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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
09/04/2015 |
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Data da última atualização: |
09/04/2015 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ERBANO, M.; SCHUHLI, G. S. e; SANTOS, É. P. dos. |
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Afiliação: |
Marianna Erbano, Pós-graduanda da UFPR; GUILHERME SCHNELL E SCHUHLI, CNPF; Élide Pereira dos Santos, UFPR. |
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Título: |
Genetic variability and population structure of Salvia lachnostachys: implications for breeding and conservation programs. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
International Journal of Molecular Sciences, v. 16, p. 7839-7850, 2015. |
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DOI: |
10.3390/ijms16047839 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The genetic diversity and population structure of Salvia lachnostachys Benth were assessed. Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) molecular markers were used to investigate the restricted distribution of S. lachnostachys in Parana State, Brazil. Leaves of 73 individuals representing three populations were collected. DNA was extracted and submitted to PCR-ISSR amplification with nine tested primers. Genetic diversity parameters were evaluated. Our analysis indicated 95.6% polymorphic loci (stress value 0.02) with a 0.79 average Simpson?s index. The Nei-Li distance dendrogram and principal component analysis largely recovered the geographical origin of each sample. Four major clusters were recognized representing each collected population. Nei?s gene diversity and Shannon?s information index were 0.25 and 0.40 respectively. As is typical for outcrossing herbs, the majority of genetic variation occurred at the population level (81.76%). A high gene flow (Nm = 2.48) was observed with a correspondingly low fixation index. These values were generally similar to previous studies on congeneric species. The results of principal coordinate analysis (PCA) and of arithmetic average (UPGMA) were consistent and all three populations appear distinct as in STRUCTURE analysis. In addition, this analysis indicated a majority intrapopulation genetic variation. Despite the human pressure on natural populations our study found high levels of genetic diversity for S. lachnostachys. This was the first molecular assessment for this endemic species with medicinal proprieties and the results can guide for subsequent bioprospection, breeding programs or conservation actions. MenosThe genetic diversity and population structure of Salvia lachnostachys Benth were assessed. Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) molecular markers were used to investigate the restricted distribution of S. lachnostachys in Parana State, Brazil. Leaves of 73 individuals representing three populations were collected. DNA was extracted and submitted to PCR-ISSR amplification with nine tested primers. Genetic diversity parameters were evaluated. Our analysis indicated 95.6% polymorphic loci (stress value 0.02) with a 0.79 average Simpson?s index. The Nei-Li distance dendrogram and principal component analysis largely recovered the geographical origin of each sample. Four major clusters were recognized representing each collected population. Nei?s gene diversity and Shannon?s information index were 0.25 and 0.40 respectively. As is typical for outcrossing herbs, the majority of genetic variation occurred at the population level (81.76%). A high gene flow (Nm = 2.48) was observed with a correspondingly low fixation index. These values were generally similar to previous studies on congeneric species. The results of principal coordinate analysis (PCA) and of arithmetic average (UPGMA) were consistent and all three populations appear distinct as in STRUCTURE analysis. In addition, this analysis indicated a majority intrapopulation genetic variation. Despite the human pressure on natural populations our study found high levels of genetic diversity for S. lachnostachys. This was the fir... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Estrutura populacional; Intraspecific diversity; ISSR; Labiatae; Melhoramento genético; Salvia lachnostachys; Variabilidade genética. |
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Thesagro: |
Conservação. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/122031/1/2015-API-GuilhermeS-GeneticVariability.pdf
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Marc: |
LEADER 02492naa a2200253 a 4500
001 2013073
005 2015-04-09
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.3390/ijms16047839$2DOI
100 1 $aERBANO, M.
