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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
14/03/2016 |
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Data da última atualização: |
22/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERRÃO, L. F. V.; CAIXETA, E. T.; PENA, G.; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; FERRAO, M. A. G.; SAKIYAMA, N. S. |
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Afiliação: |
LUÍS FELIPE V. FERRÃO, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; GUILHERME PENA, UFV; EUNICE M. ZAMBOLIM, UFV; COMES D. CRUZ, UFV; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UFV; MARIA AMELIA GAVA FERRAO, SAPC; NEY S. SAKIYAMA, UFV. |
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Título: |
New EST-SSR markers of Coffea arabica: transferability and application to studies of molecular characterization and genetic mapping. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Breeding, v. 35, n. 1, p. 2-5, jan. 2015. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Microsatellite markers (SSR) have broad utility in genetic studies due to a high rate of polymor-phisms, a codominant nature and multiallelism. EST?SSRs are markers derived from the expressed sequences of a genome and represent transcribed genes. Despite the importance of the genus Coffea , only a small number of EST?SSR markers are currently available. Thus, this study was designed to mine and develop a new set of EST?SSR markers from the Brazilian Coffee Genome Project. We investigated 130,792 expressed sequence tags (ESTs), from which 24,031 DNA sequences with microsatellites were identified. After stability and amplification testing, 101 new EST?SSR markers were developed and analyzed in different coffee species. The average rate of transferability was 88 %, showing that these markers are useful in genetic studies across the genus Coffea. Polymorphism levels and the degree of diversity were consistent with the evolutionary history of the species. All coffee genotypes were discriminated, even the C. arabica genotypes that have known narrow genetic basis. It was also possible to locate 14 EST? SSRs into different linkage groups of the C. arabica genetic map, which demonstrate that these markers can be useful in QTL mapping studies and in molecular-assisted selection. |
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Palavras-Chave: |
Brazilian Coffee Genome Project; Microsatellites. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Thesaurus Nal: |
Coffea; Genetic markers. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141110/1/New-EST-SSR-markers.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 91 | |
| 81. |  | PEREIRA, A. A.; SILVA, F. L. da; OLIVEIRA, A. C. B. de; OLIVEIRA, A. L. de; SAKIYAMA, N. S.; REZENDE, J. C. de; BOTELHO, C. E.; CARVALHO, G. R.; BONOMO, V. S. Caracterização da qualidade de bebida e outras características de acessos do banco de germoplasma de café de Minas Gerais. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 82. | | BONOMO, V. S.; SILVA, F. L. da; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; RODRIGUES, F. C.; REZENDE, J. C. de; BOTELHO, C. E.; CARVALHO, G. R. Comportamento de cafeeiros portadores de resistência à ferrugem em Viçosa, Minas Gerais. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 83. | | SILVA, F. L. da; BONOMO, V. S.; OLIVEIRA, A. C. B. de; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; RODRIGUES, F. C.; REZENDE, J. C. de; BOTELHO, C. E.; CARVALHO, G. R. Divergência genética entre clones de café robusta. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 84. | | ALKIMIM, E. R.; CAIXETA, E. T.; SOUSA, T. V.; GOIS, I. B.; SILVA, F. L. da; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; ALVES, R. S.; RESENDE, M. D. V. de. Designing the best breeding strategy for Coffea canephora: Genetic evaluation of pure and hybrid individuals aiming to select for productivity and disease resistance traits. Plos One, v. 16, n. 12, e0260997, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 85. | | PESTANA, K. N.; CAPUCHO, A. S.; CAIXETA, E. T.; ALMEIDA, D. P. de; ZAMBOLIM, E. M.; CRUZ, C. D.; ZAMBOLIM, L.; PEREIRA, A. A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; SAKIYAMA, N. S. Inheritance study and linkage mapping of resistance loci to Hemileia vastatrix in Híbrido de Timor UFV 443-03. The Genetic & Genomes, v. 11, n. 72, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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| 88. | | EIRA, M. T. S.; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O.; SILVAROLLA, M. B.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A.; FERRÃO, R. G.; SERA, T.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CARVALHO, C. H.; PADILHA, L.; SOUZA, F. de F. Bancos de germoplasma de café no Brasil: base do melhoramento para produtividade e qualidade. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. 1 CD-ROM. Parceria: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Instituto Agronômico de Campinas; Instituto Capixaba de Pesquisa, Assistência Técnica e Extensão Rural; Instituto Agronômico do Paraná; Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas...| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica | Circulação/Nível: -- - -- |
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| 90. | | EIRA, M. T. S.; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O.; SILVAROLLA, M. B.; FERRÃO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A.; FERRÃO, R. G.; SERA, T.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CARVALHO, C. H.; PADILHA, L.; SOUZA, F. de F. (ed.). Bancos de germoplasma de café no Brasil. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. 18 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 243).| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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