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| Registros recuperados : 138 | |
| 101. |  | WEBER, O. B.; SILVA, M. C. B. DA; SILVA, C. F. DA; SOUSA, J. A. de; TANIGUCHI, C. A. K.; GARRUTI, D. dos S.; ROMERO, R. E. Biological and chemical attributes of soils under forest species in Northeast Brazil. Journal of Forestry Research, Harbin, p. 1-15, 1 June 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 102. | | FIGUEIREDO, M. C. B. de; BARROS, V. da S.; SANTOS, T. de L.; GONDIM, R. S.; SOUSA, J. A. de; ARAGAO, F. A. S. de. Pegada de carbono do melão amarelo exportado. In: GUIMARÃES, M. de A.; ARAGÃO, F. A. S. de (Ed.). Produção de melão. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2019. cap. 24 p. 396-424.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 103. | | BARROS, V. DA S.; SANTOS, T. DE L.; FIGUEIREDO, M. C. B. de; SILVA, E. de O.; SOUSA, J. A. de; ARAGAO, F. A. S. de. Pegada de carbono de produtos agrícolas: estudo de caso do melão Amarelo. In: FIGUEIRÊDO, M. C. B. de; GONDIM, R. S.; ARAGÃO, F. A. S. de (Ed.). Produção de melão e mudanças climáticas: sistemas conservacionistas de cultivo para redução das pegadas de carbono e hídrica. Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 165-185 Parte 3 - Capítulo 2| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 107. | | GONDIM, R. S.; CRISOSTOMO, L. A.; MAIA, A. de H. N.; SOUSA, J. A. de; BARROS, V. DA S.; ALMEIDA, A. R. DA C. S. Estoque de carbono no solo em sistemas convencional e conservacionistas de cultivo de melão no Polo Jaguaribe-Açu. In: FIGUEIRÊDO, M. C. B. de; GONDIM, R. S.; ARAGÃO, F. A. S. de (Ed.). Produção de melão e mudanças climáticas: sistemas conservacionistas de cultivo para redução das pegadas de carbono e hídrica. Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 255-263 Parte 4 - Capítulo 3| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 108. | | GONDIM, R. S.; CRISOSTOMO, L. A.; MAIA, A. de H. N.; SOUSA, J. A. de; BARROS, V. DA S.; ALMEIDA, A. R. DA C. S. Estoque de carbono no solo em sistemas convencional e conservacionistas de cultivo de melão no Polo Jaguaribe-Açu. In: FIGUEIRÊDO, M. C. B. de; GONDIM, R. S.; ARAGÃO, F. A. S. de (Ed.). Produção de melão e mudanças climáticas: sistemas conservacionistas de cultivo para redução das pegadas de carbono e hídrica. Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 255-263 Parte 4 - Capítulo 3| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 109. | | LUNZ, A. M. P.; DELUNARDO, T. A.; SOUSA, J. A. de; OLIVEIRA, L. C. de; ASSIS, G. M. L. de; RONCATTO, G. Efeito do tipo de estaca e concentração de AIB no enraizamento de estacas de unha-de-gato (Uncaria guianensis). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 48., 2008, Maringá. Resumos... Maringá: ABH, 2008. p. S4477- S4484.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 110. | | PINHO, L. L.; LACERDA, C. F. DE; SOUSA, J. A. de; SANTOS, A. M.; BEZERRA, A. M. E.; CAVALCANTE, E. S.; SALES, J. R. DA S. Effects of artificial shading and irrigation with brackish water on the initial development of anadenanthera colubrina (vell.) brenan plants. Revista Árvore, v. 46, e4607, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Florestas. |
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| 111. | | LIMA, C. J.; MARACAJÁ, P. B.; SILVA, R. A.; SOUSA, L. C. F. S.; SOUSA, J. S.; SOUSA, J. A.; ANDRADE, A. B. A.; PEREIRA, D. S. Estudo potencial de produção de néctar da bucha vegetal (Luffa cylindrica) em cultivo convencional na cidade de Sousa - PB. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE APICULTURA, 20.; CONGRESSO BRASILEIRO DE MELIPONICULTURA, 6., 2014, Belém, PA. Sustentabilidade, tecnologia e mercados. Belém, PA: CBA, [2014]. p. 115.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 112. | | MIES FILHO, A.; JOBIM, M. I. M.; ENDLER, J. O.; WARD, V. B.; DUARTE, M. M. B.; SOUSA, J. A. C.; MARTINS, S. C. R. Estudo sobre inseminação artificial com sêmen congelado em ovinos no Rio Grande do Sul. Revista Brasileira de Reprodução Animal, v. 10, n. 4, p. 235-245, 1986.| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 113. | | BARBOZA, S. B. S. C.; SANTANA, M. C. dos S.; SOUSA, J. A. de; LÉDO, A. da S.; MELO, M. B. Indução de calogênese in vitro em explantes de pinhão manso (Jatropha curcas L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3., 2007, Goiânia. [Resumos...]. Goiânia: Revista Brasileira de Horticultura Ornamental, 2007. 1 CD-ROM. p. 960.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 115. | | SANTOS, E. L. dos; BESPALHOK FILHO, J. C.; HANSEL, F. A.; SOUSA, J. A. T.; AUER, C. G.; STEINER, N.; DEGENHARDT, J. Azacytidine affects gene expression and metabolic profile of Pinus elliottii x Pinus caribaea var. hondurensis embryogenic cell lines. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, v. 155, p. 637-651, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 116. | | BARBOZA, S. B. S. C.; SOUSA, J. A. de; SANTANA, M. C. dos S.; LÉDO, A. da S.; OLIVEIRA, I. R. de. Avaliação de métodos de assepsia e tipos de explantes para estabelecimento in vitro de pinhão manso (Jatripha curcas L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3., 2007, Goiânia. [Resumos...]. Goiânia: Revista Brasileira de Horticultura Ornamental, 2007. 1 CD-ROM. p. 969.| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 117. | | CAMPELO, D. H.; LACERDA, C. F.; SOUSA, J. A. de; BEZERRA, A. M. E.; ARAUJO, J. D. M.; NEVES, A. L. R.; SOUZA, C. H. C. Características morfofisiológicas foliares e estado nutricional de seis espécies lenhosas em função da disponibilidade de água no solo. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 28, n. 3, p. 924-936, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 118. | | RODRIGUES, V. de S.; CARVALHO, G. M. C.; BARROS, D. A.; CAVALCANTE, M. M. A. de S.; SILVA, J. H. L. da; SOUSA, J. A. T. de. Características histomorfológicas testiculares de touros curraleiro pé-duro, nelore e cruzamentos. Revista RG News, v. 4, n. 3, p. 42, 2018. Edição especial dos Anais do V Congresso Brasileiro de Recursos Genéticos, Fortaleza, nov. 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 119. | | SILVA, L. R. da; MEDEIROS, P. V. Q. de; LEITE, G. A.; SILVA, K. J. P.; MENDONÇA, V.; SOUSA, J. A. de. Caracterização física do fruto de noni (Morinda citrifolia L.). Horticultura Brasileira, v. 27, n. 2, p. S267-S271, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 120. | | SOUSA, J. A. de; SILVA, L. R. da; PONTES, C. A.; AGUIAR, A. L. L. de; CISNE, M. F.; SILVA, E. de O. Caracterização física de frutos de noni (Morinda citrifolia L.) cultivados em Trairi-CE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Anais... Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| Registros recuperados : 138 | |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
19/12/2018 |
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Data da última atualização: |
29/04/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
A - 1 |
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Autoria: |
SILVA, P. R. A. da; VIDAL, M. S.; SOARES, C. de P.; POLESE, V.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de; BALDANI, J. I. |
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Afiliação: |
PAULA RENATA ALVES DA SILVA, BOLSISTA EMBRAPA AGROBIOLOGIA; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; CLEITON DE PAULA SOARES, UFRJ; VALÉRIA POLESE, UFRJ; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR,, UFRJ; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFRJ; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB. |
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Título: |
Sugarcane apoplast fluid modulates the global transcriptional profile of the diazotrophic bacteria Paraburkholderia tropica strain Ppe8. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
PLOS ONE, v. 13, n. 12, e0207863, 2018. |
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ISSN: |
1932-6203 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
The stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of genes involved in bacterial metabolism was regulated (up and down), suggesting that the metabolism of strain Ppe8 is modulated by the apoplast fluid. These results suggest that Ppe8 alters its gene expression pattern in the presence of apoplast fluid mainly in order to use compounds present in the fluid as well as to avoid the induction of plant defense mechanisms. This is a pioneer study showing the role played by the sugarcane apoplast fluid on the global modulation of genes in P. tropica strain Ppe8. MenosThe stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bacterial growth; RNA Sequence; Sugarcane variety RB867515; Transcriptomic profile. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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520 $aThe stalk apoplast fluid of sugarcane contains different sugars, organic acids and amino acids that may supply the demand for carbohydrates by endophytic bacteria including diazotrophs P. tropica (syn. B. tropica) strain Ppe8, isolated from sugarcane, is part of the bacterial consortium recommended as inoculant to sugarcane. However, little information has been accumulated regarding this plant-bacterium interaction considering that it colonizes internal sugarcane tissues. Here, we made use of the RNA-Seq transcriptomic analysis to study the influence of sugarcane stalk apoplast fluid on Ppe8 gene expression. The bacterium was grown in JMV liquid medium (100 ml), divided equally and then supplemented with 50 ml of fresh JMV medium or 50 ml of apoplast fluid extracted from sugarcane variety RB867515. Total RNA was extracted 2 hours later, the rRNAs were depleted and mRNAs used to construct libraries to sequence the fragments using Ion Torrent technology. The mapping and statistical analysis were carried out with CLC Genomics Workbench software. The RNA-seq data was validated by RT-qPCR using the reference genes fliP1, paaF, and groL. The data analysis showed that 544 genes were repressed and 153 genes were induced in the presence of apoplast fluid. Genes that induce plant defense responses, genes related to chemotaxis and movements were repressed in the presence of apoplast fluid, indicating that strain Ppe8 recognizes the apoplast fluid as a plant component. The expression of genes involved in bacterial metabolism was regulated (up and down), suggesting that the metabolism of strain Ppe8 is modulated by the apoplast fluid. These results suggest that Ppe8 alters its gene expression pattern in the presence of apoplast fluid mainly in order to use compounds present in the fluid as well as to avoid the induction of plant defense mechanisms. This is a pioneer study showing the role played by the sugarcane apoplast fluid on the global modulation of genes in P. tropica strain Ppe8.
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700 1 $aBALDANI, J. I.
773 $tPLOS ONE$gv. 13, n. 12, e0207863, 2018.
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Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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