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BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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1.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A. Aplicação de técnicas de reconhecimento de padrões usando os descritores estruturais de proteínas da base de dados do software STING para discriminação do sítio catalítico de enzimas. 2015. 216 p. il. Dissertação (Mestrado) - Faculdade de Engenharia Elétrica e Computação, Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientador: Fernando José Von Zuben, Co-orientador: Goran Neshich.

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2.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. A comparison between internal protein nanoenvironments of α-helices and beta-sheets. Plos One, v. 15, n. 12, p. 1-13, Dec. 2020. Artigo e0244315.

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3.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple structure single parameter: analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, 2016.

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4.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; BORRO, L.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Multiple Structures Single Parameter (MSSP): analysis of a single protein nano environment descriptor characterizing a shared loci on structurally aligned proteins. Bioinformatics Advance, v. 32, n. 12, p. 1885-1887, June 2016.

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5.Imagem marcado/desmarcadoBORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. In: CONGRESS OF THE INTERNATIONAL UNION FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 23.; ANNUAL MEETING OF THE BRAZILIAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, 44., 2015, Foz do Iguaçu. Biochemistry for a better world: abstracts book. [Foz do Iguaçu]: SBBq, 2015. p. 153. C.047.

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6.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Study of specific nanoenvironments containing [alfa]-helices in all-[alfa] and ([alfa]+[beta])+([alfa]/[beta]) proteins. Plos One, v. 13, n. 7, p. 1-25, 2018. Artigo e0200018.

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7.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, G.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; SALIM, J. A; BORRO, L. C. STING_MSSP: Multiple structure single parameter. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2016.

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8.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. P.; NESHICH, G. MSSP: a web-based application for analysis of selected parameter from multiple structures in a graphical manner. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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9.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Pathogenic Prion Proteins (PrP) have higher electrostatic potential pattern than normal cellular prion protein in a specific region. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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10.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Size matters: surface hydrophobicity index (SHI) describes the impact of the size of interface area on oligomerization driven by hydrophobic effect. In: ANNUAL INTERNATIONAL CONFERENCE ON INTELLIGENT SYSTEMS FOR MOLECULAR BIOLOGY; STRUCTURAL BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOPHYSICS MEETING, 8., 2012, Long Beach, California. Abstracts... California: ISMB, 2012. Não paginado. 3Dsig 2012.

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11.Imagem marcado/desmarcadoNESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MANCINI, A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Surface hydrophobicity index (SHI): insight into the mechanisms of protein-protein associations. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009

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12.Imagem marcado/desmarcadoYANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; NESHICH, G.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G. RNDS: Rede Neural para Classificar Descritores do Sting. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.

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13.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; MAZONI, I.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. Generation of lipase B mutants with increased surface hydrophobicity in order to improve biodiesel catalysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não paginado. X-Meeting 2009.

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14.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; SALIM, J. A; NESHICH, I. A. P.; MORAES, F. R. de; NISHIMURA, L.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Structure function relationship de convoluted to a level of physical chemical descriptors: case study - lysozyme / lactalbumine differences. In: ANNUAL MEETING OF THE SBBq, 40., 2011, Foz do Iguaçu. [Proceedings...]. São Paulo, SP: Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Não paginado.

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15.Imagem marcado/desmarcadoMAZONI, I.; BORRO, L. C.; MANCINI, A.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R.; JARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; NESHICH, G. Comparison between physical chemical and geometrical characteristics of the amino acids present in alpha-helices and beta-sheets. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 5., 2009, Angra dos Reis. Abstracts book... Angra dos Reis: ABBCB, 2009. Não pagiando. X-Meeting 2009.

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16.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, G.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; NESHICH, I. P. A.; SALIM, J. A; DE MORAES, F. R. Molecular modeling and structural analysis of the protein twitching motility of Xylella fastidiosa. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOTECNOLOGIA E RODADA E FEIRA DE NEGÓCIOS, 4., 2012, Guarujá. [Resumos]... [S.l.: s.n.], 2012. Não paginado. Brasil Biotec 2012.

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17.Imagem marcado/desmarcadoJARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; BORRO, L.; NISHIMURA, L. S.; NESHICH, G. Biologia computacional molecular e suas aplicações na agricultura. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; ROMANI, L. A. S. (Ed.). Tecnologias da informação e comunicação e suas relações com a agricultura. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Cap. 6. p. 101-117.

