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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Cerrados. |
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Data corrente: |
03/02/2016 |
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Data da última atualização: |
08/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SOUZA, L. M. de; LE GUEN, V.; CERQUEIRA-SILVA, C. B. M.; SILVA, C. C.; MANTELLO, C. C.; CONSON, A. R. O.; VIANNA, J. P. G.; ZUCCHI, M. I.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FIALHO, J. de F.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, P. de S.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
JOSEFINO DE FREITAS FIALHO, CPAC. |
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Título: |
Genetic diversity strategy for the management and use of rubber genetic resources: more than 1,000 wild and cultivated accessions in a 100-Genotype core collection. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plos One, San Francisco, v. 10, n. 7, e013607, 2015. |
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DOI: |
10.1371/journal.pone.0134607. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Abstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other species from Amazonas was observed. A core collection of 99 accessions was identified that captured the maximum genetic diversity. Rubber tree breeders can effectively utilize this core collection for cultivar improvement. Furthermore, such a core collection could provide resources for forming an association panel to evaluate traits with agronomic and commercial importance. Our study generated a molecular database that should facilitate the management of the Hevea germplasm and its use for subsequent genetic and genomic breeding. MenosAbstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other spec... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Estrutura genética; Genetic structure; Natural rubber. |
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Thesagro: |
Hevea Brasiliensis. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/138347/1/Josefino-genetic-diversity.pdf
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Marc: |
LEADER 03065naa a2200325 a 4500
001 2035994
005 2017-02-08
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
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520 $aAbstract - The rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg.] is the only plant species worldwide that is cultivated for the commercial production of natural rubber. This study describes the genetic diversity of the Hevea spp. complex that is available in the main ex situ collections of South America, including Amazonian populations that have never been previously described. Genetic data were analyzed to determine the genetic structure of the wild populations, quantify the allelic diversity and suggest the composition of a core collection to capture the maximum genetic diversity within a minimal sample size. A total of 1,117 accessions were genotyped with 13 microsatellite markers. We identified a total of 408 alleles, 319 of which were shared between groups and 89 that were private in different groups of accessions. In a population structure and principal component analysis, the level of clustering reflected a primary division into the following two subgroups: cluster 1, which consisted of varieties from the advanced breeding germplasm that originated from the Wickham and Mato Grosso accessions; and cluster 2, which consisted of the wild germplasm from the Acre, Amazonas, Pará and Rondônia populations and Hevea spp. The analyses revealed a high frequency of gene flow between the groups, with the genetic differentiation coefficient (GST) estimated to be 0.018. Additionally, no distinct separation among the H. brasiliensis accessions and the other species from Amazonas was observed. A core collection of 99 accessions was identified that captured the maximum genetic diversity. Rubber tree breeders can effectively utilize this core collection for cultivar improvement. Furthermore, such a core collection could provide resources for forming an association panel to evaluate traits with agronomic and commercial importance. Our study generated a molecular database that should facilitate the management of the Hevea germplasm and its use for subsequent genetic and genomic breeding.
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700 1 $aSOUZA, A. P. de
773 $tPlos One, San Francisco$gv. 10, n. 7, e013607, 2015.
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Registro original: |
Embrapa Cerrados (CPAC) |
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| Registros recuperados : 34 | |
| 1. |  | SAMPAIO, Y. S.; SILVA, M. J.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. S.; MARTINS, M. A. Avaliação das propriedades tecnológicas da borracha natural de clones de seringueira PC 96 e PC 141 e IRCA 111 do Estado de São Paulo. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 12., 2020, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2020. Editores técnicos: Cristiane Sanchez Farinas, Daniel Souza Corrêa, José Manoel Marconcini, Maria Fernanda Berlingieri Durigan, Paulo Sérgio de Paula Herrmann Junior. 73 Embrapa Instrumentação. Documentos, 71.| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 4. | | SCALOPPI JUNIOR, E. J.; ROMERA, D. M; MARTINS, A. N.; NOMURA, E. S.; SILVA, S. de O e. Avaliação agronômica de genótipos de bananeiras em Votuporanga-SP: primeiro ciclo de produção. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE BANANICULTURA, 7., 2010, Registro, SP. Atualidades e perspectivas da bananicultura sustentável. Registro: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. 5 p. PDF T3.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | ZENATTI, S.; MORENO, R. M. B.; SCALOPPI-JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Caracterização do latéx do e da borracha natural do clone RRIM 600. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE INSTRUMENTAÇÃO AGROPECUÁRIA, 2014, São Carlos, SP Anais do SIAGRO: ciência, inovação e mercado 2014. São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2014. p. 451-454. Editores: Carlos Manoel Pedro Vaz, Débora Marcondes Bastos Pereira Milori, Silvio Crestana.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 7. | | MORENO, R. M. B.; MARTINS, M. A.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. S.; MATTOSO, L. H. C. Studies of natural rubber of the brazilian clones from IAC SERIES 500 In: INTERNATIONAL SEMINAR ON ELASTOMERS - ISE, 13., 2012, Búzios, RJ. Anais... Rio de Janeiro: UERJ, 2012. p. 27-28. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 8. | | ONO, D.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Estudo da influência do processamento na qualidade da água residual e nas propriedades da borracha natural. In: WORKSHOP DA REDE DE NANOTECNOLOGIA APLICADA AO AGRONEGÓCIO, 7.; ESCOLA DE NANOTECNOLOGIA, 3., 2013, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: Embrapa Instrumentação, 2013. p. 300-302 Editores: Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso. CD-ROM. Editores: Maria Alice Martins, Odílio Benedito Garrido de Assis, Caue Ribeiro, Luiz Henrique Capparelli Mattoso.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 9. | | ZENATTI, S.; PARIS, E. C.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Estudo da influência do teor de nanopartículas de titanato de bário nas propriedades de nanocompósitos com borracha natural. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p. 77. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 10. | | SILVA, M. J.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MARTINS, M. A.; MATTOSO, L. H. C. Estudo das propriedades do latex dos clones RRIM 600 e RRIM 926 da Hevea brasiliensis. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p. 71. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 11. | | SANT'ANNA, I. C.; GOUVÊA, L. R. L.; MARTINS, M. A.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; FREITAS, R. S.; GONÇALVES, P. S. Genetic diversity associated with natural rubber quality in elite genotypes of the rubber tree. ScientifIc Reports, v. 11, ed. 1, 1081, 2021. 1 - 10| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 12. | | VERARDI, C. K.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; SILVA, G. A P.; GOUVÊA, L. R. L.; GONÇALVES, P. de S. Genetic parameters and estimated genetic gains in young rubber tree progenies. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 4, p. 411-416, abr. 2013. Título em português: Parâmetros genéticos e ganhos de seleção estimados em progênies jovens de seringueira.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | SILVA, M. J.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Propriedades tecnológicas dos novos clones PC 119, PM 10, e PB 291. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE HEVEICULTURA, 4., 2015, São José do Rio Preto. [Anais...] São José do rio Preto: CEDAGRO, 2015. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 14. | | SCALOPPI JUNIOR, E. J.; ROMERA, D. M.; MARTINS, A. N.; NOMURA, E. S.; SILVA, S. de O. e; AMORIM, E. P. Avaliação agronômica de genótipos de bananeiras em Votuporanga-SP: primeiro ciclo de produção In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 977| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 15. | | ARANTES, F. C.; SCALOPPI JUNIOR, E. J. S.; GONÇALVES, P. S.; MORAES, M. L. T. de; GONÇALVES, E. C. P.; RESENDE, M. D. V. de. Adaptability and stability in rubber tree progenies under different environmental conditions. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 33, n. 73, p. 37-44, jan./mar. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 16. | | GONÇALVES, P. de S.; SCALOPPI JÚNIOR, E. J.; MARTINS, M. A.; MORENO, R. M. B.; BRANCO, R. B. F.; GONÇALVES, E. C. P. Assessment of growth and yield performance of rubber tree clones of the IAC 500 series. Pesq. agropec. bras,. Brasília, v. 46, n.12, p. 1643-1649, dez. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | MORENO, R. M. B.; SILVA, M. J.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; MARTINS, M. A.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C. Avaliação e monitoramento das propriedades tecnológicas da borracha natural dos novos clones da série PB 300. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p. 76. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 18. | | SILVA, M. J.; SPINELLI, R. O.; MORENO, R. M. B.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Clones PB 314 e PB 346: estudo das propriedades tecnológicas e comportamento térmico de agosto a dezembro de 2014. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA DA BORRACHA, 16, 2016, São Paulo. Poster... [São Paulo]: ABTB, 2016. não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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| 19. | | MARTINS, A. N.; DIAS, N. M. S.; SUGUINO, E.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; PERDONÁ, M. J.; AMORIM, E. P.; SILVA, S. de O. e. Comportamento agronômico de genótipos de bananeira em Palmital (SP) no primeiro ciclo de produção. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. pdf 555| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 20. | | MARCHIORI, E.; SPINELLI, R. de O.; SCALOPPI JUNIOR, E. J.; GONÇALVES, P. de S.; MATTOSO, L. H. C.; MARTINS, M. A. Avaliação da viscosidade Mooney, plasticidade Wallace e índice de retenção de plasticidade dos novos clones RRIM 711, 713, 908 e 937 no período de janeiro de 2015 a dezembro de 2015. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 8., 2016, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2016. p. 60. Editores técnicos: Wilson Tadeu Lopes da Silva, José Manoel Marconcini, Maria Alice Martins, Lucimara Aparecida Forato, Paulino Ribeiro Villas Boas. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 61).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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