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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Café; Embrapa Florestas. |
Data corrente: |
06/01/2021 |
Data da última atualização: |
27/01/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
DEL CONTE, M. V.; CARNEIRO, P. C. S.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. L. da; PETERNELLI, L. A. |
Afiliação: |
MURILO VIOTTO DEL CONTE, UFV; PEDRO CRESCÊNCIO SOUZA CARNEIRO, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa; FELIPE LOPES DA SILVA, UFV; LUIZ ALEXANDRE PETERNELLI, UFV. |
Título: |
Overcoming collinearity in path analysis of soybean [Glycine max (L.) Merr.] grain oil content. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
PLoS ONE, v. 15, n. 5, e0233290, 2020. 15 p. |
DOI: |
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0233290 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Path analysis allows understanding the direct and indirect effects among traits. Multicollinearity in correlation matrices may cause a bias in path analysis estimates. This study
aimed to: a) understand the correlation among soybean traits and estimate their direct and indirect effects on gain oil content; b) verify the efficiency of ridge path analysis and trait culling to overcome colinearity. Three different matrices with different levels of collinearity were obtained by trait culling. Ridge path analysis was performed on matrices with strong collinearity; otherwise, a traditional path analysis was performed. The same analyses were run on a simulated dataset. Trait culling was applied to matrix R originating the matrices R1 and R2. Path analysis for matrices R1 and R2 presented a high determination coefficient (0.856 and 0.832, respectively) and low effect of the residual variable (0.379 and 0.410 respectively). Ridge path analysis presented low determination coefficient (0.657) and no direct effects greater than the effects of the residual variable (0.585). Trait culling was more effective to overcome collinearity. Mass of grains, number of nodes, and number of pods are promising for indirect selection for oil content. |
Palavras-Chave: |
Coefficient; Components; Maturity; Multicollinearity; Seed protein; Software; Yield. |
Thesagro: |
Melhoramento Genético Vegetal; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Plant breeding. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/219910/1/Marcos-Deon-pone.0233290.pdf
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Marc: |
LEADER 02124naa a2200301 a 4500 001 2129613 005 2021-01-27 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1371/journal.pone.0233290$2DOI 100 1 $aDEL CONTE, M. V. 245 $aOvercoming collinearity in path analysis of soybean [Glycine max (L.) Merr.] grain oil content.$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aPath analysis allows understanding the direct and indirect effects among traits. Multicollinearity in correlation matrices may cause a bias in path analysis estimates. This study aimed to: a) understand the correlation among soybean traits and estimate their direct and indirect effects on gain oil content; b) verify the efficiency of ridge path analysis and trait culling to overcome colinearity. Three different matrices with different levels of collinearity were obtained by trait culling. Ridge path analysis was performed on matrices with strong collinearity; otherwise, a traditional path analysis was performed. The same analyses were run on a simulated dataset. Trait culling was applied to matrix R originating the matrices R1 and R2. Path analysis for matrices R1 and R2 presented a high determination coefficient (0.856 and 0.832, respectively) and low effect of the residual variable (0.379 and 0.410 respectively). Ridge path analysis presented low determination coefficient (0.657) and no direct effects greater than the effects of the residual variable (0.585). Trait culling was more effective to overcome collinearity. Mass of grains, number of nodes, and number of pods are promising for indirect selection for oil content. 650 $aPlant breeding 650 $aMelhoramento Genético Vegetal 650 $aSoja 653 $aCoefficient 653 $aComponents 653 $aMaturity 653 $aMulticollinearity 653 $aSeed protein 653 $aSoftware 653 $aYield 700 1 $aCARNEIRO, P. C. S. 700 1 $aRESENDE, M. D. V. de 700 1 $aSILVA, F. L. da 700 1 $aPETERNELLI, L. A. 773 $tPLoS ONE$gv. 15, n. 5, e0233290, 2020. 15 p.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Registros recuperados : 68 | |
3. | | BASSO, V. M.; JACOVINE, L. A. G.; ALVES, R. R.; SILVA, F. L. da. Contribuição da certificação florestal no cumprimento da legislação em plantações florestais. In: CONGRESSO BRASILEIRO SOBRE FLORESTAS ENERGÉTICAS, 1., 2009, Belo Horizonte. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2009. 1 CD-ROM. (Embrapa Florestas. Documentos, 178). Seção: Sustentabilidade Ambiental, Social e Econômica.Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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4. | | FELIPE, S. H. S.; SILVA, F. L. da; LEAO, N. V. M.; SHIMIZU, E. S. C. Comportamento germinativo de sementes de morototó armazenadas sob câmara fria analisadas em diferentes temperaturas e substratos. In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO, CIÊNCIA, ARTE E TECNOLOGIA, 1., 2010, Castanhal. [Educação, trabalho, cultura e inovação tecnológica para a sustentabilidade da Amazônia]. [Castanhal]: Instituto de Educação, Ciência e Tecnologia, 2010. SICAT 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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7. | | SILVA, F. L. da; CARVALHO, H. G. de; MARTIN, V. G.; LAMPERT, V. do N. Desenvolvimento de uma aplicação do tipo glossário com os principais indicadores utilizados na produção de bovinos de corte. In: SIMPÓSIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA PECUÁRIA SUL, 11., 2021, Bagé, RS. Resumos... Bagé: Embrapa Pecuária Sul, 2021. p. 8. (Embrapa Pecuária Sul. Eventos técnicos & científicos, 4). Ana Cristina Mazzocato, editora técnica.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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12. | | SILVA, F. L. da; FELIPE, S. H. S.; LEAO, N. V. M.; SHIMIZU, E. S. C. Teste de germinação de sementes de cumarú (Dipteryx odorata (Aubl.) Willd.) sob diferentes substratos e temperaturas. In: SEMANA DE INTEGRAÇÃO, CIÊNCIA, ARTE E TECNOLOGIA, 1., 2010, Castanhal. [Educação, trabalho, cultura e inovação tecnológica para a sustentabilidade da Amazônia]. [Castanhal]: Instituto de Educação, Ciência e Tecnologia, 2010. SICAT 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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14. | | FELIPE, S. H. S.; SILVA, F. L. da; LEAO, N. V. M.; SHIMIZU, E. S. C.; CUNHA, E. de S. Germinação de sementes de ipê amarelo em diferentes temperaturas e substratos. In: SEMANA ACADÊMICA DE ENGENHARIA FLORESTAL, 1., 2010, Belém, PA. 50 anos da Engenharia Florestal no Brasil: atualidades e perspectivas. Belém, PA: UFRA, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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15. | | ALKIMIM, E. R.; SOUSA, T. V.; SILVA, F. L. da; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CAIXETA, E. T. Identificação e validação de marcadores SNP em Coffea canephora usando sequenciamento de nova geração. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 9., 2017, Foz de Iguaçu. Melhoramento de plantas: projetando o futuro. Maringá, PR: SBMP, 2017. p. 552Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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19. | | SILVA, F. L. da; BARBOSA, M. H. P.; RESENDE, M. D. V. de; PETERNELLI, L. A.; PEDROZO, C. A. Efficiency of selection within sugarcane families via simulated individual BLUP. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 15, n. 1, p. 1-9, Jan./Mar. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Roraima. |
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Registros recuperados : 68 | |
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