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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
30/06/1992 |
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Data da última atualização: |
30/06/1992 |
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Autoria: |
SANO, S. M.; SOUSA, D. M. G. de; WARNER, A. |
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Título: |
Avaliacao da eficiencia de tres fungos endomicorrizicos isolados de um latossolo vermelho-amarelo cultivado. |
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Ano de publicação: |
1985 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIENCIA DO SOLO, 20., 1985, Belem. Programas e resumos. Campinas: Sociedade Brasileira de Ciencia do Solo, 1985. |
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Páginas: |
p.65-66. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Resumo. |
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Conteúdo: |
A presenca de fungos endomicorrizicos nativos e constatada em diferentes culturas nos solos de Cerrado, mas pouco se conhece sobre a sua eficiencia. Assim tres especies dos fungos isolados de um Latossolo Vermelho-Amarelo (LV) cultivado com Brachiaria humidicola e Glycine max (soja) foram testadas com sorgo em casa de vegetacao. Os esporos foram isolados do campo e multiplicados em solos sob condicoes estereis com sorgo, para producao do inoculante. O solo utilizado nos experimentos foi um LV argiloso, coletado em area virgem e apos a correcao do pH para 5,6 parte deste foi esterilizado a vapor. Aplicou-se entao as doses de 0, 6,25; 12,5 e 25 mg de P/kg de solo na forma de monoclacio fosfato no solo natural e esterilizado. As sementes pregerminadas de sorgo foram inoculadas com Glomus clarum, G. margarita, G. gigantea e misturas das tres e cultivadas por 60 dias. Houve interacao entre a dose de P aplicada e as especies de fungo. O rendimento da materia seca e absorcao de P pelo sorgo aumentaram significativamente com a inoculacao de G. clarum, G. margarita e mistura em solo esterilizado, mas G. gigantea nao beneficiou a planta em todos os tratamentos. No solo natural a absorcao de P pelo sorgo nao apresentou diferenca significativa com a inoculacao e a materia seca produzida com G. gigantea foi menor do que as outras especies. Com base nestes resultados podemos concluir que no solo LV existem especies de fungos micorrizicos vesicular-arbusculares eficientes no aumento da producao de materia seca e absorcao de P. MenosA presenca de fungos endomicorrizicos nativos e constatada em diferentes culturas nos solos de Cerrado, mas pouco se conhece sobre a sua eficiencia. Assim tres especies dos fungos isolados de um Latossolo Vermelho-Amarelo (LV) cultivado com Brachiaria humidicola e Glycine max (soja) foram testadas com sorgo em casa de vegetacao. Os esporos foram isolados do campo e multiplicados em solos sob condicoes estereis com sorgo, para producao do inoculante. O solo utilizado nos experimentos foi um LV argiloso, coletado em area virgem e apos a correcao do pH para 5,6 parte deste foi esterilizado a vapor. Aplicou-se entao as doses de 0, 6,25; 12,5 e 25 mg de P/kg de solo na forma de monoclacio fosfato no solo natural e esterilizado. As sementes pregerminadas de sorgo foram inoculadas com Glomus clarum, G. margarita, G. gigantea e misturas das tres e cultivadas por 60 dias. Houve interacao entre a dose de P aplicada e as especies de fungo. O rendimento da materia seca e absorcao de P pelo sorgo aumentaram significativamente com a inoculacao de G. clarum, G. margarita e mistura em solo esterilizado, mas G. gigantea nao beneficiou a planta em todos os tratamentos. No solo natural a absorcao de P pelo sorgo nao apresentou diferenca significativa com a inoculacao e a materia seca produzida com G. gigantea foi menor do que as outras especies. Com base nestes resultados podemos concluir que no solo LV existem especies de fungos micorrizicos vesicular-arbusculares eficientes no aumento da pro... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Casa de vegetacao; Endomicorriza; Glomus gigantea; Glomus margarita; Latossolo vermelho-amarelo; Micorriza vesicular-arbuscular; Sorghum. |
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Thesagro: |
Absorção; Brachiaria Humidicola; Cerrado; Fósforo; Fungo; Glomus Clarum; Glycine Max; Inoculação; Matéria Seca; Produção; Soja; Solo; Sorgo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02705naa a2200409 a 4500
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245 $aAvaliacao da eficiencia de tres fungos endomicorrizicos isolados de um latossolo vermelho-amarelo cultivado.
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300 $ap.65-66.
500 $aResumo.