245 $aGenetic variability and population structure of Salvia lachnostachys$bimplications for breeding and conservation programs.$h[electronic resource]
260 $c2015
520 $aThe genetic diversity and population structure of Salvia lachnostachys Benth were assessed. Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) molecular markers were used to investigate the restricted distribution of S. lachnostachys in Parana State, Brazil. Leaves of 73 individuals representing three populations were collected. DNA was extracted and submitted to PCR-ISSR amplification with nine tested primers. Genetic diversity parameters were evaluated. Our analysis indicated 95.6% polymorphic loci (stress value 0.02) with a 0.79 average Simpson?s index. The Nei-Li distance dendrogram and principal component analysis largely recovered the geographical origin of each sample. Four major clusters were recognized representing each collected population. Nei?s gene diversity and Shannon?s information index were 0.25 and 0.40 respectively. As is typical for outcrossing herbs, the majority of genetic variation occurred at the population level (81.76%). A high gene flow (Nm = 2.48) was observed with a correspondingly low fixation index. These values were generally similar to previous studies on congeneric species. The results of principal coordinate analysis (PCA) and of arithmetic average (UPGMA) were consistent and all three populations appear distinct as in STRUCTURE analysis. In addition, this analysis indicated a majority intrapopulation genetic variation. Despite the human pressure on natural populations our study found high levels of genetic diversity for S. lachnostachys. This was the first molecular assessment for this endemic species with medicinal proprieties and the results can guide for subsequent bioprospection, breeding programs or conservation actions.
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700 1 $aSANTOS, É. P. dos
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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| Registros recuperados : 186 | |
| 121. |  | SOUZA, F. R. S. de; GUIMARÃES, P. E. de O.; GUIMARÃES, L. J. M.; ROCHA, L. M. P. da; EL-HUSNY, J. C. Desempenho produtivo de cultivares de milho nas microrregiões de Paragominas, Belterra e Uruará no Estado do Pará. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 1806-1812. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 122. | | SOUZA, F. R. S. de; ROCHA, L. M. P. da; GUIMARAES, P. E. de O.; GUIMARAES, L. J. M.; EL-HUSNY, J. C. Desempenho produtivo de cultivares de milho nas Regiões Nordeste e Oeste no Estado do Pará. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 123. | | SOUZA, F. R. S. de; ROCHA, L. M. P. da; GUIMARAES, P. E. de O.; VELOSO, C. A. C.; EL HUSNY, J. C. Desempenho produtivo de cultivares de milho em três locais do Estado do Pará. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 31., 2016, Bento Gonçalves. Milho e sorgo: inovações, mercados e segurança alimentar: anais. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2016. p. 1355-1358.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 124. | | SOUZA, F. R. de; ROSA JÚNIOR, E. J.; FIETZ, C. R.; BERGAMIN, A. C.; ROSA, Y. B. C. J.; ZEVIANI, W. M. Efeito do gesso nas propriedades químicas do solo sob dois sistemas de manejo. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 33, n. 5, p. 1717-1732, set./out. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 126. | | VELOSO, C. A. C.; CORREA, J. R. V.; RIBEIRO, S. I.; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de; SOUZA, F. R. S. de; CARVALHO, E. J. M. Respostas do cafeeiro (Coffea canephora L.) aos nutrientes N P K em sistema adensado no estado do Pará. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003. p. 433.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 127. | | VELOSO, C. A. C.; SOUZA, F. R. S. de; RIBEIRO, S. I.; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de; CORREA, J. R. V.; CARVALHO, E. J. M. Respostas do cafeeiro conilon à calagem e adubação potássica no estado do Pará. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003. p. 433-434.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 128. | | GELAIN, E.; ROSA JÚNIOR, E. J.; MERCANTE, F. M.; FORTES, D. G.; SOUZA, F. R. de; ROSA, Y. B. C. J. Fixação biológica de nitrogênio e teores foliares de nutrientes na soja em função de doses de molibdênio e gesso agrícola. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 35, n. 2, p. 259-269, mar./abr., 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 129. | | EL-HUSNY, J. C.; ANDRADE, E. B. de; SOUZA, F. R. S. de; SILVEIRA FILHO, A.; ALMEIDA, L. A. de; KLEPKER, D.; MEYER, M. C. Recomendação de cultivares de soja para a microrregião de Paragominas, Pará. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2003. 6 p. (Embrapa Amazônia Oriental. Comunicado técnico, 82).| Tipo: Comunicado Técnico/Recomendações Técnicas |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Soja. |
