroso no solo sob milho com e sem aplicação de nitrogênio em cobertura em Sistema plantio Direto no Cerrado. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CERRADOS. Jovens talentos 2016: resumos. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2016. 99 p. p. 44 (Embrapa Cerrados. Documentos, 334). Comissão organizadora: SOUZA, K. W. de; FALEIRO, A. S. G.; SALGUES, A. L. M.; ALONSO, A. M.; CARVALHO, A. M. de; LOBATO, B. R.; CRUZ, C. V.; SOUSA, E. dos S.; PELEGRINELLI, F.; SOARES, J. P. G.; LIMA, J. E. F. W.; ARBUES, J. F. de O.;...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 156. | | SOUSA, T. de J. M.; NOBRE, H. G.; LE MOAL, M.; CANUTO, J. C.; JUNQUEIRA, A. da C.; RAMOS FILHO, L. O. Construyendo el conocimiento agroecologico en asentamientos de la reforma agraria en la busqueda por la consolidación de un nuevo modelo de producción en elEestado de São Paulo, Brasil. In: SYMPOSIUM INNOVATION AND SUSTAINABLE DEVELOPMENT IN AGRICULTURE AND FOOD - ISDA, 2010, Montpellier. Proceedings... Montpellier: Cirad: Inra, SupAgro, 2010. p.1-10| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
| |
| 157. | | PERES, T. de L.; SOUSA, T. S. de; SILVA, E. A. da; OLIVEIRA, A. K. da S.; COSTA, P. M.; ALCANTARA, R. M. C. M. de. Contribuição de bactérias promotoras de crescimento vegetal para o desenvolvimento da cultura do milho na fase de florescimento. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA MEIO-NORTE, 5., 2019,Teresina, PI. Anais... Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2022. 96 p. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 285). p. 48.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
| |
| 158. | | SOUZA, A. C. A. D.; SOUSA, T. P. D.; FILIPPI, M. C. C. D.; SILVA, G. B. D.; MARTINS, B. E. D. M. Indução de resistência e promoção de crescimento em plantas de arroz tratadas com silício e bioagentes. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 38, p. 198, ago. 2013. Suplemento. ref. 168-1. Edição dos Resumos do XLVI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Ouro Preto, MG, ago. 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 159. | | SILVA, L. D.; PAULO, E. A. de; SOUSA, T. M. de; PASSAMANI, F. R. F.; PEREIRA, G. E.; BATISATA, L. R. Incidência de fungos ocratoxigênicos em uvas destinadas a produção de vinhos do Nordeste brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICOLOGIA, 8., 2016, Florianópolis. Anais... São Paulo: Sociedade Brasileira de Micologia, 2016. p. 618.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
| |
| 160. | | SETOTAW, T. A.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; SOUSA, T. V.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; SAKYAMA, N. S. Genome introgression of Híbrido de Timor and its potential to develop high cup quality C. arabica cultivars. Journal of Agricultural Science, v. 12, n. 4, p. 64-76, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
| |
| Registros recuperados : 298 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
