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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
Data corrente: |
09/10/2020 |
Data da última atualização: |
16/11/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de. |
Afiliação: |
Jônatas Chagas de Oliveira, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Genéticos da Rede Bionorte, Universidade Federal do Acre; André Lucas Domingos da Silva, Programa de Pós-Graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre; Carla Cristina da Silva, Universidade Estadual de Campinas; Anete Pereira de Souza, Universidade Estadual de Campinas; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC. |
Título: |
Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020. |
Páginas: |
p. 83-88. |
Descrição Física: |
Banner. |
Série: |
(Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2). |
Idioma: |
Português |
Notas: |
Editores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau. |
Conteúdo: |
O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro. |
Palavras-Chave: |
Acre; Amarillo MG-100; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Amendoim forrageiro; Análisis de secuencia; Belomonte; Cacahuetes forrajeros; Cultivo mixto; Embrapa Acre; Forage peanut; Genoma funcional; Leguminosas forrajeras; Pastos forrajeros; Repeticiones de microsatélite; Rio Branco (AC); RNA sequencing; RNA-Seq; Western Amazon. |
Thesagro: |
Banco de Germoplasma; Gramínea Forrageira; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Pastagem Consorciada. |
Thesaurus Nal: |
Arachis pintoi; Forage grasses; Forage legumes; Germplasm conservation; Microsatellite repeats; Mixed cropping; Sequence analysis. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/216570/1/27049.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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Registros recuperados : 59 | |
2. | | PIOVEZAN, U.; FEIDEN, A.; ANDRIOLO, A.; COSTA, M. J. R. P. da; DUARTE, J. M. B. Corredores de biodiversidade e animais em barragens. In: KUHN, O. J.; FEY, R.; PRIOR, M.; KLEIN, J.; NUNES, R. V.; STANGARLIN, J. R.; FUJIHARA, R. T. (Org.). Ciências agrárias: avanços tecnológicos com responsabilidade ambiental na produção agropecuária. Cascavel: ASSOESTE, 2013. v.1., p. 103-121. 19 p.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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5. | | DALLA COSTA, O. A.; DIESEL, T. A.; DUTRA, D. R.; COSTA, M. J. R. P. da. Efeito do uso de ducha, antes e após o transporte, sobre a qualidade da carne dos suínos. In: FÓRUM INTERNACIONAL DE SUINOCULTURA, 6., 2012, Curitiba. Anais: artigos científicos. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2012. v.2. p. 227-228. Projeto/Plano de Ação: 02.06.01.001.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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10. | | DALLA COSTA, O. A.; LUDKE, J. V.; COSTA, M. J. R. P. da; PELOSSO, J. V.; COLDEBELLA, A.; TRIQUES, N. Efeito do jejum na granja e condições de transporte sobre o comportamento dos suínos de abate nas baias de descanso e lesões na pele Ciência Animal Brasileira, v.10, n.1, p.58-68, 2009. Disponível em: . Acesso em: 12 fev. 2010 Projeto/Plano de Ação: 02.06.10.100-01Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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12. | | BUENO, A. R.; ALENCAR, M. M. de; STARLING, J. M. C.; COSTA, M. J. R. P. da; NEGRÃO, J. A. Latência para a primeira mamada e níveis de cortisol e triiodotironina de bezerros Nelore puros e cruzados. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 37., 2000, Viçosa, MG. Resumos... Viçosa : SBZ, 2000. p.12.Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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18. | | DALLA COSTA, O. A.; ARAÚJO, A. P. de; CIOCCA, J. R.; ATHAYDE, N. B.; COSTA, M. J. R. P. da; KLEIN, E. L.; LUDTKE, C.; BAGGIO, E. E. Avaliação das condições de transporte, desembarque e ocorrência de quedas dos suínos na perspectiva do bem-estar animal. Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2007. 5 p. (Embrapa Suínos e Aves. Comunicado Técnico, 459). Projeto n. 02.06.10.100-03.Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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19. | | CARVALHAL, M.; SANT'ANNA, A.; SILVA, L. C. M.; FERREIRA, M. B. D. FERREIRA; SILVA, M. V. G. B.; COSTA, M. J. R. P. Da. Association between temperament and reproductive performance of Giroland bulls In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 1, 2016, Jaboticabal. Anais ... Jaboticabal: [s.n.], 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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20. | | DOMPIERI, M. H. G.; MENEZES, J. V. DE T.; SANTOS, T. M. B. DOS; COSTA, M. J. R. P. DA; JUNG, J.; PIOVEZAN, U. Análise espacial do comportamento bovino no Pantanal brasileiro por meio de colares com receptores GPS. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 19., 2019, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2019. p. 3449-3452.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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Registros recuperados : 59 | |
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