| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
|
Data corrente: |
09/09/2021 |
|
Data da última atualização: |
15/10/2021 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
HUL, L. M.; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; MARCELINO, D. E. P.; FERNANDES, L. T.; PEIXOTO, J. O.; CANTAO, M. E.; HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. |
|
Afiliação: |
LUDMILA MUDRI HUL, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO CENTRO-OESTE, GUARAPUAVA; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CNPSA; IGOR RICARDO SAVOLDI, UDESC; DÉBORA ESTER PETRY MARCELINO, FACULDADE DE CONCÓRDIA; LANA TEIXEIRA FERNANDES; JANE OLIVEIRA PEIXOTO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO CENTRO-OESTE, GUARAPUAVA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LUIZ LEHMANN COUTINHO, ESALQ/USP; MONICA CORREA LEDUR, CNPSA. |
|
Título: |
Differentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens. |
|
Ano de publicação: |
2021 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientific Reports, v. 11, n. 1, p. 1-13. 2021. |
|
DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41598-021-97306-3 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Notas: |
Article number: 17965. |
|
Conteúdo: |
Locomotor problems are among one of the main concerns in the current poultry industry, causing major economic losses and affecting animal welfare. The most common bone anomalies in the femur are dyschondroplasia, femoral head separation (FHS), and bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO), also known as femoral head necrosis (FHN). The present study aimed to identify differentially expressed (DE) genes in the articular cartilage (AC) of normal and FHS-affected broilers by RNA-Seq analysis. In the transcriptome analysis, 12,169 genes were expressed in the femur AC. Of those, 107 genes were DE (FDR < 0.05) between normal and affected chickens, of which 9 were downregulated and 98 were upregulated in the affected broilers. In the gene-set enrichment analysis using the DE genes, 79 biological processes (BP) were identified and were grouped into 12 superclusters. The main BP found were involved in the response to biotic stimulus, gas transport, cellular activation, carbohydrate-derived catabolism, multi-organism regulation, immune system, muscle contraction, multi-organism process, cytolysis, leukocytes and cell adhesion. In this study, the first transcriptome analysis of the broilers femur articular cartilage was performed, and a set of candidate genes (AvBD1, AvBD2, ANK1, EPX, ADA, RHAG) that could trigger changes in the broiler´s femoral growth plate was identified. Moreover, these results could be helpful to better understand FHN in chickens and possibly in humans. |
|
Palavras-Chave: |
Análises de expressão diferencial; Cartilagem da cabeça do fêmur; Differential expression analysis; Expressão gênica; Reação da cadeia de polimerase; Separação da cabeça femoral; Sequenciamento de RNA; Transcriptoma da cartilagem do fêmur. |
|
Thesagro: |
Frango; Frango de Corte. |
|
Thesaurus Nal: |
Broiler chickens; Gene expression; Quantitative polymerase chain reaction; Transcriptome. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/226988/1/final9712.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02920naa a2200433 a 4500
001 2135377
005 2021-10-15
008 2021 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41598-021-97306-3$2DOI
100 1 $aHUL, L. M.
245 $aDifferentially expressed genes in the femur cartilage transcriptome clarify the understanding of femoral head separation in chickens.$h[electronic resource]
260 $c2021
500 $aArticle number: 17965.
520 $aLocomotor problems are among one of the main concerns in the current poultry industry, causing major economic losses and affecting animal welfare. The most common bone anomalies in the femur are dyschondroplasia, femoral head separation (FHS), and bacterial chondronecrosis with osteomyelitis (BCO), also known as femoral head necrosis (FHN). The present study aimed to identify differentially expressed (DE) genes in the articular cartilage (AC) of normal and FHS-affected broilers by RNA-Seq analysis. In the transcriptome analysis, 12,169 genes were expressed in the femur AC. Of those, 107 genes were DE (FDR < 0.05) between normal and affected chickens, of which 9 were downregulated and 98 were upregulated in the affected broilers. In the gene-set enrichment analysis using the DE genes, 79 biological processes (BP) were identified and were grouped into 12 superclusters. The main BP found were involved in the response to biotic stimulus, gas transport, cellular activation, carbohydrate-derived catabolism, multi-organism regulation, immune system, muscle contraction, multi-organism process, cytolysis, leukocytes and cell adhesion. In this study, the first transcriptome analysis of the broilers femur articular cartilage was performed, and a set of candidate genes (AvBD1, AvBD2, ANK1, EPX, ADA, RHAG) that could trigger changes in the broiler´s femoral growth plate was identified. Moreover, these results could be helpful to better understand FHN in chickens and possibly in humans.
