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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
17/01/2017 |
Data da última atualização: |
14/06/2019 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
TIZIOTO, P. L.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O.; ROCHA, M. I.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; ZERLOTINI NETO, A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A. |
Afiliação: |
POLYANA C. TIZIOTO, CPPSE, University of Missouri; LUIZ L. COUTINHO, Esalq/USP; PRISCILA S. N. OLIVEIRA, CPPSE; ALINE S. M. CESAR, Esalq/USP; WELLISON J. S. DINIZ, UFSCar; ANDRESSA O. LIMA, UFSCar; MARINA I. ROCHA, UFSCar; JARED E. DECKER, University of Missouri; ROBERT D. SCHNABEL, University of Missouri; GERSON B. MOURÃO, Esalq/USP; RYMER RAMIZ TULLIO, CPPSE; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA; JEREMY F. TAYLOR, University of Missouri; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Título: |
Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 6, p. 1-12, 2016. |
DOI: |
10.1038/srep39493 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Residual feed intake (RFI), a measure of feed efficiency (FE), is defined as the difference between the observed and the predictable feed intake considering size and growth of the animal. It is extremely important to beef production systems due to its impact on the allocation of land areas to alternative agricultural production, animal methane emissions, food demand and cost of production. Global differential gene expression analysis between high and low RFI groups (HRFI and LRFI: less and more efficient, respectively) revealed 73 differentially expressed (DE) annotated genes in Longissimus thoracis (LT) muscle of Nelore steers. These genes are involved in the overrepresented pathways Metabolism of Xenobiotics by Cytochrome P450 and Butanoate and Tryptophan Metabolism. Among the DE transcripts were several proteins related to mitochondrial function and the metabolism of lipids. Our findings indicate that observed gene expression differences are primarily related to metabolic processes underlying oxidative stress. Genes involved in the metabolism of xenobiotics and antioxidant mechanisms were primarily down-regulated, while genes responsible for lipid oxidation and ketogenesis were up-regulated in HRFI group. By using LT muscle, this study reinforces our previous findings using liver tissue and reveals new genes and likely tissue-specific regulators playing key-roles in these processes. |
Palavras-Chave: |
Genome-wide association studies; Quantitative trait locus. |
Thesagro: |
Gado de corte. |
Thesaurus Nal: |
Beef cattle; Feed conversion; Gene expression; Nellore. |
Categoria do assunto: |
-- L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/162313/1/srep39493.pdf
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Marc: |
LEADER 02498naa a2200373 a 4500 001 2073482 005 2019-06-14 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1038/srep39493$2DOI 100 1 $aTIZIOTO, P. L. 245 $aGene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aResidual feed intake (RFI), a measure of feed efficiency (FE), is defined as the difference between the observed and the predictable feed intake considering size and growth of the animal. It is extremely important to beef production systems due to its impact on the allocation of land areas to alternative agricultural production, animal methane emissions, food demand and cost of production. Global differential gene expression analysis between high and low RFI groups (HRFI and LRFI: less and more efficient, respectively) revealed 73 differentially expressed (DE) annotated genes in Longissimus thoracis (LT) muscle of Nelore steers. These genes are involved in the overrepresented pathways Metabolism of Xenobiotics by Cytochrome P450 and Butanoate and Tryptophan Metabolism. Among the DE transcripts were several proteins related to mitochondrial function and the metabolism of lipids. Our findings indicate that observed gene expression differences are primarily related to metabolic processes underlying oxidative stress. Genes involved in the metabolism of xenobiotics and antioxidant mechanisms were primarily down-regulated, while genes responsible for lipid oxidation and ketogenesis were up-regulated in HRFI group. By using LT muscle, this study reinforces our previous findings using liver tissue and reveals new genes and likely tissue-specific regulators playing key-roles in these processes. 