| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
|
Data corrente: |
15/10/2020 |
|
Data da última atualização: |
06/07/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
BERNARDINO, K. C.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; HUFNAGEL, B.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de. |
|
Afiliação: |
Karine C. Bernardino, Universidade Federal de Viçosa; CICERO BESERRA DE MENEZES, CNPMS; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; Pedro C. S. Carneiro, Universidade Federal de Viçosa; ROBERT EUGENE SCHAFFERT, CNPMS; Leon V. Kochian, University of Saskatchewan; Barbara Hufnagel, University of Montpellier; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; JURANDIR VIEIRA DE MAGALHAES, CNPMS. |
|
Título: |
Association mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population. |
|
Ano de publicação: |
2021 |
|
Fonte/Imprenta: |
Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 295-312, 2021. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00122-020-03697-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Tropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pre-breeding via allele mining in the base population. Therefore, MP-RMPs such as BRP13R emerge as multipurpose resources for efcient gene discovery and deployment for breeding sorghum cultivars adapted to tropical soils. MenosTropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pr... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Seleção genômica. |
|
Thesagro: |
Gene; Genética Vegetal; Melhoramento Genético Vegetal; Sorgo. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223127/1/Association-mapping.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02692naa a2200301 a 4500
001 2125512
005 2021-07-06
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s00122-020-03697-8$2DOI
100 1 $aBERNARDINO, K. C.
245 $aAssociation mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population.$h[electronic resource]
260 $c2021
520 $aTropical soils where low phosphorus (P) and aluminum (Al) toxicity limit sorghum [Sorghum bicolor (L.) Moench] production are widespread in the developing world. We report on BRP13R, a multiparental random mating population (MPRMP), which is commonly used in sorghum recurrent selection targeting tropical soil adaptation. Recombination dissipated much of BRP13R?s likely original population structure and average linkage disequilibrium (LD) persisted up to 2.5 Mb, establishing BRP13R as a middle ground between biparental populations and sorghum association panels. Genome-wide association mapping (GWAS) identifed conserved QTL from previous studies, such as for root morphology and grain yield under low-P, and indicated the importance of dominance in the genetic architecture of grain yield. By overlapping consensus QTL regions, we mapped two candidate P efciency genes to a ~5 Mb region on chromosomes 6 (ALMT) and 9 (PHO2). Remarkably, we fnd that only 200 progeny genotyped with~45,000 markers in BRP13R can lead to GWAS-based positional cloning of naturally rare, subpopulation-specifc alleles, such as for SbMATE-conditioned Al tolerance. Genomic selection was found to be useful in such MP-RMP, particularly if markers in LD with major genes are ftted as fxed efects into GBLUP models accommodating dominance. Shifts in allele frequencies in progeny contrasting for grain yield indicated that intermediate to minor-efect genes on P efciency, such as SbPSTOL1 genes, can be employed in pre-breeding via allele mining in the base population. Therefore, MP-RMPs such as BRP13R emerge as multipurpose resources for efcient gene discovery and deployment for breeding sorghum cultivars adapted to tropical soils.
650 $aGene
650 $aGenética Vegetal
650 $aMelhoramento Genético Vegetal
650 $aSorgo
653 $aSeleção genômica
700 1 $aMENEZES, C. B. de
700 1 $aSOUSA, S. M. de
700 1 $aGUIMARÃES, C. T.
700 1 $aCARNEIRO, P. C. S.
700 1 $aSCHAFFERT, R. E.
700 1 $aKOCHIAN, L. V.
700 1 $aHUFNAGEL, B.
700 1 $aPASTINA, M. M.
700 1 $aMAGALHAES, J. V. de
773 $tTheoretical and Applied Genetics$gv. 134, p. 295-312, 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 202 | |
| 143. |  | LOPES, S. S.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. P.; ALVES, M. C.; MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Overexpression and characterization of rice Phosphorus-Starvation Tolerance 1 gene and its sorghum and maize homologs in transgenic tobacco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 62., 2016, Caxambu. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
| 145. | | NEGRI, B. F.; FERREIRA, N. F.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. P.; ALVES, M. C.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Functional analysis of the 5' regulatory region of the maize phosphorus-starvation tolerance 1 (ZMPStoL 8.02) gene. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 6., 2017, Ouro Preto. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2017.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 146. | | NEGRI, B. F.; FERREIRA, N. F.; PALHARES, P. L. S.; LANA, U. G. P.; ALVES, M. C.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Functional characterization of maize Phosphorus-Starvation Tolerance 1 (ZmPstol8.02) promoter. In: ANNUAL MAIZE GENETICS CONFERENCE, 59., 2017, St. Louis. Program and abstracts... St. Louis: [s.n.], 2017. p. 123.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 147. | | NEVES, M. R. M. das; ZAROS, L. G.; BENVENUTI, C. L.; NAVARRO, A. M. do C.; SOUSA, S. M. de; VIEIRA, L. da S. Efeitos do parasitismo gastrintestinal em ovinos da raça Somalis no estado do Ceará. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 f. 1 CD ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
