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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
24/10/2012 |
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Data da última atualização: |
25/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
HORA JUNIOR, B. T. da; POLONI, J. de F.; LOPES, M. A.; DIAS, C. V.; GRAMACHO, K. P.; SCHUSTER, I.; SABAU, X.; CASCARDO, J. C. de M.; DI MAURO, S. M. Z.; GESTEIRA, A. da S.; BONATTO, D.; MICHELI, F. |
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Afiliação: |
BRAZ TAVARES DA HORA JUNIOR, UESC; JOICE DE FARIA POLONI, PUCRS; MAÍZA ALVES LOPES, UESC; CRISTIANO VILLELA DIAS, UESC; KARINA PERES GRAMACHO, CEPLAC; IVAN SCHUSTER, COODETEC; XAVIER SABAU, CIRAD; JÚLIO CÉZAR DE MATTOS CASCARDO, UESC; SÔNIA MARLI ZINGARETTI DI MAURO, UNESP; ABELMON DA SILVA GESTEIRA, CNPMF; DIEGO BONATTO, CEPLAC; FABIENNE MICHELI, UESC. |
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Título: |
Transcriptomics and systems biology analysis in identification of specific pathways involved in cacao resistance and susceptibility to witches. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular BioSystems, n.8, p. 1507-1519, 2012 |
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ISSN: |
1742-206X |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work also identifies candidate genes for further functional studies and for genetic mapping and marker assisted selection. MenosThis study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work al... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Molecular systems biology. |
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Thesagro: |
Cação. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aThis study reports on expression analysis associated with molecular systems biology of cacao-Moniliophthora perniciosa interaction. Gene expression data were obtained for two cacao genotypes (TSH1188, resistant; Catongo, susceptible) challenged or not with the fungus M. perniciosa and collected at three time points through disease. Using expression analysis, we identified 154 and 227 genes that are differentially expressed in TSH1188 and Catongo, respectively. The expression of some of these genes was confirmed by RT-qPCR. Physical protein?protein interaction (PPPI) networks of Arabidopsis thaliana orthologous proteins corresponding to resistant and susceptible interactions were obtained followed by cluster and gene ontology analyses. The integrated analysis of gene expression and systems biology allowed designing a general scheme of major mechanisms associated with witches? broom disease resistance/susceptibility. In this sense, the TSH1188 cultivar shows strong production of ROS and elicitors at the beginning of the interaction with M. perniciosa followed by resistance signal propagation and ROS detoxification. On the other hand, the Catongo genotype displays defense mechanisms that include the synthesis of some defense molecules but without success in regards to elimination of the fungus. This phase is followed by the activation of protein metabolism which is achieved with the production of proteasome associated with autophagy as a precursor mechanism of PCD. This work also identifies candidate genes for further functional studies and for genetic mapping and marker assisted selection.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Registro |
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URL |
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| Registros recuperados : 83 | |
| 61. |  | RIBEIRO, F. N. S.; GERMANO, C. M.; ROCHA, T. T.; ROZA, H. L. H.; BERTOLUCCI, S. K. V.; LAMEIRA, A. O.; PINTO, J. E. B. P. Differents doses of cattle manure in Phyla betulifolia (Kunth) Greene Growth. In: SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE PLANTAS MEDICINAIS, 8.; SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE INVESTIGAÇÃO EM CÂNCER, 3., 2016, Itajaí. Anais. Itajaí: UNIVALI, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 62. | | PORTAL, R. K. V. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; RAMOS, G. K. de S.; ASSIS, R. M. A. de. Efeito de diferentes concentrações de BAP e sacarose no cultivo in vitro de Psychotria ipecacuanha Stoke. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 19.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 6., 2013, Recife. Anais dos trabalhos. Recife: UFRPE, 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 63. | | RIBEIRO, F. N. S.; SOUSA, M. A. F.; SOARES, F. Q.; SOUZA, C. W.; REIS, R. B.; EIRA, M. T. S. Conservação de sementes de Coffea arabica racemosa em banco de germoplasma. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 7., 2002, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2002. p. 80.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 64. | | FERREIRA, G. B.; MENDONÇA, C. E. S.; CHAVES, V. C.; MOTTA, E. F.; RIBEIRO, F. N.; SILVA, S. dos A. B. e; SILVA, M. S. L. da. Produção de fitomassa e composição química de plantas utilizadas em coquetéis vegetais para cobertura de solo e adubação verde no Vale do São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira: anais. Porto Alegre: SBCS, 2007. 1 CD-R0M.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 65. | | RIBEIRO, F. N.; SILVA, M. S. L. da; GAVA, C. A. T.; CUNHA, T. J. F.; GOMES, T. C. de A.; MENDONÇA, C. E. S. Produção de fitomassa, desenvolvimento radicular e teores de macro e micronutrientes de espécies para adubação verde e/ou cobertura do solo. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICIRRIZAS, 11; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9,; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6,. Bonito, 2006. