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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão; Embrapa Solos; Embrapa Solos / UEP-Recife. |
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Data corrente: |
07/12/2023 |
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Data da última atualização: |
07/12/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
RODRIGUES, H. M.; CEDDIA, M. B.; VASQUES, G. M.; MULDER, V. L.; HEUVELINK, G. B. M.; OLIVEIRA, R. P. de; BRANDAO, Z. N.; MORAIS, J. P. S.; NEVES, M. L.; TAVARES, S. R. de L. |
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Afiliação: |
HUGO RODRIGUES, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; MARCOS BACIS CEDDIA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; GUSTAVO DE MATTOS VASQUES, CNPS; VERA LEATITIA MULDER, WAGENINGEN UNIVERSITY; GERARD B. M. HEUVELINK, WAGENINGEN UNIVERSITY; RONALDO PEREIRA DE OLIVEIRA, CNPS; ZIANY NEIVA BRANDAO, CNPA; JOAO PAULO SARAIVA MORAIS, CNPA; MATHEUS LEAL NEVES, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO; SILVIO ROBERTO DE LUCENA TAVARES, CNPS. |
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Título: |
Remote sensing and kriging with external drift to improve sparse proximal soil sensing data and define management zones in precision agriculture. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
AgriEngineering, v. 5, n. 4, p. 2326-2348, 2023. |
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DOI: |
https://doi.org/10.3390/agriengineering5040143 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The precision agriculture scientific field employs increasingly innovative techniques to optimize inputs, maximize profitability, and reduce environmental impacts. Therefore, obtaining a high number of soil samples to make precision agriculture feasible is challenging. This data bottleneck has been overcome by identifying sub-regions based on data obtained through proximal soil sensing equipment. These data can be combined with freely available remote sensing data to create more accurate maps of soil properties. Furthermore, these maps can be optimally aggregated and interpreted for soil heterogeneity through management zones. Thus, this work aimed to create and combine soil management zones from proximal soil sensing and remote sensing data. To this end, data on electrical conductivity and magnetic susceptibility, both apparent, were measured using the EM38-MK2 proximal soil sensor and the contents of the thorium and uranium elements, both equivalent, via the Medusa MS1200 proximal soil sensor for a 72-ha grain-producing area in São Paulo, Brazil. The proximal soil sensing attributes were mapped using ordinary kriging (OK). Maps were also made using kriging with external drift (KED), and the proximal soil sensor attributes data, combined with remote sensing data, such as Landsat-8, Aster, and Sentinel-2 images, in addition to 10 terrain covariables derived from the digital elevation model Alos Palsar. As a result, three management zone maps were produced via the k-means clustering algorithm: using data from proximal sensors (OK), proximal sensors combined with remote sensors (KED), and remote sensors. Seventy-two samples (0–10 cm in depth) were collected and analyzed in a laboratory (1 sample per hectare) for concentrations of clay, calcium, organic carbon, and magnesium to assess the capacity of the management zone maps created using analysis of variance. All zones created using the three data groups could distinguish the different treatment areas. The three data sources used to map management zones produced similar map zones, but the zone map using a combination of proximal and remote data did not show an improvement in defining the management zones, and using only remote sensing data lowered the significance levels of differentiating each zone compared to the OK and KED maps. In summary, this study not only underscores the global applicability of proximal and remote sensing techniques in precision agriculture but also sheds light on the nuances of their integration. The study’s findings affirm the efficacy of these advanced technologies in addressing the challenges posed by soil heterogeneity, paving the way for more nuanced and site-specific agricultural practices worldwide. MenosThe precision agriculture scientific field employs increasingly innovative techniques to optimize inputs, maximize profitability, and reduce environmental impacts. Therefore, obtaining a high number of soil samples to make precision agriculture feasible is challenging. This data bottleneck has been overcome by identifying sub-regions based on data obtained through proximal soil sensing equipment. These data can be combined with freely available remote sensing data to create more accurate maps of soil properties. Furthermore, these maps can be optimally aggregated and interpreted for soil heterogeneity through management zones. Thus, this work aimed to create and combine soil management zones from proximal soil sensing and remote sensing data. To this end, data on electrical conductivity and magnetic susceptibility, both apparent, were measured using the EM38-MK2 proximal soil sensor and the contents of the thorium and uranium elements, both equivalent, via the Medusa MS1200 proximal soil sensor for a 72-ha grain-producing area in São Paulo, Brazil. The proximal soil sensing attributes were mapped using ordinary kriging (OK). Maps were also made using kriging with external drift (KED), and the proximal soil sensor attributes data, combined with remote sensing data, such as Landsat-8, Aster, and Sentinel-2 images, in addition to 10 terrain covariables derived from the digital elevation model Alos Palsar. As a result, three management zone maps were produced via the k-means clu... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Geoestatística; Management zones; Proximal soil sensing. |