520 $aA presenca de fungos endomicorrizicos nativos e constatada em diferentes culturas nos solos de Cerrado, mas pouco se conhece sobre a sua eficiencia. Assim tres especies dos fungos isolados de um Latossolo Vermelho-Amarelo (LV) cultivado com Brachiaria humidicola e Glycine max (soja) foram testadas com sorgo em casa de vegetacao. Os esporos foram isolados do campo e multiplicados em solos sob condicoes estereis com sorgo, para producao do inoculante. O solo utilizado nos experimentos foi um LV argiloso, coletado em area virgem e apos a correcao do pH para 5,6 parte deste foi esterilizado a vapor. Aplicou-se entao as doses de 0, 6,25; 12,5 e 25 mg de P/kg de solo na forma de monoclacio fosfato no solo natural e esterilizado. As sementes pregerminadas de sorgo foram inoculadas com Glomus clarum, G. margarita, G. gigantea e misturas das tres e cultivadas por 60 dias. Houve interacao entre a dose de P aplicada e as especies de fungo. O rendimento da materia seca e absorcao de P pelo sorgo aumentaram significativamente com a inoculacao de G. clarum, G. margarita e mistura em solo esterilizado, mas G. gigantea nao beneficiou a planta em todos os tratamentos. No solo natural a absorcao de P pelo sorgo nao apresentou diferenca significativa com a inoculacao e a materia seca produzida com G. gigantea foi menor do que as outras especies. Com base nestes resultados podemos concluir que no solo LV existem especies de fungos micorrizicos vesicular-arbusculares eficientes no aumento da producao de materia seca e absorcao de P.
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
17/12/2013 |
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Data da última atualização: |
15/06/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 2 |
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Autoria: |
McCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G. R.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. de A.; ALBUQUERQUE, M.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; SIMPSON, B.; MARQUES, E.; McEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; WILLIAMS, R.; TASSELL, C. P. V. |
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Afiliação: |
MATTHEW C. McCLURE, USDA; TAD S. SONSTEGARD, USDA; GEORGE R. WIGGANS, USDA; ALISON L. VAN EENENNAAM, University of California - Davis; KRISTINA L. WEBER, University of California-Davis; CECILIA T. PENEDO, University of California-Davis; DONAGH P. BERRY, Animal and Grassland Research and Innovation Centre, Ireland; JOHN FLYNN, Weatherbys DNA Laboratory, Ireland; JOSÉ F. GARCIA, UNESP; ADRIANA S. CARMO, Deoxi Biotecnologia, Araçatuba; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; MILLA ALBUQUERQUE, USP; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MIKE COFFEY, SRUC, Scotland; KIRSTY MOORE, SRUC, Scotland; MARIE-YVONNE BOSCHER, LABOGENA, France; LUCIE GENESTOUT, LABOGENA, France; RAFFAELE MAZZA, Italian Breeders Association, Roma; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri-Columbia; ROBERT D. SCHNABEL, University of Missouri-Columbia; BARRY SIMPSON, GeneSeek, Neogen Company, Lincoln, USA; ELISA MARQUES, GeneSeek, Neogen Company, Lincoln, USA; JOHN C. McEWAN, AgResearch, Invermay Agricultural Centre, New Zealand; ANDREW CROMIE, Irish Cattle Breeding Federation, Ireland; LUIZ L. COUTINHO, ESALQ/USP; LARRY A. KUEHN, USDA-ARS; JOHN W. KEELE, USDA-ARS; EMILY K. PIPER, University of Queensland, Australia; JIM COOK, University of New England, Australia; ROBERT WILLIAMS, American-International Charolais Association, USA; CURTIS P. VAN TASSELL, USDA. |
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Título: |
Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple Bos taurus and Bos indicus breeds. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Genetics, v. 4, n. 176, 2013. |
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Páginas: |
11 p. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
To assist cattle producers transition from microsatellite (MS) to single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping for parental verification we previously devised an effective and inexpensive method to impute MS alleles from SNP haplotypes. While the reported method was verified with only a limited data set (N = 479) from Brown Swiss, Guernsey, Holstein, and Jersey cattle, some of the MS-SNP haplotype associations were concordant across these phylogenetically diverse breeds. This implied that some haplotypes predate modern breed formation and remain in strong linkage disequilibrium. To expand the utility of MS allele imputation across breeds, MS and SNP data from more than 8000 animals representing 39 breeds (Bos taurus and B. indicus) were used to predict 9410 SNP haplotypes, incorporating an average of 73 SNPs per haplotype, for which alleles from 12 MS markers could be accurately be imputed. Approximately 25% of the MS-SNP haplotypes were present in multiple breeds (N = 2 to 36 breeds). These shared haplotypes allowed for MS imputation in breeds that were not represented in the reference population with only a small increase in Mendelian inheritance inconsistancies. Our reported reference haplotypes can be used for any