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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
30/03/2012 |
Data da última atualização: |
30/03/2012 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
SAWAZAKI, H. E.; SÁ, L. A. N. de; ALCÂNTARA, M. Q.; POLEZ, V. L. P.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. |
Afiliação: |
HAIKO ENOK SAWAZAKI, IAC; LUIZ ALEXANDRE NOGUEIRA DE SA, CNPMA; MAILA Q. ALCÂNTARA, CNPq. |
Título: |
Otimização da diagnose molecular de vírus, bactéria e fungo em cana-de-açúcar. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Biológico, São Paulo, v. 73, n. 2, p. 282-287, 2011. Anais da 24ª Reunião Anual do Instituto Biológico, São Paulo, nov. 2011. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
RESUMO: Visando à otimização da diagnose molecular de plântulas de cana-de-açúcar, tentou-se desenvolver iniciadores específicos para escaldadura e ferrugem alaranjada, assim como a comparação da PCR comum e a PCR em Tempo Real (PCR/TR) de maior resolução, importante para doenças com grande período de latência, como as causadas por: 1- Bactérias, (a) raquitismo-da-soqueira (Leifsonina xyli subsp. Xyli) e (b) escaldadura (Xanthomonas aibilineans); 2- Vírus, (a) amarelinho (Sugarcane Yellow Leaf Vírus); (b) mosaico (Sugarcane Mosaic Vírus) e (c) fijivirus (Fiji disease vírus); 3- fungo, (a) carvão (Sporisorium scitamineum) e (b) ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii). As plântulas foram obtidas do quarentenário do IAC. Os iniciadores da literatura para cana-de-açúcar detectaram especificamente o raquitismo, amarelinho, mosaico e fijivirus, enquanto os desenvolvidos para PCR/TR para as mesmas doenças, incluindo a escaldadura e ferrugem alaranjada, possibilitaram a detecção com maior diluição das amostras. Os iniciadores da ferrugem alaranjada, além de não detectarem a ferrugem marrom, também diferenciaram a ferrugem branca do milho. Os da escaldadura não foram específicos somente para o gênero Erwinia, enquanto que os da literatura não diferenciaram também outras espécies dos gêneros Kanthomonas, Pseudomonas, Enwinia, Stenotrophomona e Pantoea. A otimização das diluições para PCR/TR a partir de cDNA foi de apenas lOX. Porém, para extratos de DNA de planta, foi maior, de lOOX a lOOOX,indicando a maior sensibilidade do método. Dos 28 pares de iniciadores testados, os melhores para o agente causal de cada doença e curvas de diluições (com eficiência de PCR de 1,05 a 1,28) são apresentados. MenosRESUMO: Visando à otimização da diagnose molecular de plântulas de cana-de-açúcar, tentou-se desenvolver iniciadores específicos para escaldadura e ferrugem alaranjada, assim como a comparação da PCR comum e a PCR em Tempo Real (PCR/TR) de maior resolução, importante para doenças com grande período de latência, como as causadas por: 1- Bactérias, (a) raquitismo-da-soqueira (Leifsonina xyli subsp. Xyli) e (b) escaldadura (Xanthomonas aibilineans); 2- Vírus, (a) amarelinho (Sugarcane Yellow Leaf Vírus); (b) mosaico (Sugarcane Mosaic Vírus) e (c) fijivirus (Fiji disease vírus); 3- fungo, (a) carvão (Sporisorium scitamineum) e (b) ferrugem alaranjada (Puccinia kuehnii). As plântulas foram obtidas do quarentenário do IAC. Os iniciadores da literatura para cana-de-açúcar detectaram especificamente o raquitismo, amarelinho, mosaico e fijivirus, enquanto os desenvolvidos para PCR/TR para as mesmas doenças, incluindo a escaldadura e ferrugem alaranjada, possibilitaram a detecção com maior diluição das amostras. Os iniciadores da ferrugem alaranjada, além de não detectarem a ferrugem marrom, também diferenciaram a ferrugem branca do milho. Os da escaldadura não foram específicos somente para o gênero Erwinia, enquanto que os da literatura não diferenciaram também outras espécies dos gêneros Kanthomonas, Pseudomonas, Enwinia, Stenotrophomona e Pantoea. A otimização das diluições para PCR/TR a partir de cDNA foi de apenas lOX. Porém, para extratos de DNA de planta, foi maior, de lOOX a ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Análises moleculares; Cana-de-açúcar; Raquitismo-da-soqueira. |
Thesagro: |
Amarelinho; Bactéria; Carvão; Escaldadura; Ferrugem Alaranjada; Mosaico; Vírus. |
Thesaurus Nal: |
Fijivirus; Plant diseases and disorders; Sugarcane. |
Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/56756/1/2011AA106.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Registros recuperados : 12 | |
1. | | SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; POLEZ, V. L. P.; SA, L. A. N. de; VEIGA, R. F. A.; S. H. R. GRANDI. Caracterização molecular inicial da mancha de curvularia (Curvularia inaequalis) em plantas de cana-de-açúcar. In: Summa Phytopathologica, v. 38, supl. resumo 247, 2012. Edição dos resumos do 35º Congresso Paulista de Fitopatologia, 2012, Jaguariúna.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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2. | | SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; POLEZ, V. L. P.; SA, L. A. N. de; VEIGA, R. F. A.; GRANDI, S. H. R. Caracterização molecular do sugarcane streak mosaic virus (SCSMV). In: Summa Phytopathologica, v. 38, supl. resumo 256, 2012. Edição dos resumos do 35º Congresso Paulista de Fitopatologia, 2012, Jaguariúna.