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Thesagro: |
Agricultura de Precisão; Sensoriamento Remoto. |
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Thesaurus Nal: |
Geostatistics; Precision agriculture; Remote sensing. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1159261/1/Remote-sensing-and-kriging-with-external-drift-2023.pdf
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Marc: |
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520 $aThe precision agriculture scientific field employs increasingly innovative techniques to optimize inputs, maximize profitability, and reduce environmental impacts. Therefore, obtaining a high number of soil samples to make precision agriculture feasible is challenging. This data bottleneck has been overcome by identifying sub-regions based on data obtained through proximal soil sensing equipment. These data can be combined with freely available remote sensing data to create more accurate maps of soil properties. Furthermore, these maps can be optimally aggregated and interpreted for soil heterogeneity through management zones. Thus, this work aimed to create and combine soil management zones from proximal soil sensing and remote sensing data. To this end, data on electrical conductivity and magnetic susceptibility, both apparent, were measured using the EM38-MK2 proximal soil sensor and the contents of the thorium and uranium elements, both equivalent, via the Medusa MS1200 proximal soil sensor for a 72-ha grain-producing area in São Paulo, Brazil. The proximal soil sensing attributes were mapped using ordinary kriging (OK). Maps were also made using kriging with external drift (KED), and the proximal soil sensor attributes data, combined with remote sensing data, such as Landsat-8, Aster, and Sentinel-2 images, in addition to 10 terrain covariables derived from the digital elevation model Alos Palsar. As a result, three management zone maps were produced via the k-means clustering algorithm: using data from proximal sensors (OK), proximal sensors combined with remote sensors (KED), and remote sensors. Seventy-two samples (0–10 cm in depth) were collected and analyzed in a laboratory (1 sample per hectare) for concentrations of clay, calcium, organic carbon, and magnesium to assess the capacity of the management zone maps created using analysis of variance. All zones created using the three data groups could distinguish the different treatment areas. The three data sources used to map management zones produced similar map zones, but the zone map using a combination of proximal and remote data did not show an improvement in defining the management zones, and using only remote sensing data lowered the significance levels of differentiating each zone compared to the OK and KED maps. In summary, this study not only underscores the global applicability of proximal and remote sensing techniques in precision agriculture but also sheds light on the nuances of their integration. The study’s findings affirm the efficacy of these advanced technologies in addressing the challenges posed by soil heterogeneity, paving the way for more nuanced and site-specific agricultural practices worldwide.
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Registro original: |
Embrapa Solos (CNPS) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
14/02/2011 |
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Data da última atualização: |
14/02/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
FARIAS, T. A.; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. N.; SOUZA, I. I. F.; RUSSI, L. S.; LUIZ, H. L.; BACANELLI, G.; ROSINHA, G. M. S.; SOARES, C. O.; ELISEI, C.; OSÓRIO, A. L. A. R.; JORGE, K. S. G.; SANTOS, L. R. |
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Afiliação: |
Bolsista DTI/CNPq na Embrapa Gado de Corte; FLABIO RIBEIRO ARAUJO, CNPGC; Doutorando na Universidade Federal Rural de Pernambuco.; Bolsista DTI/CNPq na Embrapa Gado de Corte; Bolsista DTI/CNPq na Embrapa Gado de Corte; Mestranda na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.; Mestranda na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul; GRACIA MARIA SOARES ROSINHA, CNPGC; CLEBER OLIVEIRA SOARES, CNPGC; Bolsista DTI/CNPq na Embrapa Gado de Corte; Pesquisador na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul; Pesquisador na Universidade Federal de Mato Grosso do Sul; Bolsista DTI/CNPq na Embrapa Gado de Corte. |
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Título: |
Produção de proteínas recombinantes para avaliação de resposta celular contra Mycobacterium bovis. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA GADO DE CORTE,5., 2009, Campo Grande, MS. [Anais da ...]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2009. |
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Páginas: |
1 p |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Tuberculose bovina é uma enfermidade infecciosa, causada pela bactéria Mycobacterium bovis. Esta enfermidade tem acometido rebanhos de vários países, inclusive do Brasil, causando problemas econômicos e de saúde pública. Animais infectados com M. bovis, primariamente, apresentam resposta imune celular e, devido a isso, o teste intradérmico com PPD (Purified Protein Derivative) é amplamente utilizado nos programas de controle da doença. Entretanto, a tuberculinização possui algumas desvantagens, como a detecção de reações cruzadas e necessidade de imobilização dos animais em dois momentos distintos. Além disso, bovinos submetidos à intradermorreação tornam-se temporariamente anérgicos, e em casos de reações inconclusivas, não podem ser re-testados por pelo menos 60 dias. Uma forma de minimizar esses problemas é o desenvolvimento de testes de diagnósticos in vitro, nos quais a capacidade de antígenos estimularem a liberação de citocinas é mensurada. O objetivo deste trabalho foi produzir as proteínas PE5 e ESAT-6 de M. bovis em sistema heterólogo de expressão para posterior avaliação da indução de resposta celular de bovinos. Os genes pe5 e esat-6 foram amplificados por PCR (Polymerase Chain Reaction), clonados em plasmídeo pGEM-T Easy e subclonados em plasmídeo pRSet-C. A expressão dos genes foi verificada por eletroforese em gel de SDS-poliacrilamida, bem como por Western blot com anticorpo monoclonal anti-histidina. Foi possível observar proteínas de 15 e 16 kDa, que correspondem, respectivamente, às massas moleculares estimadas das proteínas recombinantes PE5 e ESAT-6 fusionadas a cauda de histidina. No Western blot, as proteínas recombinantes foram reconhecidas pelo anticorpo monoclonal. ESAT-6 é um dos antígenos de M. bovis mais bem documentados, demonstrando sensibilidade de moderada a alta em diversos testes de diagnóstico e a proteína PE-5 demonstrou anteriormente alta especificidade. Portanto, a utilização destas proteínas, individualmente ou em conjunto, poderá incrementar o diagnóstico da tuberculose bovina em testes de tuberculinização intradérmica e de dosagem de interferon-γ. MenosTuberculose bovina é uma enfermidade infecciosa, causada pela bactéria Mycobacterium bovis. Esta enfermidade tem acometido rebanhos de vários países, inclusive do Brasil, causando problemas econômicos e de saúde pública. Animais infectados com M. bovis, primariamente, apresentam resposta imune celular e, devido a isso, o teste intradérmico com PPD (Purified Protein Derivative) é amplamente utilizado nos programas de controle da doença. Entretanto, a tuberculinização possui algumas desvantagens, como a detecção de reações cruzadas e necessidade de imobilização dos animais em dois momentos distintos. Além disso, bovinos submetidos à intradermorreação tornam-se temporariamente anérgicos, e em casos de reações inconclusivas, não podem ser re-testados por pelo menos 60 dias. Uma forma de minimizar esses problemas é o desenvolvimento de testes de diagnósticos in vitro, nos quais a capacidade de antígenos estimularem a liberação de citocinas é mensurada. O objetivo deste trabalho foi produzir as proteínas PE5 e ESAT-6 de M. bovis em sistema heterólogo de expressão para posterior avaliação da indução de resposta celular de bovinos. Os genes pe5 e esat-6 foram amplificados por PCR (Polymerase Chain Reaction), clonados em plasmídeo pGEM-T Easy e subclonados em plasmídeo pRSet-C. A expressão dos genes foi verificada por eletroforese em gel de SDS-poliacrilamida, bem como por Western blot com anticorpo monoclonal anti-histidina. Foi possível observar proteínas de 15 e 16 kDa, que corres... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Tuberculose bovina. |
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Thesagro: |
Mycobacterium Bovis; Sanidade Animal. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/27148/1/PRODUCAO-DE-PROTEINAS-RECOMBINANTES-PARA-AVALIACAO-DE-RESPOSTA.pdf
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Marc: |
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520 $aTuberculose bovina é uma enfermidade infecciosa, causada pela bactéria Mycobacterium bovis. Esta enfermidade tem acometido rebanhos de vários países, inclusive do Brasil, causando problemas econômicos e de saúde pública. Animais infectados com M. bovis, primariamente, apresentam resposta imune celular e, devido a isso, o teste intradérmico com PPD (Purified Protein Derivative) é amplamente utilizado nos programas de controle da doença. Entretanto, a tuberculinização possui algumas desvantagens, como a detecção de reações cruzadas e necessidade de imobilização dos animais em dois momentos distintos. Além disso, bovinos submetidos à intradermorreação tornam-se temporariamente anérgicos, e em casos de reações inconclusivas, não podem ser re-testados por pelo menos 60 dias. Uma forma de minimizar esses problemas é o desenvolvimento de testes de diagnósticos in vitro, nos quais a capacidade de antígenos estimularem a liberação de citocinas é mensurada. O objetivo deste trabalho foi produzir as proteínas PE5 e ESAT-6 de M. bovis em sistema heterólogo de expressão para posterior avaliação da indução de resposta celular de bovinos. Os genes pe5 e esat-6 foram amplificados por PCR (Polymerase Chain Reaction), clonados em plasmídeo pGEM-T Easy e subclonados em plasmídeo pRSet-C. A expressão dos genes foi verificada por eletroforese em gel de SDS-poliacrilamida, bem como por Western blot com anticorpo monoclonal anti-histidina. Foi possível observar proteínas de 15 e 16 kDa, que correspondem, respectivamente, às massas moleculares estimadas das proteínas recombinantes PE5 e ESAT-6 fusionadas a cauda de histidina. No Western blot, as proteínas recombinantes foram reconhecidas pelo anticorpo monoclonal. ESAT-6 é um dos antígenos de M. bovis mais bem documentados, demonstrando sensibilidade de moderada a alta em diversos testes de diagnóstico e a proteína PE-5 demonstrou anteriormente alta especificidade. Portanto, a utilização destas proteínas, individualmente ou em conjunto, poderá incrementar o diagnóstico da tuberculose bovina em testes de tuberculinização intradérmica e de dosagem de interferon-γ.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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