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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
03/01/2018 |
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Data da última atualização: |
03/01/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LAGROTTA, M. R.; SILVA, F. F. e; RESENDE, M. D. V. de; NASCIMENTO, M.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C. F.; MOTA, R. R. |
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Afiliação: |
Marcos Rodrigues Lagrotta, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; Fabyano Fonseca e Silva, UFV; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Moysés Nascimento, UFV; Darlene Ana Souza Duarte, UFV; Camila Ferreira Azevedo, UFV; Rodrigo Reis Mota, University of Liège. |
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Título: |
Computação paralela aplicada à seleção genômica via inferência Bayesiana. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Biometria, Lavras, v. 35, n. 3, p. 440-448, 2017. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Em seleção genômica (SG), o grande número de marcadores moleculares utilizados, bem como a demanda computacional dos modelos bayesianos, fundamentados nos algoritmos Monte Carlo Via Cadeias de Markov, faz com que as análises exijam semanas ou até meses de processamento. A computação paralela representa uma solução natural para este problema, visto que esta subdividi um algoritmo em várias tarefas independentes, as quais podem ser processadas em paralelo, reduzindo o tempo de processamento. Objetivou-se comparar a eficiência de processamento do método BayesCπ programado em paralelo com o seu algoritmo sequencial padrão. Duas estratégias de paralelização foram estudadas. A primeira envolveu a análise de múltiplas cadeias MCMC em paralelo, e a segunda referiu-se à paralelização de uma única cadeia MCMC. Utilizou-se a biblioteca MPI e o pacote OpenMPI associado ao compilador gfortran para execução em paralelo desses algoritmos. Foram utilizados dados simulados considerando 10.000 marcadores SNPs e 4.100 indivíduos. O algoritmo sequencial padrão foi processado em 77,29 horas. Ao usar múltiplas cadeias em paralelo o processamento foi 77% mais rápido (17,75hs), enquanto que a estratégia de paralelização de uma única cadeia apresentou um ganho de desempenho de 15% (65,37hs). Conclui-se que a computação paralela é eficiente e pode ser aplicada à SG. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores SNP; Regressão Bayesiana. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Statistics. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/170170/1/2017-M.Deon-RBM-Computacao.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
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Data corrente: |
19/04/2001 |
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Data da última atualização: |
03/04/2023 |
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Autoria: |
AMARAL, E. F. do; MELO, A. W. F. de; OLIVEIRA, T. K. de. |
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Afiliação: |
EUFRAN FERREIRA DO AMARAL, CPAF-Acre; ANTONIO WILLIAN FLORES DE MELO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; TADARIO KAMEL DE OLIVEIRA, CPAF-Acre. |
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Título: |
Levantamento de reconhecimento de baixa intensidade dos solos da região de inserção do Projeto Reca, Estados de Rondônia, Acre e Amazonas. |
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Ano de publicação: |
2000 |
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Fonte/Imprenta: |
Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2000. |
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Páginas: |
39 p. |
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Série: |
(Embrapa Acre. Boletim de pesquisa, 27). |
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ISSN: |
0101-5516 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O levantamento de solos, em nível de reconhecimento de baixa intensidade da área de inserção do Projeto de Reflorestamento Econômico Consorciado e Adensado (Reca), foi realizado com o objetivo de mapear, caracterizar e classificar os principais solos que ocorrem na àrea, com a finalidade de servir de base física para avaliar a potencialidade agrícola das terras, que é um dos instrumentos essenciais para planejamento de uso sustentável dos recursos de solos. O Projeto Reca esta situado no Estado de Rondônia, na região de fronteira com o Estado do Acre, entre as coordenadas geográficas de 02o54'45" e 3o16'36" de latitude sul e 47o55'38" e 48o26'44" UTM 8.894.812, 795.132 e 8.939.925, 735.026, com área de aproximadamente 260.00 ha. Os principais componentes das unidades de mapeamento foram: Latossolo Vermelho (92.098,36 ha); Argissolo Vermelho-Amarelo (101.372.45 ha); Argissolo Amarelo (50.098,36 ha); Plintossolo (10.484 ha); e Gleissolo e Neossolo (9.405.36 ha). São solos de baixo nível de fertilidade natural, condicionada pelos baixos conteúdos de bases trocáveis e baixa capacidade de troca de cations. Os Latossolos, por apresentarem boas propriedades físicas e relevo plano e suave ondulado, são capazes de suportar atividades agrícolas intensivas. |
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Palavras-Chave: |
Acre; Amazonas; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Aptitud del suelo; Argissolo; Brasil; Caracterização; Characterization; Classificação; Gleissolo; Levantamento de solo; Levantamento do solo; Mapeamento; Mapping; Plintossolo; Projeto Reca; Reca; Reconocimiento de suelos; Rondônia; Soil survey; Vila Extrema (RO); Vila Nova Califórnia (RO); Western Amazon. |
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Thesagro: |
Agricultura; Aptidão agrícola; Classificação do Solo; Latossolo; Levantamento; Reconhecimento do Solo; Solo. |
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Thesaurus NAL: |
Agriculture; Brazil; soil; soil classification; Soil suitability; soil surveys. |
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Categoria do assunto: |
--
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/CPAF-AC/7301/1/bp27.pdf
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Marc: |
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520 $aO levantamento de solos, em nível de reconhecimento de baixa intensidade da área de inserção do Projeto de Reflorestamento Econômico Consorciado e Adensado (Reca), foi realizado com o objetivo de mapear, caracterizar e classificar os principais solos que ocorrem na àrea, com a finalidade de servir de base física para avaliar a potencialidade agrícola das terras, que é um dos instrumentos essenciais para planejamento de uso sustentável dos recursos de solos. O Projeto Reca esta situado no Estado de Rondônia, na região de fronteira com o Estado do Acre, entre as coordenadas geográficas de 02o54'45" e 3o16'36" de latitude sul e 47o55'38" e 48o26'44" UTM 8.894.812, 795.132 e 8.939.925, 735.026, com área de aproximadamente 260.00 ha. Os principais componentes das unidades de mapeamento foram: Latossolo Vermelho (92.098,36 ha); Argissolo Vermelho-Amarelo (101.372.45 ha); Argissolo Amarelo (50.098,36 ha); Plintossolo (10.484 ha); e Gleissolo e Neossolo (9.405.36 ha). São solos de baixo nível de fertilidade natural, condicionada pelos baixos conteúdos de bases trocáveis e baixa capacidade de troca de cations. Os Latossolos, por apresentarem boas propriedades físicas e relevo plano e suave ondulado, são capazes de suportar atividades agrícolas intensivas.
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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