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18.Imagem marcado/desmarcadoDRUCKER, D. P.; SALIM, J. A; TREKELS, M.; GROOM, Q.; PARR, C.; SOARES, F. M.; AGOSTINI, K.; SARAIVA, A. M.; MOLLOY, L.; HODSON, S.; GREGORY, A. Plant-pollinator interaction data: a case study of the WorldFAIR Project. Biodiversity Information Science and Standards, v. 6, e94310, 2022. Edição de resumos de The Biodiversity Information Standards (TDWG) annual conference, 2022, Sofia, Bulgaria.

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19.Imagem marcado/desmarcadoSALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; VON ZUBEN, F.; NESHICH, G. A pattern recognition approach for catalytic site residues prediction using STING structural protein descriptors. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR, 41., 2012, Foz do Iguaçu. Resumos... [S.l]: SBBq, 2012. Não paginado. 1 pôster.

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20.Imagem marcado/desmarcadoMORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. Plos One, San Francisco, v. 9, n. 1, p. 1-15, Jan. 2014.

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1.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S. Embriogênese somática e regeneração de plantas de dendezeiro. 2008. 126 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia: Produção Vegetal) - Programa de Pós-graduação em Agronomia, Universidade Federal do Acre, Rio Branco. Orientador: Jonny Everson Scherwinski Pereira.
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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2.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S. Embriogênese somática e regeneração de plantas de dendezeiro. 2008. Dissertação (Mestrado em Agronomia) Universidade Federal do Acre, Rio Branco, AC. Orientadora: Jonny Everson Scherwinski Pereira, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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3.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; PEREIRA, J. E. S. Fitorreguladores e fonte de explantes na organogênese in vitro de pimenta longa. In: Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 37-40, jul. 2006. Suplemento. 1 CD ROM. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCOSTA, F. H. da S.; GUEDES, R. da S.; BERGO, C. L.; PEREIRA, J. E. S. Avaliação do desenvolvimento inicial de progênies de dendezeiro (Elaeis guineensis) nas condições da Amazônia Sul Ocidental. In: CONFERÊNCIA INTERNACIONAL DE AGROENERGIA, 2006, Londrina. Anais... Londrina: Federação dos Engenheiros Agrônomos de Londrina, 2006. 4 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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5.Imagem marcado/desmarcadoFERMINO JÚNIOR, P. C. P.; PEREIRA, J. E. S.; NAGAO, E. O.; GUEDES, R. da S. Calogênese e organogênese in vitro a partir de segmentos nodais de cerejeira (Amburana acreana (Ducke) A.C. Sm.) da Amazônia Ocidental: estabelecimento e regeneração de brotos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1., 2007, Goiânia. Biodiversidade e competitividade: buscando novas opções: anais. Campinas: Sociedade Brasileira de Floricultura e Plantas Ornamentais, 2007. p. 811-815.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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6.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. da S.; PEREIRA, J. E. S. Características físicas e nutricionais da matriz de encapsulamento na produção de sementes sintéticas de pimenta-longa (Piper hispidinervum C. DC.). Revista Árvore, Viçosa, MG, v. 31, n. 6, p. 1005-1011, 2007.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - B
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7.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; MACIEL, S. de A.; PEREIRA, J. E. S. Indução de embriogênese somática em açaizeiro a partir de embriões zigóticos imaturos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 19., 2006, Cabo Frio, RJ. Frutas do Brasil: saúde para o mundo: palestras e resumos. Cabo Frio, RJ: UENF: UFRRJ, 2006. p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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8.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. E. S.; GUEDES, R. da S.; SCHIMITZ, G. C. B.; MACHADO, B. J. A. Indução de massas celulares embriogênicas em Physalis sp. a partir de discos caulinares de plântulas estabelecidas in vitro. In: Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 2621-2624, jul. 2006. Suplemento. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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9.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; SANTOS, F. C. B.; SILVA, L. J. B.; PEREIRA, J. E. S. Multiplicação in vitro do abacaxizeiro, cv. Rio Branco, influenciado por diferentes citocininas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 19., 2006, Cabo Frio, RJ. Frutas do Brasil: saúde para o mundo: palestras e resumos. Cabo Frio, RJ: UENF: UFRRJ, 2006. p. 185.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. E. S.; GUEDES, R. da S.; FERMINO JÚNIOR, P. C. P. Organogênese direta in vitro de explantes foliares de Physalis angulata L. - uma espécie medicinal. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1., 2007, Goiânia. Biodiversidade e competitividade: buscando novas opções: anais. Campinas: Sociedade Brasileira de Floricultura e Plantas Ornamentais, 2007. p. 519-521.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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11.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. S.; PEREIRA, J. E. S. Reversão de inflorescências imaturas de dendezeiro (Elaeis guineensis) ao estado vegetativo embriogênico: potencialidades de uso para a multiplicação de genótipos elite. In: CONFERÊNCIA INTERNACIONAL DE AGROENERGIA, 2006, Londrina. Anais... Londrina: Federação dos Engenheiros Agrônomos de Londrina, 2006. 4 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. E. S.; GUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. da S.; SCHMITZ, G. C. B. Avaliação de uso da tecnologia de produção de sementes sintéticas para pimenta longa. In: Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 2621-2624, jul. 2006. Suplemento. p. 53-56. 1 CD-ROM. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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13.Imagem marcado/desmarcadoFERMINO JÚNIOR, P. C. P.; SILVA, R. A.; MACIEL, S.; GUEDES, R. da S.; PEREIRA, J. E. S. Análises morfo-histológicas da embriogênese somática em açaizeiro (Euterpe oleraceae Mart.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 16.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 3.; SIMPÓSIO DE PLANTAS ORNAMENTAIS NATIVAS, 1., 2007, Goiânia. Biodiversidade e competitividade: buscando novas opções: anais. Campinas: Sociedade Brasileira de Floricultura e Plantas Ornamentais, 2007. p. 845-848.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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14.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; SCHMITZ, G. C. B.; MACIEL, S. de A.; OLIVEIRA, J. P. de; PEREIRA, J. E. S. Avaliação da germinação de sementes e do desenvolvimento inicial de plantas de pimenta longa in vitro. Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 41-44, jul. 2006. Suplemento. 1 CD ROM. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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15.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. E. S.; GUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. da S.; SCHMITZ, G. C. B. Composição da matriz de encapsulamento na formação e conversão de sementes sintéticas de pimenta-longa. Horticultura Brasileira, v.26, n.1, p. 93-96, 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Nacional - A
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16.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. E. S.; COSTA, F. H. da S.; MACHADO, B. J. A.; GUEDES, R. da S. Respostas morfogenéticas in vitro de inflorescências imaturas de dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq.) influenciadas por fatores do meio de cultura. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURA E BIODIESEL, 3., 2006, Varginha, MG. Anais... Lavras: UFLA, 2006. 6 p. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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17.Imagem marcado/desmarcadoGUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. dA S.; SCHMITZ, G. C. B.; PEREIRA, J. E. S. Produção de unidades encapsuláveis de pimenta longa a partir de sementes pré-germinadas. Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 33-36, jul. 2006. Suplemento. 1 CD-ROM. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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18.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, T. L. da; GUEDES, R. da S.; FERMINO JÚNIOR, P. C. P.; PEREIRA, J. E. S. Indução da embriogênese somática em dendezeiro (Elaeis guineensis Jacq.). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA PIBIC/CNPq//UFAC/EMBRAPA, 16.; MOSTRA DE PESQUISA E PÓS-GRADUAÇÃO, 6., 2007, Rio Branco, AC. A pesquisa e a pós-graduação contribuindo com o desenvolvimento da região: anais. Rio Branco, AC: Ufac, 2007. 2 p. 1 CD ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Acre.
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19.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, T. L. da; GUEDES, R. da S.; COSTA, F. H. da S.; PEREIRA, J. E. S. Multiplicação in vitro da pimenta longa. Horticultura Brasileira, v. 24, n. 1, p. 65-68, jul. 2006. Suplemento. 1 CD ROM. Edição dos anais do 46º Congresso Brasileiro de Olericultura, Goiânia, 2006.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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20.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, J. B. M.; GUEDES, R. da S.; ARAÚJO, E. A. de; MASTRÂNGELO, J. P.; AMARAL, E. F. do; OLIVEIRA, T. K. de; BARDALES, N. G. Combinação de cultivos florestais com a cultura da palma de óleo no estado do Acre. In: RAMALHO FILHO, A.; MOTTA, P. E. F. da; FREITAS, P. L. de; TEIXEIRA, W. G. T. Zoneamento agroecológico, produção e manejo para a cultura da palma de óleo na Amazônia. Rio de Janeiro: Embrapa Solos, 2010. p. 179-188.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
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