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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Trigo; Embrapa Uva e Vinho. |
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Data corrente: |
06/03/2019 |
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Data da última atualização: |
06/03/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
VALENTE, J. B.; PEREIRA, F. S.; STEMPKOWSKI, L. A.; FARIAS, M.; KUHNEM, P.; LAU, D.; FAJARDO, T. V. M.; NHANI JUNIOR, A.; CASA, R. T.; BOGO, A.; SILVA, F. N. da. |
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Afiliação: |
UDESC; UDESC; UDESC; UDESC; BIOTRIGO; DOUGLAS LAU, CNPT; THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; ANTONIO NHANI JUNIOR, CNPTIA; UDESC; UDESC; UDESC. |
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Título: |
A novel putative member of the family Benyviridae is associated with soilborne wheat mosaic disease in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Pathology, v. 68, n. 3, p. 588-600, Apr. 2019. |
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DOI: |
10.1111/ppa.12970 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Soilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae. WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identities, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae. However, isolates of WhSMV formed a clade distinct from members of the genus Benyvirus. It was also demonstrated that the plasmodiophorid Polymyxa graminis is associated with wheat roots showing SBWMD symptoms and infected by WhSMV. Keywords: Benyviridae, mosaic symptoms, next-generation sequencing, Polymyxa graminis, Triticum aestivum, wheat stripe mosaic virus MenosSoilborne wheat mosaic disease (SBWMD), originally attributed to infections by Soilborne wheat mosaic virus (SBWMV) and Wheat spindle streak mosaic virus (WSSMV), is one of the most frequent virus diseases and causes economic losses in wheat in southern Brazil. This study aimed to characterize molecularly the viral species associated with wheat plants showing mosaic symptoms in Brazil. Wheat leaves and stems displaying mosaic symptoms were collected from different wheat cultivars in Passo Fundo municipality, Rio Grande do Sul State, southern Brazil. Double-stranded RNA was extracted and submitted to cDNA library synthesis and next-generation sequencing. No sequences of SBWMV and WSSMV were detected but the complete genome sequence of a putative new member of the family Benyviridae was determined, for which the name wheat stripe mosaic virus (WhSMV) is proposed. WhSMV has a bipartite genome with RNA 1 and RNA 2 organization similar to that of viruses belonging to Benyviridae. WhSMV RNA 1 has a single open reading frame (ORF) encoding a polyprotein with putative viral replicase function. WhSMV RNA 2 has six ORFs encoding the coat protein, the major protein (read-through), triple gene block movement proteins (TGB 1, 2 and 3) and ORF 6 (hypothetical protein). In addition to the genomic organization and nucleotide and amino acid sequence identities, phylogenetic analyses also corroborated that WhSMV is a virus species of the Benyviridae. However, isolates of WhSMV formed a clade ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Benyviridae; Bioinformática; Mosaic symptoms; Next-generation sequencing; Vírus do mosaico de trigo; Wheat stripe mosaic virus. |
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Thesagro: |
Doença de Planta; Mosaico; Polymyxa Graminis; Trigo; Triticum Aestivum. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Plant diseases and disorders; Soil-borne wheat mosaic virus. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193668/1/ID44548-2019v68n3p588PantPathol.pdf
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Marc: |
LEADER 03056naa a2200421 a 4500
001 2106700
005 2019-03-06
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Registro original: |
Embrapa Trigo (CNPT) |
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| Registros recuperados : 15 | |
| 2. |  | SCAGLIUSI, S. M. M.; CIMA, F. F. Otimização de protocolo para produção de plantas duplo-haploides de trigo através da cultura de micrósporos isolados. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 8.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 9., 2014, Canela; REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 9.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 10., 2015, Passo Fundo. Anais... Passo Fundo: Biotrigo Genética: Embrapa Trigo, 2015. 2014 - Melhoramento, Aptidão industrial e Sementes - Trabalho 97. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 3. | | CIMA, F. F.; ROCHA, D.; TERRES, L.; AZEVEDO, F. Q.; VIZZOTTO, M.; PEREIRA, A. da S. Potencial produtivo e peso específico de clones de batata coloridos. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 5., 2014, Pelotas. Qual o papel da ciência na agricultura familiar?: anais. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2015. 120 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 4. | | WOLTER, D. D.; CIMA, F. F.; CASAGRANDE, C.; RODRIGUES, A. da S.; AZEVEDO, F. Q.; PEREIRA, A. da S. Aptidão para fritura e sensibilidade ao esverdeamento de tubérculos de clones avançados de batata. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 24.; SEMANA INTEGRADA ENSINO PESQUISA EXTENSÃO da UFPel, 2015, Pelotas. [Anais.]. Pelotas: UFPel, 2015. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | WOLTER, D. D.; CIMA, F. F.; LENZ, E. A.; SILVA, T. A.; AZEVEDO, F. Q.; PEREIRA, A. da S. Carcteres de producción de clones de papa en la cosecha de otoño en el sur de Brasil. Journal of Basic & Applied Genetics, v. 27, n. 1, p. 297, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | SILVA, T. A. da; LENZ, E. A.; CIMA, F. F.; WOLTER, D. D.; CASAGRANDE, C.; PEREIRA, A. da S. Concentração de glicose em genótipos de batata durante o armazenamento. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS, 20., 2016, Lavras. Fenômica: A nova era dos dados biométricos: anais. Lavras: UFLA, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 8. | | ROHR, L. P.; SILVA, T. A. da; CIMA, F. F.; WOLTER, D. D.; PEREIRA, A. da S. Qualidade industrial de clones de batata. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 26.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 19.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 3., 2017, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 9. | | WOLTER, D. D.; COILA, V. H. C.; CIMA, F. F.; GOMES, C. B.; PEREIRA, A. da S. Resistência de genotipos de batata (Solanum tuberosum L.) A Phytophthora infestans (Mont.) de Bary. In: CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 25.; ENCONTRO DE PÓS-GRADUAÇÃO UFPEL, 18.; SEMANA INTEGRADA DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO, 2., 2016, Pelotas. Anais... Pelotas: UFPel, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 10. | | LENZ, E. A.; SILVA, T. A. da; CIMA, F. F.; WOLTER, D. D.; SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S. Acúmulo de glicose em clones avançados de batata sob armazenamento a baixa temperatura. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE ATUALIZAÇÃO EM GENÉTICA E MELHORAMENTO DE PLANTAS, 20., 2016, Lavras. Fenômica: A nova era dos dados biométricos: anais. Lavras: UFLA, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 11. | | LENZ, E. A.; RODRIGUES, A. de S.; CASAGRANDE, C.; AZEVEDO, F. Q.; CIMA, F. F.; SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S. Caracteres de produção, peso específico e aparência de tubérculos de clones avançados de batata. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 5., 2014, Pelotas. Qual o papel da ciência na agricultura familiar?: anais. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2015. 120 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 12. | | WOLTER, D. D.; CIMA, F. F.; AZEVEDO, F. Q.; CASAGRANDE, C.; RODRIGUES, A. da S.; SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S. Potencial produtivo de dois clones com aptidão à fritura. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA CLIMA TEMPERADO, 5., 2014, Pelotas. Qual o papel da ciência na agricultura familiar?: anais. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2015. 120 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 13. | | CIMA, F. F.; CERIOLI, M. de F.; RODRIGUES, A. da S.; WOLTER, D. D.; SILVA, G. O. da; PEREIRA, A. da S. Tamanho do recipiente na expressão de caracteres de aparência geral de tubérculos nas gerações iniciais de seleção. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: Universidade Federal de Goias, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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