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| 130. | | SOUZA, F. R. de; BERGAMIM, A. C.; VENTUROSO, L. dos R.; ROSA JÚNIOR, E. J.; ROSA JÚNIOR, C. J.; FIETZ, C. R. Porosidade do solo de uma topossequência sob pastagem e mata nativa. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: SBCS: Embrapa Solos: Embrapa Agrobiologia, 2008. (Embrapa Solos. Documentos, 101). 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 132. | | VELOSO, C. A. C.; MUNIZ, A. C. M.; PEREIRA, W. L. M.; SOUZA, F. R. S. de; CARVALHO, E. J. M. Rendimento e qualidade de frutos da laranjeira submetida à adubação com NPK em latossolo amarelo. Revista de Ciências Agrarias, Belém, PA, n. 40, p. 133-144, jul./dez. 2003. il.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 133. | | SOUZA, F. R. de; ROSA JUNIOR, E. J.; FIETZ, C. R.; BERGAMIN, A. C.; MELO, J. S. de; SANTANA, D. R. S. Índice S de um Latossolo Vermelho distroférrico submetido ao tráfego de trator agrícola e sistemas de manejo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 134. | | VELOSO, C. A. C.; SOUZA, F. R. S. de; CORREA, J. R. V.; RIBEIRO, S. I.; OLIVEIRA JUNIOR, M. C. M. de; CARVALHO, E. J. M. Manejo de poda e espaçamento em cafeeiro (Coffea canephora) no estado do Pará. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 3., 2003, Porto Seguro. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2003. p. 303-304.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 135. | | PINHEIRO, C. C. C.; BENCHIMOL, R. L.; SILVA, C. M. da; SOUZA, F. R. S. de; SANTOS, A. K. A.; CARVALHO, E. de A. Levantamento de doenças foliares em cultivares e híbridos de milho no sistema plantio direto no estado do Pará. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 20.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 4., 2016, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2016. p. 347-351.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 136. | | DIAS, J. R. M.; WADT, P. G. S.; PARTELLI, F. L.; ESPINDULA, M. C.; PEREZ, D. V.; SOUZA, F. R.; BERGAMIN, A. C.; DELARMELINDA, E. A. Normal nutrient ranges and nutritional monitoring of 'Pêra' orange trees based on the CND method in different fruiting stages. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 9, p. 776-785, ago. 2017. Título em português: Faixas normais de nutrientes e monitoramento nutricional de laranjeiras 'Pêra' com uso do método CND em diferentes estádios de frutificação.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia; Embrapa Solos; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 137. | | SOUZA, F. R.; ROSA JÚNIOR, E. J.; FIETZ, C. R.; PELLIN, D. M. P.; BERGAMIN, A. C.; ROSA, Y. B. C. J. Morphology and stability of aggregates of an Oxisol according to tillage system and gypsum application. Revista Ceres, Viçosa, v. 59, n. 6, p. 859-866, nov./dez. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 138. | | SOUZA, F. R. de; ROSA JUNIOR, E. J.; FIETZ, C. R.; ROSA, Y. B. C. J.; BERGAMIN, A. C.; MELO, J. S. de. Sistema radicular de girassol em função do tráfego de trator agrícola. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 34., 2013, Florianópolis. Ciência do solo: para quê e para quem: anais. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 139. | | FRANCO, A. L.; TAGLIATTE, M. A.; AZEVEDO, A. L. S.; CAMPOS, R. A.; SOUZA, F. R. de; PEREIRA, A. V.; VICCINI, L. F. Transferability of microsatellite markers (SSR) from Setaria italica to Setaria sphacelata (Poaceae). In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 66., 2021. E-Book. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2021. p. 469.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 140. | | FREITAS, S. V. de; SOUZA, F. R. de; RODRIGUES NETO, J. C.; VASCONCELOS, G. A.; ABDELNUR, P. V.; VAZ, B. G.; HENRY, C. S.; COLTRO, W. K. T. Uncovering the formation of color gradients for glucose colorimetric assays on microfluidic paper-based analytical devices by mass spectrometry imaging. Analytical Chemistry, v. 90, n. 20, p. 11949-11954, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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