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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sudeste. |
Data corrente: |
02/12/2016 |
Data da última atualização: |
02/12/2016 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C. S.; JUNGMANN, L.; VALLE, C. B. do; MOLLINARI, M.; PASTINA, M. M.; PAGLIARINI, M. S.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. |
Afiliação: |
Bianca B. Z. Vigna, UNICAMP; Jean C. S. Santos, UNICAMP; LETICIA JUNGMANN CANCADO, CNPAE; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; Marcelo Mollinari, ESALQ; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS; Maria Suely Pagliarini, Universidade Estadual de Maringá; Antonio A. F. Garcia, ESALQ; Anete P. Souza, UNICAMP. |
Título: |
Evidence of Allopolyploidy in Urochloa humidicola based on cytological analysis and genetic linkage mapping. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
Plos One, San Francisco, v. 11, n. 4, p. 1-23, Apr. 2016. |
DOI: |
10.1371/ journal.pone.0153764 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The African species Urochloa humidicola (Rendle) Morrone & Zuloaga (syn. Brachiaria humidicola (Rendle) Schweick.) is an important perennial forage grass found throughout the tropics. This species is polyploid, ranging from tetra to nonaploid, and apomictic, which makes genetic studies challenging; therefore, the number of currently available genetic resources is limited. The genomic architecture and evolution of U. humidicola and the molecular markers linked to apomixis were investigated in a full-sib F1 population obtained by crossing the sexual accession H031 and the apomictic cultivar U. humidicola cv. BRS Tupi, both of which are hexaploid. A simple sequence repeat (SSR)-based linkage map was constructed for the species from 102 polymorphic and specific SSR markers based on simplex and double-simplex markers. The map consisted of 49 linkage groups (LGs) and had a total length of 1702.82 cM, with 89 microsatellite loci and an average map density of 10.6 cM. Eight homology groups (HGs) were formed, comprising 22 LGs, and the other LGs remained ungrouped. The locus that controls apospory (apo-locus) was mapped in LG02 and was located 19.4 cM from the locus Bh027.c.D2. In the cytological analyses of some hybrids, bi- to hexavalents at diakinesis were observed, as well as two nucleoli in some meiocytes, smaller chromosomes with preferential allocation within the first metaphase plate and asynchronous chromosome migration to the poles during anaphase. The linkage map and the meiocyte analyses confirm previous reports of hybridization and suggest an allopolyploid origin of the hexaploid U. humidicola. This is the first linkage map of an Urochloa species, and it will be useful for future quantitative trait locus (QTL) analysis after saturation of the map and for genome assembly and evolutionary studies in Urochloa spp. Moreover, the results of the apomixis mapping are consistent with previous reports and confirm the need for additional studies to search for a co-segregating marker. MenosThe African species Urochloa humidicola (Rendle) Morrone & Zuloaga (syn. Brachiaria humidicola (Rendle) Schweick.) is an important perennial forage grass found throughout the tropics. This species is polyploid, ranging from tetra to nonaploid, and apomictic, which makes genetic studies challenging; therefore, the number of currently available genetic resources is limited. The genomic architecture and evolution of U. humidicola and the molecular markers linked to apomixis were investigated in a full-sib F1 population obtained by crossing the sexual accession H031 and the apomictic cultivar U. humidicola cv. BRS Tupi, both of which are hexaploid. A simple sequence repeat (SSR)-based linkage map was constructed for the species from 102 polymorphic and specific SSR markers based on simplex and double-simplex markers. The map consisted of 49 linkage groups (LGs) and had a total length of 1702.82 cM, with 89 microsatellite loci and an average map density of 10.6 cM. Eight homology groups (HGs) were formed, comprising 22 LGs, and the other LGs remained ungrouped. The locus that controls apospory (apo-locus) was mapped in LG02 and was located 19.4 cM from the locus Bh027.c.D2. In the cytological analyses of some hybrids, bi- to hexavalents at diakinesis were observed, as well as two nucleoli in some meiocytes, smaller chromosomes with preferential allocation within the first metaphase plate and asynchronous chromosome migration to the poles during anaphase. The linkage map and the m... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Análise citológica; Cytological analysis; Genetic linkage mapping; Grass; Ligações genéticas; Mapeamento genético. |
Thesagro: |
