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Biblioteca(s): | Embrapa Unidades Centrais.
Data corrente: | 20/04/2011
Data da última atualização: | 11/12/2017
Autoria: | SALGADO, C. C.; CRUZ, C. D.; NASCIMENTO, M.; BARRERA, C. F. S.
Afiliação: | Caio Césio Salgado, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Cosme Damião Cruz, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Moysés Nascimento, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento; Carlos Felipe Sanches Barrera, Universidade Federal de Viçosa/Departamento de Genética e Melhoramento.
Título: | O uso da variância como metodologia alternativa para integração de mapas genéticos.
Ano de publicação: | 2011
Fonte/Imprenta: | Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 1, p. 66-73, jan. 2011.
Idioma: | Português
Notas: | Título em inglês: Variance utilization as an alternative methodology for integrating genetic maps.
Conteúdo: | O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro novos mapas: três com oito marcadores e um com nove marcadores, cada qual com quatro marcadores âncoras. Os mapas foram alinhados, ordenados, integrados e, em seguida, comparados ao mapa de origem. O processo de integração de mapas proposto mostrou-se eficiente. Os mapas gerados tiveram pequena tensão interna em comparação aos mapas dos quais se originaram. A integração de mapas depende do tipo de população utilizada, tamanho da população, tipo de marcador, da frequência de recombinação e da fase de ligação.
Palavras-Chave: | Frequência de recombinação; Grupos de ligação; Internal tension; Recombination frequency; Tensão interna.
Thesagro: | Marcador molecular.
Thesaurus Nal: | Genetic markers; Linkage groups.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/105560/1/O-uso-da-variancia.pdf
Registro original: | Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE)
Exemplares: | AI-SEDE - (49732-1) - UPE - AP - PP - 630.72081 - P474 -  - DIS