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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
Data corrente: |
30/09/2020 |
Data da última atualização: |
07/10/2020 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MOTTA, L. B.; SOARES, T. C. B.; FERRAO, M. A. G.; CAIXETA, E. T.; PEREIRA JÚNIOR, R. M.; LORENZONI, R. M. |
Afiliação: |
Ludymila Brandão Motta, Universidade Federal do Espírito Santo; Taís Cristina Bastos Soares, Universidade Federal do Espírito Santo; MARIA AMELIA GAVA FERRAO, CNPCa; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; Ronald Martins Pereira Júnior, Universidade Federal do Espírito Santo; Rodrigo Monte Lorenzoni, Universidade Federal do Espírito Santo. |
Título: |
Transferability of microsatellite loci in Coffea canephora. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Australian Journal of Crop Science, v. 8 , n. 6, p. 987-991 , 2014. |
ISSN: |
1835-2707 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Coffee is one of the most important international trade commodities. Good prospects presented by the application of SSR markers to access the diversity in Coffea, and the small number of SSR primers available for C. canephora, encouraged the realization of this study. Thus, we tested the heterologous amplification of 71 microsatellite markers, originally developed for Coffea arabica, in Coffea canephora. Heterologous amplification occurred with 38 of the 71 primers. Approximately 52.63% of the primers used were polymorphic; 35% of the primer sets were classified as non-informative, 50% as moderately informative and 15% as highly informative. The loci evaluated by SSRCa 088, M793, SSRCa 054, SSRCa 085, CM5, M25, CFGA54 were low informative; SSRCa 084, SSRCa 052 and SSRCa 040 were highly informative. The validated primer sets can be used in molecular studies for different purposes once they were efficient in the genotypes discrimination. |
Palavras-Chave: |
Molecular characterization; Molecular markers; SSR; Transferability. |
Thesagro: |
Café. |
Thesaurus Nal: |
Coffee (beverage). |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216309/1/Motta-et-al-2014a-1.pdf
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Marc: |
LEADER 01701naa a2200265 a 4500 001 2125191 005 2020-10-07 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1835-2707 100 1 $aMOTTA, L. B. 245 $aTransferability of microsatellite loci in Coffea canephora.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aCoffee is one of the most important international trade commodities. Good prospects presented by the application of SSR markers to access the diversity in Coffea, and the small number of SSR primers available for C. canephora, encouraged the realization of this study. Thus, we tested the heterologous amplification of 71 microsatellite markers, originally developed for Coffea arabica, in Coffea canephora. Heterologous amplification occurred with 38 of the 71 primers. Approximately 52.63% of the primers used were polymorphic; 35% of the primer sets were classified as non-informative, 50% as moderately informative and 15% as highly informative. The loci evaluated by SSRCa 088, M793, SSRCa 054, SSRCa 085, CM5, M25, CFGA54 were low informative; SSRCa 084, SSRCa 052 and SSRCa 040 were highly informative. The validated primer sets can be used in molecular studies for different purposes once they were efficient in the genotypes discrimination. 650 $aCoffee (beverage) 650 $aCafé 653 $aMolecular characterization 653 $aMolecular markers 653 $aSSR 653 $aTransferability 700 1 $aSOARES, T. C. B. 700 1 $aFERRAO, M. A. G. 700 1 $aCAIXETA, E. T. 700 1 $aPEREIRA JÚNIOR, R. M. 700 1 $aLORENZONI, R. M. 773 $tAustralian Journal of Crop Science$gv. 8 , n. 6, p. 987-991 , 2014.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
Data corrente: |
04/01/2022 |
Data da última atualização: |
04/01/2022 |
Autoria: |
SZARESKI, V. J.; CARVALHO, I. R.; KEHL, K.; LEVIEN, A. M.; ROSA, T. C. da; SOUZA, V. Q. de. |
Afiliação: |
VINÍCIUS JARDEL SZARESKI, Grupo DonMario, Votuporanga; IVAN RICARDO CARVALHO, Universidade Regional do Noroeste do Rio Grande do Sul, Departamento de Estudos Agrários; KASSIANA KEHL, Fundação Pró-Sementes, Matriz Passo Fundo; ALEXANDRE MOSCARELLI LEVIEN, Fundação Pró-Sementes, Matriz Passo Fundo; TIAGO CORAZZA DA ROSA, Tropical Melhoramento e Genética, Londrina; VELCI QUEIRÓZ DE SOUZA, Universidade Federal do Pampa, Campus Universitário, São Gabriel. |