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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3. | | SAWAZAKI, E.; GALLO, P. B.; CASTRO, J. L.; SAWAZAKI, H. E.; DUARTE, A.; VIANA, J. M. S.; MIRANDA, G. V.; PACHECO, C. A. P. Comportamento de genótipos de milho pipoca na região Centro-Sul do Estado de São Paulo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte, Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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4. | | SAWAZAKI, E.; GALLO, P. B.; CASTRO, J. L.; SAWAZAKI, H. E.; DUARTE, A.; VIANA, J. M. S.; MIRANDA, G. V.; PACHECO, C. A. P. Comportamento de genótipos de milho pipoca na região Centro-Sul do Estado de São Paulo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: resumos. Sete Lagoas: ABMS: Embrapa Milho e Sorgo, 2006. p. 257.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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5. | | SIQUEIRA, D. M.; SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; SA, L. A. N. de; POLEZ, V. L. P.; VEIGA, R. F. de A. Validação de marcadores moleculares ligados a genes de resistência da ferrugem marrom para a ferrugem laranja da cana-de-açúcar. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 5., 2011, Campinas. Anais... Campinas: Embrapa Monitoramento por Satélite, 2011. 1 CD ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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6. | | SAWAZAKI, H. E.; SA, L. A. N. de; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. Molecular diagnosis optimization of virus, bacteria and fungi in sugarcane. Internacional Research Journal of Plant Science, Sapele, v. 4, n. 3, p. 76-83, 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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7. | | SAWAZAKI, H. E.; SÁ, L. A. N. de; ALCÂNTARA, M. Q.; POLEZ, V. L. P.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. Otimização da diagnose molecular de vírus, bactéria e fungo em cana-de-açúcar. Biológico, São Paulo, v. 73, n. 2, p. 282-287, 2011. Anais da 24ª Reunião Anual do Instituto Biológico, São Paulo, nov. 2011.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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8. | | CARVALHO, V. C.; SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; SENGER, M. M. M.; SA, L. A. N. de; VEGA, R. F. A.; ALCÂNTARA, M. Q.; COLOMBO, C. A. Análises moleculares de bactérias e fungo em cana-de-açúcar. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2010, Campinas. Anais... Campinas: IAC: ITAL: APTA; Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2010. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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9. | | SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; SA, L. A. N. de; VEGA, R. F. A.; RIBEIRO, C.; MARTINS, M. C.; CARVALHO, V. C.; SENGER, M. M. M. Análises moleculares de bactérias e fungo em cana-de-açúcar. In: CONGRESSO PAULISTA DE FITOPATOLOGIA, 33., 2010, Ituverava. Resumos... Ituverava: Grupo Paulista de Fitopatologia, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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10. | | SA, L. A. N. de; PESSOA, M. C. P. Y.; SAWAZAKI, H. E.; TANAKA, J. A. C. de S.; VEIGA, R. F. A. de; WILCKEN, C. F.; DUDIENAS, C.; ROSSI, C. E.; TEIXEIRA, E. P.; DEUBER, R. Desenvolvimento de métodos e aplicativos para sistemas quarentenários em apoio à defesa agropecuária nas culturas de citros, cana-de-açúcar, eucalipto e flores/plantas ornamentais no Estado de São Paulo. In: FÓRUM DE APRESENTAÇÃO DE RESULTADOS DE PESQUISA: AVANÇOS E OPORTUNIDADES, 1., 2014, Campinas. Anais... Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2014. RE017. 9 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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11. | | SAWAZAKI, H. E.; SIQUEIRA, D. M.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; SA, L. A. N. de; FERREIRA, D. N. M.; POLEZ, V. L. P.; VEIGA, R. F. A. Validação preliminar de marcadores de resistência a ferrugem marrom (Puccinia melanocephala) para a ferrugem laranja (P. kuehnii) da cana-de-açúcar. In: CONGRESSO PAULISTA DE FITOPATOLOGIA, 34., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Grupo Paulista de Fitopatologia, 2011. n. 200.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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12. | | VIEIRA, L. G. E.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; MORAES, A. H. de A.; METHA, A.; OLIVEIRA, A. C. de; LABATE, C. A.; MARINO, C. L.; MONTEIRO-VITORELLO, C. de B.; MONTE, D. C.; GIGLIOTI, E.; KIMURA, E. T.; ROMANO, E.; KURAMAE, E. E.; LEMOS, E. G. M.; ALMEIDA, E. R. P. de; JORGE, E. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S.; SILVA, F. R. da; VINECKY, F.; SAWAZAKI, H. E.; DORRY, H. F. A.; CARRER, H.; ABREU, I. N.; BATISTA, J. A. N.; TEIXEIRA, J. B.; KITAJIMA, J. P.; XAVIER, K. G.; LIMA, L. M. de; CAMARGO, L. E. A. de; PEREIRA, L. F. P.; COUTINHO, L. L.; LEMOS, M. V. F.; ROMANO, M. R.; MACHADO, M. A.; COSTA, M. M. do C.; SÁ, M. F. G. de; GOLDMAN, M. H. S.; FERRO, M. I. T.; TINOCO, M. L. P.; OLIVEIRA, M. C.; VAN SLUYS, M-A.; SHIMIZU, M. M.; MALUF, M. P.; EIRA, M. T. S. da; GUERREIRO FILHO, O.; ARRUDA, P.; MAZZAFERA, P.; MARIANI, P. D. S. C.; OLIVEIRA, R. L. B. C. de; HARAKAVA, R.; BALBAO, S. F.; TSAI, S. M.; MAURO, S. M. Z. di; SANTOS, S. N.; SIQUEIRA, W. J.; COSTA, G. G. L.; FORMIGHIERI, E. F.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource. Brazilian Journal of Plant Physiology, v. 18, n. 1, p. 95-108, 2006.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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