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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
18/10/2019 |
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Data da última atualização: |
23/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEREIRA, L. F. P.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; SANT'ANA, G. C.; NOGUEIRA, L.; PEREIRA, L. A.; SILVA, B. S. R. da; GUIMARÃES, P. de S.; GUERREIRO FILHO, O.; PADILHA, L. |
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Afiliação: |
LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; Juliana C. M. Schenk, Bolsista CNPq/INCT/Embrapa Café/IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; Gustavo C. Sant'ana, Tropical Melhoramento & Genética - TMG; Livia Nogueira, Universidade Estadual de Londrina - UEL. Bolsista CAPES; Ligia A. Pereira, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Bruna S. R. da Silva, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/DSc; Paula de S. Guimarães, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Oliveiro Guerreiro Filho, Instituto Agronômico Campinas - IAC. Bolsista CNPq DT; LILIAN PADILHA, CNPCa. |
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Título: |
Marcadores SNP avaliados em cultivares de Café Arábica. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars. |
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Conteúdo: |
A demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país. MenosA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para an... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cultivar discrimination; Discriminação de cultivar; GBS. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203198/1/Marcadores-SNP-avaliados.pdf
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Marc: |
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500 $aTítulo em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars.
520 $aA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Origem |
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| Registros recuperados : 17 | |
| 6. |  | LOPES, M. de R.; SOUZA, G. da S. e; LOPES, I. V.; HONCZAR, G. O problemas do acesso ao capital na agricultura brasileira. Revista de Política Agrícola, Brasília, DF, ano 10, n. 4, p. 16-25, Out./Nov./Dez. 2001.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 9. | | LOPES, M. de R.; SOUZA, G. da S. e; ROCHA, D. de P.; LOPES, I. V.; HONCZAR, G. Quem são e como decidem os agricultores líderes da agropecuária brasileira. Revista de Política Agrícola, Brasília, ano 11, nº 2, p. 21-30, Abr./Maio/Jun. 2002.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 10. | | LOPES, M. de R.; SOUZA, G. da S. e; ROCHA, D. de P.; LOPES, I. V.; HONCZAR, G. Perfil do produtor rural e capacitação profissional na agricultura. Revista de Política Agrícola, Brasília, DF, ano 11 , n. 4, p. 57-69, out./nov./dez. 2002 , ano 12, nº 1, jan./fev./mar. 2003.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | MATTOSO, M. J.; LOPES, M. de R.; VIEIRA, R. de C. M. T.; OLIVEIRA, A. J. de; LIMA FILHO, J. R. de; SANTOS FILHO, J. dos. Cadeia produtiva do milho. In: VIEIRA, R. de C. M. T.; TEIXEIRA FILHO, A. R.; OLIVEIRA, A. J.; LOPES, M. R. (Ed.). Cadeias produtivas no Brasil: análise da competitividade. Brasília, DF: EmbrapaComunicação para Transferência de Tecnologia: Embrapa, Secretária de Administração Estratégica, 2001. p. 321-333.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 13. | | TALAMINI, D. J. D.; LOPES, M. de R.; MARTINS, F. M.; OLIVEIRA, A. J. de; LIMA FILHO. de; BARCELOS, F. C. Effects of public policies in the poultry chain in the west of Santa Catarina state, Brazil. In: INTERNATIONAL PENSA CONFERENCE, 6., 2007., Ribeirão Preto. Sustainable agri-food and bioenergy chains/netwoeks economics and management: proceedings. Ribeirão Preto: University of São Paulo, 2007. 1p. Projeto n. 16.00.30001-16| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 14. | | TALAMINI, D. J. D.; LOPES, M. de R.; MARTINS, F. M.; OLIVEIRA, A. J. de; LIMA FILHO, J. R. de; BARCELOS, F. C. Effects of public policies in the poultry chain in the west of Santa Catarina state, Brazil. In: INTERNATIONAL PENSA CONFERENCE, 6., 2007., Ribeirão Preto. Sustainable agri-food and bioenergy chains/netwoeks economics and management: proceedings. Ribeirão Preto: University of São Paulo, 2007. 13 p. Projeto n. 16.00.30001-16| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 15. | | LOPES, M. de R.; SOUZA, G. da S. e; LOPES, I. G. V.; OLIVEIRA, M. S. de; BARCELOS, F. C.; BOGADO, P. R. Estradas rurais ou urbano-industriais: processo de escolha em regime de competição por fundos públicos. Revista de Política Agrícola, Brasília, DF, ano 17, n. 4, p. 47-64, out./dez. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | PAULINELLI, A.; LUISELLI, C.; ROCHA, C. M. C. da; ALVES, E. R. de A.; DALL'ACQUA, F.; MELO, F. H. de; CABRAL, J. I.; LOPES, M. de R.; OTERO, M. Os desafios da agricultura brasileira nos anos 90: da crise macroeconomica ao crescimento setorial auto-sustentado. Brasília, DF: IICA, 1989. 225p. (Proposicoes, resultados e recomendacoes de eventos tecnicos, n.A4/SB-89-01) Na publicação: Eliseu Alves.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Registros recuperados : 17 | |
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