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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
23/11/2017 |
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Data da última atualização: |
28/11/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F.; CARDOSO, F. F.; REGITANO, L. C. de A.; VENTURA, R.; SOLLERO, B. P.; Souza, M. D.; MOKRY, F. B.; FERREIRA, A. B. R.; TORRES JUNIOR, R. A. de A. |
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Afiliação: |
Federal University of Mato Grosso do Sul; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; Department of Animal and Poultry Science/University of Guelph/Centre for Genetic Improvement of Livestock -CGIL; BRUNA PENA SOLLERO, CPPSUL; Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; Brazilian Association of Canchim Cattle Breeders - ABCCAN; ANNA BEATRIZ ROBOTTON FERREIRA, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC. |
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Título: |
Genomewide association study for production and meat quality traits in Canchim beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal Animal Science, v. 95, n. 8, p. 3381-3390, Aug. 2017. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described in the literature reinforces associations found in this study. MenosThe commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Bayesian inference; Carcaça bovina; Carcass; Growth; Melhoramento genético do crescimento. |
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Thesagro: |
Gado canchim. |
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Thesaurus Nal: |
Cattle; Genomics; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aThe commercial value of the bovine carcass is determined by a set of traits, such as weight, yield, back fat thickness, and marbling; therefore, the genetic improvement of growth, meat, and carcass quality traits is an important tool to add value to the supply chain. Genomewide association studies (GWAS) enable the identification of loci that control phenotypic expression of quantitative traits (QTL). Therefore, the objective of this work was to perform a GWAS to identify genomic regions and genes associated with growth, carcass traits, and meat quality in Canchim beef cattle. These traits were yearling weight (YW), rib eye area (REA), back fat thickness (BFT), and marbling (MARB). To increase sample size and marker density, genotype imputation was performed, and only markers imputed with greater than 95% accuracy were used. Genomewide association study was performed using a Bayesian approach, by the Bayes B statistical method, incorporating genotypes and phenotypes from 614 animals from both the Canchim breed and the MA genetic group (offspring of Charolais bulls and one-half Canchim + one-half Zebu cows). This investigation identified 1 and 4 genomic regions explaining 0.23 and 7.35% of the genetic variance for REA and YW, respectively. These regions harbor a total of 19 genes, 7 of which were classified for biological functions by functional analysis. Significant associations were not observed for BFT and MARB. The identification of QTL that had been previously described in the literature reinforces associations found in this study.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 16 | |
| 3. |  | AMORIM, F. M. de; SOUSA, C. B. de; CAMARGO, U. A.; SOARES, J. M. Comportamento da videira cultivar Deckrot na região do Submédio São Francisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 298. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 55).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 5. | | AMORIM, F. M. de; SOUSA, C. B. de; CAMARGO, U. A.; SOARES, J. M. Influência do sistema de poda na produtividade de cultivares viníferas brancas na região do Submédio São Francisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 281. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 55).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 6. | | AMORIM, F. M. de; SOUSA, C. B. de; CAMARGO, U. A.; SOARES, J. M. Influência do sistema de poda na produtividade de cultivares viníferas tintas na região do Submédio São Fancisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 281. (Embrapa Uva e Vinho. Documentos, 55).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 7. | | AMORIM, F. M. de; SOUZA, C. B. de; CAMARGO, U. A.; SOARES, J. M. Influência do sistema de poda na produtividade de cultivares viníferas tintas na região do Submédio São Francisco. In: CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 10.; CONGRESSO BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 11.; SEMINÁRIO FRANCO-BRASILEIRO DE VITICULTURA E ENOLOGIA, 2., 2005, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2005. p. 281.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 9. | | RINGENBERG, R.; BOTTON, M.; GARCIA, M. S.; AMORIM, F. M. de; HAJI, F. N. P. Traça voraz. Cultivar Hortaliças e Frutas, Pelotas, v. 6, n. 35, p. 31-33, dez. 2005/jan. 2006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 10. | | VASCONCELOS, G. B. N.; OLIVEIRA, J. B. de; BATISTA, F. da S. L.; BIASOTO, A. C. T.; AMORIM, F. M. de; PEREIRA, G. E. Características analíticas de vinhos brancos das variedades Arinto e Fernão Pires elaborados no Nordeste brasileiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 11. | | AMORIM, F. M. de; SOUSA, C. B. de; PEREIRA, G. E.; SOARES, J. M.; LIMA, M. A. C.; SANTOS, J. de O. Efeito da colheita seletiva na qualidade fisico-química da cultivar Ruby Cabernet plantada em diferentes sistemas de condução no Vale do Submédio São Francisco, Brasil. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 11., 2007, Mendoza. Seduciendo al consumidor de hoy: anales. [Mendoza: INV: CLEIFRA], 2007. 1 CD-ROM. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 12. | | AMORIM. F. M. de; SOUSA, C. B. de; PEREIRA, G. E.; SOARES, J. M.; LIMA, M. A. C. de; SANTOS, J. de O. Efeito da colheita seletiva na qualidade fisico-química da cultivar Ruby Cabernet plantada em diferentes sistemas de condução no vale do Submédio São Francisco, Brasil. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 11., 2007, Mendonza. Seduciendo al concumidor de hoy. Mendonza: IVV: CLEIFRA: SECYT, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 13. | | AMORIM, F. M. de; SOUSA, C. B. de; PEREIRA, G. E.; SOARES, J. M.; LIMA, M. A. C.; SANTOS, J. de O. Produção da videira 'Ruby Cabernet' submetida a diferentes modalidades de colheita e sistemas de condução, no Vale do Submédio são Francisco, Brasil. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 11., 2007, Mendoza. Seduciendo al consumidor de hoy: anales. [Mendoza: INV: CLEIFRA], 2007. 1 CD-ROM. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 14. | | AMORIM, F. M. de; SOUSA. C. B. de; PEREIRA, G. E.; SOARES, J. M.; LIMA, M. A. C. de; SANTOS, J. de O. Produção da videira Ruby Cabernet submetida a diferentes modalidades de colheita e sistemas de condução, no vale do Submédio São Francisco, Brasil. In: CONGRESO LATINOAMERICANO DE VITICULTURA Y ENOLOGIA, 11., 2007, Mendonza. Seduciendo al concumidor de hoy. Mendonza: IVV: CLEIFRA: SECYT, 2007. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 15. | | PEREIRA, G. E.; GUERRA, C. C.; AMORIM, F. M. de; NASCIMENTO, A. M. de S.; SOUZA, J. F. de; LIMA, L. L. de A.; LIMA, M. dos S.; PADILHA, C. V. da S.; PROTAS, J. F. da S.; ZANUS, M. C.; TONIETTO, J. Vinhos tropicais do semiárido do Brasil: desvendando o potencial vitivinícola desta nova fronteira geográfica do vinho. Territoires du Vin, v. 9, p. 1-13, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido; Embrapa Uva e Vinho. |
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| 16. | | PEREIRA, G. E.; GUERRA, C. C.; AMORIM, F. M. de; NASCIMENTO, A. M. DE S.; SOUZA, J. F. DE; LIMA, L. L. DE A.; LIMA, M. DOS S.; PADILHA, C. V. S.; PROTAS, J. F. da S.; ZANUS, M. C.; TONIETTO, J. Vins tropicaux de la région semi-aride du Brésil. Territoires du vin, v. 11, dez. 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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