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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Data corrente: |
23/10/2012 |
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Data da última atualização: |
04/02/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SILVA, A. M. O. DA; SILVA, G. F. da; DIAS, M. C.; SOUZA, A.; CLEMENT, C. R.; SOUSA, N. R. |
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Afiliação: |
GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; MIGUEL COSTA DIAS, CPAA; NELCIMAR REIS SOUSA, CPAA. |
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Título: |
Desenvolvimento de "inter-retrotransposon amplified polymorphism" para análise de diversidade genética em germoplasma de mandioca. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2012. Anais. Belém, PA. 2012. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A mandioca, Manihot esculenta Crantz, possui importância econômica na maioria dos países tropicais e subtropicais. A variabilidade genética da espécie não foi totalmente explorada e novas informações podem ajudar a expandir seu uso. Os marcadores moleculares baseados em retrotransposons, devido a sua abundancia no genoma, permitem uma eficiente análise de diversidade genética. O IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism) é baseado no polimorfismo entre retrotransposons, possui uma alta reprodutibilidade, elevado nível de polimorfismo e baixo custo. O objetivo deste trabalho foi desenvolver primers para IRAP em mandioca. Oito diferentes retrotransposons do tipo LTR foram selecionados para o desenvolvimento de IRAP e os primers baseados nestes elementos foram denominados de ME_1 a ME_8. Foram analisados 21 indivíduos (12 de Anori/AM, 6 Anamã/AM e 3 da Bahia) provenientes do banco de germoplasma de mandioca da Embrapa Amazônia Ocidental. O percentual de loci polimórficos, heterozigosidade esperada (*h) e o Índice de Shannon (*I) foram calculados usando o software PopGene 1.31. Dos oito primers desenvolvidos, dois deles (ME_1 e ME_3) produziram poucas e fracas bandas. Os demais primers produziram de 21 a 61 bandas com médias de 85% de polimorfismo (65,5 - 97), 0,33 de heterozigosidade (0,24 ? 0,40) e 0,49 de índice de Shannon (0,35 ? 0,57). Dos pares de primers desenhados, ME_4 apresentou os menores valores e o ME_8 os maiores para todos os parâmetros avaliados. |
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Palavras-Chave: |
IRAP; Retrotransposon. |
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Thesagro: |
Manihot Esculenta; Polimorfismo. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/76029/1/166-2.doc-gilvan.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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