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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/04/2010 |
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Data da última atualização: |
24/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
SILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. |
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Afiliação: |
MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAUL M. VANRADEN, USDA; CURT P. VAN TASSEL, USDA; TAD S. SOSTENGARD, USDA; LAKSHMI K. MATUKUMALLI, GEORGE MASON UNIVERSITY; EUI-SOO KIM, USDA; GEORGE R. WIGGANS, USDA. |
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Título: |
Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Foi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas. |
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Palavras-Chave: |
Associação por todo genoma. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711787/1/Analise-de-associacao-por-todo-o-genoma.pdf
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Marc: |
LEADER 01984nam a2200193 a 4500
001 1711787
005 2024-04-24
008 2009 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aSILVA, M. V. G. B.
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520 $aFoi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas.
653 $aAssociação por todo genoma
700 1 $aVANRADEN, P. M.
700 1 $aVAN TASSEL, C. P.
700 1 $aSOSTENGARD, T. S.
700 1 $aMATUKUMALLI, L. K.
700 1 $aKIM, E.
700 1 $aWIGGANS, G. R.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 535 | |
| 82. |  | MARTINS, M. F.; PINTO, I. S. B.; FONSECA, I.; MACHADO, M. A.; ARBEX, W. A.; SILVA, M. V. G. B. Testes de paternidade em bovinos. Parte 2: interpretação dos resultados. O Girolando, v. 14, n. 78, p. 28-29, 2011.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 83. | | MELLO, F. de; MARTINS, M. F.; COBUCI, J. A.; SILVA, M. V. G. B.; BRACCINI NETO, J.; PAIVA, D. de S. Análise de diversidade genética do gene da osteopontina em bovinos da raça girolando. Revista Brasileira de Zootecnia, v. 40, n. 11, p. 2374-2377, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 84. | | RIBEIRO, V. M. P.; RAIDAN, F. S. S.; BARBOSA, A. R.; WINKELSTROTER, L. K.; SILVA, M. V. G. B.; TORAL, F. L. B. Avaliação genética multirracial via regressão aleatória com polinômios lineares do tipo spline. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 11., 2015, Santa Maria, RS. Melhoramento animal da academia ao campo: uma parceria em construção: anais. Santa Maria, RS: SBMA: UFSM, 2015. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 85. | | PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; EGITO, A. A. do; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Assessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data. Animal Genetics, v. 54, n. 3, p. 254-270, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 86. | | OTTO, P. I.; OLIVEIRA, R. A. de; NEGRI, R.; MELLO, F. C. B.; PANETTO, J. C. do C.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do período gestacional para a facilidade de partos em bovinos Girolando. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BOVINOCULTURA LEITEIRA, 9., 2023, Viçosa, MG. Anais... Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2023. p. 447-450. IX SIMLEITE.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 87. | | MEIRA, L. H. R.; PAIVA, D. S.; ALVINO, R. M.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R.; ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B. Avaliação do polimorfismo do gene da Beta-lactoglobulina na raça Girolando. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 88. | | GUIMARÃES, M. F. M.; FONSECA, I.; COSTA, G. C.; SILVA, P. V.; SILVA, M. V. G. B.; LEITE, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F. Análise da expressão gênica de IL-8 e TNF-@ em células do leite de vacas sadias e com mastite. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DO LEITE, 6., 2007, Resende. Anais... Juiz de Fora: Embrapa Gado de Leite, 2007. 1 CD.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 89. | | CARVALHO, L. S.; ALMEIDA, E. A. R.; SOUZA, K. G. L. de; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análise funcional de genes candidatos associados à resistência ao carrapato em bovinos da raça Gir. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 24-26.