|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
Data corrente: |
28/07/2015 |
Data da última atualização: |
03/03/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CARMO, C. D.; SANTOS, D. B.; ALVES, L. B.; OLIVEIRA, G. A. F.; OLIVEIRA, E. J. de. |
Afiliação: |
C. D. CARMO, UFRB; D. B. SANTOS, UFRB; L. B. ALVES, UFRB; G. A. F. OLIVEIRA, UFRB; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
Título: |
Development of TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) as New Tool for Molecular Genetic Analysis in Cassava. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporte, 18 April 2015. |
Páginas: |
14P. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Cassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as a molecular tool in cassava, in addition to the association with genetic regions that may increase the chances of obtaining functional markers. MenosCassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Marcador molelular. |
Thesagro: |
Mandioca; Marcador genético. |
Thesaurus Nal: |
Cassava; Genetic markers. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02362naa a2200241 a 4500 001 2020697 005 2023-03-03 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCARMO, C. D. 245 $aDevelopment of TRAP (Target Region Amplification Polymorphism) as New Tool for Molecular Genetic Analysis in Cassava.$h[electronic resource] 260 $c2015 300 $a14P. 520 $aCassava (Manihot esculenta Crantz) lacks molecular studies for use in breeding and germplasm bank maintenance. This work aimed to develop and validate TRAP (target region amplification olymorphism) markers for cassava and evaluate their potential for structuring the genetic diversity of this species. Preliminary analyses with 396 combinations found 64%of combinations with a good amplification pattern and polymorphism. The 69 most polymorphic TRAP combinations were used to characterize 46 cassava genotypes, from which 606 alleles (range 3 to 18 with a mean of 8.8 alleles per combination) were identified. The polymorphic information content (PIC) ranged from 0.03 to 0.38 (average 0.23), while 31 combinations showed a PIC >0.25. The resolving power (Rp) parameter ranged from 0.10 to 6.30 (average 3.21). The primers that were related to starch and carotenoid biosynthesis, cyanogenic compounds, post-harvest physiological deterioration, root formation, and defense responses were the most polymorphic (>70 % of polymorphic fragments, PIC>0.25, and Rp>3.21). A total of 37 private alleles were identified in 20 accessions. Bayesian clustering as implemented in STRU CTURE revealed the presence of two major clusters (K=2) and four subclusters (K=4). The group differentiation based on the molecular variance analysis (AMOVA) showed that most of the genetic variation is within groups but with significant differences between groups. Therefore, TRAP primers have a high polymorphism for use as a molecular tool in cassava, in addition to the association with genetic regions that may increase the chances of obtaining functional markers. 650 $aCassava 650 $aGenetic markers 650 $aMandioca 650 $aMarcador genético 653 $aMarcador molelular 700 1 $aSANTOS, D. B. 700 1 $aALVES, L. B. 700 1 $aOLIVEIRA, G. A. F. 700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de 773 $tPlant Molecular Biology Reporte, 18 April 2015.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 125 | |
42. | | SANTOS, D. B. dos; CECÍLIO, R. A.; COELHO, E. F.; BATISTA, R. O.; SILVA, A. J. P. da. Calibração de TDR: desempenho de alguns métodos e equações de calibração. Agrarian, Dourados, v. 5, n. 16, p. 131-139, 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
43. | | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; OLIVEIRA, D. R. de; SANTOS, D. B. dos; SILVA, A. D. da. Concentração de nutrientes em resíduos de colheita de plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 82-86.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
44. | | MELO, D. M. de; COELHO, E. F.; SANTOS, D B. dos; BOA SORTE, R. A.; CAMPOS, M. S. Crescimento da bananeira Cv. Princesa, em seu primeiro ciclo de produção, sob aplicação de biofertilizantes e extratos vegetais. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA MANDIOCA E FRUTICULTURA, 9., 2015: Cruz das Almas, BA. Pesquisa: para quê? para quem? : resumos. Brasília, DF : Embrapa, 2015.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
