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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
Data corrente: |
28/04/2021 |
Data da última atualização: |
28/04/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CORNACINI, M. R.; MANOEL, R. O.; ALCANTARA, M. A. M.; MORAES, M. L. T.; SILVA, E. A. A.; PEREIRA NETO, L. G.; SEBBENN, A. M.; ROSSINI, B. C.; MARINO, C. L. |
Afiliação: |
MAIARA R. CORNACINI, UNESP, Botucatu-SP; RICARDO O. MANOEL, UNESP, Botucatu-SP; MARCELO A. M. ALCANTARA, UNESP, Botucatu-SP; MARIO L. T. MORAES, UNESP, Ilha Solteira-SP; EDVALDO A. A. SILVA, UNESP, Botucatu-SP; LEONEL GONCALVES PEREIRA NETO, CNPASA; ALEXANDRE M. SEBBENN, INSTITUTO FLORESTAL DE SÃO PAULO, Piracicaba-SP; BRUNO C. ROSSINI, UNESP, Botucatu-SP; CELSO L. MARINO, UNESP, Botucatu-SP. |
Título: |
Detection and application of novel SSR markers from transcriptome data for Astronium fraxinifolium Schott, a threatened Brazilian tree species. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, 2021. |
ISSN: |
0301-4851 |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-021-06338-5 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Astronium fraxinifolium is an endangered tree species from Brazil. Due to its significance in environmental reforestation, as well as the continued exploitation of its wood, it is necessary to develop management programs that support the conservation of the species. Simple sequence repeats (SSR) or microsatellite markers are widely used in population genetic studies across a range of diverse organisms. In this study, we present the first SSR markers developed for A. fraxinifolium as well as their frequency and distribution based on transcriptome data. From transcriptome data, we identified more than 100 thousand sequences presenting microsatellites, with a predominant distribution of trinucleotide repeats. From the initial screening, we selected 20 microsatellite loci which were validated and evaluated for genetic indices in two natural populations. All loci were polymorphic, ranging from four to 11 alleles per locus. The observed and expected heterozygosities ranged from 0 to 1.0 and from 0.533 to 1.0, respectively, while the genetic differentiation (GST = 0.363) was greater within than between populations. The developed SSR loci from RNA-Seq data provides a foundation for future studies on genetic diversity and population structure, mating system, and gene flow for A. fraxinifolium populations and related species, aiming at conservation and management. |
Palavras-Chave: |
Conservation genetics; Microsatellite markers. |
Thesagro: |
Anacardiaceae; Astronium Fraxinifolium. |
Thesaurus Nal: |
Conservation plants; Genetic markers; Microsatellite repeats; Population genetics. |
Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/222904/1/mbr-2021.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Cutter |
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Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Uva e Vinho. |
Data corrente: |
13/01/2017 |
Data da última atualização: |
01/03/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
Autoria: |
HOFF, R.; BERGMAN, M.; CRUS, M. T. P. da; SILVEIRA, C. A. P. |
Afiliação: |
ROSEMARY HOFF, CNPUV; Magda Bergman, Companhia de Pesquisa de Recursos Minerais ? CPRM), magda.bergmann@cprm.com.br; Maria Tarciana Pereira da Cruz, Universidade do Vale do Rio dos Sinos - UNISINOS, tarcianapcruz@gmail.com; CARLOS AUGUSTO POSSER SILVEIRA, CPACT. |
Título: |
Caracterização de pó de rocha como remineralizador e corretor de solos para viticultura sustentável na fronteira oeste, RS, Brasil. |
Ano de publicação: |
2016 |
Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ROCHAGEM, 3., 2016, Pelotas, RS. Anais... Pelotas: CBR, 2016. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Sumário: O emprego de rochas para remineralização e correção de acidez de solos na viticultura ainda é pouco difundido no Rio Grande do Sul. Na Região Vitivinícola Campanha, o setor tem buscado desenvolver e implantar uma indicação geográfic a para vinhos de alta qualidade e práticas sustentáveis são propícias e podem agregar valor ao produto final, ou seja, o vinho . As rochas vulcânicas da Formação Serra Geral, são representadas na região da fronteira oeste do RS pela Fácies Alegrete, conjunto de derrames de composição andesítica a basáltica, dentre os quais os derrames Catalán e Cordillera comportam espessas brechas de topo cimentadas por calcita, com quantidades subordinadas de zeolitas. Rochas disponíveis de britagem em lavras estão situadas em Santana do Livramento,Rosário do Sul, e Quaraí. A maioria das rochas da Formação Serra Geral não apresenta restrição quanto aos Elementos Potencialmente Tóxicos (EPT)e também cumprem requisito para comercialização de remineralizadores de solos pelo MAPA,apresentando Soma de Bases (K2O+CaO+MgO)entre 14 e 17% e sendo fontes de Ca e Mg, além de micronutrientes Cu, Ni e Zn. As brechas têm conteúdo de CaO de 12 -19%, MgO de 3-6,4%,sendo portadoras de Cu e Zn e apresentando ainda teores de Co. Os clastos de basalto amigdaloide são ricos em materiais devitrificados, o que favorece sua reatividade em solos e assegura a presença de argilominerais (esmectitas) com elevada capacidade de trocas catiônicas (CTC). A viticultura em Santana do Livramento, Quaraí e Rosário do Sul ocorre sobre solos arenosos pobres em nutrientes, sendo predominantemente Neossolos Quartzarênicos, desenvolvidos sobre arenitos, q ue poderiam ser beneficiados pela correção de acidez. Palavras?chave: remineralização de solos, vitivinicultura, basaltos, região vitivinícola Campanha MenosSumário: O emprego de rochas para remineralização e correção de acidez de solos na viticultura ainda é pouco difundido no Rio Grande do Sul. Na Região Vitivinícola Campanha, o setor tem buscado desenvolver e implantar uma indicação geográfic a para vinhos de alta qualidade e práticas sustentáveis são propícias e podem agregar valor ao produto final, ou seja, o vinho . As rochas vulcânicas da Formação Serra Geral, são representadas na região da fronteira oeste do RS pela Fácies Alegrete, conjunto de derrames de composição andesítica a basáltica, dentre os quais os derrames Catalán e Cordillera comportam espessas brechas de topo cimentadas por calcita, com quantidades subordinadas de zeolitas. Rochas disponíveis de britagem em lavras estão situadas em Santana do Livramento,Rosário do Sul, e Quaraí. A maioria das rochas da Formação Serra Geral não apresenta restrição quanto aos Elementos Potencialmente Tóxicos (EPT)e também cumprem requisito para comercialização de remineralizadores de solos pelo MAPA,apresentando Soma de Bases (K2O+CaO+MgO)entre 14 e 17% e sendo fontes de Ca e Mg, além de micronutrientes Cu, Ni e Zn. As brechas têm conteúdo de CaO de 12 -19%, MgO de 3-6,4%,sendo portadoras de Cu e Zn e apresentando ainda teores de Co. Os clastos de basalto amigdaloide são ricos em materiais devitrificados, o que favorece sua reatividade em solos e assegura a presença de argilominerais (esmectitas) com elevada capacidade de trocas catiônicas (CTC). A viticultura em Santana do L... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Basaltos; Região vitivinícola Campanha; Remineralização de solos; Vitivinicultura. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/153276/1/Hoff.et.al-IIICBR.artigo.pdf
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Marc: |
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Embrapa Uva e Vinho (CNPUV) |
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