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 66. | | RIBEIRO, F. N.; SILVA, M. S. L. da; OLIVEIRA NETO, M. B. de; MARQUES, F. A.; PARAHYBA, R. da B. V. Prática de uso e manejo do solo em área de barragem subterrânea no sertão do Araripe. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DA DIVERSIDADE DO SEMIÁRIDO, 1., 2016, Campina Grande. Diversidade: aprender o Semiárido, no Semiárido e com o Semiárido. Campina Grande: CEMEP: INSA, 2016.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 68. | | RIBEIRO, F. N.; CHAVES, V. C.; MENDONÇA. C. E. S.; SILVA, M. S. L. da; CUNHA, T. J. F.; MOREIRA, M. M.; NETO, M. B. de O. Estudo de caso: impacto de barragem subterrânea no agroecossistema rural e na vida do agricultor. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. Fortaleza: UFC: SBCS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 69. | | RIBEIRO, F. N.; CHAVES, V. C.; MENDONÇA, C. E. S.; SILVA, M. S. L. da; CUNHA, T. J. F.; MOREIRA, M. M.; OLIVEIRA NETO, M. B. de. Estudo de caso: impacto de barragem subterrânea no agroecossistema rural e na vida do agricultor. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 70. | | RIBEIRO, F. N.; CHAVES, V. C.; MENDONÇA, C. E. S.; FERREIRA, G. B.; SILVA, M. S. L. da; CUNHA, T. J. F. Manejo de solo compactado em cultivo irrigado de videira de mesa no Vale do São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Porto Alegre: Universidade Federal do Rio Grande do Sul, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 71. | | SILVA, M. S. L. da; CHAVES, V. C.; RIBEIRO, F. N.; FERREIRA, G. B. F.; MENDONÇA, C. E. S.; CUNHA, T. J. F. Espécies vegetais para adubação verde e/ou cobertura do solo em cultivo orgânico de fruteiras na região semi-árida do Nordeste brasileiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: SBCS: Embrapa Solos: Embrapa Agrobiologia, 2008. 1 CD-ROM. (Embrapa Solos. Documentos, 101).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 72. | | SILVA, M. S. L. da; CHAVES, V. C.; RIBEIRO, F. N.; FERREIRA, G. B.; MENDONÇA, C. E. S.; CUNHA, T. J. F. Espécies vegetais para adubação verde e/ou cobertura do solo em cultivo orgânico de fruteiras na região semi-árida do Nordeste Brasileiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2008. 1 CD-ROM. (Embrapa Solos. Documentos, 101).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 73. | | RIBEIRO, F. N. S.; HÜTHER, C. M.; OLIVEIRA, E. de; MORAES, J. B. de; MACHADO, T. de B.; LAMEIRA, O. A.; PEREIRA, C. R. Influência de diferentes substratos e níveis de radiação no crescimento de Carapichea ipecacuanha (Brot) L Andersson (ipecacuanha). Revista Cubana de Plantas Medicinales, v. 24, n. 4, e764, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 74. | | ROCHA, T. T.; RIBEIRO, F. N.; GERMANO, C. M.; BERTOLUCCI, S. K. V.; LAMEIRA, O. A.; PINTO, J. E. B. P. Influência de diferentes tipos de meios de cultura para o estabelecimento in vitro de Phyla betulifolia(Kunth) Greene. In: SIMPÓSIO DE PLANTAS MEDICINAIS DO BRASIL, 24., 2016, Belo Horizonte. [Anais]. [Belo Horizonte: CEPLAMT], 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 75. | | SILVA, M. S. L. da; CHAVES, V. C.; FERREIRA, G. B.; MENDONÇA, C. E. S.; MOTTA, E. F.; RIBEIRO, F. N.; SILVA, S. dos A. B. E. Indicadores biológicos de qualidade de solo em área de produção de manga sob manejo orgânico em perímetro irrigado no Vale do São Francisco. CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Resumo| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 76. | | SILVA, M. S. L. da; CHAVES, V. C.; FERREIRA, G. B.; MENDONÇA, C. E. S.; MOTTA, E. F.; RIBEIRO, F. N.; SILVA, S. dos A. B. Indicadores biológicos de qualidade de solo em área de produção de manga sob manejo orgânico em perímetro irrigado no Vale do São Francisco. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira: anais. Porto Alegre: SBCS, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 77. | | ROCHA, T. T.; RIBEIRO, F. N.; GERMANO, C. M.; BITTENCOURT, W. J. M.; BERTOLUCCI, S. K. V.; LAMEIRA, O. A.; PINTO, J. E. B. P. Light intensity on the in vitro growth of Phyla betulifolia (Kunth) Greene. In: SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE PLANTAS MEDICINAIS, 8.; SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE INVESTIGAÇÃO EM CÂNCER, 3., 2016, Itajaí. Anais. Itajaí: UNIVALI, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 78. | | SILVA, M. S. L. da; MENDONÇA, C. E. S.; RIBEIRO, F. N.; OLIVEIRA NETO, M. B. de; PARAHYBA, R. da B. V.; SANTOS, J. C. P. dos; CUNHA, T. J. F.; SOUZA, B. A. de. Barragem subterrânea: experiências no território do Sertão do Araripe, Estado de Pernambuco. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010. 4 p. il. color. (Embrapa Solos. Comunicado técnico, 58).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 79. | | SILVA, M. S. L. da; GAVA, C. A. T.; GOMES, T. C. de A.; SILVA, S. dos A. B. e; MENDONÇA, C. E. S.; PIMENTEL, M. S.; RIBEIRO, F. N. Carbono da biomassa e atividade microbiana em solo sob manejo orgânico e manga no Pólo de Irrigação Petrolina - PE/Juazeiro - BA. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICIRRIZAS, 11; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9,; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6,. Bonito, 2006. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 80. | | RIBEIRO, F. N. S.; GERMANO, C. M.; ROCHA, T. T.; FERREIRA, C. C. Q.; BITTENCOURT, W. J. M.; BERTOLUCCI, S. K. V.; LAMEIRA, A. O.; PINTO, J. E. B. P. Development of Phyla betulifolia (Kunth) Greene cuttings on time influences, types of cuttings and substrates. In: SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE PLANTAS MEDICINAIS, 8.; SIMPÓSIO IBERO-AMERICANO DE INVESTIGAÇÃO EM CÂNCER, 3., 2016, Itajaí. Anais. Itajaí: UNIVALI, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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