45. | | BARBOSA, A. C. O.; SANTOS, D. B.; OLIVEIRA, P. H. G. A.; CORDEIRO, Z. J. M.; FERREIRA, C. F. Diversidade genética de porta-enxertos cítricos baseada em marcadores moleculares ISSR. CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 25., 2017; REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE INTERAMERICANA DE HORTICULTURA TROPICAL, 62., 2017. Resumos... Porto Seguro, BA: SIHT, 2017.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
| |
46. | | CRUZ, E. K. S. da; ALVES, M. A.; GALLO, J.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SANTOS, D. B. dos. Disponibilidade de cálcio e magnésio em solo, sob diferentes cultivos no planalto santareno. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 111-114.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
48. | | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; TANABE, C. S.; OLIVEIRA, D. R. de; SANTOS, D. B. dos. Resíduos de colheita e quantificação de raízes em plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 190-194.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
49. | | SIMOES, W. L.; SANTOS, D. B. dos; COELHO FILHO, M. A.; COELHO, E. F.; GUIMARÃES, M. J. M. Respostas fisiológicas do mamoeiro, submetido a diferentes níveis de salinidade do solo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENGENHARIA AGRICOLA, 38., 2009, Juazeiro, Petrolina. Planejamento da bacia hidrográfica e o desenvolvimento da agricultura: anais. Juazeiro, Petrolina: UNIVASF: Embrapa Semiárido: CEFET: SBEA, 2009. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
| |
51. | | MARQUES, E.; CUNHA, M. de O. C.; SANTOS, D. B. dos; MARTINS, I.; MELLO, S. C. M. de. Identificação molecular de isolados de Trichoderma. In. CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Resumo. 197. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
52. | | SANTOS, D. B. M.; ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G.; CARNEIRO, M.; SILVA, F. R. da. Identificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
53. | | SANTOS, D. B. M.; SILVA, F. R.; ALMEIDA, J. D.; BARROS, L. M. G.; SOBRAL, L. T. CARNEIRO, M. Identificação de ESTs tecido-específicas no banco de dados do genoma funcional de Coffea spp. In: ENCONTRO DO TALENTO ESTUDANTIL DA EMBRAPA RECURSOS GENÉTICOS E BIOTECNOLOGIA, 11., 2006, Brasília, DF. Anais: resumos dos trabalhos. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2006 p. 84.Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
54. | | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; CARVALHO, E. J. M.; OLIVEIRA, D. R. de; BELDINI, T. P.; SANTOS, D. B. dos. Efeito de sistemas de manejo sobre emissões de gases de efeito estufa em Latossolo amarelo muito argiloso de Paragominas-PA. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 130-134.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
56. | | OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; CARVALHO, E. J. M.; MACHADO, W. F.; SANTOS, D. B. dos; OLIVEIRA, D. R. de. Estoques de nitrogênio e carbono sob diferentes sistemas de uso e manejo de um Latossolo amarelo no município de Paragominas. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 135-138.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
57. | | RODRIGUES, N. E.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; SANTOS, D. B. dos; TANABE, C. S.; OLIVEIRA, D. R. de. Quantificação da mineralização e da nitrificação em plantios de soja no Oeste paraense. In: CONGRESSO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DA AMAZÔNIA, 10.; SALÃO DE PESQUISA E INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 17.; SALÃO DE EXTENSÃO, 4., 2017, Santarém. Caderno de resumos expandidos. Santarém: ULBRA, 2017. p. 184-189.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
59. | | SOUSA, H. R.; ALMEIDA, J. de D.; SANTOS, D. B. M.; CARNEIRO, M.; BARROS, L. M. G. Seleção e caracterização de um transcrito específico de folha de Coffea arabica para isolamento de seu promotor. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 56.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
Registros recuperados : 125 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|