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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
Data corrente: |
17/08/2006 |
Data da última atualização: |
17/05/2022 |
Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
Autoria: |
MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JUNIOR, W. |
Afiliação: |
RAQUEL C. MELO, UFMG; IVAN MAZONI, CNPTIA; GORAN NESHICH, CNPTIA; MARCELO M. SANTORO, UFMG; WAGNER MEIRA JUNIOR, UFMG. |
Título: |
Protein structure topology comparison based on contact maps. |
Ano de publicação: |
2006 |
Fonte/Imprenta: |
In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. |
Páginas: |
Não paginado. |
Idioma: |
Inglês |
Notas: |
ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-5. |
Conteúdo: |
Short Abstract: Topologs (Topology Homologous) is a tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS). It is a structural classification of proteins totally based on the pattern of intrachain interactions. Its precision is higher than 85% for all tested fold types and has been precomputed for all ASTRAL 40 chains |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Topologia. |
Thesagro: |
Proteína. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Proteins. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/173805/1/I-5-ISMB-2006.pdf
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Marc: |
LEADER 01145nam a2200241 a 4500 001 1009284 005 2022-05-17 008 2006 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aMELO, R. C. 245 $aProtein structure topology comparison based on contact maps.$h[electronic resource] 260 $aIn: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB$c2006 300 $aNão paginado. 500 $aISMB, X-MEETING 2006. Poster I-5. 520 $aShort Abstract: Topologs (Topology Homologous) is a tool which is part of the Star Sting Suite (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS). It is a structural classification of proteins totally based on the pattern of intrachain interactions. Its precision is higher than 85% for all tested fold types and has been precomputed for all ASTRAL 40 chains 650 $aBioinformatics 650 $aProteins 650 $aProteína 653 $aBioinformática 653 $aTopologia 700 1 $aMAZONI, I. 700 1 $aNESHICH, G. 700 1 $aSANTORO, M. M. 700 1 $aMEIRA JUNIOR, W.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
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Origem |
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URL |
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Registros recuperados : 29 | |
2. | | MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JÚNIOR, W. Contacts as the key elements for comparing two protein structures. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-6.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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3. | | MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JUNIOR, W. Protein structure topology comparison based on contact maps. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY, 14.; ANNUAL AB3C CONFERENCE, 2., 2006, Fortaleza. Conference Program... Fortaleza: ISCB, 2006. Não paginado. ISMB, X-MEETING 2006. Poster I-5.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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4. | | MELO, R. C.; GOMIDE, J. S.; MEIRA JUNIOR, W.; LOPES, J. C. D.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M. Mining structural signatures in proteins using intrachain interactions. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 3., 2007, São Paulo. Proceedings... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2007. p. 133. X-meeting 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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5. | | VIANA, P. A.; REZENDE, S. T. de; ALVES, A. de A.; MANFRINI, R. M.; ALVES, R. J.; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M.; GUIMARÃES, V. M. Activity of Debaryomyces hansenii UFV-1 alfa-galactosidades against alfa-D-galactophyranoside derivatives. Carbohydrate Research, v. 346, p. 602-605, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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6. | | LIMA, F. L.; CARVALHO, M. A. R. de; APOLÔNIO, A. C. M.; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M.; OLIVEIRA, J. S.; ALVIANO, C. S.; FARIAS, L. de M. Actinomycetemcomitin: a new bacteriocin produced by Aggregatibacter (Actinobacillus) actinomycetemcomitans. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, v. 35, p. 103-110, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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7. | | LIMA, F. L.; CARVALHO, M. A. R.; SANTORO, M. M.; BEMQUERER, M. P.; OLIVEIRA, J. S.; APOLÔNIO, A. C. M.; ALVIANO, C. S.; FARIAS, L. M. Actinomycetemcomitin: a new bacteriocin produced by Aggregatibacter (Actinobacillus) Actinomycetemcomitans. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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8. | | MELO, R. C.; RIBEIRO, C.; MURRAY, C. S.; VELOSO, C. J. M.; SILVEIRA, C. H. da; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; CARCERONI, R. L.; SANTORO, M. M. Finding protein-protein interaction patterns by contact map matching. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 4, p. 946-963, 2007.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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9. | | APOLÔNIO, A. C. M.; CARVALHO, M. A. R.; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M.; PINTO, S. Q.; OLIVEIRA, J. S.; SANTOS, K. V.; FARIAS, L. M. Purification and partial characterization of a bacteriocin produced by Eikenella corrodens. Journal of Applied Microbiology, v. 104, p. 508-514, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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11. | | PIMENTA, A. M. C.; RATES, B.; BLOCH JUNIOR, C.; GOMES, P. C.; SANTORO, M. M.; LIMA, M. E. de; RICHARDSON, M.; CORDEIRO, M. do N. Electrospray ionization quadrupole time-of-flight and matrix-assisted laser desorption/ionization tandem time-of-flight mass spectrometric analyses to solve micro heterogeneity in post-translationally modified peptides from Phoneutria nigriventer (Aranea, Ctenidae) venom. Rapid Communications in Mass Spectrometry, Chichester, UK, v. 19, p. 31-37, 2005.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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12. | | SANTOS, A. M. C.; OLIVEIRA, J. S. de; BITTAR, E. R.; SILVA, A. L. da; GUIA, M. L. dos; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M. Improved purification process of β- and α-tripsin isoforms by ion-exchange choromatography. Brazilian Archives of Biology and technologgy: an International Journal, v.51, n. 4, p. 711-721, jul.-ago., 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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13. | | GOMIDE, F. T. F.; SANTOS, A. M. C.; BITTAR, E. R.; VASCONCELOS, A. B.; TEIXEIRA, K. N.; SANTANA, M. A. de; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M. Thermodynamic characterization of alfa trypsin at acid pH range. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 36.; IUBMB CONFERENCE, 10., 2007, Salvador, BA. Infectious diseases: biochemistry of parasites, vectors and hosts: program and abstracts. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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14. | | RIBEIRO, C.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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15. | | RIBEIRO; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. BMC Structural Biology, London, v. 10, n. 36, p. 1-16, 2010. Disponível em:.Acesso em: 5 jan. 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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16. | | VIANA, P. A.; REZENDE, S. T. de; PASSOS, F. M. L.; OLIVEIRA, J. S.; TEIXEIRA, K. N.; SANTOS, A. M. C.; BEMQUERER, M. P.; ROSA, J. C.; SANTORO, M. M.; GUIMARÃES, V. M. Debaryomyces hansenii UFV-1 intracellular alfa-galactosidase characterization and comparative studies with the extracellular enzyme. Journal of Agricultural and Food Chemistry, v. 57, p. 2515-2522, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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17. | | RICHARDSON, M.; PIMENTA, A. M. C.; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M.; BEIRAO, P. S. L.; LIMA, M. E.; FIGUEIREDO, S. G.; BLOCH JUNIOR, C.; VASCONCELOS, E. A. R.; CAMPOS, F. A. P.; GOMES, P. C.; CORDEIRO, M. N. Comparision of the partial proteomes of the venoms of Brazilian spiders of the genus Phoneutria. Comparative Biochemistry and Physiology, Part C, v. 142, p. 173-187, 2006.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: -- - A |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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18. | | FIGUEIREDO, J. E. F.; COELHO, V. T. da S.; COELHO, E. A. F.; OLIVEIRA, J. S. de; SANTORO, M. M.; ALMEIDA, P. L. B. de; De PAOLI, H. C.; CORREA, G. V.; TEIXEIRA, M. A.; MOTTA, A. C. F. Bioquímica molecular como ferramenta para conservação e uso da biodiversidade agrícola tropical: desenvolvimento de marcador imunoquímico para identificação da bactérias endofíticas do milho. Sete Lagoas: Embrapa Milho e Sorgo, 2005. 12 p. (Embrapa Milho e Sorgo. Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento, 2).Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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19. | | VERLY, R. M.; RODRIGUES, M. A.; DAGHASTANLI, K. R. P.; DENADAI, A. M. L.; CUCCOVIA, I. M.; BLOCH JÚNIOR, C.; FRÉZARD, F.; SANTORO, M. M.; PILÓ VELOSO, D.; BEMQUERER, M. P. Effect of cholesterol on the interaction of the amphibian antimicrobial peptide DD K with liposomes. Peptides, v. 29, p. 15-24, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
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20. | | MIRANDA, A. A. C.; GOMIDE, F. T. F.; SANTANA, M. A.; TEIXEIRA, K. N.; OLIVEIRA, J. S.; BIONDI, I.; SANTOS, A. M. C.; BEMQUERER, M. P.; SANTORO, M. M. Development and optimization of liquid bovine trypsin formulation for using as a Biopharmaceutical. In: ANNUAL MEETING OF SBBQ, 37.; CONGRESS OF THE PABMB, 11., 2008, Águas de Lindóia, SP. Abstracts... Águas de Lindóia: SBBq, 2008. 1 CD-ROM.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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