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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
25/10/2017 |
Data da última atualização: |
06/05/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
MOURA, C. J. M. de; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; SILVA, F. N. da; NICKEL, O. |
Afiliação: |
Cátia Jacira Martins de Moura, 1Biological Institute ? Dept. of Plant Pathology ? Lab. of Plant Virology, Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252 ? 04014-900 ? São Paulo, SP ? Brazil.; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; Marcelo Eiras, 1Biological Institute ? Dept. of Plant Pathology ? Lab. of Plant Virology, Av. Conselheiro Rodrigues Alves, 1252 ? 04014-900 ? São Paulo, SP ? Brazil.; Fábio Nascimento da Silva, 3Santa Catarina State University/Centre of Agroveterinary Sciences, Av. Luiz de Camões, 2090 ? 88520-000 ? Lages, SC ? Brazil.; OSMAR NICKEL, CNPUV. |
Título: |
Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area. |
Ano de publicação: |
2018 |
Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, Brasília,DF, v. 75, n. 1, p.43-51, jan./feb. 2018. |
DOI: |
10.1590/1678-992X-2016-0328 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by realtime RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and multiple infections, ranging from 15 % up to 76 %. Eight isolates of GSyV-1 and six of GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing and a variability study showed nucleotide identities ranging from 91 % to 99 % (GSyV-1) and from 98 % to 100 % (GLRaV-3) among themselves, respectively. Comparisons between conventional and real-time RT-PCR detections were implemented for GSyV-1 and GLRaV-3 infections. Analysis of genetic variability indicated molecular differences between GSyV-1 and GLRaV-3 isolates and negative selection acting on the coat protein gene of both viruses. This is the first report of GSyV-1 in commercial vineyards in Brazil. The survey revealed widespread infections of seven important pathogens in one prominent Brazilian grape-producing region implying contaminated grapevine cuttings in the spread of disease. Keywords: Vitis, diagnosis, variability, incidence, leafroll MenosThe aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by realtime RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and multiple infections, ranging from 15 % up to 76 %. Eight isolates of GSyV-1 and six of GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing and a variability study showed nucleotide identities ranging from 91 % to 99 % (GSyV-1) and from 98 % to 100 % (GLRaV-3) among themselves, respectively. Comparisons between conventional and real-time RT-PCR detections were implemented for GSyV-1 and GLRaV-3 infections. Analysis of genetic variability indicated molecular differences between GSyV-1 and GLRaV-3 isolates and negative selection acting on the coat protein gene of both viruses. This is the first report of GSyV-1 in commercial vineyards in Brazil. The survey revealed widespread infections of seven important pat... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Caracterização molecular; Cultivo de uva; Diagnosis; Leafroll; Variabilitty; Videira; Vírus em videira. |
Thesagro: |
DOença de planta; Uva. |
Thesaurus Nal: |
incidence; Vitis. |
Categoria do assunto: |
A Sistemas de Cultivo |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/165554/1/SA-Molecular-characterization-GSyV1-and-GLRaV3-2018.pdf
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Marc: |
LEADER 02596naa a2200313 a 4500 001 2078147 005 2019-05-06 008 2018 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1590/1678-992X-2016-0328$2DOI 100 1 $aMOURA, C. J. M. de 245 $aMolecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area.$h[electronic resource] 260 $c2018 520 $aThe aims of this study were to determine the prevalence of viruses in 119 samples from 32 grapevine cultivars, collected from nine vineyards in a specific grape-growing area in southeastern Brazil, perform a partial molecular characterization of 14 isolates of Grapevine Syrah virus 1 (GSyV-1) and Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) and assess the coat protein genetic variability of these viruses. The detection of viruses was implemented by realtime RT-PCR (reverse transcription polymerase chain reaction) aiming to detect seven viruses and one viroid. With the exception of the Grapevine Cabernet Sauvignon reovirus (GCSV), the viruses and viroid that were evaluated were widespread in the sampled areas, often in high prevalence and multiple infections, ranging from 15 % up to 76 %. Eight isolates of GSyV-1 and six of GLRaV-3, partially characterized by complete coat protein gene nucleotide sequencing and a variability study showed nucleotide identities ranging from 91 % to 99 % (GSyV-1) and from 98 % to 100 % (GLRaV-3) among themselves, respectively. Comparisons between conventional and real-time RT-PCR detections were implemented for GSyV-1 and GLRaV-3 infections. Analysis of genetic variability indicated molecular differences between GSyV-1 and GLRaV-3 isolates and negative selection acting on the coat protein gene of both viruses. This is the first report of GSyV-1 in commercial vineyards in Brazil. The survey revealed widespread infections of seven important pathogens in one prominent Brazilian grape-producing region implying contaminated grapevine cuttings in the spread of disease. Keywords: Vitis, diagnosis, variability, incidence, leafroll 650 $aincidence 650 $aVitis 650 $aDOença de planta 650 $aUva 653 $aCaracterização molecular 653 $aCultivo de uva 653 $aDiagnosis 653 $aLeafroll 653 $aVariabilitty 653 $aVideira 653 $aVírus em videira 700 1 $aFAJARDO, T. V. M. 700 1 $aEIRAS, M. 700 1 $aSILVA, F. N. da 700 1 $aNICKEL, O. 773 $tScientia Agricola, Brasília,DF$gv. 75, n. 1, p.43-51, jan./feb. 2018.