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 90. | | MIYATA, M.; GASPARINI, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; REGITANO, L. C. de A. Associação entre o marcador microssatélite ILSTS011 e peso ao nascimento no cromossomo 14 (BTA14) de bovinos. In: SIMPÓSIO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE MELHORAMENTO ANIMAL, 5., 2004, Pirassunuga, SP. Anais... Pirassunuga: SBMA, 2004.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 91. | | MELLO, F. de; PAIVA, D. de S.; COBUCI, J. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; BRACCINI NETO, J. Associação do gene Osteopontina com a produção de leite em animais da raça Girolando. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 8., 2010, Maringá. Melhoramento animal no Brasil: uma visão crítica - anais. Maringá: SBMA, 2010. 1 CD-ROM. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 92. | | SILVA, M. V. G. B. da; BERGMANN, J. A. G.; MARTINEZ, M. L.; PEREIRA, C. S.; FERRAZ, J. B. S.; SILVA, H. C. M. da. Associação genética, fenotípica e de ambiente entre medidas de eficiência reprodutiva e produção de leite na raça Holandesa. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, v. 27, n. 6, p. 1115-1122, 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 93. | | CARVALHAL, M.; SANT'ANNA, A.; SILVA, L. C. M.; FERREIRA, M. B. D. FERREIRA; SILVA, M. V. G. B.; COSTA, M. J. R. P. Da. Association between temperament and reproductive performance of Giroland bulls In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 1, 2016, Jaboticabal. Anais ... Jaboticabal: [s.n.], 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 94. | | MACHADO, J. D.; DALTRO, D. dos S.; PADILHA, A. H.; BRACCINI NETO, J.; SILVA, M. V. G. B.; COBUCI, J. A. Ajuste da curva de lactação de três grupos genéticos de Girolando. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 95. | | ARBEX, W. A.; MARTINS, M. F.; PEREIRA, L. G. R.; GUEDES, E.; ANDRADE, L. G. DE; COSTA, L. C. N.; SILVA, M. V. G. B. Aquecimento global, bovinos e caprinos: desafios e estudo. O Girolando, v. 14, n. 84, p. 48-50, 2012| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 96. | | VASCONCELOS, C. C. M. P. de; MCMANUS, C. M.; SOUZA, C. J. H. de; SILVA, M. V. G. B.; CAETANO, A. R.; PAIVA, S. R. Análise de paternidade com marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) em ovinos da raça Crioula Lanada. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 P.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 97. | | SANTOS, D. J.; BOISON, S. A.; UTSUNOMIYA, Y. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; TONHATI, H.; SÖLKNER, J.; SILVA, M. V. G. B. An approach to genomic analysis of longitudinal data using random regression In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 98. | | ARBEX, W. A.; GUIMARAES, M. F. M.; SILVA, M. V. G. B.; GUEDES, E.; ANDRADE, L. G. de; MUNIZ, M. N. M.; TAGLIATTI, R. F. Aprendizado de máquina, descoberta de conhecimento e mineração de dados: recursos da matemática e da computação traçando novos caminhos para a pesquisa agropecuária. O Girolando, Uberaba, v. 11, n. 74, p. 20-22, 2010.| Tipo: Artigo de Divulgação na Mídia |
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| 99. | | ALMEIDA, E. A. R.; PEREIRA, J. R.; CARVALHO, L. S.; SILVA, M. V. G. B.; MAGALHÃES, A. F. B.; VERARDO, L. L. Análises pós-estudo de associação no genoma de bovinos da raça Gir para a identificação de genes candidatos para perfil de ácidos graxos no leite. In: SIMPÓSIO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 7.; SIMPÓSIO DO PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO, 2.; SEMANA DA ZOOTECNIA, 15., 2023, Diamantina. Rumo ao futuro: [anais]. Diamantina: Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2023. p. 36-38.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 100. | | OLIVEIRA JUNIOR, G. A.; REY, F. S. B.; SILVA, M. V. G. B.; SANTANA, M. H. A.; ALEXANDRE, P. A.; ELER, J. P.; FERRAZ, J. B. S. Analysis of copy number variation regions in a Nellore population evaluated for feed efficiency. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 10., 2014, Vancouver. Proceedings... Champaign: ASAS, 2014. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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