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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
30/12/2019 |
Data da última atualização: |
22/08/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
AVELLAR-COSTA, P.; SANTOS, D. C. DOS; LANGE, C. C.; LAPORT, M. S.; BRITO, M. A. V. P.; ROSSI, C. C.; GIAMBIAGI-DEMARVAL, M. |
Afiliação: |
PEDRO AVELLAR-COSTA; DANIELLE CABRAL DOS SANTOS; CARLA CHRISTINE LANGE, CNPGL; MARINELLA SILVA LAPORT; MARIA APARECIDA VASCONCELOS PAIVA BRITO; CIRO CÉSAR ROSSI; MARCIA GIAMBIAGI-DEMARVAL. |
Título: |
Accurate identification of atypical Staphylococcus chromogenes plasma-clotting strains causing bovine mastitis. |
Ano de publicação: |
2019 |
Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, v. 49, n. 6, e20190168, 2019. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/0103-8478cr20190168 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
ABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento do gene do rRNA 16S e do gene do fator de elongação Tu, tuf, foram avaliados. Os resultados dos quatro métodos foram coincidentes para apenas metade das cepas, devido à baixa precisão da PCR-RFLP com groEL (51,2% de acurácia). Apesar de todos os resultados do sequenciamento serem idênticos, a alta precisão dos resultados do MALDI-TOF (97,7% de acurácia, com apenas uma cepa identificada incorretamente) encoraja o uso dessa técnica, pois, não requer preparação laboriosa de amostras, sendo rápida e simples de executar. MenosABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
GroEL; MALDI-TOF; Tuf. |
Thesaurus Nal: |
Mastitis; Staphylococcus chromogenes. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207948/1/CiRural-Lange-Accurate.pdf
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Marc: |
LEADER 02850naa a2200265 a 4500 001 2117891 005 2022-08-22 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/0103-8478cr20190168$2DOI 100 1 $aAVELLAR-COSTA, P. 245 $aAccurate identification of atypical Staphylococcus chromogenes plasma-clotting strains causing bovine mastitis.$h[electronic resource] 260 $c2019 520 $aABSTRACT - We compared the potential of routine techniques used for the identification of Staphylococcus species, aiming to evaluate their accuracy in the detection of 43 Staphylococcus chromogenes strains isolated from bovine mastitis that, despite being a coagulase-negative species, are able to clot plasma. These strains could be mistakenly suspected to be S. aureus and lead to an unappropriated treatment of the disease. MALDI-TOF, PCR-RFLP of the chaperonine gene groEL, and sequencing of the 16S rRNA and elongation factor Tu gene tuf were employed. Results from the four methods were coincident for only half of the strains because of the low accuracy of the groEL PCR-RFLP (51.2% accuracy). Even though all the sequencing results were identical, the high accuracy of the MALDI-TOF results (97.7% accuracy, with only one strain misidentified) encourage the use of this technique, since it does not require laborious sample preparation, being fast and simple to perform. RESUMO - Nós comparamos o potencial de técnicas rotineiras utilizadas para a identificação de espécies de Staphylococcus, com o objetivo de avaliar a acurácia delas na detecção de 43 isolados de Staphylococcus chromogenes envolvidos com mastite bovina que, apesar de ser uma espécie coagulase-negativa, são capazes de coagular o plasma. Essas cepas poderiam ser erroneamente suspeitas de serem S. aureus e levarem a um tratamento não adequado da doença. MALDI-TOF, PCR-RFLP do gene da chaperonina groEL e sequenciamento do gene do rRNA 16S e do gene do fator de elongação Tu, tuf, foram avaliados. Os resultados dos quatro métodos foram coincidentes para apenas metade das cepas, devido à baixa precisão da PCR-RFLP com groEL (51,2% de acurácia). Apesar de todos os resultados do sequenciamento serem idênticos, a alta precisão dos resultados do MALDI-TOF (97,7% de acurácia, com apenas uma cepa identificada incorretamente) encoraja o uso dessa técnica, pois, não requer preparação laboriosa de amostras, sendo rápida e simples de executar. 650 $aMastitis 650 $aStaphylococcus chromogenes 653 $aGroEL 653 $aMALDI-TOF 653 $aTuf 700 1 $aSANTOS, D. C. DOS 700 1 $aLANGE, C. C. 700 1 $aLAPORT, M. S. 700 1 $aBRITO, M. A. V. P. 700 1 $aROSSI, C. C. 700 1 $aGIAMBIAGI-DEMARVAL, M. 773 $tCiência Rural$gv. 49, n. 6, e20190168, 2019.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