Gene; Genoma; Planta forrageira. |
Thesaurus Nal: |
Grasses. |
Categoria do assunto: |
-- F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/151127/1/Evidence-allopolyploidy.PDF
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Marc: |
LEADER 03041naa a2200349 a 4500 001 2057798 005 2016-12-02 008 2016 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1371/ journal.pone.0153764$2DOI 100 1 $aVIGNA, B. B. Z. 245 $aEvidence of Allopolyploidy in Urochloa humidicola based on cytological analysis and genetic linkage mapping.$h[electronic resource] 260 $c2016 520 $aThe African species Urochloa humidicola (Rendle) Morrone & Zuloaga (syn. Brachiaria humidicola (Rendle) Schweick.) is an important perennial forage grass found throughout the tropics. This species is polyploid, ranging from tetra to nonaploid, and apomictic, which makes genetic studies challenging; therefore, the number of currently available genetic resources is limited. The genomic architecture and evolution of U. humidicola and the molecular markers linked to apomixis were investigated in a full-sib F1 population obtained by crossing the sexual accession H031 and the apomictic cultivar U. humidicola cv. BRS Tupi, both of which are hexaploid. A simple sequence repeat (SSR)-based linkage map was constructed for the species from 102 polymorphic and specific SSR markers based on simplex and double-simplex markers. The map consisted of 49 linkage groups (LGs) and had a total length of 1702.82 cM, with 89 microsatellite loci and an average map density of 10.6 cM. Eight homology groups (HGs) were formed, comprising 22 LGs, and the other LGs remained ungrouped. The locus that controls apospory (apo-locus) was mapped in LG02 and was located 19.4 cM from the locus Bh027.c.D2. In the cytological analyses of some hybrids, bi- to hexavalents at diakinesis were observed, as well as two nucleoli in some meiocytes, smaller chromosomes with preferential allocation within the first metaphase plate and asynchronous chromosome migration to the poles during anaphase. The linkage map and the meiocyte analyses confirm previous reports of hybridization and suggest an allopolyploid origin of the hexaploid U. humidicola. This is the first linkage map of an Urochloa species, and it will be useful for future quantitative trait locus (QTL) analysis after saturation of the map and for genome assembly and evolutionary studies in Urochloa spp. Moreover, the results of the apomixis mapping are consistent with previous reports and confirm the need for additional studies to search for a co-segregating marker. 650 $aGrasses 650 $aGene 650 $aGenoma 650 $aPlanta forrageira 653 $aAnálise citológica 653 $aCytological analysis 653 $aGenetic linkage mapping 653 $aGrass 653 $aLigações genéticas 653 $aMapeamento genético 700 1 $aSANTOS, J. C. S. 700 1 $aJUNGMANN, L. 700 1 $aVALLE, C. B. do 700 1 $aMOLLINARI, M. 700 1 $aPASTINA, M. M. 700 1 $aPAGLIARINI, M. S. 700 1 $aGARCIA, A. A. F. 700 1 $aSOUZA, A. P. 773 $tPlos One, San Francisco$gv. 11, n. 4, p. 1-23, Apr. 2016.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registros recuperados : 15 | |
1. | | SANTOS, J. C. S.; SILVA, V. B. da; MATTOS, W. da S.; CURSINO, L. H. S.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Eficiência simbiótica de rizóbios isolados de nódulos de Vigna spp. em feijão-caupi BRS Pujante. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 65. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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2. | | CURSINO, L. H. S.; JOVINO, R. S.; MATTOS, W. da S.; SANTOS, J. C. S.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Eficiência agronômica da estirpe Bradyrhizobium sp. ESA 123 na cultura do amendoim em Petrolina e Juazeiro. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 64. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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3. | | PEREIRA, E. C.; BOMFIM, C. S. G.; SILVA, V. B. da; SANTOS, J. C. S.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Fingerprinting molecular de bactérias endofíticas isoladas de sementes de milho BRS Gorutuba. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 14., 2019, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 183-188. (Embrapa Semiárido. Documentos, 288).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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4. | | MATTOS, W, da S.; SILVA, T. R. da; SANTOS, J. C. S.; CURSINO, L. H. S.; FERNANDES JUNIOR, P. I. Isolados não rizobianos endofíticos de nódulos são estimulantes da eficiência da simbiose feijão-caupi-Bradyrhizobium pachyrhizi BR 3262. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTIFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 15., 2020, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2020. p. 63. (Embrapa Semiárido. Documentos, 299).