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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
13/08/2021 |
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Data da última atualização: |
29/12/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
TEIXEIRA, F. R. F.; NASCIMENTO, M.; CECON, P. R.; CRUZ, C. D.; SILVA, F. F. e; NASCIMENTO, A. C. C.; AZEVEDO, C. F.; MARQUES, D. B. D.; SILVA, M. V. G. B.; CARNEIRO, A. P. S.; PAIXAO, D. M. |
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Afiliação: |
Universidade Federal do Piauí; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; A.C.C. NASCIMENTO, Universidade Federal de Viçosa; Universidade Federal de Viçosa; D.B.D. MARQUES, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; A.P.S. CARNEIRO, Universidade Federal de Viçosa; Universidade de São Paulo. |
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Título: |
Genomic prediction of lactation curves of Girolando cattle based on nonlinear mixed models. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 20, n. 1, gmr18691, 2021. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.4238/gmr18691 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Knowledge of lactation curves in dairy cattle is essential for understanding the animal production in milk production systems. Genomic prediction of lactation curves represents the genetic pattern of milk production of the animals in the herd. In this context, we made genomic predictions of lactation curves through genome-wide selection (GWS) to characterize the genetic pattern of lactation traits in Girolando cattle based on parameters estimated by nonlinear mixed effects (NLME) models. Data of 1,822 milk control records from 226 Girolando animals genotyped for 37,673 single nucleotide polymorphisms were analyzed. Nine NLME models were compared to identify the equation with the best fit. The lactation traits estimated by the best model were submitted to GWS analysis, using the Bayesian LASSO method. Then, based on the genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained, genomic predictions of lactation curves were constructed, and the genetic parameters were calculated. Wood's equation showed the best fit among the evaluated models. Heritabilities ranged from 0.09 to 0.29 for the seven lactation variables (initial production, rates of increase and decline, lactation peak, time to peak yield, persistence and total production). The correlations among GEBVs ranged from -0.85 to 0.98. The concordances between the best animals selected according to the selected traits were greater when the correlations between GEBVs for these traits were also high. Consequently, the methodology allowed us to identify the best nonlinear model and to construct the genetic lactation curves of a Girolando cattle population, as well as to assess the differences between animals and the association between lactation variables. MenosKnowledge of lactation curves in dairy cattle is essential for understanding the animal production in milk production systems. Genomic prediction of lactation curves represents the genetic pattern of milk production of the animals in the herd. In this context, we made genomic predictions of lactation curves through genome-wide selection (GWS) to characterize the genetic pattern of lactation traits in Girolando cattle based on parameters estimated by nonlinear mixed effects (NLME) models. Data of 1,822 milk control records from 226 Girolando animals genotyped for 37,673 single nucleotide polymorphisms were analyzed. Nine NLME models were compared to identify the equation with the best fit. The lactation traits estimated by the best model were submitted to GWS analysis, using the Bayesian LASSO method. Then, based on the genomic estimated breeding values (GEBVs) obtained, genomic predictions of lactation curves were constructed, and the genetic parameters were calculated. Wood's equation showed the best fit among the evaluated models. Heritabilities ranged from 0.09 to 0.29 for the seven lactation variables (initial production, rates of increase and decline, lactation peak, time to peak yield, persistence and total production). The correlations among GEBVs ranged from -0.85 to 0.98. The concordances between the best animals selected according to the selected traits were greater when the correlations between GEBVs for these traits were also high. Consequently, the methodology a... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Previsão genômica. |
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Thesagro: |
Bovino; Curva de Lactação; Gado Leiteiro. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Girolando; Heritability. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/225151/1/Genomic-prediction.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 117 | |
| 2. |  | RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Análise estatística da interação genótipo x ambientes e normas de reação. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 369-394.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 3. | | RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e. Modelos lineares generalizados e dados categóricos. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 559-594.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 5. | | SILVA, F. F. e; MUNIZ, J. A.; AQUINO, L. H. de; SÁFADI, T. Abordagem Bayesiana da curva de lactação de cabras Saanen de primeira e segunda ordem de parto. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 1, p. 27-33, jan. 2005 Título em inglês: Bayesian approach in the lactation curve of Saanen goats from first and second calving orders.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e. Análise estatística de dados longitudinais. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 312-368.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 7. | | RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Análise de sobrevivência e dados censurados. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 595-626.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | ROSSI, R. M.; MARTINS, E. N.; LOPES, P. S.; SILVA, F. F. e. Análise bayesiana univariada e bivariada para a conversão alimentar de suínos da raça Piau. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 10, p. 754-761, out. 2014. Título em inglês: Univariate and bivariate Bayesian analysis for feed conversion of the Piau swine breed.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | SILVA, F. F. e; SÁFADI, T.; MUNIZ, J. A.; AQUINO, L. H. de; MOURÃO, G. B. Comparação bayesiana de modelos de previsão de diferenças esperadas nas progênies no melhoramento genético de gado Nelore. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 1, p. 37-45, jan. 2008| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. | | RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; SILVA, F. F. e. Inferência bayesiana. In: RESENDE, M. D. V. de; SILVA, F. F. e; AZEVEDO, C. F. Estatística matemática, biométrica e computacional: modelos mistos, multivariados, categóricos e generalizados (REML/BLUP), inferência bayesiana, regressão, aleatória, seleção genômica, QTL, GWAS, estatística espacial e temporal, competição, sobrevivência. Viçosa, MG: UFV, 2014. p. 449-503.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 16. | | RENHE, I. R. T.; STRINCHETA, P. C.; SILVA, F. F. e; OLIVEIRA, T. V. de. Obtenção de corante natural azul extraído de frutos de jenipapo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 6, p. 649-652, jun. 2009. Notas científicas.
Título em inglês: Obtention of blue colorant from jenipapo fruit.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | SILVA, H. T.; COSTA, C. N.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; SILVA, F. F. e. Parâmetros genéticos para Stayabilityem bovinos da raça holandesa no Brasil. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 14., 2021, Santa Catarina. Passado, presente e futuro: anais. Santa Catarina: Sociedade Brasileira de Melhoramento Animal, 2021.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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