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Registro original: |
Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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Registros recuperados : 49 | |
2. | | STEMPKOWSKI, L. A.; PEREIRA, F. S.; RODRIGUES, O.; LAU, D.; KUHNEM, P.; SILVA, F. N. da. Aplicação de nitrogênio em cobertura como alternativa ao manejo do mosaico-comum na cultura do trigo. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 12., 2018, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Projeto Passo Fundo, 2019. Fitopatologia, p. 322-326.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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4. | | NICKEL, O.; FAJARDO, T. V. M.; BERNARDI, J.; SINSKI, I.; SILVA, F. N. DA; BOGO, A. Ocorrência de vírus em morangos no Rio Grande do Sul e detecção biológica e molecular. In: SIMPÓSIO NACIONAL DO MORANGO, 3.; ENCONTRO SOBRE PEQUENAS FRUTAS E FRUTAS NATIVAS DO MERCOSUL, 2., 2006, Pelotas. Resumos... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2006. (Embrapa Clima Temperado. Documentos, 167). 1 CD-ROM. Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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6. | | BALBINOTTE, J.; NICKEL, O.; SILVA, F. N. da; RADAELLI, P.; VANNI, M. F.; FAJARDO, T. V. M. Avaliação de incidência de Peach latent mosaic virus em pessegueiros e nectarineiras das principais regiões produtoras do Rio Grande do Sul. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA UVA E VINHO, 5., ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 1., 2007, Bento Gonçalves. Resumos. Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2007. p. 31. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 63). Resumo.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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8. | | WINKEL, T. F.; WOLFF, L. F.; SILVA, F. N. da; BEZZERRA, A. J. A.; NASCIMENTO, S. G. S. Buscando a construção social dos mercados: a experiência da cooperativa coomelca no Sul do RS. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 25.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 2., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2016.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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9. | | MENDES, A. M. S.; OLSZEVSKI, N.; SILVA, F. N. da; MENDES, R. L.; BRITO, L. T. de L. Impactos ambientais causados pelo uso de fertilizantes agrícolas. In: BRITO, L. T. de L.; MELO, R. F. de; GIONGO, V. (Ed.). Impactos ambientais causados pela agricultura no Semiárido brasileiro. Petrolina: Embrapa Semiárido, 2010. cap. 3, p. 55-99.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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10. | | MOURA, C. J. M. de; FAJARDO, T. V. M.; EIRAS, M.; SILVA, F. N. da; NICKEL, O. Molecular characterization of GSyV-1 and GLRaV-3 and prevalence of grapevine viruses in a grape-growing area. Scientia Agricola, Brasília,DF, v. 75, n. 1, p.43-51, jan./feb. 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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11. | | NUNES, C. C.; ALVES, S. A. M.; BOGO, A.; CASA, R. T.; CZERMAINSKI, A. B. C.; SILVA, F. N. da. Optimal conditions for conidial germination and infection of European pear leaves by Diplocarpon mespili. Tropical Plant Pathology, v. 41, n. 2, p. 78-83, April 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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14. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; BOGO, A.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Caracterização molecular do vírus da espiga branca do trigo no Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021, Passo Fundo. Atas e resumos. Castro: Fundação ABC, 2021. p. 276-279.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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15. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; BOGO, A.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Caracterização molecular do vírus da espiga branca do trigo no Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021. Atas e resumos... Castro: Fundação ABC: Passo Fundo: Biotrigo Genética, 2021. p. 276-279.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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16. | | PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; BOGO, A.; SILVA, F. N. da. Caracterização molecular do vírus da espiga branca do trigo no Brasil. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021, Passo Fundo. Atas e Resumos... Passo Fundo: Fundação ABC/Biotrigo Genética, 2021. p. 276-279.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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17. | | STEMPKOWSKI, L. A.; PAREIRA, F. S.; LAU, D.; RODRIGUES, O.; COSTENARO, E. R.; KUHNEM, P.; SILVA, F. N. da; CASA, R. T. Contribuição da resistência genética e fertilização nitrogenada na redução de danos causados pelo mosaico-comum do trigo. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 14., 2021. Atas e Resumos... Castro: Fundação ABC: Passo Fundo: Biotrigo Genética, 2021. p. 260-265.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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18. | | STEMPKOWSKI, L. A.; PEREIRA, F. S.; VALENTE, J. B.; LAU, D.; RODRIGUES, O.; DALMAGO, G. A.; SANTI, A.; KUHNEM, P.; CASA, R. T.; SILVA, F. N. da. Cultural practices effects on a Soil-Borne Wheat Mosaic Disease in Southern Brazil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VIROLOGIA, 29.; ENCONTRO DE VIROLOGIA DO MERCOSUL, 13., 2018, Gramado. Resumos... Brasília, DF: SBV, 2018. p. 285-286.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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19. | | STEMPKOWSKI, L. A.; NASCIMENTO, S. C. do; MAR, T. B.; GONÇALVES, N. P.; LAU, D.; MELLO, R. N. de; SILVA, F. N. da; ZERBINI, F. M. Diversidade genética de Polymyxa graminis infectando arroz e trigo no sul do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FITOPATOLOGIA, 53., 2023, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Fitopatologia, 2023. p. 680.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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20. | | CAMPOS, M. L.; SILVA, F. N. da; FURTINI NETO, A. E.; GUILHERME, L. R. G.; MARQUES, J. J.; ANTUNES, A. S. Determinação de cádmio, cobre, cromo, níquel, chumbo e zinco em fosfatos de rocha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 4, p. 361-367, abr. 2005 Título em inglês: Determination of cadmium, copper, chromium, nickel, lead and zinc in rock phosphates.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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