| |
| 148. | | MATTOS, B. B.; MARRIEL, I. E.; SOUSA, S. M. de; LANA, U. G. de P.; SCHAFFERT, R. E.; GOMES, E. A.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A. Sorghum genotypes response to inoculation with phosphate solubilizing bacteria. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, v. 19, e1177, 2020. Título em português: Resposta de genótipos de sorgo à inoculação com bactérias solubilizadoras de fosfato.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Solos. |
| |
| 150. | | MÓDOLO, D. G.; HORN, C. S.; SOARES, J. S. M.; YUNES, J. A.; LIMA, L. M.; SOUSA, S. M. de; MENOSSI, M. Transgenic nicotiana tabacum seeds expressing the Mycobacterium tuberculosis Alanine- and Proline-rich Antigen. AMB Express, v. 8, n. 178, p. 1-10, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 151. | | PALHARES, P. L. S.; LOPES, S. S.; LANA, U. G. P.; ALVES, M. C.; MAGALHAES, J. V.; GUIMARAES, C. T.; CARNEIRO, A. A.; SOUSA, S. M. de. Tobacco transformation with rice phosphorus starvation tolerance 1 gene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 61., 2015, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 152. | | VALINHAS, M. C.; OLIVEIRA, K. E. S. de; OLIVEIRA, R. P. de; SOUSA, S. M. de; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P. Transformação transiente de embriões imaturos de milho L3 como método de seleção de RNA-guias para a técnica de CRISPR/Cas9. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 33., 2022, Sete Lagoas. Brasil: 200 anos de independência: sustentabilidade e desafios para a cadeia produtiva de grãos: resumos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2022. Evento online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 154. | | ANDRADE, D. L.; CARVALHO, C.; PALHARES, V.; OLIVEIRA, N. T.; MARRIEL, I. E.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; PASTINA, M. M.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. P.; SOUSA, S. M. de. Avaliação do efeito de bactérias promotoras de crescimento no desenvolvimento de plântulas de milho em hidroponia. In: SIMPÓSIO DE MICROBIOLOGIA DA UFMG, 4., 2017, Belo Horizonte. Metabolismo microbiano: saúde, ambiente e biotecnologia: resumos. Belo Horizonte: UFMG, 2017. p. 40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 155. | | BERNARDINO, K. C.; MENEZES, C. B. de; SOUSA, S. M. de; GUIMARÃES, C. T.; CARNEIRO, P. C. S.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; HUFNAGEL, B.; PASTINA, M. M.; MAGALHAES, J. V. de. Association mapping and genomic selection for sorghum adaptation to tropical soils of Brazil in a sorghum multiparental random mating population. Theoretical and Applied Genetics, v. 134, p. 295-312, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 156. | | CONCEIÇÃO, C. L. da; ANDRADE, D. L.; CARVALHO, C.; PALHARES, V.; OLIVEIRA, N. T. de; BATISTA, F. de C.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. de P.; SOUSA, S. M. de. Avaliação de promotores de crescimento microbianos em plântulas de milho crescidas em solução nutritiva. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA PIBIC/BIC JÚNIOR, 12., 2017, Sete Lagoas. [Trabalhos apresentados]. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 157. | | SILVEIRA, M. C. T. da; SIMEÃO, R. M.; LEANDRO, T. T.; RIBEIRO, A. C. G.; GONTIJO NETO, M. M.; SOUSA, S. M. de; PARRELLA, R. A. da C.; TARDIN, F. D. Caracterização da produção de forragem de cultivares tropicais anuais em resposta a diferentes estratégias de manejo e aprimoramento de uso. Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2024. 26 p. (Embrapa Pecuária Sul. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 57)| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 158. | | RIBEIRO, V. P.; RODRIGUES, R. A. L.; CARVALHO, C. G.; OLIVEIRA, K. H. D.; SOUSA, S. M. de; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A. Co-inoculação com Bacillus e Azospirillum e promoção de crescimento de raízes de milho. In: SIMPÓSIO DE MICROBIOLOGIA DA UFMG, 4., 2017, Belo Horizonte. Metabolismo microbiano: saúde, ambiente e biotecnologia: resumos. Belo Horizonte: UFMG, 2017. p. 111.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 159. | | RODRIGUES, M. E. G. M.; RIBEIRO, V. P.; OLIVEIRA, R. S.; TAVARES, A. N. G.; GOMES, E. A.; SOUSA, S. M. de; CARVALHO, C.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; LANA, U. G. P. Caracterização molecular e monitoramento de microrganismos promotores de crescimento em milho. In: SIMPÓSIO DE MICROBIOLOGIA DA UFMG, 4., 2017, Belo Horizonte. Metabolismo microbiano: saúde, ambiente e biotecnologia: resumos. Belo Horizonte: UFMG, 2017. p. 211.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 160. | | BERNARDINO, K. da C.; MENEZES, C. B. de; PASTINA, M. M.; SOUSA, S. M. de; GUIMARAES, C. T.; SOUZA, D. A. de; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHAES, J. V. de. Caracterização de uma população de recombinação ao acaso de sorgo para a tolerância ao alumínio e eficiência na utilização de fósforo. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2016. 25 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 148).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 202 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