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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5. | | SANTOS, J. C. S.; SILVA, V. B. da; PEREIRA, E. C.; SOUZA, A. P. de; FERNANDES JUNIOR, P. I. Diversidade genética de bactérias isoladas de nódulos de Vigna radiata cultivado em solos do Semiárido. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 14., 2019, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2019. p. 169-175. (Embrapa Semiárido. Documentos, 288).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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8. | | SOUSA, M. de; MESQUITA, F. M. R.; FREITAS, M. M. M.; SANTOS, J. C. S. dos; SÁ, T. N. M.; PINTO, G. A. S. Fermentação alcoólica utilizando suco do pedúnculo de caju (Anacardium occidentale L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA QUÍMICA, 18., 2010, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2010. p. 6960-6966. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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9. | | BOMFIM, C. S. G.; SILVA, V. B. da; CURSINO, L. H. S.; MATTOS, W. da S.; SANTOS, J. C. S.; SOUZA, L. S. B. de; DANTAS, B. F.; FREITAS, A. D. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I. Endophytic bacteria naturally inhabiting commercial maize seeds occupy different niches and are efficient plant growth-promoting agent. Symbiosis, v. 81, p. 255?269, august 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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10. | | VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C. S.; JUNGMANN, L.; VALLE, C. B. do; MOLLINARI, M.; PASTINA, M. M.; PAGLIARINI, M. S.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. Evidence of Allopolyploidy in Urochloa humidicola based on cytological analysis and genetic linkage mapping. Plos One, San Francisco, v. 11, n. 4, p. 1-23, Apr. 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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11. | | ODA, A. D. C. M.; NEVES, A. F.; CARVALHO, M. M. P.; SANTOS, J. C. S. dos; VIANA, K. G. S.; ALVES, E. de C. S.; SILVA JUNIOR, V. L. da; COSTA-LIMA, T. C. da. Efeito de óleo de nim e espinetoram sobre adultos de Lasiothyris luminosa (Lepidoptera: Tortricidae). In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 17.; SIMPÓSIO LATINO-AMERICANO DE CONTROLE BIOLOGICO, 2., 2023, Juazeiro, BA, Petrolina, PE. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido: Univasf, 2023. p. 561.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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12. | | SILVA, V. B. da; BOMFIM, C. S. G.; SENA, P. T. S.; SANTOS, J. C. S.; MATTOS, W. da S.; GAVA, C. A. T.; SOUZA, A. P. de; FERNANDES JUNIOR, P. I. Vigna spp. root-nodules harbor potential pathogenic fungi controlled by co-habiting bacteria. Current Microbiology, v. 78, n. 5, p. 1835-1845, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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13. | | SANTOS, J. C. S. dos; ALVES, E. de C. S.; CARVALHO, M. M. P.; NEVES, A. F.; ODA, A. D. C. M.; VIANA, K. G. S.; SILVA JÚNIOR, V. L. da; COSTA-LIMA, T. C. da. Toxicidade de óleos vegetal e mineral sobre a cochonilha-de-escama em palma-forrageira. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 17.; SIMPÓSIO LATINO-AMERICANO DE CONTROLE BIOLOGICO, 2., 2023, Juazeiro, BA, Petrolina, PE. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido: Univasf, 2023. p. 580.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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14. | | LOUREIRO, M. M.; PADUA, V. L. M.; SANTOS, J. C. S.; ALMEIDA, L. L.; VENTURA, R. C.; COSTA C. F.; OLIVEIRA, B. S. G.; BALDANI, J. I.; HERMELY A. S.; COELHO, A. screening, identification and characterization of Gluconacetobacter diazotrophicus PAL 5 mutants pottentially related with biofilm formation In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 25.,2009, Porto de Galinhas, PE. Anais... [São Paulo]: Sociedade Bras. de Microbiologia, 2009. 01 01 de 01Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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15. | | DIAS, M. A. M.; BOMFIM, C. S. G.; RODRIGUES, D. R.; SILVA, A. F. da; SANTOS, J. C. S.; NASCIMENTO, T. R. do; MARTINS, L. M. V.; DANTAS, B. F.; RIBEIRO, P. R. de A.; FREITAS, A. D. S. de; FERNANDES JUNIOR, P. I. Paraburkholderia spp. are the main rhizobial microsymbionts of Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir. in soils of the Brazilian tropical dry forests (Caatinga biome). Systematic and Applied Microbiology, v. 44, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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