650 $aBroiler chickens
650 $aGene expression
650 $aQuantitative polymerase chain reaction
650 $aTranscriptome
650 $aFrango
650 $aFrango de Corte
653 $aAnálises de expressão diferencial
653 $aCartilagem da cabeça do fêmur
653 $aDifferential expression analysis
653 $aExpressão gênica
653 $aReação da cadeia de polimerase
653 $aSeparação da cabeça femoral
653 $aSequenciamento de RNA
653 $aTranscriptoma da cartilagem do fêmur
700 1 $aIBELLI, A. M. G.
700 1 $aSAVOLDI, I. R.
700 1 $aMARCELINO, D. E. P.
700 1 $aFERNANDES, L. T.
700 1 $aPEIXOTO, J. O.
700 1 $aCANTAO, M. E.
700 1 $aHIGA, R. H.
700 1 $aGIACHETTO, P. F.
700 1 $aCOUTINHO, L. L.
700 1 $aLEDUR, M. C.
773 $tScientific Reports$gv. 11, n. 1, p. 1-13. 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 31 | |
| 21. |  | KOWACIC, R. da C.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Genes Col16A1 e ANGPT4 são menos expressos em suínos afetados com osteocondrose latens. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 10., 2016, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2017. p. 15-16. JINC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|    |
| 22. | | RODRIGUES, A. F. G.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; OLIVEIRA, H. C. de; SAVOLDI, I. R.; SOUZA, M. R.; MORES, M. A. Z.; CARREÑO, L. O. D.; LEDUR, M. C. Genes and SNPs Involved with Scrotal and Umbilical Hernia in Pigs. Genes, v. 12, n. 166, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
|  |
| 23. | | SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; LAGOS, E. B.; LOPES, J. S.; ZANELLA, R.; LEDUR, M. C. A joint analysis using exome and transcriptome data identifiescandidate polymorphisms and genes involved with umbilical hernia in pigs. BMC Genomics, v. 22, n. 818, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 24. | | LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; OLIVEIRA, H. C. de; LEDUR, M. C. Identification of endogenous normalizing genes for expression studies in inguinal ring tissue for scrotal hernias in pigs. Plos One, v. 13, n.9, e0204348, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 25. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; MORÉS, N.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial no cromossomo 6 de suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 13., 2019, Concórdia. Anais... Concórdia: Embrapa Suínos e Aves: UNC, 2019. p. 36-37. JINC 2019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 26. | | DAL PIZZOL, M. S.; IBELLI, A. M. G.; SALMÓRIA, L. A.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; PERTILLE, F.; MARIANI, P. D. S. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Perfil de metilação diferencial em suínos normais e afetados com osteocondrose latens. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL ON-LINE, 14., 2021. Anais... Chapecó: UDESC: Concórdia: Embrapa Suínos e Aves, 2022.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 27. | | PEIXOTO, J. de O.; SAVOLDI, I. R.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; ZANELLA, R.; MARCHESI, J. A. P.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Proximal femoral head transcriptome reveals novel candidate genes related to epiphysiolysis in broiler chickens. BMC Genomics, v. 20, p. 1-17, 2019. Na publicação: José Rodrigo Pandolfi. Article number: 1031.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 28. | | SILVA, A. N. da; IBELLI, A. M. G.; SAVOLDI, I. R.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, E. L.; MARQUES, M. G.; SILVA, M. V. G. B.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; LOPES, J. S.; VARGAS, J. E.; ZANELLA, R. Whole-exome sequencing indicated new candidate genes associated with unilateral cryptorchidism in pigs. Sexual Development, 9 Feb 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 29. | | SAVOLDI, I. R; DAL PIZZOL, M. S.; CARMO, K. B. do; IBELLI, A. M. G.; KRAMER, B.; MORES, M. A. Z.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; JAENISCH, F. R. F.; AVILA, V. S. de; KRABBE, E. L.; LEDUR, M. C.; PANDOLFI, J. R. C. Caracterização metagenômica do microbioma intestinal de aves de corte através do sequenciamento parcial do gene 16S-rRNA. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA (JINC), 10., 2016, Concórdia. Anais... Brasília: Embrapa, 2016. p. 54-55.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 30. | | ROMANO, G. de S.; LORENZETTI, W. R.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, M. A. Z.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; LOPES, J. S.; PEDROSA, V. B.; CANTAO, M. E.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. The involvement of muscle-related genes in the occurrence of scrotal hernia in pigs. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland, New Zealand. Proceedings... Massey University, 2018. Digital Archive.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 31. | | ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; MORES, N.; MORES, M. A. Z.; CANTAO, M. E.; RECH, R. R.; SAVOLDI, I. R.; CARMO, K. B. do; FIGUEIREDO, E. A. P. de; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C. Identificação de mecanismos genéticos envolvidos na oesteocondrose latens em suínos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| Registros recuperados : 31 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
