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Biblioteca(s):  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Data corrente:  12/02/2015
Data da última atualização:  15/03/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Anais de Congresso
Autoria:  SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B.
Afiliação:  JOAQUIM MANOEL DA SILVA, Unemat, IB/Unicamp, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ OTAVIO CAMPOS DA SILVA, CNPGC; SAMUEL REZENDE PAIVA, SRI; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.
Título:  Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data.
Ano de publicação:  2014
Fonte/Imprenta:  In: PLANT & ANIMAL GENOME CONFERENCE, 22., 2014, San Diego, CA. [Abstracts]. San Diego: [s.n.], 2014.
Páginas:  Não paginado.
Idioma:  Inglês
Notas:  P553.
Conteúdo:  Genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping platforms have been widely used in studies in diverse areas, ranging from population genetics to applied genetic improvement and breeding. SNP genotyping data generated with these platforms can also be used for detecting and genotyping copy number variations (CNVs). CNVs are defined as a variable copy numbers of DNA segments ranging from 50bp to several megabases (Mbp), in comparison with a reference genome. Several studies have identified an abundance of CNVs in human and domestic animal genomes, where it has been shown that they are involved in phenotypic variability. This initial study reports a high resolution map of CNVs in Nelore beef cattle generated with the PennCNV software. CNVs were called in a dataset from 1709 animals of the Nelore breed genotyped with Illumina BovineHD BeadChip for a total of 735,242 markers. After non-restrictive quality filtering, a total of 246,290 CNVs were identified on autosomal chromosomes, representing 219,997 and 26,293 gain and loss events, respectively. CNVs lengths ranged from 20.02 Kb to 8.37 Mb with an average of 352 Kb and a median of 204.5 Kb. The number of SNPs in each detected CNV varied from 20 to 2,116 with an average of 104 and a median of 63. A total of 138,066 CNVs were present in regions with annotated genes.
Palavras-Chave:  Polimorfismo de nucleotídeo único.
Thesagro:  Gado de corte.
Thesaurus Nal:  Beef cattle; Nellore; Single nucleotide polymorphism.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/117503/1/Joaquim-Manoel-Silva-PAG-XXII-2014-ARC-CNVR.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CENARGEN35822 - 1UPCPC - DDSP 20682aSP 20682a
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Registros recuperados : 193
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61.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, A. M. G.; OLIVEIRA, S. M. A. de; SILVA, J. M. da; TERAO, D. Podridão por Fusicoccum em mangas submetidas a baixas doses de radiação gama. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 10, p. 1066-1072, out. 2010.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Unidades Centrais.
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62.Imagem marcado/desmarcadoKICHEL, A. N.; MIRANDA, C. H. B.; SILVA, J. M. da. O milheto (Pennisetum americanum (L.) Leek) como planta forrageira. In: WORKSHOP INTERNACIONAL DE MILHETO, 1999, Planaltina, DF. Anais... Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 1999. p.97-103. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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63.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, F. P.; THIAGO, L. R. L. de S.; CORRÊA, E. S.; SILVA, J. M. da. Nota sobre métodos de colheita do sorgo sacarino para produção de álcool. Brasília, DF : EMBRAPA-DID, 1981. 18 p. (EMBRAPA-CNPGC. Boletim de Pesquisa, 1).
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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64.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, R. S.; SILVA, J. M. da; ANDRADE NETO, R. de C. Ocorrência de Erythmelus tingitiphagus (Hymenoptera: Mymaridae) na bordadura de talhões de seringueira vizinha ao cerrado e mata ripária em Itiquira, MT. Revista de Agricultura, Piracicaba, v. 86, n. 3, p. 215-221, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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65.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. M. S. M; TALAMINI, V.; SILVA, J. M. da; BARBEDO, J. G. A. Obtenção de imagens e identificação dos sintomas das doenças bióticas e abióticas do coqueiro para inserção em programa de diagnose virtual. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 6., Aracaju, 2016. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. p. 21.
