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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da. Development and applications of high-throughput SNP genotyping technologies in non-model plant genomes. 2017 169 f. Tese (Doutorado em Ciências Genômicas) - Universidade Católica de Brasília, Brasília, DF. Orientador: Dário Grattapaglia, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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2.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, linkage disequilibrium and nucleotide diversity from pooled resequencing and single nucleotide polymorphism genotyping unlock the evolutionary history of Eucalyptus grandis. New Phytologist, v. 208, p. 830-845, 2015.

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3.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B.; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. Genome-wide patterns of recombination, nucleotide diversity and linkage disequilibrium in Eucalyptus from high density SNP genotyping and pooled whole-genome resequencing. In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 23., 2015, San Diego, CA. [Abstracts...]. San Diego: [s.n.], 2015. PAG 2015. Pôster P1231.

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4.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, R. T.; SILVA JUNIOR, O. B.; GRATTAPAGLIA, D. ENVIROTYPING in forest tree breeding: exploitation of genotype by environment interaction to avoid misallocation of genotypes in field deployment. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 313-314. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.

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5.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. New Phytologist, v. 206, n. 4, p. 1527(14), 2015.

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6.Imagem marcado/desmarcadoSILVA-JUNIOR, O. B.; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Genome assembly of the Pink Ipê (Handroanthus impetiginosus, Bignoniaceae), a highly valued, ecologically keystone Neotropical timber forest tree. GigaScience, v. 7, p. 1-16, 2018.

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7.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B.; LIRA, M.; BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. S.; GRATTAPAGLIA, D. Descoberta e genotipagem de SNPs em cajueiro via sequencimento de representações genômicas reduzidas. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 658. 1 CD-ROM.

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8.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.

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9.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 26., 2017, Lavras. Anais... Lavras: UFLA, 2017.

Biblioteca(s): Embrapa Café.

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10.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. CD-ROM. Resumo.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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11.Imagem marcado/desmarcadoSILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. DNA Research, v. 25, n. 5, p. 535-545, 2018. Na publicação: Orzenil Bonfim Silva-Junior.

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12.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.

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13.Imagem marcado/desmarcadoCARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE GENÉTICA E MELHORAMENTO, 8., 2017, Viçosa, MG. Ômicas: do gene ao fenótipo. [Proceedings...] Viçosa, MG: UFV, 2017.

Biblioteca(s): Embrapa Café.

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14.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SILVA, P. I. T. A five-species 50K Axiom SNP microarray allows high quality genotyping of coffee, cashew, cassava, brazilian pine and eucalyptus. In: PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 25., 2017, San Diego. [Abstracts...]. San Diego, CA: [s.n.], 2017.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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15.Imagem marcado/desmarcadoTANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; GRATTAPAGLIA, D. A genotyping array of 3,400 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) advances the genetic analysis of the iconic tree Araucaria angustifolia, showing that the natural populations ar e more differentiated than previously reported. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, (nesp), e201902043, 2019. p. 188. Edição especial dos resumos do IUFRO World Congress, 25., 2019, Curitiba.

Biblioteca(s): Embrapa Florestas.

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16.Imagem marcado/desmarcadoALVES, W. B. dos S.; PACHECO, C. A. P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. High density genetic mapping of dwarfism traits ina a tall x dwarf coconut (Cococs nucifera L.) F2 population uncovers a major QTL for early flowering col-localized with the flowering time gene FT. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. E-book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 425.

Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.

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17.Imagem marcado/desmarcadoALVES, W. B. dos S.; PACHECO, C. A. P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. High density genetic mapping of dwarfism traits in a tall x dwarf coconut (Cocos Nucifera L.) f2 population uncovers a major QTL for early flowering co-localized with the flowering time gene FT. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 68., 2023, Ouro Preto. Paleogenomics: sequencing ancient DNA. E-book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2023. p. 425

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18.Imagem marcado/desmarcadoGRATTAPAGLIA, D.; MAMANI, E. M. C.; SILVA JUNIOR, O. B.; FARIA, D. A. A novel genome-wide microsatellite resource for species of Eucalyptus with linkage-to-physical correspondence on the reference genome sequence. Molecular Ecology Resources, v. 15, p. 437-448, 2015.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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19.Imagem marcado/desmarcadoANDRADE, A. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; CARNEIRO, F.; MARRACCINI, P.; GRATTAPAGLIA, D. Towards GWAS and Genomic Prediction in Coffee: Development and Validation of a 26K SNP Chip for Coffea Canephora. In: PLANT & ANIMAL GENOME, 25., 2017, San Diego. Final program & exhibite guide... San Diego: USDA, 2017.

Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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20.Imagem marcado/desmarcadoCAPPA, E. P.; LIMA, B. M. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GARCIA, C. C.; MANSFIELD, S. D.; GRATTAPAGLIA, D. Improving genomic prediction of growth and wood traits in Eucalyptus using phenotypes from non-genotyped trees by single-step GBLUP. Plant Science, v. 284, p. 9-15, 2019.

Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.

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Biblioteca(s):  Embrapa Florestas.
Data corrente:  13/05/2020
Data da última atualização:  05/01/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Circulação/Nível:  A - 1
Autoria:  TAHERI, S.; DECAËNS, T.; CUNHA, L.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; BARTZ, M. L. C.; BARETTA, D.; DUPONT, L.
Afiliação:  Sorbonne Universite; Universite de Montpellier; University of South Wales; GEORGE GARDNER BROWN, CNPF; Universidade Positivo; Universidade do Estado de Santa Catarina; Universite Paris.
Título:  Genetic evidence of multiple introductions and mixed reproductive strategy in the peregrine earthworm Pontoscolex corethrurus.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Biological Invasions, v. 22, p. 2545-2557, 2020.
DOI:  DOI 10.1007/s10530-020-02270-0
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Pontoscolex corethrurus is a well-known invasive earthworm in tropical zone which is believed to have originated from the Guayana Shield in South America and was described as parthenogenetic. A recent phylogenetic study revealed four cryptic species in the P. corethrurus complex (L1, L2, L3 and L4), among them L1 was particularly widespread and was proposed as P. corethrurus sensu stricto. Here, our aims were to investigate the genetic variation of P. corethrurus L1 in its presumed native and introduced ranges and to examine its reproductive strategy. An extensive dataset of 478 cytochrome oxidase I gene (COI) sequences, obtained in specimens sampled all around the world, revealed a weak COI haplotype diversity with one major haplotype (H1) present in 76% of the specimens. Analyses of the genetic variation of 12 L1 populations were done using both nuclear (226 AFLP profiles) and mitochondrial (269 COI sequences) genetic information. The high AFLP genotype diversity at the worldwide scale and the fact that no genotype was shared among populations, allowed to reject the ?super-clone? invasion hypothesis. Moreover, a similar level of mean genetic diversity indices were observed between the introduced and native ranges, a pattern explained by a history of multiple introductions of specimens from different parts of the world. At last, occurrence of identical AFLPs genotypes (i.e. clones) in several population confirmed asexual reproduction, but recombination was also revealed by ... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Genetic diversity; Soil macrofauna; Tropical invasive species.
Thesaurus NAL:  Founder effect; Genetic recombination; Parthenogenesis.
Categoria do assunto:  K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Florestas (CNPF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status
CNPF57299 - 1UPCAP - DD
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