cattle breed and the reported methods can be applied to any species to aid the transition from MS to SNP genetic markers. While ~91% of the animals with imputed alleles for 12 MS markers had ≤1 Mendelian inheritance conflicts with their parents' reported MS genotypes, this figure was 96% for our reference animals, indicating potential errors in the reported MS genotypes. The workflow we suggest autocorrects for genotyping errors and rare haplotypes, by MS genotyping animals whose imputed MS alleles fail parentage verification, and then incorporating those animals into the reference dataset. MenosTo assist cattle producers transition from microsatellite (MS) to single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping for parental verification we previously devised an effective and inexpensive method to impute MS alleles from SNP haplotypes. While the reported method was verified with only a limited data set (N = 479) from Brown Swiss, Guernsey, Holstein, and Jersey cattle, some of the MS-SNP haplotype associations were concordant across these phylogenetically diverse breeds. This implied that some haplotypes predate modern breed formation and remain in strong linkage disequilibrium. To expand the utility of MS allele imputation across breeds, MS and SNP data from more than 8000 animals representing 39 breeds (Bos taurus and B. indicus) were used to predict 9410 SNP haplotypes, incorporating an average of 73 SNPs per haplotype, for which alleles from 12 MS markers could be accurately be imputed. Approximately 25% of the MS-SNP haplotypes were present in multiple breeds (N = 2 to 36 breeds). These shared haplotypes allowed for MS imputation in breeds that were not represented in the reference population with only a small increase in Mendelian inheritance inconsistancies. Our reported reference haplotypes can be used for any cattle breed and the reported methods can be applied to any species to aid the transition from MS to SNP genetic markers. While ~91% of the animals with imputed alleles for 12 MS markers had ≤1 Mendelian inheritance conflicts with their parents' reported MS ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Imputation; Microsatellite; Parentage verification; SNP; STR. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 03360naa a2200565 a 4500
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005 2023-06-15
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245 $aImputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple Bos taurus and Bos indicus breeds.$h[electronic resource]
260 $c2013
300 $a11 p.
520 $aTo assist cattle producers transition from microsatellite (MS) to single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping for parental verification we previously devised an effective and inexpensive method to impute MS alleles from SNP haplotypes. While the reported method was verified with only a limited data set (N = 479) from Brown Swiss, Guernsey, Holstein, and Jersey cattle, some of the MS-SNP haplotype associations were concordant across these phylogenetically diverse breeds. This implied that some haplotypes predate modern breed formation and remain in strong linkage disequilibrium. To expand the utility of MS allele imputation across breeds, MS and SNP data from more than 8000 animals representing 39 breeds (Bos taurus and B. indicus) were used to predict 9410 SNP haplotypes, incorporating an average of 73 SNPs per haplotype, for which alleles from 12 MS markers could be accurately be imputed. Approximately 25% of the MS-SNP haplotypes were present in multiple breeds (N = 2 to 36 breeds). These shared haplotypes allowed for MS imputation in breeds that were not represented in the reference population with only a small increase in Mendelian inheritance inconsistancies. Our reported reference haplotypes can be used for any cattle breed and the reported methods can be applied to any species to aid the transition from MS to SNP genetic markers. While ~91% of the animals with imputed alleles for 12 MS markers had ≤1 Mendelian inheritance conflicts with their parents' reported MS genotypes, this figure was 96% for our reference animals, indicating potential errors in the reported MS genotypes. The workflow we suggest autocorrects for genotyping errors and rare haplotypes, by MS genotyping animals whose imputed MS alleles fail parentage verification, and then incorporating those animals into the reference dataset.
653 $aImputation
653 $aMicrosatellite
653 $aParentage verification
653 $aSNP
653 $aSTR
700 1 $aSONSTEGARD, T. S.
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700 1 $aEENENNAAM, A. L. V.
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700 1 $aPENEDO, C. T.
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700 1 $aGARCIA, J. F.
700 1 $aCARMO, A. S.
700 1 $aREGITANO, L. C. de A.
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700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
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773 $tFrontiers in Genetics$gv. 4, n. 176, 2013.
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Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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