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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66.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, J. M. S. M; TALAMINI, V.; SILVA, J. M. da; BARBEDO, J. G. A. Obtenção de imagens e identificação dos sintomas das doenças bióticas e abióticas do coqueiro para inserção em programa de diagnose virtual. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA TABULEIROS COSTEIROS, 6., Aracaju, 2016. Anais... Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2016. p. 21.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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67.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, L. A. do; SILVA, J. M. da; WADT, P. G. S.; SILVA, D. J. Normas DRIS multivariadas para avaliação do estado nutricional da mangueira. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 7.; JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA FACEPE/UNIVASF, 1., 2012, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2012. p. 345-350. 1 CD-ROM. (Embrapa Semiárido. Documentos, 248).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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68.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, M. L. T. de; SILVA, J. M. da; MISSIO, R. F.; AGUIAR, A. V. de. Melhoramento de Pinus caribaea no Brasil. In: REUNIÃO PAULISTA DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 1; ENCONTRO SOBRE TEMAS DE GENETICA E MELHORAMENTO, 24., 2008, Piracicaba, SP. Impactos de Melhoramento de Plantas no Agronegócio. Piracicaba: ESALQ, Departamento de Genetica, 2008. p. 72-75.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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69.Imagem marcado/desmarcadoO'DONOVAN, P. B.; EUCLIDES, V. P. B.; SILVA, J. M. da. Nutritive value of Brachiaria decumbens and native pasture at various stages of maturity. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 17, n. 11, p. 1655-1670, nov. 1982. Título em português: Valor nutritivo de Brachiaria decumbens e pastos nativos em vários estádios de maturação.
Tipo: Artigo em Periódico Indexado
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Unidades Centrais.
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70.Imagem marcado/desmarcadoNUNES, S. G.; SILVA, J. M. da; ANDRADE, S. F. de; COELHO, G. C. de S. Produtividade de Panicum maximum jacq., linhagem k 187b e cultivar Coloniao sob pastejo. Campo Grande : EMBRAPA-CNPGC, 1985. 7p. (EMBRAPA-CNPGC. Pesquisa em Andamento, 29). CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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71.Imagem marcado/desmarcadoVALLE, L. S.; SILVA, J. M. da; BARROS, J. V. de. Producao animal em feno-em-pe de Brachiaria decembens durante o periodo seco. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 34., 1997, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora : SBZ, 1997. v.2. p.246-248. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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72.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, E. G.; SILVA, J. M. da; EUCLIDES, V. P. B. Proteina bruta e fibra em detergente neutro em Brachiaria decumbens sob pastejo. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 34., 1997, Juiz de Fora. Anais... Juiz de Fora : SBZ, 1997. v.2. p.261-263. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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73.Imagem marcado/desmarcadoTHIAGO, L. R. L. de S.; SILVA, J. M. da; COSTA, F. P.; CORREA, E. S. A ponta de cana na engorda de novilhos em confinamento. Agricultura Hoje, Rio de Janeiro, v.8, n.82, p.24-27, jul. 1982. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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74.Imagem marcado/desmarcadoNUNES, S. G.; SILVA, J. M. da; SCHENK, J. A. P. Problemas com cavalos em pastagens de humidicola. Campo Grande : EMBRAPA-CNPGC, 1990. 4p. (EMBRAPA-CNPGC. Comunicado Tecnico, 37). CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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75.Imagem marcado/desmarcadoAGUIAR, A. V. D.; SILVA, J. M. da; MORI, E. S.; MORAES, M. L. T. de. Seleção de genótipos superiores em um teste de progênies de Pinus caribaea var. caribaea. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11). Poster.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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76.Imagem marcado/desmarcadoEUCLIDES, V. P. B.; SILVA, J. M. da; O'DONOVAN, P. B. Suplementacao com feno. O Produtor Rural, Rio de Janeiro, v.2, n.13, p.13, out. 1985. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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77.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, J. C. de; GOMES. R. F. C.; SILVA, J. M. da; EUCLIDES, V. P. B. Suplementacao mineral de novilhos de corte em pastagens adubadas de capim-coloniao. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.20, n.2, p.259-269, fev. 1985.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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78.Imagem marcado/desmarcadoSOUSA, J. C. de; GOMES, R. F. C.; SILVA, J. M. da; EUCLIDES, V. P. B. Suplementacao mineral de novilhos em pastagens adubadas de capim-coloniao. In: REUNIAO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 21., 1984, Belo Horizonte. Anais. Belo Horizonte : SBZ, 1984. p.351. CNPGC.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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79.Imagem marcado/desmarcadoCATTO, J. B.; SILVA, J. M. da; SANTOS, S. A.; COMASTRI FILHO, J. Suplementação protéico-energética para vacas de corte sob pastejo na sub-região da Nhecolândia, Pantanal Sul Mato-Grossense. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 9, n.2, p. 309-320, abr./jun. 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pantanal.
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80.Imagem marcado/desmarcadoCARDOSO, E. G.; EUCLIDES, V. P. B.; SILVA, J. M. da. Stockpiling of Brachiaria decumbens for steer maintenance during dry season. In: INTERNATIONAL GRASSLAND CONGRESS, 17., 1993, Palmerston North. Proceedings... Palmerston North: New Zealand Grassland Association, 1993. v. 3. p. 2002-2003.
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte.
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