Título: |
Adaptability and stability with multivariate definition of macroenvironments for wheat yield in Rio Grande do Sul. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 56, e02468, 2021. |
DOI: |
https://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2021.v56.02468 |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
Título em português: Adaptabilidade e estabilidade com definição multivariada de macroambientes para o rendimento de trigo no Rio Grande do Sul. |
Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the adaptability, stability, and environmental stratification of wheat (Triticum aestivum) grown in 20 environments, in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experiments were performed during four crop years, in five wheat growing regions, considering 20 distinct growing environments. In the presence of genotype x environment (GxE) interaction, the additive main effects and multiplicative interaction analysis (AMMI) method was used. This method combines variances of additive effects of genotypes and environments with the multiplicative effects of GxE interaction, and the obtained scores are displayed in biplot graphs, using the principal component analysis. The environments stratified by the factor analysis, and the macroenvironments were defined according to grain yield behavior. The patterns of adaptability and phenotypic stability for genotypes 'BRS 327', 'BRS 331', 'Fundacep Raízes', 'BRS 328', and 'BRS Guamirim' were obtained through the multivariate biometric approaches AMMI and the factor analysis. The definition of macroenvironments is intrinsic to peculiarities of the crop year in the state of Rio Grande do Sul, and there is similarity between the municipalities of Santo Augusto, Cachoeira do Sul, and São Luiz Gonzaga, as well as between Cachoeira do Sul and São Gabriel. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade, a estabilidade e a estratificação ambiental de trigo (Triticum aestivum) em 20 ambientes, no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os experimentos foram realizados durante quatro anos agrícolas, em cinco regiões de cultivo, tendo-se considerado 20 ambientes distintos. Na presença da interação genótipo x ambiente (GxA), utilizou-se o método ?additive main effects and multiplicative interaction analysis? (AMMI). Este método combina as variâncias dos efeitos aditivos dos genótipos e dos ambientes com os efeitos multiplicativos da interação GxA, e os escores obtidos são mostrados em gráficos biplot, com uso de análise de componentes principais. A estratificação dos ambientes foi obtida com análise fatorial, e os macroambientes foram definidos de acordo com o comportamento do rendimento de grãos. Os padrões de adaptabilidade e estabilidade fenotípica dos genótipos 'BRS 327', 'BRS 331', 'Fundacep Raízes', 'BRS 328' e 'BRS Guamirim' foram obtidos por meio dos métodos biométricos multivariados AMMI e análise de fatores. A definição de macroambientes é intrínseca a peculiaridades dos anos agrícolas, no estado do Rio Grande do Sul, e há similaridade entre os municípios de Santo Augusto, Cachoeira do Sul e São Luiz Gonzaga, bem como entre Cachoeira do Sul e São Gabriel. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the adaptability, stability, and environmental stratification of wheat (Triticum aestivum) grown in 20 environments, in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experiments were performed during four crop years, in five wheat growing regions, considering 20 distinct growing environments. In the presence of genotype x environment (GxE) interaction, the additive main effects and multiplicative interaction analysis (AMMI) method was used. This method combines variances of additive effects of genotypes and environments with the multiplicative effects of GxE interaction, and the obtained scores are displayed in biplot graphs, using the principal component analysis. The environments stratified by the factor analysis, and the macroenvironments were defined according to grain yield behavior. The patterns of adaptability and phenotypic stability for genotypes 'BRS 327', 'BRS 331', 'Fundacep Raízes', 'BRS 328', and 'BRS Guamirim' were obtained through the multivariate biometric approaches AMMI and the factor analysis. The definition of macroenvironments is intrinsic to peculiarities of the crop year in the state of Rio Grande do Sul, and there is similarity between the municipalities of Santo Augusto, Cachoeira do Sul, and São Luiz Gonzaga, as well as between Cachoeira do Sul and São Gabriel. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade, a estabilidade e a estratificação ambiental de trigo (Triticum aestivum) ... Mostrar Tudo |