650 $aBeef cattle 650 $aFeed conversion 650 $aGene expression 650 $aNellore 650 $aGado de corte 653 $aGenome-wide association studies 653 $aQuantitative trait locus 700 1 $aCOUTINHO, L. L. 700 1 $aOLIVEIRA, P. S. N. 700 1 $aCESAR, A. S. M. 700 1 $aDINIZ, W. J. S. 700 1 $aLIMA, A. O. 700 1 $aROCHA, M. I. 700 1 $aDECKER, J. E. 700 1 $aSCHNABEL, R. D. 700 1 $aMOURÃO, G. B. 700 1 $aTULLIO, R. R. 700 1 $aZERLOTINI NETO, A. 700 1 $aTAYLOR, J. F. 700 1 $aREGITANO, L. C. de A. 773 $tScientific Reports$gv. 6, p. 1-12, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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3. | | NOGUEIRA, E.; TIRPÁK, F.; HAMILTON, L.; ZIGO, M.; KERNS, K.; SUTOVSKY, M.; KIM, J.; VOLKMANN, D.; JOVINE, L.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; SUTOVSKY, P. A Non-synonymous point mutation in a WD-40 domain repeat of EML5 leads to decreased bovine sperm quality and fertility. Frontiers in Cell and Developmental Biology, v. 10, 872740, Apr. 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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4. | | BEHURA, S. K.; TIZIOTO, P. C.; KIM, J.; GRUPIONI, N. V.; SEABURY, C. M.; SCHNABEL, R. D.; GERSHWIN, L. J.; VAN EEnenNAAM, A. L.; TOAF-FROSENSTEIN, R.; NEIBERGS, H. L.; REGITANO, L. C. de A.; TAYLOR, J. F. Tissue tropism in host transcriptional response to members of the bovine respiratory disease complex. Scientific Reports, v.7, n. 17938, p. 1-15, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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17. | | DECKER, J. E.; PIRES, J. C.; CONANT, G. C.; MCKAY, S. D.; HEATON, M. P.; CHEN, K.; COOPER, A.; VIKKI, J.; SEABURY, C. M.; CAETANO, A. R.; JOHNSON, G. D.; BRENNEMAN, R. A.; HANOTTE, O.; EGGERT, L. S.; WIENER, P.; KIM, J.-J.; KIM, K. S.; SONSTEGARD, T. S.; TASSELL, C. P. V.; NEIBERGS, H. L.; MCEWAN, J. C.; BRAUNING, R.; COUTINHO, L. L.; BABAR, M. E.; WILSON, G. A.; MCCLURE, M. C.; ROLF, M. M.; KIM, J. W.; SCHNABEL, R. D.; TAYLOR, J. F. Resolving the evolution of extant and extinct ruminants with hith-throughput phylogenomics. Proceedings of the National Academy of Sciences, v. 106, n. 44, p. 18644-18649, 2009Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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18. | | MCCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. A.; SOUZA, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; MACHADO, M. A.; SIMPSON, B.; MCEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; MARQUES, E.; TASSELL, C. P. V. Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple bos taurus and bos indicus breeds. In: ANNUAL INTERNATIONAL PLANT AND ANIMAL GENOME CONFERENCE, 21., 2013, San Diego. Abstracts... San Diego: [s.n.], 2013.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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19. | | McCLURE, M. C.; SONSTEGARD, T. S.; WIGGANS, G. R.; EENENNAAM, A. L. V.; WEBER, K. L.; PENEDO, C. T.; BERRY, D. P.; FLYNN, J.; GARCIA, J. F.; CARMO, A. S.; REGITANO, L. C. de A.; ALBUQUERQUE, M.; SILVA, M. V. G. B.; MACHADO, M. A.; COFFEY, M.; MOORE, K.; BOSCHER, M. Y.; GENESTOUT, L.; MAZZA, R.; TAYLOR, J. F.; SCHNABEL, R. D.; SIMPSON, B.; MARQUES, E.; McEWAN, J. C.; CROMIE, A.; COUTINHO, L. L.; KUEHN, L. A.; KEELE, J. W.; PIPER, E. K.; COOK, J.; WILLIAMS, R.; TASSELL, C. P. V. Imputation of microsatellite alleles from dense SNP genotypes for parentage verification across multiple Bos taurus and Bos indicus breeds. Frontiers in Genetics, v. 4, n. 176, 2013. 11 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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20. | | GIBBS, R. A.; TAYLOR, J. F.; VAN TASSELL, C. P.; BARENDSE, W.; EVERSOLE, K. A.; GILL, C. A.; GREEN, R. D.; HAMERNIK, D. L.; KAPPES, S. M.; LIEN, S.; MATUKUMALLI, L. K.; MCEWAN, J. C.; NAZARETH, L. V.; SCHNABEL, R. D.; WEINSTOCK, G. M.; WHEELER, D. A.; AJMONE-MARSAN, P.; BOETTCHER, P. J.; CAETANO, A. R.; GARCIA, J. F.; HANOTTE, O.; MARIANI, P.; SKOW, L. C.; SONSTEGARD, T. S.; WILLIAMS, J. L.; DIALLO, B.; HAILEMARIAM, L.; MARTINEZ, M. L.; MORRIS, C. A.; SILVA, L. O. C. da; SPELMAN, R. J.; MULATU, W.; ZHAO, K.; ABBEY, C. A.; AGABA, M.; ARAUJO, F. R.; BUNCH, R. J.; BURTON, J.; GORNI, C.; OLIVIER, H.; HARRISON, B. E.; LUFF, B.; MACHADO, M. A.; MWAKAYA, J.; PLASTOW, G.; SIM, W.; SMITH, T.; THOMAZ, M. B.; VALENTINI, A.; WILLIAMS, P.; WOMACK, J.; WOOLLIAMS, J. A.; LIU, Y.; QIN, X.; WORLEY, K. C.; GAO, C.; JIANG, H.; MOORE, S. S.; REN, Y.; SONG, X.-Z.; BUSTAMANTE, C. D.; HERNANDEZ, R. D.; MUZNY, D. M.; PATIL, S.; SAN LUCAS, A.; FU, Q.; KENT, M. P.; VEGA, R.; MATUKUMALLI, A.; MCWILLIAM, S.; SCLEP, G.; BRYC, K.; CHOI, J.; GAO, H.; GREFENSTETTE, J. J.; MURDOCH, B.; STELLA, A.; VILLA-ANGULO, R.; WRIGHT, M.; AERTS, J.; JANN, O.; NEGRINI, R.; GODDARD, M. E.; HAYES, B. J.; BRADLEY, D. G.; SILVA, M. V. G. B.; LAU, L. P. L.; LIU, G. E.; LYNN, D. J.; PANZITTA, F.; DODDS, K. G. Genome-wide survey of SNP variation uncovers the genetic structure of cattle breeds. Science, v. 324, n. 5926, p. 528-532, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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