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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
14/04/2009 |
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Data da última atualização: |
30/05/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
COELHO, M. R. R.; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; SELDIN, L. |
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Afiliação: |
Marcia Reed Rodrigues Coelho, UFRJ; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS; IVANILDO EVODIO MARRIEL, CNPMS; Lucy Seldin, UFRJ. |
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Título: |
Molecular detection of nifH gene-containing Paenibacillus in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown in Cerrado soil. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 48, n. 5, p. 611-617, 2009. |
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DOI: |
10.1111/j1472.765X.2009.02578.x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Aims: To develop a polymerase chain reaction (PCR)-based approach for the detection of nifH gene-containing Paenibacillus in environmental samples. Methods and Results: The primers, nitHPAENf and nitHPAENr, were designed and tested with DNA from: (i) strains of different nitrogen-fixing Paenibacillus species, (ii) strains of other nitrogen-fixing genera and (iii) rhizosphere of sorghum sown in Cerrado soi! amended with either 12 or 120 kg ha-1 of nitrogen fertilizer. All nitrogen-fixing Paenibacillus strains tested and the DNA samples from rhizosphere soil were amplified when these primers were used, generating a 280 bp fragment. When the PCR products obtained from both sorghum rhizospheres were cloned and sequenced, the majority of the clones analysed could be identified as Paenibacillus durus. Moreover, a greater diversity in the nifH sequences could be observed in the rhizosphere treated with a high amount of nitrogen fertilizer. Conclusions: Nitrogen fertilization slightly influenced the structure of the nifH gene-containing Paenibacillus community in sorghum rhizospheres cultivated in Cerrado soil. Significance and Impact of the Study: The PCR detection method developed is adequate to assess the presence of nifH gene-containing Paenibacillus in the environment and can be used in future to determine the ecological role of this group of micro-organisms for the nitrogen input to the plants. |
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Palavras-Chave: |
nifH; PCR; Primers; Sorghum. |
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Thesaurus Nal: |
Paenibacillus. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registro |
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| Registros recuperados : 51 | |
| 22. |  | MOTA, F. F. da; NOBREGA, F. F.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Genetic diversity of Paenibacillus polymyxa populations isolated from the rhizosphere of four cultivars of maize (Zea mays) planted in cerrado soil. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 20, n. 2, p. 119-132, 2002.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 23. | | PINTO, P. P.; RAPOSEIRAS, R.; MACEDO, A. M.; SELDIN, L.; PAVA, E.; SA, N. M. H. Effects of high temperature on survival, symbiotic performance and genomic modifications of bean nodulating Rhizobium strains. Revista de Microbiologia, São Paulo, v. 29, n. 4, p. 295-300, 1998.| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 24. | | MOTA, F. F. da; GOMES, E. A.; PAIVA, E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L. Use of rpoB gene analysis for identification of nitrogen-fixing Paenibacillus species as an alternative to the 16S rRNA gene. Letters in Applied Microbiology, Oxford, v. 39, n. 1, p. 34-40, 2004.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 26. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Avaliação do possível impacto de milho geneticamente modificado na ciclagem do nitrogênio em solo de Cerrado. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2012. 1 CD-ROM. Fertbio 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 27. | | SELDIN, L.; ROSADO, A. S.; CRUZ, D. W. da; NOBREGA, A.; ELSAS, J. D. van; PAIVA, E. Comparison of Paenibacillus azotofixans strains isolated from rhizoplane, rhizosphere, and non-root-associated soil from maize planted in two different Brazilian soils. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 64, n. 10, p. 3860-3868, 1998.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 29. | | OLIVEIRA, I. A. de; VASCONCELLOS, M. J.; SELDIN, L.; PAIVA, E.; VARGAS, M. A.; SA, N. M. H. de. Random amplified polymorphic DNA analysis of effective Rhizobium sp. associated with beans cultivated in brazilian cerrado soils. Brazilian Journal of Microbiology, Sao Paulo, v. 31, p. 39-44, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 30. | | OLIVEIRA, I. A. de; VASCONCELOS, M. J.; SELDIN, L.; PAIVA, E.; VARGAS, M. A.; SA, N. M. H. de. Random amplified polymorphic DNA analysis of effective Rhizobium sp. associated with beans cultivated in Brazilian cerrado soils. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, v.31, n. 1, p. 39-44, 2000.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 31. | | COELHO, M. R. R.; MARRIEL, I. E.; JENKINS, S. N.; LANYON, C. V.; SELDIN, L.; O'DONNELL, A. G. Molecular detection and quantification of nifH gene sequences in the rhizosphere of sorghum (Sorghum bicolor) sown with two levels of nitrogen fertilizer. Applied Soil Ecology, Amsterdam, v. 42, n. 1, p. 48-53, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 32. | | COELHO, M. R. R.; MOTA, F. F.; PAIVA, E.; MARRIEL, I. E.; ROSADO, A. S.; SELDIN, L.; CARNEIRO, N. P. Diversidade de Paenibacillus spp. na rizosfera de quatro cultivares de sorgo plantados em solo de cerrado sob condições contrastantes de nitrogênio. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 33. | | COELHO, M. R. R.; VOS, M. de; CARNEIRO, N. P.; MARRIEL, I. E.; PAIVA, E.; SELDIN, L. Diversity of nifH gene pools in the rhizosphere of two cultivars of sorghum (Sorghum bicolor) treated with contrasting levels of nitrogen fertilizer. FEMS Microbiology Letters, Amsterdam, v. 279, n. 1, p. 15-22, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 34. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; ANDREOTE, F. D.; SELDIN, L.; ELSAS, J. D. van. Different effects of transgenic maize and nontransgenic maize on nitrogen-transforming archaea and bacteria in tropical soils. Applied and Environmental Microbiology, Washington, v. 80, n. 20, p. 6437-6445, Oct. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 35. | | SA, N. M. H. de; SILVA-KATTAH, L da; SELDIN, L.; VASCONCELOS, M. J. V.; PAIVA, E. Genomic heterogeneity within bean nodulating Rhizobium strains isolated from cerrado soils. Soil Biology and Biochemistry, Oxford, v. 29, n. 5/6, p. 1011-1014, 1997.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 37. | | COTTA, S. R.; DIAS, A. C. F.; MARRIEL, I. E.; GOMES, E. A.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Temporal dynamics of microbial communities in the rhizosphere of two genetically modified (GM) maize hybrids in tropical agrosystems. Antonie van Leeuwenhoek, Dordrecht, v. 103, n. 3, p. 589-601, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 38. | | SILVA, T. F. da; COELHO, M. R. R.; VOLLÚ, R. E.; GOULART, F. R. de V.; ALVIANO, D. S.; ALVIANO, C. S.; SELDIN, L. Bacterial community associated with the trunk latex of Hancornia speciosa Gomes (Apocynaceae) grown in the northeast of Brazil. Antonie van Leeuwenhoek, v. 99, p. 523-532, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 39. | | OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; CALAZANS, G. M.; FIGUEIREDO, J. E. F.; MENDES, S. M.; GOMES, E. A.; MARUCCI, R. C.; VIANA, P. A.; SELDIN, L.; MARRIEL, I. E. Atividade microbiana em solos de várzea e Cerrado cultivados com milho transgênico expressando os genes Cry1Ab e Cry1F de Bacillus thuringiensis. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2017. 27 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 159).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 40. | | EVANS, F. F.; ROSADO, A. S.; SEBASTIÁN, G. V.; CASELLA, R.; MACHADO, P. L. O. de A.; HOLMSTRÖM, C.; KJELLEBERG, S.; ELSAS, J. D. van; SELDIN, L. Impact of oil contamination and biostimulation on the diversity of indigenous bacterial communities in soil microcosms. FEMS Microbiology Ecology, v. 49, n. 2, p. 295-305, Aug. 2004. Na publicação: Pedro L. O. A. Machado.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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