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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Data corrente: |
27/09/2019 |
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Data da última atualização: |
07/11/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
AZEVEDO, D. A. A. de; MONTEIRO, J. P.; PINHEIRO, R. R.; MUDADU, M. de A.; ANDRIOLI, A.; ARAÚJO, J. F.; SOUSA, A. L. M. de; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. |
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Afiliação: |
DALVA ALANA ARAGÃO DE AZEVEDO, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; JOMAR PATRICIO MONTEIRO, CNPC; RAYMUNDO RIZALDO PINHEIRO, CNPC; MAURICIO DE ALVARENGA MUDADU, CNPTIA; ALICE ANDRIOLI, CNPC; JUSCILÂNIA FURTADO ARAÚJO, Northeast Biotechnology Network, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; ANA LÍDIA MADEIRA DE SOUSA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil; LUCIA HELENA SIDER, CNPC; RENATO MESQUITA PEIXOTO, Universidade Federal do Acre (UFAC) - Rio Branco, AC, Brazil; MARIA FÁTIMA DA SILVA TEIXEIRA, Universidade Estadual do Ceará (UECE) - Fortaleza, CE, Brazil. |
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Título: |
Molecular characterization of circulating strains of small ruminant lentiviruses in Brazil based on complete gag and pol genes. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Small Ruminant Research, v. 177, p. 160-166, 2019. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.smallrumres.2019.06.011 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte. MenosAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BR... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caracterização molecular; Molecular characterization; SRLV. |
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Thesaurus Nal: |
Genome; Goats; Lentivirus; Phylogeny; Sheep. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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Marc: |
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260 $c2019
520 $aAbstract: Small ruminant lentiviruses (SRLV) are widely distributed in the world and cause productive and economic losses. These pathogens have high genetic variability, which hinders diagnosis by molecular methods. Molecular characterization studies are good strategies for elaborating programs aimed to control or eradicate diseases. Hence, this study aimed to sequence, characterize and compare strains of SRLV, which were isolated from naturally infected goats from the states of Ceará, Rio Grande do Norte and Minas Gerais, Brazil, based on total nucleotide sequences of gag and pol genes. SRLV isolates from the microbiological collection of Sheep and Goat of Embrapa were cultured in goat synovial membrane. Supernatants containing cells were stored and viral particles were purified with sucrose density gradient centrifugation for RNA extraction. Then, sequencing in HiSeq 2500 platform (Illumina) was performed to obtain the total genome of the SRLV strains. The software MEGA version 7.0 was used for sequence editing and phylogeny analysis. A total of 17 isolates were multiplied in cellular culture and six were viable, which were two from Minas Gerais (MG), one from Rio Grande do Norte (RN) and three from Ceará (CE). Two sequences were obtained from the sequencing by synthesis, one from MG (BRMG CNPC) and one from RN (BRRN CNPC). From the total SRLV genome (9,200 bases), sample BRMG CNPC generated a consensus of 6,378 bases, approximately 69,34% of the viral genome and sample BRRN CNPC generated a consensus of 5,351 bases, which comprised 58.16% of the total genome. Samples in this study demonstrated closer phylogenetic relation with genotype B (B1 group). The remaining strains sequenced in Brazil are also present in the same group with the exception of three samples from genotype A. Immunodominant regions of gag gene and motifs of pol gene were similar to the standard CAEV Cork strain. For the first time, the complete gag and pol genes were sequenced in Brazil from the strain BRMG CNPC isolated in Minas Gerais state. In addition, 2490 bases from the total of 3316 bases were sequenced from the pol gene of the BRRN CNPC sample from Rio Grande do Norte.
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Registro original: |
Embrapa Caprinos e Ovinos (CNPC) |
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| Registros recuperados : 60 | |
| 42. |  | SOUSA, A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; ANDRIOLI, A. A.; SIDER, L. H.; PINHEIRO, R. R. Perfil imunogênico bidimensional de antígeno da artrite encefalite caprina produzido com cepa nativa do estado do Ceará. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 63-64. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 43. | | SOUSA. A. L. M. de; AZEVEDO, D. A. A. de; AZEVEDO, D. A. A. de; ARAÚJO, J. F.; ANDRIOLI, A.; SIDER, L. H.; PINHEIRO, R. R. Perfil proteico bidimensional de antígeno da Artrite Encefalite Caprina produzido a partir de isolados do Estado do Ceará. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA CAPRINOS E OVINOS, 2., 2013, Sobral. Resumos... Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2013. p. 61-62. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 109).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 44. | | ZAROS, L. G.; NAVARRO, A. M. do C.; NEVES, M. R. M. das; BENVENUI, C. L.; COUTINHO, L. L.; SIDER, L. H.; VIEIRA, L. da S. What cytokines are expressed on Abomasum Lymph nodes when Somalis crossbreed sheep are infected by Haemonchus contortus in Northeast of Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE WORLD ASSOCIATION FOR THE ADVANCEMENT OF VETERINARY PARASITOLOGY, 23., 2011, Buenos Aires. Proceedings... Buenos Aires: WAAVP, 2011. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 45. | | SIDER, L. H.; HEATON, M. P.; CHITKO-McKOWN, C. G.; HARHAY, G. P.; SMITH, T. P. L.; LEYMASTER, K. A.; LAEGREID, W. W.; CLAWSON, M. L. Small ruminant lentivirus genetic subgroups associate with sheep TMEM154 genotypes. Veterinary Research, v. 44, p. 64, Jul. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 46. | | ZAROS, L. G.; COUTINHO, L. L.; NAVARRO, A. M. C.; NEVES, M. R. N.; BENVENUTI, C. L.; SIDER, L. H.; VIEIRA, L. da S. TH1 and TH2 cytokines mRNA levels in Brazilian Somalis crossbreed sheep resistant and suceptible to Trichostrongylus colubriformis infection. In: CONFERENCE FOR THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 32., 2010. Edinburgo (UK). Proceedings... Edinburgo: ISAG, 2010. p. 132. Abstract P5052.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 47. | | ZAROS, L. G.; COUTINHO, L. L.; NAVARRO, A. M. C.; NEVES, M. R. M.; BENVENUTI, C. L.; SIDER, L. H.; VIEIRA, L. da S. Variação no padrão de expressão de citocinas em ovinos da raça Somalis naturalmente infectados por Haemonchus contortus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 5.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 48. | | RODRIGUES, A. S.; PINHEIRO, R. R.; BRITO, R. L. L.; ANDRIOLI, A.; OLIVEIRA, L. S.; SIDER, L. H.; SANTOS, V. W.; OLIVEIRA, E. L. de; DIAS, R. P.; GOUVEIA, A. M. G.; TEIXEIRA, M. F. S. Avaliação de um controle estratégico da artrite encefalite caprina em rebanho caprino leiteiro. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, Belo Horizonte, v. 70, n. 1, p. 139-146, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 49. | | AZEVEDO, D. A. A. de; PINHEIRO, R. R.; SANTOS, V. W. S. dos; DAMASCENO, E. M.; SOUSA, A. L. M. de; ARAÚJO, J. F.; ANDRIOLI, A.; SIDER, L. H.; PEIXOTO, R. M.; TEIXEIRA, M. F. da S. Comparação de testes sorológicos e molecular para diagnóstico da Artrite Encefalite Caprina e avaliação clínica da glândula mamária de caprinos leiteiros infectados. Acta Scientiae Veterinariae, v. 47, Pub. 1668, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 50. | | ZAROS, L. G.; COUTINHO, L. L.; SIDER, L. H.; MEDEIROS, H. R. de; NEVES, M. R. M. das; BENVENUTI, C. L.; NAVARRO, A. M. do C.; VIEIRA, L. da S. Evaluation of reference genes for real-time PCR studies of Brazilian Somalis sheep infected by gastrointestinal nematodes. Genetics and Molecular Biology, v. 33, n. 3, p. 486-490, 2010. Short communication.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
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| 52. | | SIDER, L. H.; VERAS, A. K. A.; OLIVEIRA, A. N. de; BRITO, R. L. L. de; ANDRIOLI, A.; RAVAZZOLO, A. P.; TEIXEIRA, M. F. da S.; PINHEIRO, R. R. Detecção de RNA genômico do vírus da artrite-encefalite caprina (CAEV) por amplificação do gene estrutural gag em amostras sangüíneas e de líquido sinovial após injúria tecidual. In: SIMPÓSIO INTERNACIONAL SOBRE CAPRINOS E OVINOS DE CORTE, 4.; FEIRA NACIONAL DO AGRONEGÓCIO DA CAPRINO-OVINOCULTURA DE CORTE, 3., 2009, João Pessoa. Anais... João Pessoa: EMEPA-PB, 2009. 3 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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