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Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Acre. |
Data corrente: |
09/02/2015 |
Data da última atualização: |
05/02/2019 |
Tipo da produção científica: |
Autoria/Organização/Edição de Livros |
Autoria: |
COSTA, F. de S.; AMARAL, E. F. do (ed.). |
Afiliação: |
FALBERNI DE SOUZA COSTA, CPAF-AC; EUFRAN FERREIRA DO AMARAL, CPAF-AC. |
Título: |
Inventário de emissões antrópicas e sumidouros de gases de efeito estufa do estado do Acre: ano-base 2012. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Brasília, DF: Embrapa, 2014. |
Páginas: |
98 p. |
ISBN: |
978-85-7035-433-4 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
O Acre é o primeiro estado da Amazônia a ter um Inventário de Gases de Efeito Estufa (GEE) e o quarto do Brasil a ter este instrumento, que aqui se transforma numa base de dados eficiente para monitorar e avaliar as fontes e sumidouros no estado. O inventário de GEE contabiliza de maneira precisa as emissões de carbono, constituindo-se um instrumento de trabalho para pesquisadores, estudantes, técnicos e tomadores de decisão envolvidos em ações de mitigação e adaptação às mudanças climáticas, a partir da implementação de programas, planos de ação ou projetos, de acordo com os princípios e critérios estabelecidos. O inventário está estruturado em dois capítulos. No primeiro capítulo são apresentadas as estimativas setoriais (energia ? termelétricas; transporte ? fontes móveis veiculares; mudança no uso da terra e florestas; agropecuária; disposição e tratamento de resíduos) das emissões antrópicas e sumidouros de gases de efeito estufa. Os destaques nesse capítulo são a abordagem no nível de detalhamento TIER 2 do setor de uso da terra, mudança no uso da terra e floresta, conforme recomendado pela Convenção-Quadro das Nações Unidas sobre Mudanças do Clima, doravante convenção, e a inserção da avaliação dos estoques totais de carbono por município. Nesse capítulo ainda é apresentada a contabilização das emissões-sumidouros de GEE. No segundo capítulo são realizadas recomendações setoriais a partir dos resultados do inventário e considerando-se o contexto atual do Estado do Acre. Colocamos à disposição da sociedade acriana e mundial um documento de referência que mostra os caminhos das emissões e dos sumidouros nesta porção da Amazônia. MenosO Acre é o primeiro estado da Amazônia a ter um Inventário de Gases de Efeito Estufa (GEE) e o quarto do Brasil a ter este instrumento, que aqui se transforma numa base de dados eficiente para monitorar e avaliar as fontes e sumidouros no estado. O inventário de GEE contabiliza de maneira precisa as emissões de carbono, constituindo-se um instrumento de trabalho para pesquisadores, estudantes, técnicos e tomadores de decisão envolvidos em ações de mitigação e adaptação às mudanças climáticas, a partir da implementação de programas, planos de ação ou projetos, de acordo com os princípios e critérios estabelecidos. O inventário está estruturado em dois capítulos. No primeiro capítulo são apresentadas as estimativas setoriais (energia ? termelétricas; transporte ? fontes móveis veiculares; mudança no uso da terra e florestas; agropecuária; disposição e tratamento de resíduos) das emissões antrópicas e sumidouros de gases de efeito estufa. Os destaques nesse capítulo são a abordagem no nível de detalhamento TIER 2 do setor de uso da terra, mudança no uso da terra e floresta, conforme recomendado pela Convenção-Quadro das Nações Unidas sobre Mudanças do Clima, doravante convenção, e a inserção da avaliação dos estoques totais de carbono por município. Nesse capítulo ainda é apresentada a contabilização das emissões-sumidouros de GEE. No segundo capítulo são realizadas recomendações setoriais a partir dos resultados do inventário e considerando-se o contexto atual do Estado do Acr... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Acre; Actividades antropogénicas; Amazonia Occidental; Amazônia Ocidental; Cambio climático; Desechos sólidos; Efecto invernadero; Emissões antrópicas; Estimación del riesgo; Gases de invernadero; Inventário de Gases de Efeito Estufa (GEE); Reservorios de carbono; Sumidouros de gases; Uso de la tierra; Vehicles; Western Amazon. |
Thesagro: |
Carbono; Efeito Estufa; Eliminação de Resíduo; Energia Elétrica; Estimativa; Estoque; Mudança Climática; Resíduo Solido; Uso da Terra; Veiculo. |
Thesaurus NAL: |
Anthropogenic activities; Carbon sinks; Climate change; Electric power industry; Greenhouse effect; Greenhouse gases; Land use; Risk estimate; Solid wastes. |
Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/124461/1/25438.pdf
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Marc: |
LEADER 03356nam a2200565 a 4500 001 2008120 005 2019-02-05 008 2014 bl uuuu 00u1 u #d 020 $a978-85-7035-433-4 100 1 $aCOSTA, F. de S. 245 $aInventário de emissões antrópicas e sumidouros de gases de efeito estufa do estado do Acre$bano-base 2012.$h[electronic resource] 260 $aBrasília, DF: Embrapa$c2014 300 $a98 p. 520 $aO Acre é o primeiro estado da Amazônia a ter um Inventário de Gases de Efeito Estufa (GEE) e o quarto do Brasil a ter este instrumento, que aqui se transforma numa base de dados eficiente para monitorar e avaliar as fontes e sumidouros no estado. O inventário de GEE contabiliza de maneira precisa as emissões de carbono, constituindo-se um instrumento de trabalho para pesquisadores, estudantes, técnicos e tomadores de decisão envolvidos em ações de mitigação e adaptação às mudanças climáticas, a partir da implementação de programas, planos de ação ou projetos, de acordo com os princípios e critérios estabelecidos. O inventário está estruturado em dois capítulos. No primeiro capítulo são apresentadas as estimativas setoriais (energia ? termelétricas; transporte ? fontes móveis veiculares; mudança no uso da terra e florestas; agropecuária; disposição e tratamento de resíduos) das emissões antrópicas e sumidouros de gases de efeito estufa. Os destaques nesse capítulo são a abordagem no nível de detalhamento TIER 2 do setor de uso da terra, mudança no uso da terra e floresta, conforme recomendado pela Convenção-Quadro das Nações Unidas sobre Mudanças do Clima, doravante convenção, e a inserção da avaliação dos estoques totais de carbono por município. Nesse capítulo ainda é apresentada a contabilização das emissões-sumidouros de GEE. No segundo capítulo são realizadas recomendações setoriais a partir dos resultados do inventário e considerando-se o contexto atual do Estado do Acre. Colocamos à disposição da sociedade acriana e mundial um documento de referência que mostra os caminhos das emissões e dos sumidouros nesta porção da Amazônia. 650 $aAnthropogenic activities 650 $aCarbon sinks 650 $aClimate change 650 $aElectric power industry 650 $aGreenhouse effect 650 $aGreenhouse gases 650 $aLand use 650 $aRisk estimate 650 $aSolid wastes 650 $aCarbono 650 $aEfeito Estufa 650 $aEliminação de Resíduo 650 $aEnergia Elétrica 650 $aEstimativa 650 $aEstoque 650 $aMudança Climática 650 $aResíduo Solido 650 $aUso da Terra 650 $aVeiculo 653 $aAcre 653 $aActividades antropogénicas 653 $aAmazonia Occidental 653 $aAmazônia Ocidental 653 $aCambio climático 653 $aDesechos sólidos 653 $aEfecto invernadero 653 $aEmissões antrópicas 653 $aEstimación del riesgo 653 $aGases de invernadero 653 $aInventário de Gases de Efeito Estufa (GEE) 653 $aReservorios de carbono 653 $aSumidouros de gases 653 $aUso de la tierra 653 $aVehicles 653 $aWestern Amazon 700 1 $aAMARAL, E. F. do
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Registro original: |
Embrapa Acre (CPAF-AC) |
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