Data/hora: 07/06/2024 02:53:34

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 29/01/2013
Data da última atualização: | 22/01/2020
Autoria: | SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.
Afiliação: | ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, Unesp; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURÍCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Título: | Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.
Ano de publicação: | 2012
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Páginas: | Não paginado.
Idioma: | Português
Notas: | SBMA 2012.
Conteúdo: | A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).
Palavras-Chave: | Desequilíbrio de ligação; Genotipagem.
Thesagro: | Bos Indicus.
Thesaurus Nal: | Genotype; Linkage disequilibrium; Single nucleotide polymorphism; Zebu.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/75496/1/LUCIANA.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Exemplares: | CNPTIA - (17161-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS