| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
|
Data corrente: |
17/09/2007 |
|
Data da última atualização: |
18/02/2008 |
|
Autoria: |
AMARAL, P. de P. R.; ALVES, P. C. M.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; CAPDEVILLE, G. de; SOUZA JÚNIOR, M. T. |
|
Título: |
Identification and characterization of a Resistence Gene Analog (RGA) from the Caricaceae Dumort family. |
|
Ano de publicação: |
2006 |
|
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 28, n. 3, p. 458-462, dez. 2006. |
|
ISSN: |
0100-2945 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
The majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); V cauliflora C papaya; Papaya. MenosThe majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases.
Cri... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
cauliflora; Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); Papaya. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02300naa a2200241 a 4500
001 1654024
005 2008-02-18
008 2006 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0100-2945
100 1 $aAMARAL, P. de P. R.
245 $aIdentification and characterization of a Resistence Gene Analog (RGA) from the Caricaceae Dumort family.
260 $c2006
520 $aThe majority of cloned resistance (R) genes characterized so far contain a nucleotide-binding site (NBS) and a leucine-rich repeat (LRR) domain, where highly conservrd motifs are found. Resistance genes analogs (RGAs) are genetic markers obtained by a PCR-based strategy using degenerated oligonucleotide primers drawn from these highlyconserved "motifs". This strategy has the advantage of the high degree of structural and amino acid sequence conservation that is observed in R genes. The objective of the present study was to search for RGAs in Carica papaya L. and Vasconcellea cauliflora Jacq. A. DC. Out of three combinations of primers tested, only one resulted in amplification. The amplified product was cloned in pCR2.1TOPO and than sequenced using M13 forward and reserve primers. Forty-eight clones were sequenced from each species. The 96 sequencies generated for each species were cleaned of vector sequences and clustered using CAP3 assembler. From the GENEBANK, one RGA was identified in C. papaya showing a BlastX e-value of 2x10-61 to the gb[AAP45165.1] putative disease resistant protein RGA3 (Solanum bulbocastanum). To the extent of our knowledge this is the first report of a RGA in the Caricaceae Dumort Family. Preliminary structural studies were performed to further characterize this putative NBS-LRR type protein. Efforts to search for other RGAs in papaya should continue, mostly to provide basis for the development of transgenic papaya with resistance to diseases. Cricaceae; Nucleotide-binding site (NBS); V cauliflora C papaya; Papaya.
653 $acauliflora
653 $aCricaceae
653 $aNucleotide-binding site (NBS)
653 $aPapaya
700 1 $aALVES, P. C. M.
700 1 $aMARTINS, N. F.
700 1 $aSILVA, F. R. da
700 1 $aCAPDEVILLE, G. de
700 1 $aSOUZA JÚNIOR, M. T.
773 $tRevista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal$gv. 28, n. 3, p. 458-462, dez. 2006.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 169 | |
| 62. |  | MEHTA, A.; RABELLO, A. R.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SILVA, F. R. da; COSTA, M. M. C.; TOGAWA, R. C.; FERREIRA, M. E. Biblioteca subtrativa de cDNA de plantas de arroz (Oryza sativa L. ) submetidas ao estresse hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 440.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
|    |
| 64. | | CORDEIRO, M. C. R.; SILVA, F. R. da; FRAGOSO, R. da R.; OLIVEIRA, J. da S.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FALEIRO, F. G.; COSTA, A. M. Caracterização do gene ácido cafeico-O-Methyl Transferase de Passiflora tenuifila. In: SIMPÓSIO LATINO AMERICANO DE CIÊNCIA DE ALIMENTOS, 12., 2017, Campinas. Ciência de alimentos e seu impacto no mundo em transformação: trabalhos. Campinas: UNICAMP, 2017. Ref. 71321.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
|  |
| 65. | | CAETANO, P.; PAES, N. S.; SALES, R. M. O. B.; SILVA, F. R. da; CARNEIRO, R. M. D.; GROSSI DE SÁ, M. F.; MEHTA, A. Caracterização de bibliotecas subtrativas de c.DNA de genótipos suscetível e resistente de algodão infectados com Meloidogyne incognita. Nematologia Brasileira, Brasília, v. 31, n. 2, p. 152, 2007. Edição dos resumos do XXVII Congresso Brasileiro de Nematologia, Goiânia, GO, maio 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 66. | | SILVA, F. R. da; BITTENCOURT, D. M. de C.; LACORTE, C. C.; ANDRADE, A. C.; VERZA, N. C.; RECH FILHO, E. L. BioPol: an integrated resource for spider EST sequences abundant on brazilian biodiversity. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 17., 2009, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2009. p784| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 67. | | BARROS, E. V. S. A.; LECOULS, A. C.; OLIVEIRA, P. E. F.; SILVA, F. R. da; CARNEIRO, R. M. D. G.; FERNANDEZ, D.; GROSSI de SÁ, M. F. Construção e análise de uma biblioteca subtrativa de cDNAs de plantas Coffea arabica inoculada e não inoculada com o nematóide da galha Meloidogyne paranaensis. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 449.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 68. | | VINECKY, F.; VIEIRA, N. G.; FERREIRA, D. L. A.; FREIRE, L. P.; MARRACCINNI, P.; SILVA, F. R. da; ANDRADE, A. C. Construção de macroarranjos de cDNA de café, para a identificação de genes de interesse agronômico. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 70. | | ARAÚJO, M. M. de; CASSIANO, L. P.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; BUZAR, A. G.; TOGAWA, R. C.; SILVA, F. R. da; SOUZA JÚNIOR, M. T. MASBP56 - a banana (Musa acuminata) homologue of mammalian selenium-binding protein. In: SC. Bananicultura: um negócio sustentável. [S.l.]: ACORBAT, 2006. Editores: Eliséo Soprano, Fernando Adami Tcacenco, Luiz Alberto Lichtemberg, Maurício Cesar Silva. p. 308.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 72. | | SATO, J. H.; RABELLO, F. R.; SCHMIDT, A. B.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SILVA, F. R. da; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Expressão diferencial de genes potencialmente envolvidos na tolerância à seca pela análise de bibliotecas subtrativas de cDNA de arroz (Oryza sativa). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 262.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 73. | | SATO, J. H.; RABELLO, F. R.; SCHMIDT, A. B.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SILVA, F. R. da; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Expressão diferencial de genes potencialmente envolvidos na tolerância à seca pela análise de bibliotecas subtrativas de cDNA de arroz (Oryza sativa). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 74. | | MEHTA, A.; ANDRADE, A. E.; GUIMARÃES, L. M.; FRAGOSO, R.; CARNEIRO, R. M. D.; SILVA, F. R. da; OLIVEIRA, J. T. A. de; SÁ, M. F. G. de. Expressão diferencial de genes em raízes de feijão de corda (Vigna unguiculata) infectadas com o nematóide Meloidogyne incognita. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. Anais... Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste: 2006. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 75. | | RABELLO, A. R.; BOITEUX, M. E. N. F.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SILVA, F. R. da; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Expressão diferencial em genótipos contrastantes de Oryza sativa L. para a tolerância a seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. p. 283| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| 76. | | RABELLO, A. R.; BOITEUX, M. E. N. F.; RANGEL, P. H. N.; GUIMARÃES, C. M.; SILVA, F. R. da; FERREIRA, M. E.; MEHTA, A. Expressão diferencial em genótipos contrastantes de Oryza sativa L. para a tolerância a seca. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia. Resumos... Águas de Lindóia: Sociedade Brasileira de Genética, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
| |
| 77. | | PASSOS, M. C. dos; OLIVEIRA, A. D. de; RIBEIRO, F. C.; LIMA, A. S.; SILVA, F. R. da C.; MENDONÇA, S. R. L. de. Emissão de óxido nitroso em latossolo sob cultivos de eucalipto e vegetação de Cerrado. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE LA CIENCIA DEL SUELO, 20.; CONGRESO PERUANO DE LA CIENCIA DEL SUELO, 16., 2014, Cusco. Educar para preservar el suelo y conservar la vida en la tierra. Cusco: Centro de Convenciones de la Municipalidad del Cusco, 2014. 1 Pendrive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 78. | | SANTOS, I. L. dos; OLIVEIRA, A. D. de; FIGUEIREDO, C. C. de; CEOLIN, J. G. R.; SILVA, F. R. da C.; SOUSA, C. A. N. de. Emissões de óxido nitroso do solo com resíduos culturais de soja sob sistemas de manejo no Cerrado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 35., 2015, Natal. O solo e suas múltiplas funções: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2015. Disponível online.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 79. | | FERREIRA, D. N. M.; MARSARO JÚNIOR, A. L.; SILVA, F. R. da; GONDIM JÚNIOR, M. G. C.; MORAES, G. J. de. First report of the red palm mite, Raoiella indica Hirst (Acari: Tenuipalpidae), in Brazil. Neotropical Entomology, Londrina, v. 40, n. 3, p. 409-411, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Trigo. |
| |
| 80. | | PROITE, K.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; BERTIOLI, D. J.; MORETZSOHN, M. C.; SILVA, F. R. da; MARTINS, N. F.; GUIMARÃES, P. M. ESTs from a wild Arachis species for gene discovery and marker development. BMC Plant Biology, v. 7, n. 7, online, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
| Registros recuperados : 169 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
