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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






Registro Completo
Biblioteca(s):  Embrapa Café.
Data corrente:  10/01/2023
Data da última atualização:  10/01/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  EVANGELISTA, J. S. P. C.; PEIXOTO, M. A.; COELHO, I.; ALVES, R.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LAVIOLA, B.; BHERING, L. L.
Afiliação:  JENIFFER SANTANA PINTO COELHO EVANGELISTA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MARCOS ANTONIO PEIXOTO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; IGOR COELHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; RODRIGO ALVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPCa; FABYANO FONSECA E SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; BRUNO LAVIOLA, EMBRAPA AGROENERGIA; LEONARDO LOPES BHERING, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA.
Título:  Genetic evaluation and selection in jatropha curcas through frequentist and bayesian inferences.
Ano de publicação:  2022
Fonte/Imprenta:  Bragantia, v. 81, 2022.
Páginas:  12 p.
DOI:  https://doi.org/10.1590/1678-4499.20210262
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  An accurate and efficient statistical method for genetic evaluation is a key requirement for progress in any breeding program. Thus, the present study aimed to evaluate the performance of Frequentist and Bayesian inferences for repeated measures analysis in Jatropha curcas breeding. To this end, 730 individuals from 73 half-sib families were evaluated for grain yield trait, over six crop years. Frequentist and Bayesian analyses were made considering repeatability models with different residual variance structures. Variance components were estimated through restricted maximum likelihood (REML) and Markov Chain Monte Carlo (MCMC). Genetic values were predicted through best linear unbiased prediction (BLUP) and estimated through MCMC. Variance components and genetic and non-genetic parameters estimated by the Frequentist inference presented values similar to those estimated by the Bayesian inference. The selective accuracy presented high magnitude (0.84) by the Frequentist and Bayesian inferences, indicating high reliability. Confidence and highest posterior density (HPD) intervals were similar for the genetic parameters, however the HPD intervals range was slightly short. This study highlighted the importance of testing the residual variance structure and pointed out that the Frequentist and Bayesian inferences presented similar results when using non-informative prior. Then, both inferences can be efficiently applied in Jatropha curcas breeding.
Thesaurus Nal:  Bayesian theory; Genetic variance; Jatropha; Plant breeding; Plant selection guides.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1150826/1/Genetic-evaluation-and-selection.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Café (CNPCa)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
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1.Imagem marcado/desmarcadoNASCIMENTO, M.; SÁFADI, T.; SILVA, F. F. e. Aplicação da análise de agrupamento de dados de expressão gênica temporal a dados em painel. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 11, p. 1489-1495, nov. 2011 Título em inglês: Application of cluster analysis of temporal gene expression data to panel data.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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2.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Análise estatística da interação genótipo x ambientes e normas de reação. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 369-394.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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3.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Modelos lineares generalizados e dados categóricos. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 559-594.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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4.Imagem marcado/desmarcadoJUNQUEIRA, V. S.; LOPES, P. S.; LOURENCO, D.; SILVA, F. F. e; CARDOSO, F. F. Applying the metafounders approach for genomic evaluation in a multibreed beef cattle population. Frontiers in Genetics, v. 11, 556399, Dec. 2020. Article 556399.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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5.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. F. e; MUNIZ, J. A.; AQUINO, L. H. de; SÁFADI, T. Abordagem Bayesiana da curva de lactação de cabras Saanen de primeira e segunda ordem de parto. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 1, p. 27-33, jan. 2005 Título em inglês: Bayesian approach in the lactation curve of Saanen goats from first and second calving orders.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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6.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Análise de sobrevivência e dados censurados. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 595-626.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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7.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e. Análise estatística de dados longitudinais. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 312-368.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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8.Imagem marcado/desmarcadoROSSI, R. M.; MARTINS, E. N.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. e. Análise bayesiana univariada e bivariada para a conversão alimentar de suínos da raça Piau. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 10, p. 754-761, out. 2014. Título em inglês: Univariate and bivariate Bayesian analysis for feed conversion of the Piau swine breed.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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9.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, J. M. S.; FARIA, V. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de. Best linear unbiased prediction and family selection in crop species. Crop Science, v. 51, n. 6, p. 2371-2381, Nov./Dec. 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. F. e; VIANA, J. M. S.; FARIA, V. R.; RESENDE, M. D. V. de. Bayesian inference of mixed models in quantitative genetics of crop species. Theoretical and Applied Genetics, v. 126, p. 1749-1761, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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11.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, R. T.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; TAKAHASHI, E. K. Acurácia preditiva de testes clonais de Eucalyptus spp. utilizando efeitos aditivos do parentesco e validação cruzada. Scientia Forestalis, Piracicaba, v. 45, n. 113, p. 39-47, mar. 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, F. F. e; SÁFADI, T.; MUNIZ, J. A.; AQUINO, L. H. de; MOURÃO, G. B. Comparação bayesiana de modelos de previsão de diferenças esperadas nas progênies no melhoramento genético de gado Nelore. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 1, p. 37-45, jan. 2008
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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13.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, J. M. S.; FARIA, V. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de. Combined selection of progeny in crop breeding using best linear unbiased prediction. Canadian Journal of Plant Science, v. 92, p. 553-562, 2012.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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14.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, V. S. dos; MARTINS FILHO, S.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de. Uma aplicação do modelo de sobrevivência de Cox na seleção genômica ampla de suínos. Revista Matemática e Estatística em foco, v. 1, n. 2, 2013. Edição especial dos anais do Encontro Mineiro de Estatística, 12., 2013, Uberlândia. Resumo.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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15.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; RESENDE JÚNIOR, M. F. R. Genética de associação (GWAS). In: BORÉM, A.; FRITSCHE-NETO, R. (Ed.). Biotecnologia aplicada ao melhoramento de plantas. Viçosa, MG, 2013. p. 119-150
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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16.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e. Inferência bayesiana. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 449-503.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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17.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; RESENDE JÚNIOR, M. F. R. Seleção genômica ampla (GWS). In: BORÉM, A.; FRITSCHE-NETO, R. (Ed.). Biotecnologia aplicada ao melhoramento de plantas. Viçosa, MG, 2013. p. 151-188.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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18.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; LOPES, P. S.; AZEVEDO, C. F. Seleção genômica ampla (GWS) via modelos mistos (REML/BLUP), inferência Bayesiana (MCMC), regressão aleatória multivariada e estatística espacial. Viçosa, MG: UFV, 2012. 291 p. Livro eletrônico.
Tipo: Autoria/Organização/Edição de Livros
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19.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e. Seleção genômica. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência Bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 627-768.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Florestas.
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20.Imagem marcado/desmarcadoPÉRTILE, S. F. N.; SILVA, F. F. e; MOURÃO, G. B. Seleção e associação genômica ampla para o melhoramento genético animal com uso do método ssGBLUP. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 10, p. 1729-1736, out. 2016. Título eminglês: Genome?wide selection and association in animal breeding using ssGBLUP.
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