| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
|
Data corrente: |
05/02/2024 |
|
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
DUARTE, M. F.; ANDRADE, I. A. de; SILVA, J. M. F.; MELO, F. L. de; MACHADO, A. M.; INOUE-NAGATA, A. K.; NAGATA, T. |
|
Afiliação: |
MACÁRIA FERREIRA DUARTE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; IKARO ALVES DE ANDRADE, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; JOÃO MARCOS FAGUNDES SILVA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; FERNANDO LUCAS DE MELO, UNIVERSIDADE DE BRASILIA; ANA MARIA MACHADO, COMPANHIA DE SANEAMENTO AMBIENTAL DO DF; ALICE KAZUKO INOUE NAGATA, CNPH; TATSUYA NAGATA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA. |
|
Título: |
Metagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring. |
|
Ano de publicação: |
2023 |
|
Fonte/Imprenta: |
Tropical Plant Pathology, v. 48, p. 408-416, 2023. |
|
DOI: |
10.1007/s40858-023-00575-8 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Frequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study. MenosFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources.... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
High-throughput sequencing. |
|
Thesagro: |
Vírus. |
|
Thesaurus Nal: |
Wastewater. |
|
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
|
Marc: |
LEADER 02294naa a2200241 a 4500
001 2161643
005 2024-02-05
008 2023 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s40858-023-00575-8$2DOI
100 1 $aDUARTE, M. F.
245 $aMetagenomic analyses of plant virus sequences in sewage water for plant viruses monitoring.$h[electronic resource]
260 $c2023
520 $aFrequent monitoring of emerging viruses of agricultural crops is one of the most important missions for plant virologists. A fast and precise identifcation of potential harmful viruses may prevent the occurrence of serious epidemics. Nowadays, highthroughput sequencing (HTS) technologies became an accessible and powerful tool for this purpose. The major discussion of this strategy resides in the process of sample collection, which is usually laborious, costly and nonrepresentative. In this study, we assessed the use of sewage water samples for monitoring the widespread, numerous, and stable plant viruses using HTS analysis and RT-qPCR. Plant viruses belonged to 12 virus families were found, from which Virgaviridae, Solemoviridae, Tymoviridae, Alphafexiviridae, Betafexiviridae, losteroviridae and Secoviridae were the most abundant ones with more than 20 species. Additionally, we detected one quarantine virus in Brazil and a new tobamovirus species. To assess the importance of the processed foods as virus release origins to sewage, we selected two viruses, the tobamovirus pepper mild mottle virus (PMMoV) and the carlavirus garlic common latent virus (GarCLV), to detect in processed food materials by RT-qPCR. PMMoV was detected in large amount in pepper-based processed foods and in sewage samples, while GarCLV was less frequent in dried and fresh garlic samples, and in the sewage samples. This suggested a high correlation of virus abundance in sewage and processed food sources. The potential use of sewage for a virus survey is discussed in this study.
650 $aWastewater
650 $aVírus
653 $aHigh-throughput sequencing
700 1 $aANDRADE, I. A. de
700 1 $aSILVA, J. M. F.
700 1 $aMELO, F. L. de
700 1 $aMACHADO, A. M.
700 1 $aINOUE-NAGATA, A. K.
700 1 $aNAGATA, T.
773 $tTropical Plant Pathology$gv. 48, p. 408-416, 2023.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Agrobiologia. Para informações adicionais entre em contato com cnpab.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
|
Data corrente: |
17/08/2017 |
|
Data da última atualização: |
17/08/2017 |
|
Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
|
Autoria: |
OLIVEIRA, D. C. M. de. |
|
Afiliação: |
DAVID CASTOR MAXWEL DE OLIVEIRA, UFRRJ. |
|
Título: |
Plantio do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) em um Sistema Agroflorestal com Açaí, Mogno Africano e leguminosas arbóreas implantado há 10 anos em Seropédica, RJ. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
2016. |
|
Idioma: |
Português |
|
Notas: |
Dissertação. (Mestrado em Agricultura Orgânica) - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica. Orientação de Eduardo Francia Carneiro Campello. Co-orientação de José Guilherme Marinho Guerra. |
|
Conteúdo: |
Os sistemas agroflorestais (SAF) podem ser configurados como cultivos agroecológicos, onde a similaridade com as florestas em estrutura e função confere ao sistema uma maior sustentabilidade, tornando-os ambientalmente adequados. Este estudo avaliou um SAF com 10 anos de implantação, gerando informações sobre quanto as culturas de leguminosas fixadoras de nitrogênio influenciaram nas propriedades químicas do solo e na produção do sistema, quantificando a produção de palmito, o crescimento de plantas de Khaya ivorensis A. Chevalier e Euterpe oleracea Mart. plantados e o cultivo de feijão. O experimento estava localizado no Campo Experimental da Embrapa Agrobiologia, no município de Seropédica, do Rio de Janeiro. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso com cinco tratamentos e quatro repetições, com parcelas de 9 m x 9 m cada, totalizando 1.620 m2. Em todos os tratamentos existiam açaís plantados de 3 m x 3 m ao longo de todas as parcelas que também continham um mogno africano no centro de cada uma. Os tratamentos foram compostos por adubações verdes nas entrelinhas dos açaís, constituídos por Acacia angustissima (Mill.) Kuntze; Gliricidia sepium (Jacq.) Steud.; p adubação nitrogenada de cobertura com torta de mamona e o controle com vegetação espontânea. Para avaliação química do solo foram feitas duas coletas, uma antes e outra pós manejo da biomassa vegetal. Foi realizada a biometria das plantas de mogno africano, de açaí, e a quantificação da produção de palmito, onde foi possível perceber que essas culturas tiveram o crescimento prejudicado devido a falta de manejo, tendo em vista que houve menos competição nas parcelas sem leguminosas arbóreas, onde essas culturas de interesse atingiram maiores diâmetros e alturas, refletindo da mesma forma na produção de palmito. A adubação verde foi eficiente na ciclagem de nutrientes do solo, aumentando o teor da maioria dos elementos após um manejo e superando vegetação espontânea além de ter beneficiado a produção do feijoeiro. A inoculação com extrato de nódulos é capaz de aumentar a nodulação e o teor de nitrogênio da parte aérea do feijoeiro, porém não aumentou a produção de grãos. MenosOs sistemas agroflorestais (SAF) podem ser configurados como cultivos agroecológicos, onde a similaridade com as florestas em estrutura e função confere ao sistema uma maior sustentabilidade, tornando-os ambientalmente adequados. Este estudo avaliou um SAF com 10 anos de implantação, gerando informações sobre quanto as culturas de leguminosas fixadoras de nitrogênio influenciaram nas propriedades químicas do solo e na produção do sistema, quantificando a produção de palmito, o crescimento de plantas de Khaya ivorensis A. Chevalier e Euterpe oleracea Mart. plantados e o cultivo de feijão. O experimento estava localizado no Campo Experimental da Embrapa Agrobiologia, no município de Seropédica, do Rio de Janeiro. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso com cinco tratamentos e quatro repetições, com parcelas de 9 m x 9 m cada, totalizando 1.620 m2. Em todos os tratamentos existiam açaís plantados de 3 m x 3 m ao longo de todas as parcelas que também continham um mogno africano no centro de cada uma. Os tratamentos foram compostos por adubações verdes nas entrelinhas dos açaís, constituídos por Acacia angustissima (Mill.) Kuntze; Gliricidia sepium (Jacq.) Steud.; p adubação nitrogenada de cobertura com torta de mamona e o controle com vegetação espontânea. Para avaliação química do solo foram feitas duas coletas, uma antes e outra pós manejo da biomassa vegetal. Foi realizada a biometria das plantas de mogno africano, de açaí, e a quantificação da produção d... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Agrofloresta; Ciclagem de nutrientes. |
|
Thesagro: |
Adubação Verde. |
|
Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
|
Marc: |
LEADER 02997nam a2200157 a 4500
001 2074142
005 2017-08-17
008 2016 bl uuuu m 00u1 u #d
100 1 $aOLIVEIRA, D. C. M. de
245 $aPlantio do feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.) em um Sistema Agroflorestal com Açaí, Mogno Africano e leguminosas arbóreas implantado há 10 anos em Seropédica, RJ.$h[electronic resource]
260 $a2016.$c2016
500 $aDissertação. (Mestrado em Agricultura Orgânica) - Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica. Orientação de Eduardo Francia Carneiro Campello. Co-orientação de José Guilherme Marinho Guerra.
520 $aOs sistemas agroflorestais (SAF) podem ser configurados como cultivos agroecológicos, onde a similaridade com as florestas em estrutura e função confere ao sistema uma maior sustentabilidade, tornando-os ambientalmente adequados. Este estudo avaliou um SAF com 10 anos de implantação, gerando informações sobre quanto as culturas de leguminosas fixadoras de nitrogênio influenciaram nas propriedades químicas do solo e na produção do sistema, quantificando a produção de palmito, o crescimento de plantas de Khaya ivorensis A. Chevalier e Euterpe oleracea Mart. plantados e o cultivo de feijão. O experimento estava localizado no Campo Experimental da Embrapa Agrobiologia, no município de Seropédica, do Rio de Janeiro. O delineamento experimental adotado foi o de blocos ao acaso com cinco tratamentos e quatro repetições, com parcelas de 9 m x 9 m cada, totalizando 1.620 m2. Em todos os tratamentos existiam açaís plantados de 3 m x 3 m ao longo de todas as parcelas que também continham um mogno africano no centro de cada uma. Os tratamentos foram compostos por adubações verdes nas entrelinhas dos açaís, constituídos por Acacia angustissima (Mill.) Kuntze; Gliricidia sepium (Jacq.) Steud.; p adubação nitrogenada de cobertura com torta de mamona e o controle com vegetação espontânea. Para avaliação química do solo foram feitas duas coletas, uma antes e outra pós manejo da biomassa vegetal. Foi realizada a biometria das plantas de mogno africano, de açaí, e a quantificação da produção de palmito, onde foi possível perceber que essas culturas tiveram o crescimento prejudicado devido a falta de manejo, tendo em vista que houve menos competição nas parcelas sem leguminosas arbóreas, onde essas culturas de interesse atingiram maiores diâmetros e alturas, refletindo da mesma forma na produção de palmito. A adubação verde foi eficiente na ciclagem de nutrientes do solo, aumentando o teor da maioria dos elementos após um manejo e superando vegetação espontânea além de ter beneficiado a produção do feijoeiro. A inoculação com extrato de nódulos é capaz de aumentar a nodulação e o teor de nitrogênio da parte aérea do feijoeiro, porém não aumentou a produção de grãos.
650 $aAdubação Verde
653 $aAgrofloresta
653 $aCiclagem de nutrientes
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