Thesagro: |
Genótipo; Método de Análise; Rendimento; Trigo; Triticum Aestivum. |
Thesaurus NAL: |
Genotype-environment interaction; Principal component analysis; Wheat. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/229950/1/Adaptability-stability-multivariate-2021.pdf
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Marc: |
LEADER 03813naa a2200301 a 4500 001 2138733 005 2022-01-04 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi. org/10.1590/S1678-3921.pab2021.v56.02468$2DOI 100 1 $aSZARESKI, V. J. 245 $aAdaptability and stability with multivariate definition of macroenvironments for wheat yield in Rio Grande do Sul.$h[electronic resource] 260 $c2021 500 $aTítulo em português: Adaptabilidade e estabilidade com definição multivariada de macroambientes para o rendimento de trigo no Rio Grande do Sul. 520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the adaptability, stability, and environmental stratification of wheat (Triticum aestivum) grown in 20 environments, in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. The experiments were performed during four crop years, in five wheat growing regions, considering 20 distinct growing environments. In the presence of genotype x environment (GxE) interaction, the additive main effects and multiplicative interaction analysis (AMMI) method was used. This method combines variances of additive effects of genotypes and environments with the multiplicative effects of GxE interaction, and the obtained scores are displayed in biplot graphs, using the principal component analysis. The environments stratified by the factor analysis, and the macroenvironments were defined according to grain yield behavior. The patterns of adaptability and phenotypic stability for genotypes 'BRS 327', 'BRS 331', 'Fundacep Raízes', 'BRS 328', and 'BRS Guamirim' were obtained through the multivariate biometric approaches AMMI and the factor analysis. The definition of macroenvironments is intrinsic to peculiarities of the crop year in the state of Rio Grande do Sul, and there is similarity between the municipalities of Santo Augusto, Cachoeira do Sul, and São Luiz Gonzaga, as well as between Cachoeira do Sul and São Gabriel. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a adaptabilidade, a estabilidade e a estratificação ambiental de trigo (Triticum aestivum) em 20 ambientes, no estado do Rio Grande do Sul, Brasil. Os experimentos foram realizados durante quatro anos agrícolas, em cinco regiões de cultivo, tendo-se considerado 20 ambientes distintos. Na presença da interação genótipo x ambiente (GxA), utilizou-se o método ?additive main effects and multiplicative interaction analysis? (AMMI). Este método combina as variâncias dos efeitos aditivos dos genótipos e dos ambientes com os efeitos multiplicativos da interação GxA, e os escores obtidos são mostrados em gráficos biplot, com uso de análise de componentes principais. A estratificação dos ambientes foi obtida com análise fatorial, e os macroambientes foram definidos de acordo com o comportamento do rendimento de grãos. Os padrões de adaptabilidade e estabilidade fenotípica dos genótipos 'BRS 327', 'BRS 331', 'Fundacep Raízes', 'BRS 328' e 'BRS Guamirim' foram obtidos por meio dos métodos biométricos multivariados AMMI e análise de fatores. A definição de macroambientes é intrínseca a peculiaridades dos anos agrícolas, no estado do Rio Grande do Sul, e há similaridade entre os municípios de Santo Augusto, Cachoeira do Sul e São Luiz Gonzaga, bem como entre Cachoeira do Sul e São Gabriel. 650 $aGenotype-environment interaction 650 $aPrincipal component analysis 650 $aWheat 650 $aGenótipo 650 $aMétodo de Análise 650 $aRendimento 650 $aTrigo 650 $aTriticum Aestivum 700 1 $aCARVALHO, I. R. 700 1 $aKEHL, K. 700 1 $aLEVIEN, A. M. 700 1 $aROSA, T. C. da 700 1 $aSOUZA, V. Q. de 773 $tPesquisa Agropecuária Brasileira$gv. 56, e02468, 2021.
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